New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 102 | 11456 = | 9 (0.140) | 32 (0.560) +GTGATGCTGCCAACT |
31/170 | 0.8 | 89.3% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 223 | = 698 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
TTCTGGTCGTCTACAACATCTCGTTGATGAACTGGCGATGCCAGATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 102/11554‑11456 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTG < 223/698‑617 ||||||||||||||| TTCTGGTCGTCTACAACATCTCGTTGATGAACTGGCGATGCCAGATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGT < 2:1078616/101‑1 TGGTCGTCTACAACATCTCGTTGATGAACTGGCGATGCCAGATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGAT > 1:1381709/1‑101 TCTACAACATCTCGTTGATGAACTGGCGATGCCAGATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCC < 1:88304/101‑1 TCTACAACATCTCGTTGATGAACTGGCGATGCCAGATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCC < 2:217101/101‑1 CTACAACATCTCGTTGATGAACTTGCGATGCCAGATACTGATTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTGCGGGGCGGCGGTGATGCTGCCA > 2:154678/1‑101 TACAACATCTCGTTGATGAACTGGCGATGCCAGATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAA > 1:95477/1‑101 CAACATCTCGTTGATGAACTGGCGATGCCAGATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACT < 2:959215/101‑1 ACATCTCGTTGATGAACTGGCGATGCCAGATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTA < 2:1193915/101‑1 CATCTCGTTGATGAACTGGCGATGCCAGATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTAC > 2:1497409/1‑101 GTTGATGAACTGGCGATGCCAGATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT > 2:327958/1‑101 TGATGAACTGGCGATGCCAGATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG < 2:924077/101‑1 GATGAACTGGCGATGCCAGATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT < 2:1200120/101‑1 ACTGGCGATGCCAGATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATG < 2:733845/101‑1 TGGCGATGCCAGATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGAT > 2:596121/1‑101 GGCGATGCCAGATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATG < 2:1381703/101‑1 GATGCCAGATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTG > 2:1291205/1‑101 ATGCCAGATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGT < 1:318629/101‑1 GCCAGATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT > 1:770180/1‑101 GCCAGATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT < 2:147225/101‑1 GATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA > 2:629724/1‑101 ACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGT > 1:1682526/1‑101 TGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGCGTTTTTGAGGGGC > 2:570053/1‑101 ATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGG > 1:1407625/1‑101 GCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCACGGTGATGCTGCCATCTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCT < 2:1425557/101‑1 CCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTT > 2:1377056/1‑101 GATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTT > 1:711675/1‑101 GATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTT < 2:1604036/101‑1 TGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTC < 2:722630/101‑1 gCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTA < 1:1102556/100‑1 CGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATC < 2:1251015/101‑1 AGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAG > 2:318237/1‑101 ATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTTTTAGCTGTC > 2:1538348/1‑101 ATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTC > 1:1056744/1‑101 TGGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCC > 1:879869/1‑101 GGAAAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCC < 1:629729/101‑1 AAAAGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCC > 2:894010/1‑101 AGTTCGGGGCCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGT > 1:799180/1‑101 CCGCGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACT < 2:890635/101‑1 CGCGTTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTG < 2:328614/101‑1 ||||||||||||||| TTCTGGTCGTCTACAACATCTCGTTGATGAACTGGCGATGCCAGATACTGCTTTTTATGCCTGGGATGCCCGAGGGCATGGAAAAAGTTCGGGGCCGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 102/11554‑11456 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTG < 223/698‑617 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |