| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 3 | 52189 = | 5 (0.080) | 53 (0.820) | 41/194 | 0.6 | 57.3% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 5 | = 1340 | 74 (1.090) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 320 total aligned reads displayed.
AATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTCCGTTATGCATGGGGCGGTCAAATATTTCGGCTACCCTGATGAACACAGTGCAGAGCCTGATCAGGTGATCCTTATCGAAG > 5/1242‑1440 | aaTATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgg > 1:256906‑M2/1‑99 (MQ=255) atatGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATggg > 1:697359‑M2/1‑98 (MQ=255) tatGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATCCCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggg < 2:804868/101‑1 (MQ=255) atGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggat < 1:1436444‑M2/101‑6 (MQ=255) atGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGt > 1:1028999/1‑101 (MQ=255) tGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACACCCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGtt < 2:934201/101‑1 (MQ=255) tGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggata > 1:1382076‑M2/1‑95 (MQ=255) gggCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGttt < 1:1269347/101‑1 (MQ=255) gCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggattact < 1:454798‑M2/101‑10 (MQ=255) gCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTtt > 1:508350‑M1/1‑99 (MQ=255) ccAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggattactc < 2:296807‑M2/101‑11 (MQ=255) cAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttcc > 2:1431572‑M1/1‑97 (MQ=255) aGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccc > 1:1355926‑M1/1‑96 (MQ=255) gAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCAc < 1:34888/101‑1 (MQ=255) aaTTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggattactccccg < 2:862541‑M2/101‑15 (MQ=255) aaTTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggataattccccg > 1:360671‑M2/1‑87 (MQ=255) aTTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccac > 2:772780‑M1/1‑93 (MQ=255) tGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccg > 2:57212‑M1/1‑91 (MQ=255) gCTGAACAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggataattccccggttt > 2:112668‑M2/1‑83 (MQ=255) cTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggattactccccgcacaa < 1:1665130‑M2/101‑20 (MQ=255) cTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggattactccccgcacaa < 1:887447‑M2/101‑20 (MQ=255) tGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttc > 2:499879‑M1/1‑88 (MQ=255) gACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggattactccccgcacaacg < 2:209210‑M2/101‑22 (MQ=255) gACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTcc > 1:715192/1‑101 (MQ=255) gACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTcc < 2:1567917/101‑1 (MQ=255) aCCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggataattccccggttttttt > 2:646267‑M2/1‑79 (MQ=255) cAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttcaggg < 1:756838‑M1/101‑18 (MQ=255) gTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTCCGTTAt < 1:48322/101‑1 (MQ=255) ttATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggataattccccggtttttttacgcc < 1:515993‑M2/101‑28 (MQ=255) ttATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTCCGTTATg < 2:1701454/101‑1 (MQ=255) aTCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttcagggtgttc < 1:309636‑M1/101‑23 (MQ=255) aTCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTCCGTTATGCa < 2:617414/101‑1 (MQ=255) aTCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTCCGTTATGCa < 1:1472900/101‑1 (MQ=255) tCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTCCGTTATGCAt < 1:176063/101‑1 (MQ=255) cGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggagatctccccactgccgggcttcagtca > 1:66088‑M2/1‑70 (MQ=255) cGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggagatctccccactgccgggcttcagtca < 1:1132931‑M2/101‑32 (MQ=255) gTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggataattccccggtttttttacgcctgtta > 2:1296969‑M2/1‑69 (MQ=255) gTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttcagggtgttcccc < 1:780485‑M1/101‑26 (MQ=255) gTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttcagggtgttcccc > 2:1519745‑M1/1‑76 (MQ=255) tGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTCCGTTATGCATggg > 2:1272552/1‑101 (MQ=255) gagaGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggataattccccggtttttttacgcctgttaat < 2:1403842‑M2/101‑35 (MQ=255) gagaGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttcagggtgttccccgc > 1:1570202‑M1/1‑74 (MQ=255) agagTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggataattccccggtttttttacgcctgttaatc > 2:1462204‑M2/1‑66 (MQ=255) agTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTCCGTTATGCATGGGGCgg > 2:1620568/1‑101 (MQ=255) gTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggagatctccccactgccgggcttcagtcaggaaacc > 1:384841‑M2/1‑63 (MQ=255) tAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggataattccccggtttttttacgcctgttaatcagct > 2:552747‑M2/1‑62 (MQ=255) aaTTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggataattccccggtttttttacgcctgttaatcagcta < 1:150957‑M2/101‑41 (MQ=255) aTTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggataattccccggtttttttacgcctgttaatcagctaa < 1:1094560‑M2/101‑42 (MQ=255) aTTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTCCGTTATGCATGGGGCGGTCaa < 1:411285/101‑1 (MQ=255) ttCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttcagggtgttccccgcgccagcgg > 1:170002‑M1/1‑66 (MQ=255) ttCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttcagggtgttccccgcgccagcgg < 1:117843‑M1/101‑36 (MQ=255) ttCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttcagggtgttccccgcgccagcgg > 1:1291212‑M1/1‑66 (MQ=255) tCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttcagggtgttccccgcgccagcggg > 1:243667‑M1/1‑65 (MQ=255) cGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggataattccccggtttttttacgcctgttaatcagctaatggctg > 1:1591004‑M2/1‑54 (MQ=255) cGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggagatctccccactgccgggcttcagtcaggaaacctgggaagag > 1:1606130‑M2/1‑54 (MQ=255) cGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttcagggtgttccccgcgccagcggggata < 1:1530623‑M1/101‑41 (MQ=255) ggCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttcagggtgttccccgcgccagcggggataa < 2:404259‑M1/101‑42 (MQ=255) cagatcttttaTCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTCCGTTATGCATGGGGCGGTCAAATATTTc > 2:450645/11‑101 (MQ=255) gCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggataattccccggtttttttacgcctgtaaatcagctaatggctgcg > 1:1637768‑M2/1‑52 (MQ=255) cACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggagatctccccactgccgggcttcagtcaggaaacctgggaagaggcg < 2:595097‑M2/101‑51 (MQ=255) cACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTCCGTTATGCATGGGGCGGTCAAATATTTCgg < 1:571316/101‑1 (MQ=255) aCGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTCCGTTATGCATGGGGCGGTCAAATATTTCGGc < 2:715187/101‑1 (MQ=255) gTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttcagggtgttccccgcgccagcggggataaaccgg > 1:946102‑M1/1‑55 (MQ=255) aaaTCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggagatctccccactgccgggcttcagtcaggaaacctgggaagaggcgcaaagt > 2:1358584‑M2/1‑45 (MQ=255) aTCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttcagggtgttccccgcgccagcggggataaaccggtcatc > 1:1201888‑M1/1‑50 (MQ=255) tcattacaggcgtAATACCACACCTGTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttctccaccgttcagggtgttccccgcgccagcggggataaaccggtcatca < 2:256411‑M1/95‑53 (MQ=255) cATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTCCGTTATGCATGGGGCGGTCAAATATTTCGGCTACCCtgat < 2:1653388/101‑1 (MQ=255) atCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttcagggtgttccccgcgccagcggggataaaccggtcatcacgat > 2:1085178‑M1/1‑45 (MQ=255) tCAGGCGTGATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTatcccctccgttcagggtgtgccccgctccagcggggataaaccggtcatcgcgatg < 2:820510‑M1/101‑58 (MQ=255) cAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttcagggtgttccccgcgccagcggggataaaccggtcatcacgatga > 1:678572‑M1/1‑43 (MQ=255) aGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggataattccccggtttttttacgcctgttaatcagctaatggctgcgggcgaccaatcaaatac > 2:351579‑M2/1‑35 (MQ=255) aGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggagatctccccactgccgggcttcagtcaggaaacctgggaagaggcgcaaagtgtgctgcttg < 2:1030344‑M2/101‑67 (MQ=255) aGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggagatctccccactgccgggcttcagtcaggaaacctgggaagaggcgcaaagtgtgctgcttg < 2:543509‑M2/101‑67 (MQ=255) ggCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTCCGTTATGCATGGGGCGGTCAAATATTTCGGCTACCCTGATGAAcaca > 1:60365/1‑101 (MQ=255) cGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttcagggtgttccccgcgccagcggggataaaccggtcatcacgatgaatca < 1:914245‑M1/101‑63 (MQ=255) gTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttcagggtgttccccgcgccagcggggataaaccggtcatcacgatgaatcaa > 2:952095‑M1/1‑38 (MQ=255) gTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTCCGTTATGCATGGGGCGGTCAAATATTTCGGCTACCCTGATGAACACAGTg > 2:119175/1‑101 (MQ=255) tAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTCCGTTATGCATGGGGCGGTCAAATATTTCGGCTACCCTGATGAACACAGTGc > 1:105026/1‑101 (MQ=255) aaTACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttcagggtgttccccgcgccagcggggataaaccggtcatcacgatgaatcaaaa < 2:689635‑M1/101‑66 (MQ=255) aaTACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttcagggtgttccccgcgccagcggggataaaccggtcatcacgatgaatcaaaa > 2:275773‑M1/1‑36 (MQ=255) aaTACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttcagggtgttccccgcgccagcggggataaaccggtcatcacgatgaatcaaaa > 2:1475945‑M1/1‑36 (MQ=255) aTACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTCCGTTATGCATGGGGCGGTCAAATATTTCGGCTACCCTGATGAACACAGTGCag < 2:157553/101‑1 (MQ=255) tACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggagatctccccactgccgggcttcagtcaggaaacctgggaagaggcgcaaagtgtgctgcttgcctgggta < 1:1536789‑M2/101‑75 (MQ=255) tACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTCCGTTATGCATGGGGCGGTCAAATATTTCGGCTACCCTGATGAACACAGTGCaga > 2:1601187/1‑101 (MQ=255) aCCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTCCGTTATGCATGGGGCGGTCAAATATTTCGGCTACCCTGATGAACACAGTGCagag > 2:122924/1‑101 (MQ=255) cacaACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttcagggtgttccccgcgccagcggggataaaccggtcatcacgatgaatcaaaatttcg < 2:508345‑M1/101‑71 (MQ=255) acaACCCTTAAGTTAGCGCTTATgggataattccccggtttttttacgcctgttaatcagctaatggctgcgggcgaccaatcaaatacccttgcagatat < 2:1095171‑M2/101‑79 (MQ=255) acaACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttcagggtgttccccgcgccagcggggataaaccggtcatcacgatgaatcaaaatttcgc > 2:608084‑M1/1‑30 (MQ=255) aCCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttcagggtgttccccgcgccagcggggataaaccggtcatcacgatgaatcaaaatttcgccca < 2:384254‑M1/101‑75 (MQ=255) cTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttcagggtgttccccgcgccagcggggataaaccggtcatcacgatgaatcaaaatttcgcccagct > 2:1237611‑M1/1‑24 (MQ=255) cTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTCCGTTATGCATGGGGCGGTCAAATATTTCGGCTACCCTGATGAACACAGTGCAGAGCCTGATCAg > 2:205545/1‑101 (MQ=255) gTTAGCGCTTATgggataattccccggtttttttacgcctgttaatcagctaatggctgcgggcgaccaatcaaatacccttgcagatattgcaccccgag > 2:482934‑M2/1‑12 (MQ=255) ttAGCGCTTATgggagatctccccactgccgggcttcagtcaggaaacctgggaagaggcgcaaagtgtgctgcttgcctgggtaaataactggctggcag > 2:431647‑M2/1‑11 (MQ=255) ttAGAGCTTATgggagatctccccactgccgggcttcagtcaggaaacctgggaagaggcgcaaagtgtgctgcttgcctgggtaaataactggctggcag > 1:1105613‑M2/1‑11 (MQ=255) gcgcTTATGGGGTTGttccccgccgttcagggtgttccccgcgccagcggggataaaccggtcatcacgatgaatcaaaatttcgcccagctgtgttcccc < 1:1006695‑M1/101‑87 (MQ=255) tctTAGgggataattccccggtttttttacgcctgttaatcagctaatggctgcgggcgcccaatcaaatacccttgcagatattgcaccccgagcttatg > 2:1057420‑M2/2‑6 (MQ=255) cTTATGGGGTTTttccccaccgttcagggtgttccccgcgccagcggggataaaccggtcatcacgatgaatcaaaatttcgcccagctgtgttccccgcg > 1:216539‑M1/1‑12 (MQ=255) aTgggataattccccggtttttttacgcctgttaatcagctaatggctgcgggcgaccaatcaaatacccttgcagatattgcaccccgagcttatgcaat > 1:33020‑M2/1‑2 (MQ=255) aTgggagatctccccactgccgggcttcagtcaggaaacctgggaagaggcgcaaagtgtgctgcttgcctgggtaaataactggctggcaggcgattgcg < 1:231821‑M2/101‑100 (MQ=255) tGGGGTTTACCCACGCCTTTCCGTTATGCATGGGGCGGTCAAATATTTCGGCTACCCTGATGAACACAGTGCAGAGCCTGATCAGGTGATTCTTATCGAAg < 1:1227774/101‑1 (MQ=255) | AATATGGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTCCGTTATGCATGGGGCGGTCAAATATTTCGGCTACCCTGATGAACACAGTGCAGAGCCTGATCAGGTGATCCTTATCGAAG > 5/1242‑1440 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |