New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 110 | 1 = | 0 (0.000) | 67 (1.200) +GGTGATGCTGCCAACT |
54/168 | 0.1 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 223 | = 698 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
AAGCGCGTTTTAATGAGTTTATCAGTGAACTTACCCGTCGAATGCCACAACACAGGGAGCGAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 110/100‑1 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTA < 223/698‑620 |||||||||||||||| AAGCGCGTTTTAATGAGTTTATCAGTGAACTTGCCCGTCGAATGCCACAACACAGGGAGCGAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAG < 2:18780/101‑1 GCGCGTTTTAATGAGTTTATCAGTGAACTTACCCGTCGAATGCCACAACACAGGGAGCGAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGT > 1:878296/1‑101 CGTTTTAATGAGTTTATCAGTGAACTTACCCGTCGAATGCCACAACACAGGGAGCGAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGAT < 1:27346/101‑1 CGTTTTAATGAGTTTATCAGTGAACTTACCCGTCGAATGCCACAACACAGGGAGCGAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGAT > 1:215038/1‑101 CGTTTTAATGAGTTTATCAGTGAACTTACCCGTCGAATGCCACAACACAGGGAGCGAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGAT < 2:501337/101‑1 TTTAATGAGTTTATCAGTGAACTTACCCGTCGAATGCCACAACACAGGGAGCGAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCT > 1:1014609/1‑101 AGTTTATCAGTGAACTTACCCGTCGAATGCCACAACACAGGGAGCGAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACT < 1:1051404/101‑1 GTTTATCAGTGAACTTACCCGTCGAATGCCACAACACAGGGAGCGAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTT < 1:745491/101‑1 GTTTATCAGTGAACTTACCCGTCGAATGCCACAACACAGGGAGCGAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTT > 2:1331040/1‑101 TTATCAGTGAACTTACCCGTCGAATGCCACAACACAGGGAGCGAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTAC > 1:1601148/1‑101 TATCAGTGAACTTACCCGTCGAATGCCACAACACAGGGAGCGAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACT > 1:904043/1‑101 ATCAGTGAACTTACCCGTCGAATGCCACAACACAGGGAGCGAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTG < 1:197114/101‑1 TCAGTGAACTTACCCGTCGAATGCCACAACACAGGGAGCGAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGA > 1:1497646/1‑101 CAGTGAACTTACCCGTCGAATGCCACAACACAGGGAGCGAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGAT < 1:2685/101‑1 AGTGAACTTACCCGTCGAATGCCACAACACAGGGAGCGAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT < 2:1632426/101‑1 TGAACTTACCCGTCGAATGCCACAACACAGGGAGCGAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA > 1:221271/1‑101 AACTTACCCGTCGAATGCCACAACACAGGGAGCGAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT > 1:568316/1‑101 ACTTACCCGTCGAATGCCACAACACAGGGAGCGAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTG < 1:950893/101‑1 CTTACCCGTCGAATGCCACAACACAGGGAGCGAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT > 1:829438/1‑101 TTACCCGTCGAATGCCACAACACAGGGAGCGAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTA < 2:886216/101‑1 CCGTCGAATGCCCCAACACAGGGAGCGAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGAT < 2:1601142/101‑1 CCGTCGAATGCCACAACACAGGGAGCGAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGAT < 1:1331046/101‑1 CGTCGAATGCCACAACACAGGGAGCGAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATG > 1:656113/1‑101 GTCGAATGCCACAACACAGGGAGCGAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGG > 1:1492622/1‑101 TCGAATGCCACAACACAGGGAGCGAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGT < 1:993652/101‑1 CGAATGCCACAACACAGGGAGCGAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTG > 1:1010023/1‑101 AATGCCACAACACAGGGAGCGAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTT < 2:401918/101‑1 AATGCCACAACACAGGGAGCGAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTT < 1:604313/101‑1 AATGCCACAACACAGGGAGCGAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTT < 1:1207276/101‑1 AATGCCACAACACAGGGAGCGAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTT > 1:208638/1‑101 GCCACAACGCAGGGGCCGAATAATGACGATTGCTGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGGGATGCGCCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTT < 2:1298555/101‑1 GCCACAACACAGGGAGCGAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTT < 2:650064/101‑1 CCACAACACAGGGAGCGAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG < 2:922463/101‑1 CACAACACAGGGAGCGAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA > 2:1674494/1‑101 ACAACACAGGGAGCGAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAG < 2:1609655/101‑1 CAACACAGGGAGCTAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGG < 2:878291/101‑1 GGGAGCGAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCA < 2:1010018/101‑1 GAGCGAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGT < 2:1021675/101‑1 GCGAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGG < 1:1674500/101‑1 CGAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGC > 1:248859/1‑101 CGAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGC > 2:1217540/1‑101 GAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCT < 2:560615/101‑1 AATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTT < 1:834922/101‑1 ATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTC > 1:563305/1‑101 AATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTG < 2:583399/101‑1 TGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTT > 1:289330/1‑101 CGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCT < 1:1573611/101‑1 CGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCT > 2:1198352/1‑101 GATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTA < 1:1129622/101‑1 GATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTA > 2:1513044/1‑101 GATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTA < 2:215038/101‑1 GCAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAG < 1:90391/101‑1 CAGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC > 2:1685413/1‑101 AGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCT > 2:1199818/1‑101 AGAGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTACGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCT < 1:1029768/101‑1 AGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGT > 2:1426431/1‑101 AGCGAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGT > 2:841081/1‑101 GAATTCATATTGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCC < 1:1710995/101‑1 GAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCC > 2:235978/1‑101 GAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCC > 1:902046/1‑101 GAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCC > 2:404137/1‑101 GAATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCC < 2:563300/101‑1 AATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCT > 1:853599/1‑101 ATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTC > 1:479720/1‑101 ATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTC > 2:1306910/1‑101 ATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTC > 1:941142/1‑101 ATTCATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTC > 1:1615397/1‑101 CATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTG > 1:1413958/1‑101 CATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTG < 2:568311/101‑1 ATAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGT > 2:82333/1‑101 TAATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTT > 2:930703/1‑101 ATGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCA > 2:405439/1‑101 TGATGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAG > 1:737257/1‑101 TGGATAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTA > 1:1663186/1‑101 |||||||||||||||| AAGCGCGTTTTAATGAGTTTATCAGTGAACTTACCCGTCGAATGCCACAACACAGGGAGCGAATAATGACGATTGCAGAGCGAATTCATAATGATGGATA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 110/100‑1 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTA < 223/698‑620 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |