New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 223 | = 698 | 0 (0.000) | 51 (0.060) +AGT |
42/194 | 0.6 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 85 | = 19737 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
TACTCATGTCCATTAGCACCACGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 85/19637‑19737 | tACTCATGTCCATTAGCACCACGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCa > 1:1343764/1‑101 (MQ=255) cTCATGTCCATTAGCACCACGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTACCGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAac > 2:505730‑M2/1‑99 (MQ=255) cTCATGTCCATTAGCACCACGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAac > 1:1052917‑M2/1‑99 (MQ=255) cATGTCCATTAGCACCACGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAactt > 2:237266‑M2/1‑97 (MQ=255) aTGTCCATTAGCACCACGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAactta < 2:502101‑M2/101‑6 (MQ=255) gTCCATTAGCACCACGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttact > 1:1266360‑M2/1‑94 (MQ=255) tCCATTATCGCCACGTCAACGGCATTTGCCCGACACCTCTGAACGGCGTCTTCACCGCACGATTCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttgctg > 2:1536206‑M2/1‑93 (MQ=255) ccATTAGCACCACGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactga < 1:338483‑M2/101‑10 (MQ=255) cATTAGCACCACGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgat < 2:1038034‑M2/101‑11 (MQ=255) cATTAGCACCACGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgat > 1:60752‑M2/1‑91 (MQ=255) ttAGCACCACGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCATCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgattt > 2:425475‑M2/1‑89 (MQ=255) tAGCACCACGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgattta > 1:884963‑M2/1‑88 (MQ=255) aGCACCACGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgatttag > 1:457110‑M2/1‑87 (MQ=255) gCACCACGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgatttagt > 2:341926‑M2/1‑86 (MQ=255) gCACCACGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgatttagt > 2:1404381‑M2/1‑86 (MQ=255) caccacGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgatttagtg < 1:1003163‑M2/101‑17 (MQ=255) accacGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgatttagtgt < 1:312659‑M2/101‑18 (MQ=255) cacGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgatttagtgtat < 2:229170‑M2/101‑20 (MQ=255) acGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgatttagtgtatg < 1:1025547‑M2/101‑21 (MQ=255) gTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgatttagtgtatgat < 2:1368106‑M2/101‑23 (MQ=255) gTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgatttagtgtatgat > 1:617754‑M2/1‑79 (MQ=255) cAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgatttagtgtatgatgg > 2:633815‑M2/1‑77 (MQ=255) aCGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgatttagtgtatgatggtg > 2:1592786‑M2/1‑75 (MQ=255) aTTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgatttagtgtatgatggtgttttt < 1:712136‑M2/101‑32 (MQ=255) aTTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgatttagtgtatgatggtgttttt > 1:252580‑M2/1‑70 (MQ=255) aTTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgatttagtgtatgatggggttttt < 1:357776‑M2/101‑32 (MQ=255) aTTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCAAGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgatttagtgtatgatggtgttttt < 1:1697601‑M2/101‑32 (MQ=255) tttGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCGCCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgatttagtgtatgatggtgtttttg > 2:1626125‑M2/1‑69 (MQ=255) ccGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtg > 1:1690759‑M2/1‑64 (MQ=255) gACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgct > 1:419967‑M2/1‑62 (MQ=255) acacCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctc < 2:265021‑M2/101‑41 (MQ=255) accacTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctcca > 2:712131‑M2/1‑59 (MQ=255) accacTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctcca < 1:471541‑M2/101‑43 (MQ=255) cTTAACGGCGTCTTCCCCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtgg > 1:360737‑M2/1‑55 (MQ=255) tAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggct > 1:846561‑M2/1‑53 (MQ=255) aaCGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggctt < 1:1202203‑M2/101‑50 (MQ=255) cGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtt < 2:898253‑M2/101‑55 (MQ=255) gTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgttt > 1:959890‑M2/1‑46 (MQ=255) gTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgttt < 1:281695‑M2/101‑56 (MQ=255) aCCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatca > 1:426757‑M2/1‑40 (MQ=255) aCCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatca > 1:883872‑M2/1‑40 (MQ=255) aCGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgt > 2:309918‑M2/1‑35 (MQ=255) tGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggttctccagtggcttctgtttctatcagctgtccct < 2:1509167‑M2/101‑71 (MQ=255) tGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccct < 1:524847‑M2/101‑71 (MQ=255) tGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccct < 1:140381‑M2/101‑71 (MQ=255) gCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctc > 2:785599‑M2/1‑30 (MQ=255) cTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcct < 2:177365‑M2/101‑74 (MQ=255) cTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcct < 2:785454‑M2/101‑74 (MQ=255) cTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcct < 1:520454‑M2/101‑74 (MQ=255) cTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCAacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagatgtccctccc < 2:14820‑M2/101‑74 (MQ=255) acgacTTTGGTGATGCTGCCAacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagc < 2:1184394‑M2/101‑81 (MQ=255) acTTTGGTGATGCTGCCAacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctac < 2:49262‑M2/101‑84 (MQ=255) cTTTGGTGATGCTGCCAacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctact > 2:312659‑M2/1‑17 (MQ=255) tttGGTGATGCTGCCAacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactg > 2:245339‑M2/1‑16 (MQ=255) | TACTCATGTCCATTAGCACCACGTCAACGGCATTTGCCCGACACCACTTAACGGCGTCTTCACCGCACGATGCCTCACCGACGACTTTGGTGATGCTGCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 85/19637‑19737 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |