New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 106 | 14 = | 4 (0.060) | 48 (0.840) | 34/172 | 0.5 | 96.5% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 155 | 15 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
CAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 106/127‑14 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tattgctgctgcggTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGACCATCATCCAGCAACGCTTTCATTGGCGAAAATTCA > 155/15‑114 CAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGAT < 2:236699/101‑1 AACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGGTGATGCGGCTGCTGATA > 1:708368/1‑101 CGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCT < 2:348745/101‑1 GGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTG < 2:836429/101‑1 TGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTG > 1:620244/1‑101 GAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGC > 2:900863/1‑101 AAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGGTATTGCTGCTGCG > 2:711118/1‑101 tggctgcGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCCGGTGTT > 2:124673/8‑101 ggctgcGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTG < 2:1477771/95‑1 cGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCT < 2:1448045/100‑1 cGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCT < 1:1662560/100‑1 GGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTG > 1:961568/1‑101 CGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCT > 2:1037671/1‑101 CGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCTGCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCT < 1:329720/101‑1 GCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGTGGCTGCGGCGCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTG < 1:900868/101‑1 GCAACCGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTTCTt > 1:495586/1‑100 CAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGg > 2:303339/1‑100 CAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATAATGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGa > 1:5788/1‑100 AACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATGCTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGat < 2:609899/101‑3 accGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGGTGTTGCGGGTGGTGTtc > 2:590126/4‑99 CTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCCGCTGCGGCGCAACCGGATGTTGCGGCTGCTGatat < 2:1472380/101‑5 cGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAG < 1:1450874/100‑1 GGCTGTTGTGGCTTCTGATACTGCTGCTGCGGCGCTACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCCGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGatattg < 2:184815/101‑7 GGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGG < 1:968089/101‑1 GCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGT < 1:1431479/101‑1 gTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTT < 2:180559/100‑1 CTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGgtattgtg > 1:422127/1‑93 CTGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGGTGTACAGGgt > 1:1466910/1‑99 TGTTGTGGCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTC < 2:1118767/101‑1 GCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGGTCAACAATT > 2:1102486/1‑101 GCTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCCGCGGGGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATT > 2:275273/1‑101 CTGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTG < 2:101476/101‑1 TGCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGG < 1:1680622/101‑1 GCTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGC < 1:124673/101‑1 CTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCG < 2:852416/101‑1 CTGATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGGTCAACAATTtggg > 2:1376658/1‑97 ATACTGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAA > 2:1315619/1‑101 TGCGGCTGCGGCGGAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAA < 2:387506/101‑1 gAACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGA > 1:268870/2‑101 AACTGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGAC > 2:1676893/1‑101 actGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGACC < 1:1244577/98‑1 ctGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTTGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGACCA > 1:1440474/3‑101 GTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGACCATCATCC < 1:1272004/101‑1 GCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGACCATCATCCAGC < 1:590131/101‑1 GGCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGACCATCATCCAGCAA < 2:495581/101‑1 GCTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGACCATCATCCAGCAAC < 1:1315625/101‑1 CTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGACCATCATCCAGCAACG > 1:1457227/1‑101 CTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGACCATCATCCAGCAACG > 1:305396/1‑101 CTGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGACCATCATCCAGCAACG > 1:1711241/1‑101 TGCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGACCATCATCCAGCAACGC > 1:436180/1‑101 GCTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGACCATCATCCAGCAACGCT > 2:504440/1‑101 GCTGATATTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTCTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGACCATCATCCAGCAACGCT < 2:952494/101‑1 CTGATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGACCATCATCCAGCAACGCTT > 2:329136/1‑101 GATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGACCATCATCCAGCAACGCTTTC > 1:506633/1‑101 ATATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGACCATCATCCAGCAACGCTTTCA > 2:1346991/1‑101 TATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGACCATCATCCAGCAACGCTTTCAT > 2:1365098/1‑101 ATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGACCATCATCCAGCAACGCTTTCATT > 1:1444297/1‑101 TTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGACCATCATCCAGCAACGCTTTCATTG > 2:970425/1‑101 TGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGACCATCATCCAGCAACGCTTTCATTGG < 2:563398/101‑1 GTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGGCCATCATCCAGCCACGCTTTCATTGGCGAAAATTCA > 2:779749/1‑101 CAACAGCGGATGAAGCAGGGTATCCTGCGGTTGTGGCGCAACTGGCTGTTGTGGCTGCTGATACTGCTGCTGCGGCGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGATATTGCTGCTGCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 106/127‑14 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tattgctgctgcggTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGACCATCATCCAGCAACGCTTTCATTGGCGAAAATTCA > 155/15‑114 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |