New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 31 | 1 = | 0 (0.000) | 64 (1.960) +CTTATTGATAGTGTTTTA |
47/164 | 0.2 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 83 | = 998 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
CTTCAACATTCTCCATTCACGCCTCGAAGAGATGAATGGCGTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACGTGCGGAAGACATTGTGCTGGCGACGCTTATCCTGCTGCTGATCTCCCCGGTGCTGTGCTGCATTGCGCTGGCGGTGAAACTGAGCTCACCGGGGCCGGT > 83/901‑1098 | cTTCAACATTCTCCATTCACGCCTCGAAGAGATGAATGGCGTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaa < 2:852606‑M2/101‑4 (MQ=255) cTTCAACATTCTCCATTCACGCCTCGAAGAGATGAATGGCGTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaa < 1:562229‑M2/101‑4 (MQ=255) ttCAACATTCTCCATTCACGCCTCGAAGAGATGAATGGCGTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaa < 1:991600‑M2/101‑5 (MQ=255) tCAACATTCTCCATTCACGCCTCGAAGAGATGAATGGCGTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaa < 2:959194‑M2/101‑6 (MQ=255) cAACGTTCTCCATTCACGCCTCGAAGAGATGAATGGCGTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaac > 1:446305‑M2/1‑95 (MQ=255) cAACATTCTCCATTCACGCCTCGAAGAGATGAACGGCGTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaac < 2:431373‑M2/101‑7 (MQ=255) aaCATTCTCCATTCACGCCTCGAAGAGATGAATGGCGTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaaca < 2:1029910‑M2/101‑8 (MQ=255) aCATTCTCCATTCACGCCTCGAAGAGATGAATGGCGTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacac < 2:1470613‑M2/101‑9 (MQ=255) cATTCTCCATTCACGCCTCGAAGAGATGAATGGCGTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacact > 2:547299‑M2/1‑92 (MQ=255) cATTCTCCATTCACGCCTCGAAGAGATGAATGGCGTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacact < 2:777603‑M2/101‑10 (MQ=255) cATTCTCCATTCACGCCTCGAAGAGATGAATGGCGCACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacact < 1:541729‑M2/101‑10 (MQ=255) aTTCTCCATTCACGCCTCGAAGAGATGAATGGCGTGCCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacacta > 2:1075489‑M2/1‑91 (MQ=255) aTTCTCCATTCACGCCTCGAAGAGATGAATGGCGTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacacta < 2:161146‑M2/101‑11 (MQ=255) aTTCTCCATTCACGCCTCGAAGAGATGAATGGCGTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacacta > 1:228145‑M2/1‑91 (MQ=255) ctcCATTCACGCCTCGAAGAGATGAATGGCGTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatca < 1:703793‑M2/101‑14 (MQ=255) ctcCATTCACGCCTCGAAGAGATGAATGGCGTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatca > 1:587390‑M2/1‑88 (MQ=255) tcCATTCACGCCTCGAAGAGATGAATGGCGTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCTCCTGCTCAAACtaaaacactatcaa > 2:504100‑M2/1‑87 (MQ=255) ccATTCACGCCTCGAAGAGATGAATGGCGTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaat < 1:474582‑M2/101‑16 (MQ=255) aTTCACGCCTCGAAGAGATGAATGGCGTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataa < 1:1315408‑M2/101‑18 (MQ=255) aTTCACGCCTCGAAGAGATGAATGGCGTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataa < 1:1245987‑M2/101‑18 (MQ=255) aTTCACGCCTCGAAGAGATGAATGGCGTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataa < 2:147679‑M2/101‑18 (MQ=255) aTTCACGCCTCGAAGAGATGAATGGCGTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataa > 2:1356955‑M2/1‑84 (MQ=255) aTTCACGCCTCGAAGAGATGAATGGCGTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataa < 2:1487432‑M2/101‑18 (MQ=255) cACGCCTCGAAGAGATGAATGGCGTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagtt > 2:1136046‑M2/1‑81 (MQ=255) aCGCCTCGAAGAGATGAATGGCGTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttg < 1:1254340‑M2/101‑22 (MQ=255) gCCTCGAAGAGATGAATGGCGTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttgga > 2:512166‑M2/1‑78 (MQ=255) cTCGAAGAGATGAATGGCGTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGTTCAAACtaaaacactatcaataagttggagt > 2:1658569‑M2/1‑76 (MQ=255) cTCGAAGAGATGAATGGCGTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagt > 1:1717006‑M2/1‑76 (MQ=255) cTCGAAGAGATGAATGGCGTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGGTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagc < 1:1598823‑M2/101‑26 (MQ=255) cGAAGAGATGAATGGCGTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtca > 1:508194‑M2/1‑74 (MQ=255) gAAGAGATGAATGGCGTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcat < 1:1408803‑M2/101‑29 (MQ=255) gAAGAGATGAATGGCGTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGCTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcat < 1:98615‑M2/101‑29 (MQ=255) aaGAGATGAATGGCGTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcatt > 1:84170‑M2/1‑72 (MQ=255) agagATGAATGGCGTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcatta > 2:1042114‑M2/1‑71 (MQ=255) gaTGAATGGCGTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccg > 2:1049011‑M2/1‑68 (MQ=255) gAATGGCGTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggat > 1:1350848‑M2/1‑65 (MQ=255) cGTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgt < 1:1549899‑M2/101‑43 (MQ=255) gTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgtt < 1:1362025‑M2/101‑44 (MQ=255) gTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgtt < 2:1134566‑M2/101‑44 (MQ=255) gTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgtt < 2:953304‑M2/101‑44 (MQ=255) gTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgtt > 2:87647‑M2/1‑58 (MQ=255) gTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgtt < 2:902089‑M2/101‑44 (MQ=255) aCCGGTGGTGCCGCTGTATGGCACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttag > 1:943218‑M2/1‑56 (MQ=255) aCCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttag > 2:1388440‑M2/1‑56 (MQ=255) ggtggtGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttagact > 2:784032‑M2/1‑53 (MQ=255) tggtgCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttagacttc < 1:1191289‑M2/101‑51 (MQ=255) gtgCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttagacttctt > 1:756440‑M2/1‑49 (MQ=255) gtgCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttagacttctt > 2:1111518‑M2/1‑49 (MQ=255) gCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttagacttcttcc > 2:331996‑M2/1‑47 (MQ=255) gCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttagacttcttcc > 2:1573444‑M2/1‑47 (MQ=255) cGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttagacttcttccca > 1:327500‑M2/1‑45 (MQ=255) cTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttagacttcttcccact > 2:1705256‑M2/1‑43 (MQ=255) cTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttagacttcttcccact < 2:425437‑M2/101‑59 (MQ=255) tGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttagacttcttcccacta < 1:19177‑M2/101‑60 (MQ=255) gTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttagacttcttcccactag < 2:1000293‑M2/101‑61 (MQ=255) aTGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttagacttcttcccactagtt > 1:379150‑M2/1‑39 (MQ=255) aTGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttagacttcttcccactagtt > 2:1245982‑M2/1‑39 (MQ=255) gACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttagacttcttcccactagtttt > 2:871948‑M2/1‑37 (MQ=255) acacGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttagacttcttcccactagttttc > 1:1189818‑M2/1‑36 (MQ=255) cacGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttagacttcttcccactagttttcg < 1:997890‑M2/101‑67 (MQ=255) gccgcTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttagacttcttcccactagttttcgtgg < 2:814966‑M2/101‑70 (MQ=255) gccgcTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttagacttcttcccactagttttcgtgg > 2:285918‑M2/1‑32 (MQ=255) gccgcTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttagacttcttcccactagttttcgtgg > 1:902094‑M2/1‑32 (MQ=255) ccgcTTTCCGGGGTTCATCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagcgggagtcattaccggatatttgttagacttcttcccactagttttcgtggc < 2:1078383‑M2/101‑71 (MQ=255) ccgcTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttagacttcttcccactagttttcgtggc < 2:1180472‑M2/101‑71 (MQ=255) gcTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttagacttcttcccactagttttcgtggcta < 1:1326990‑M2/101‑73 (MQ=255) cTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttagacttcttcccactagttttcgtggctat < 2:1182486‑M2/101‑74 (MQ=255) ttGCGGAGTTACCTGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttagacttcttcccactagttttcgtggctatat > 2:1334585‑M2/1‑26 (MQ=255) ttCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttagacttcttcccactagttttcgtggctatat > 2:991595‑M2/1‑26 (MQ=255) gggTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttagacttcttcccactagttttcgtggctatatatata > 1:852611‑M2/1‑21 (MQ=255) ggTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttagacttcttcccactagttttcgtggctatatatataa > 1:959199‑M2/1‑20 (MQ=255) gTTAACCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttagacttcttcccactagttttcgtggctatatatataaa < 1:325727‑M2/101‑83 (MQ=255) aCCGCCTGCTCAAACtaaagcactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttagacttcttcccactagttttcgtggctatatatataaaaaag > 1:147679‑M2/1‑15 (MQ=255) aCCGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttagacttcttcccactagttttcgtggctatatatataaaaaag > 1:910410‑M2/1‑15 (MQ=255) cGCCTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttagacttcttcccactagttttcgtggctatatatataaaaaagtt > 2:570464‑M2/1‑13 (MQ=255) ccTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttagacttcttcccactagttttcgtggctatatatataaaaaagttat < 1:1510856‑M2/101‑91 (MQ=255) ccTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttagacttcttcccactagttttcgtggctatatatataaaaaagttat < 1:1445604‑M2/101‑91 (MQ=255) ccTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttagacttcttcccactagttttcgtggctatatatataaaaaagttat < 2:793598‑M2/101‑91 (MQ=255) ccTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttagacttcttcccactagttttcgtggctatatatataaaaaagttat < 2:1173601‑M2/101‑91 (MQ=255) cTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttagacttcttcccactagttttcgtggctatatatataaaaaagttatc > 2:799059‑M2/1‑10 (MQ=255) cTGCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttagacttcttcccactagttttcgtggctatatatataaaaaagttatc > 2:105695‑M2/1‑10 (MQ=255) gCTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttagacttcttcccactagttttcgtggctatatatataaaaaagttatcag < 1:715217‑M2/101‑94 (MQ=255) cTCAAACtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttagacttcttcccactagttttcgtggctatatatataaaaaagttatcagg < 1:224285‑M2/101‑95 (MQ=255) aaCtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttagacttcttcccactagttttcgtggctatatatataaaaaagttatcaggagat > 1:1029915‑M2/1‑3 (MQ=255) aCtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttagacttcttcccactagttttcgtggctatatatataaaaaagttatcaggagatt < 1:914870‑M2/101‑100 (MQ=255) aCtaaaacactatcaataagttggagtcattaccggatatttgttagacttcttcccactagttttcgtggctatatatataaaaaagttatcaggagatt > 1:953309‑M2/1‑2 (MQ=255) ctaaaacactatcaataagtcggagtcattaccggatatttgttagacttcttcccactacttttcgtggctatatatataaaaaagttatcaggagattt < 2:409819‑M2/101‑101 (MQ=255) | CTTCAACATTCTCCATTCACGCCTCGAAGAGATGAATGGCGTACCGGTGGTGCCGCTGTATGACACGCCGCTTTCCGGGGTTAACCGCCTGCTCAAACGTGCGGAAGACATTGTGCTGGCGACGCTTATCCTGCTGCTGATCTCCCCGGTGCTGTGCTGCATTGCGCTGGCGGTGAAACTGAGCTCACCGGGGCCGGT > 83/901‑1098 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |