New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 112 | 3 = | 0 (0.000) | 39 (0.600) +CC |
33/196 | 1.0 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 123 | = 14064 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
TGACCCCGCATGTACAAAAGTCTGCCCCAGCGGCGCAATGCATAAGCGTGAAGATGGCTTTGTGGTGGTTGATGAAGATGTTTGTATCGGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 112/95‑3 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCTACTGCCACATGGCTTGTCCGTACGGCGCGCCACAGTACAATGCTGAAAAAGGGCACATGACGAAGTGCGATGGTTGTTATTCGCGCGTCGCCGAGGG < 123/14064‑13965 || TGACCCCGCATGTACAAAAGTCTGCCCCAGCGGCGCAATGCATAAGCGTGAAGATGGCTTTGTGGTGGTTGATGAAGATGTTTGTATCGGCTGCCGCTACT < 2:1110929/101‑1 TGACCCCGCATGTACAAAAGTCTGCCCCAGCGGCGCAATGCATAAGCGTGAAGATGGCTTTGTGGTGGTTGATGAAGATGTTTGTATCGGCTGCCGCTACT < 1:1554667/101‑1 CCCCGCATGTACAAAAGTCTGCCCCAGCGGCGCAATGCATAAGCGTGAAGATGGCTTTGTGGTGGTTGATGAAGATGTTTGTATCGGCTGCCGCTACTGCC < 2:174104/101‑1 CGCATGTACAAAAGTCTGCCCCAGCGGCGCAATGCATAAGCGTGAAGATGGCTTTGTGGTGGTTGATGAAGATGTTTGTATCGGCTGCCGCTACTGCCACA > 2:1514613/1‑101 CGCATGTACAAAAGTCTGCCCCAGCGGCGCAATGCATAAGCGTGAAGATGGCTTTGTGGTGGTTGATGAAGATGTTTGTATCGGCTGCCGCTACTGCCACA > 1:556039/1‑101 GCATGTACAAAAGTCTGCCCCAGCGGCGCAATGCATAAGCGTGAAGATGGCTTTGTGGTGGTTGATGAAGATGTTTGTATCGGCTGCCGCTACTGCCACAT < 2:1128682/101‑1 CATGTACAAAAGTCTGCCCCAGCGGCGCAATGCATAAGCGTGAAGATGGCTTTGTGGTGGTTGATGAAGATGTTTGTATCGGCTGCCGCTACTGCCACATG < 1:1373147/101‑1 ATGTACAAAAGTCTGCCCCAGCGGCGCAATGCATAAGCGTGAAGATGGCTTTGTGGTGGTTGATGAAGATGTTTGTATCGGCTGCCGCTACTGCCACATGG > 1:1419879/1‑101 TACAAAAGTCTGCCCCAGCGGCGCAATGCATAAGCGTGAAGATGGCTTTGTGGTGGTTGATGAAGATGTTTGTATCGGCTGCCGCTACTGCCACATGGCTT < 1:1611666/101‑1 TACAAAAGTCTGCCCCAGCGGCGCAATGCATAAGCGTGAAGATGGCTTTGTGGTGGTGGATGAAGATGTTTGTCTCGGCTGCCGCTACTGCCGCATGGCTT < 2:759120/101‑1 AAAGTCTGCCCCAGCGGCGCAATGCATAAGCGTGAAGATGGCTTTGTGGTGGTTGATGAAGATGTTTGTATCGGCTGCCGCTACTGCCACATGGCTTGTCC > 1:1125728/1‑101 TCTGCCCCAGCGGCGCAATGCATAAGCGTGAAGATGGCTTTGTGGTGGTTGATGAAGATGTTTGTATCGGCTGCCGCTACTGCCACATGGCTTGTCCGTAC < 2:1097230/101‑1 GCGGCGCAATGCATAAGCGTGAAGATGGCTTTGTGGTGGTTGATGAAGATGTTTGTATCGGCTGCCGCTACTGCCACATGGCTTGTCCGTACGGCGCGCCA < 2:94000/101‑1 CAATGCATAAGCGTGAAGATGGCTTTGTGGTGGTTGATGAAGATGTTTGTATCGGCTGCCGCTACTGCCACATGGCTTGTCCGTACGGCGCGCCACAGTAC < 1:890362/101‑1 ATGCATAAGCGTGAAGATGGCTTTGTGGTGGTTGATGAAGATGTTTGTATCGGCTGCCGCTACTGCCACATGGCTTGTCCGTACGGCGCGCCACAGTACAA < 1:1178606/101‑1 GCATAAGCGTGAAGATGGCTTTGTGGTGGTTGATGAAGATGTTTGTATCGGCTGCCGCTACTGCCACATGGCTTGTCCGTACGGCGCGCCACAGTACAATG > 2:1421507/1‑101 ATAAGCGTGAAGATGGCTTTGTGGTGGTTGATGAAGATGTTTGTATCGGCTGCCGCTACTGCCACATGGCTTGTCCGTACGGCGCGCCACAGTACAATGCT < 2:1105830/101‑1 ATAAGCGTGAAGATGGCTTTGTGGTGGTTGATGAAGATGTTTGTATCGGCTGCCGCTACTGCCACATGGCTTGTCCGTACGGCGCCCCACCGGACAATGCT > 1:1458550/1‑101 TAAGCGTGAAGATGGCTTTGTGGTGGTTGATGAAGATGTTTGTATCGGCTGCCGCTACTGCCACATGGCTTGTCCGTACGGCGCGCCACAGTACAATGCTG < 2:556034/101‑1 GTGAAGATGGCTTTGTGGTGGTTGATGAAGATGTTTGTATCGGATGCCGCTACTGCCACATGGCTTGTCCGGACGGCGCGCCACAGTACAATGCTGAAAAA > 1:408189/1‑101 TGAAGATGGCTTTGTGGTGGTTGATGAAGATGTTTGTATCGGCTGCCGCTACTTCCACATGGCTTGTCCGTACGGCGCGCCACAGTACAATGCTGAAAAAG > 1:250155/1‑101 TGAAGATGGCTTTGTGGTGGTTGATGAAGATGTTTGTATCGGCTGCCGCTACTGCCACATGGCTTGTCCGTACGGCGCGCCACAGTACAATGCTGAAAAAG < 2:1419873/101‑1 TGAAGATGGCTTTGTGGTGGTTGATGAAGATGTTTGTATCGGCTGCCGCTACTGCCACATGGCTTGTCCGTACGGCGCGCCACAGTACAATGCTGAAAAAG > 1:698713/1‑101 GAAGATGGCTTTGTGGTGGTTGATGAAGATGTTTGTATCGGCTGCCGCTACTGCCACATGGCTTGTCCGTACGGCGCGCCACAGTACAATGCTGAAAAAGG < 1:959420/101‑1 GGCTTTGTGGTGGTTGATGAAGATGTTTGTATCGGCTGCCGCTACTGCCACATGGCTTGTCCGTACGGCGCGCCACAGTACAATGCTGAAAAAGGGCACAT < 1:1413506/101‑1 GGCTTTGTGGTGGTTGATGAAGATGTTTGTATCGGCTGCCGCTACTGCCACATGGCTTGTCCGTACGGCGCGCCACAGTACAATGCTGAAAAAGGGCACAT < 2:1291799/101‑1 GCTTTGTGGTGGTTGATGAAGATGTTTGTATCGGCTGCCGCTACTGCCACATGGCTTGTCCGTACGGCGCGCCACAGTACAATGCTGAAAAAGGGCACATG < 1:1221344/101‑1 TTTGTGGTGGTTGATGAAGATGTTTGTATCGGCTGCCGCTACTGCCACATGGCTTGTCCGTACGGCGCGCCACAGTACAATGCTGAAAAAGGGCACATGAC > 2:296278/1‑101 TGGTTGATGAAGATGTTTGTATCGGCTGCCGCTACTGCCACATGGCTTGTCCGTACGGCGCGCCACAGTACAATGCTGAAAAAGGGCACATGACGAAGTGC < 2:1209995/101‑1 GTTGATGAAGATGTTTGTATCGGCTGCCGCTACTGCCACATGGCTTGTCCGTACGGCGCGCCACAGTACAATGCTGAAAAAGGGCACATGACGAAGTGCGA < 1:1186035/101‑1 TGATGAAGATGTTTGTATCGGCTGCCGCTACTGCCACATGGCTTGTCCGTACGGCGCGCCACAGTACAATGCTGAAAAAGGGCACATGACGAAGTGCGATG > 2:620891/1‑101 TGATGAAGATGTTTGTATCGGCTGCCGCTACTGCCACATGGCTTGGCCGTACGGCGCGCCACAGTACAAAGCTGAAAAATGGCACATGACGAAGAGCGATG > 1:881885/1‑101 ATGAAGATGTTTGTATCGGCTGCCGCTACTGCCACATGGCTTGTCCGTACGGCGCGCCACAGTACAATGCTGAAAAAGGGCACATGACGAAGTGCGATGGT < 2:1125723/101‑1 ATGAAGATGTTTGTATCGGCTGCCGCTACTGCCACATGGCTTGTCCGTACGGCGCGCCACAGTACAATGCTGAAAAAGGGCACATGACGAAGTGCGATGGT > 2:338650/1‑101 GAAGATGTTTGTATCGGCTGCCGCTACTGCCACATGGCTTGTCCGTACGGCGCGCCACAGTACAATGCTGAAAAAGGGCACATGACGAAGTGCGATGGTTG < 2:304544/101‑1 TGTATCGGCTGCCGCTACTGCCACATGGCTTGTCCGTACGGCGCGCCACAGTACAATGCTGAAAAAGGGCACATGACGAAGTGCGATGGTTGTTATTCGCG < 2:408184/101‑1 GTATCGGCTGCCGCTACTGCCACATGGCTTGTCCGTACGGCGCGCCACAGTACAATGCTGAAAAAGGGCACATGACGAAGTGCGATGGTTGTTATTCGCGC > 2:153661/1‑101 TATCGGCTGCCGCTACTGCCACATGGCTTGTCCGTACGGCGCGCCACAGTACAATGCTGAAAAAGGGCACATGACGAAGTGCGATGGTTGTTATTCGCGCG > 1:95676/1‑101 CTGCCGCTACTGCCACATGGCTTGTCCGTACGGCGCGCCACAGTACAATGCTGAAAAAGGGCACATGACGAAGTGCGATGGTTGTTATTCGCGCGTCGCCG > 1:1367959/1‑101 CCGCTACTGCCACATGGCTTGTCCGTACGGCGCGCCACAGTACAATGCTGAAAAAGGGCACATGACGAAGTGCGATGGTTGTTATTCGCGCGTCGCCGAGG < 2:872683/101‑1 CGCTACTGCCACATGGCTTGTCCGTACGGCGCGCCACAGTACAATGCTGAAAAAGGGCACATGACGAAGTGCGATGGTTGTTATTCGCGCGTCGCCGAGGG < 2:411692/101‑1 || TGACCCCGCATGTACAAAAGTCTGCCCCAGCGGCGCAATGCATAAGCGTGAAGATGGCTTTGTGGTGGTTGATGAAGATGTTTGTATCGGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 112/95‑3 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCTACTGCCACATGGCTTGTCCGTACGGCGCGCCACAGTACAATGCTGAAAAAGGGCACATGACGAAGTGCGATGGTTGTTATTCGCGCGTCGCCGAGGG < 123/14064‑13965 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |