New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 11 | 30149 = | 198 (2.970) | 57 (1.020) | 33/168 | 0.6 | 40.7% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 93 | 17 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
TGAATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 11/30263‑30149 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑actgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTGAGCGCAACAAAAATTTCGATGCAGATCAC > 93/17‑116 TGAATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAAC > 1:831750/1‑101 GAATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACT < 2:299146/101‑1 AATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTG > 1:1232917/1‑101 CGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACAGTGGTGGGTCGCGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCA < 2:140125/101‑1 GCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCAt > 2:621859/1‑100 CCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCAta < 2:413986/101‑3 CCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCAta > 2:289863/1‑99 CTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCAtat > 2:495618/1‑98 CTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCAtat < 1:1590729/101‑4 CTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCAtat > 1:825699/1‑98 TTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCAtatg > 1:1250823/1‑97 TTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCAtatg > 2:194169/1‑97 TTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCAtatg > 2:1564922/1‑97 TAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCAtatggg > 1:1632880/1‑95 AGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCAtatgggt < 2:1357280/101‑8 GGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCAtatgggtg < 1:60730/101‑9 GGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCAtatgggggt > 2:1481781/1‑92 GCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCAtatgggtgtt < 2:416038/101‑11 accttagcgATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCT > 1:1067827/10‑101 cttagcgATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTT > 2:1083132/8‑101 ttagcgATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTC > 2:180353/7‑101 ttagcgATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTC < 1:409623/95‑1 tagcgATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCCCTTTTTCGTTGCTTTCG < 2:875926/96‑1 tagcgATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCG < 2:651426/96‑1 tagcgATTGGTGGGTCGTGCAGAATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCG < 1:1404330/96‑1 ATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTG < 1:1083137/101‑1 ATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGAACCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTG > 2:577942/1‑101 TGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGA < 1:378946/101‑1 GGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATA < 1:754027/101‑1 GGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATA < 2:465966/101‑1 GGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATA > 1:1052356/1‑101 CGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCC > 2:184116/1‑101 GTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCC > 2:342647/1‑101 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCG > 1:582653/1‑101 TGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCG > 1:911804/1‑101 TTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAAC < 1:530112/101‑1 TTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAAC < 1:558328/101‑1 GAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGC > 1:873336/1‑101 GAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGC > 1:1443402/1‑101 CGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATAT < 2:1161597/101‑1 CCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATACCGTGGCAACGGCGGCATATATT > 2:1631339/1‑101 ATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACT > 1:209181/1‑101 TGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGA > 1:1089401/1‑101 TTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTT < 2:658415/101‑1 TAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTC < 1:342647/101‑1 AAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAG < 1:371946/101‑1 AAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAG > 2:1101974/1‑101 AAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAG < 1:1628815/101‑1 AAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGA > 1:328432/1‑101 AGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTTAGAC > 1:1515348/1‑101 AGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGAC > 1:848273/1‑101 GTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACT > 2:320686/1‑101 TCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTT < 2:273946/101‑1 TCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTT < 2:1107437/101‑1 CAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTG < 2:1526689/101‑1 CAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTG < 1:577947/101‑1 AACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTGA > 1:1287769/1‑101 TACCAACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTGAGCGCAACA > 2:494733/1‑101 CCAACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTGAGCGCAACAAA > 2:347615/1‑101 AACTGAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTGAGCGCAACAAAAA < 2:810883/101‑1 GAGCTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTGAGCGCAACAAAAATTTC > 1:139313/1‑101 CTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTGAGCGCAACAAAAATTTCGAT < 1:1033137/101‑1 CTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTGAGCGCAACAAAAATTTCGAT < 2:209181/101‑1 CTAACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTGAGCGCAACAAAAATTTCGAT < 2:1649297/101‑1 AACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTGAGCGCAACAAAAATTTCGATGC < 1:388938/101‑1 ACGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTGAGCGCAACAAAAATTTCGATGaa < 1:489829/101‑3 CGACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTGAGCGCAACAAAAATTTCGATGCAG > 1:1081822/1‑101 GACCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTGAGCGCAACAAAAATTTCGATGCAGA > 2:315957/1‑101 CCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTGAGCGCAACAAAAATTTCGATGCAGATC > 1:303253/1‑101 CCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTGAGCGCAACAAAAATTTCGATGCAGATC > 1:1547118/1‑101 CCCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTGAGCGCAACAAAAATTTCGATGCAGATC > 1:1399473/1‑101 CCACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTGAGCGCAACAAAAATTTCGATGCAGATCA > 2:216855/1‑101 CACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTGAGCGCAACAAAAATTTCGATGCAGATCAC < 2:911799/101‑1 TGAATAGCAAAAAAGCGCCTTTAGGGCGCTTTTTTACATTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGATTAAAAGTCAACTGCTCTACCAACTGAGCTAACGACCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 11/30263‑30149 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑actgagctaacgacccACTTTTTCGTTGCTTTCGGTTTGTTTGATATCCCGTGGCAACGGCGGCATATATTACTGATTTCAGACTTGAGCGCAACAAAAATTTCGATGCAGATCAC > 93/17‑116 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |