| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 5 | 1 = | 0 (0.000) | 93 (1.100) | 61/194 | 0.1 | 80.2% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 65 | = 23871 | 46 (0.460) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 147 total aligned reads displayed.
TCGAAGCACTCGTAAGAGGCGTGTGGTGAGGTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATCCCCGCCTCACCGCCA‑TTTGCATCCGTAGCTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 65/23771‑23905 | cGAAGCACTCGTAAGAGGCGTGTGGTGAGGTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATc < 1:1622730‑M2/101‑2 (MQ=255) cGAAGCACTCGTAAGAGGCGTGTGGTGAGGTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATc < 1:346708‑M2/101‑2 (MQ=255) gAAGCACTCGTAAGAGGCGTGTGGTGAGGTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATcc > 2:887396‑M2/1‑99 (MQ=255) gAAGCACTCGTAAGAGGCGTGTGGTGAGGTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATcc > 1:1643846‑M2/1‑99 (MQ=255) aaGCACTCGTAAGAGGCGTGTGGTGAGGTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATccc < 1:637591‑M2/101‑4 (MQ=255) aaGCACTCGTAAGAGGCGTGTGGTGAGGTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATccc < 2:1709155‑M2/101‑4 (MQ=255) aGCACTCGTAAGAGGCGTGTGGTGAGGTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATccca > 2:132091‑M2/1‑97 (MQ=255) gCACTCGTAAGAGGCGTGTGGTGAGGTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATCCCCg > 1:1046283/1‑101 (MQ=255) cACTCGTAAGAGGCGTGTGGTGAGGTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATcccata > 2:645386‑M2/1‑95 (MQ=255) aCTCGTAAGAGGCGTGTGGTGAGGTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATcccataa < 1:1017682‑M2/101‑8 (MQ=255) aCTCGTAAGAGGCGTGTGGTGAGGTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATcccataa < 2:1438744‑M2/101‑8 (MQ=255) aCTCGTAAGAGGCGTGTGGTGAGGCGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCCCCTTTGGGAGAATATGGCCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATCCCCGcc > 2:889310/1‑101 (MQ=255) cTCGTAAGAGGCGTGTGGTGAGGTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGTAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATcccataag < 2:1423437‑M2/101‑9 (MQ=255) cTCGTAAGAGGCGTGTGGTGAGGTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATcccataag < 1:749969‑M2/101‑9 (MQ=255) cTCGTAAGAGGCGTGTGGTGAGGTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATCCCCGCCt > 1:402090/1‑101 (MQ=255) cGTAAGAGGCGTGTGGTGAGGTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATcccataagcg < 2:4343‑M2/101‑11 (MQ=255) cGTAAGAGGCGTGTGGTGAGGTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATcccataagcg > 2:1146927‑M2/1‑91 (MQ=255) gTAAGAGGCGTGTGGTGAGGTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATcccataagcgc < 1:275501‑M2/101‑12 (MQ=255) gTAAGAGGCGTGTGGTGAGGTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATCCCCGCCTCAc > 1:984345/1‑101 (MQ=255) tAAGAGGCGTGTGGTGAGGTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATcccataagcgct < 2:393562‑M2/101‑13 (MQ=255) tAAGAGGCGTGTGGTGAGGTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATCCCCGCCTCAcc > 1:418965/1‑101 (MQ=255) aaGAGGCGTGTGGTGAGGTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATgccataagcgcta < 2:650407‑M2/101‑14 (MQ=255) agagGCGTGTGGTGAGGTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGCGTATGCGGTCAAAAACTGCATCCGGGGTTCGAATCCCCGCCTCACCGc > 1:1273809/1‑101 (MQ=255) agGCGTGTGGTGAGGTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATcccataagcgctaact < 1:195477‑M2/101‑17 (MQ=255) ggCGTGTGGTGAGGTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATCCCCGCCTCACCGCCA‑t > 2:1499355/1‑101 (MQ=255) tgtgGTGAGGTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATcccataagcgctaacttaagg > 2:1659162‑M2/1‑80 (MQ=255) tgtgGTGAGGTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATcccataagcgctaacttaagg < 1:1257353‑M2/101‑22 (MQ=255) gtggtgAGGTGGCCGAGGGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATcccataagcgctaacttaaggg < 2:1672543‑M2/101‑23 (MQ=255) gtggtgAGGTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATCCCCGCCTCACCGCCA‑TTTGCa > 2:1593525/1‑101 (MQ=255) gtggtgAGGTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCCAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATCCCCGCCTCACCGCCA‑TTTGCa > 2:815941/1‑101 (MQ=255) gtgAGGTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATCCCCGCCTCACCGCCA‑TTTGCATcc < 1:815893/101‑1 (MQ=255) gAGGTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATcccataagcgctaacttaagggttgaa > 1:1018790‑M2/1‑74 (MQ=255) gAGGTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATcccataagcgctaacttaagggttgaa > 2:386514‑M2/1‑74 (MQ=255) gAGGTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATCCCCGCCTCACCGCCA‑TTTGCATCCGt > 1:1707320/1‑101 (MQ=255) aGGTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATcccataagcgctaacttaagggttgaac < 2:548492‑M2/101‑29 (MQ=255) ggTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATcccataagcgctaacttaagggttgaacc > 2:1192178‑M2/1‑72 (MQ=255) ggTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATCCCCGCCTCACCGCCA‑TTTGCATCCGTAg < 1:1496465/101‑1 (MQ=255) ggTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATCCCCGCCTCACCGCCA‑TTTGCATCCGTAg < 2:1541383/101‑1 (MQ=255) gTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATcccataagcgctaacttaagggttgaacca > 2:940936‑M2/1‑71 (MQ=255) gTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATcccataagcgctaacttaagggttgaacca < 1:979737‑M2/101‑31 (MQ=255) gTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATCCCCGCCTCACCGCCA‑TTTGCATCCGTAGc > 1:1181723/1‑101 (MQ=255) ccGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATCCCCGCCTCACCGCCA‑TTTGCATCCGTAGCTCAg < 2:1013810/101‑1 (MQ=255) cGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctga < 2:1179162‑M2/101‑36 (MQ=255) cGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctga < 2:2088‑M2/101‑36 (MQ=255) cGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATCCCCGCCTCACCGCCA‑TTTGCATCCGTAGCTCAgc > 2:1383355/1‑100 (MQ=255) cGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATCCCCGCCTCACCGCCA‑TTTGCATCCGTAGCTCAgc > 2:352442/1‑100 (MQ=255) gagaGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaa < 1:1295386‑M2/101‑37 (MQ=255) gagaGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaa < 1:660639‑M2/101‑37 (MQ=255) gagaGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaa < 2:183813‑M2/101‑37 (MQ=255) gagaGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATCCCCGCCTCACCGCCA‑TTTGCATCCGTAGCTCAgct > 1:14914/1‑99 (MQ=255) agagGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaag > 1:578734‑M2/1‑64 (MQ=255) gagGCTGAAGGCGGCCCCCTTCTAAGGGAGTATGCCGTCAAAAGCTGCCTCCGGGGTTCGAATCCCCCCCTCCCCGCCATTTTGCATCCGTAGCTCAgctg < 1:1308230/101‑4 (MQ=255) agGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaa > 2:757547‑M2/1‑62 (MQ=255) agGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaa > 1:1205445‑M2/1‑62 (MQ=255) ggCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaat < 1:102611‑M2/101‑41 (MQ=255) ggCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATCCCCGCCTCACCGCCA‑TTTGCATCCGTAGCTCAgctggat > 1:281136/1‑95 (MQ=255) cTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgc < 2:361215‑M2/101‑43 (MQ=255) cTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgc < 1:909771‑M2/101‑43 (MQ=255) cTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATCCCCGCCTCACCGCCA‑TTTGCATCCGTAGCTCAgctggatag > 2:516340/1‑93 (MQ=255) cTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATCCCCGCCTCACCGCCA‑TTTGCATCCGTAGCTCAgctggatag > 2:468320/1‑93 (MQ=255) tGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcg < 2:426537‑M2/101‑44 (MQ=255) tGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATCCCCGCCTCACCGCCA‑TTTGCATCCGTAGCTCAgctggataga > 1:221762/1‑92 (MQ=255) 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gAATcacataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgta > 2:834648‑M2/1‑4 (MQ=255) aaTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtag > 1:711054‑M2/1‑3 (MQ=255) aaTcccataagcgctaacttaagggttgaaccatctgaagaatgcgacgcctcggtgcctcgttaagacgatgcctcgcgttcttcaattgcgttttgtag > 1:1340466‑M2/1‑3 (MQ=255) | TCGAAGCACTCGTAAGAGGCGTGTGGTGAGGTGGCCGAGAGGCTGAAGGCGCTCCCCTGCTAAGGGAGTATGCGGTCAAAAGCTGCATCCGGGGTTCGAATCCCCGCCTCACCGCCA‑TTTGCATCCGTAGCTCAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 65/23771‑23905 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |