New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 223 | = 698 | 0 (0.000) | 42 (0.040) | 35/200 | 1.5 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 50 | = 29744 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
AAACTCTCCAGTATTTAATTATTCAACTTAACACTAAAAAAAATCACATATTTAATATCATAATTTTTCTTTGGTCTACGTATGCGGTGATGCTGCCAACT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 50/29644‑29744 | aaaCTCTCCAGTATTTAATTATTCAACTTAACACTAAAAAAAATCACATATTTAATATCATAATTTTTCTTTGGTCTACGTATGCGGTGATGCTGCCAACt < 1:1058204/101‑1 (MQ=255) aaaCTCTCCAGTATTTAATTATTCAACTTAACACTAAAAAAAATCACATATTTAATATCATAATTTTTCTTTGGTCTACGTATGCGGTGATGCTGCCAACt < 1:85174/101‑1 (MQ=255) aaaCTCTCCAGTATTTAATTATTCAACTTAACACTAAAAAAAATCACATATTTAATATCATAATTTTTCTTTGGTCTACGTATGCGGTGATGCTGCCAACt > 2:547138/1‑101 (MQ=255) aaCTCTCCAGTATTTAATTATTCAACTTAACACTAAAAAAAATCACATATTTAATATCATAATTTTTCTTTGGTCTACGTATGCGGTGATGCTGCCAACTt < 1:62872‑M2/101‑2 (MQ=255) aCTCTCAAGTATTTAATTATTCAACTTAACACTAAAAAAAATCACATATTTAATATCATAATTTTTCTTTGGTCTACGTATGCGGTTATGCTTCCAACTta > 2:287955‑M2/1‑99 (MQ=255) tctcCAGTATTTAATTATTCAACTTAACACTAAAAAAAATCACATATTTAATATCATAATTTTTCTTTGGTCTACGTATGCGGTGATGCTGCCAACTtact > 2:1501934‑M2/1‑97 (MQ=255) ctcCAGTATTTAATTATTCAACTTAACACTAAAAAAAATCACATATTTAATATCATAATTTTTCTTTGGTCTACGTATGCGGTGATTCTGCCAACTtactg > 2:1622238‑M2/1‑96 (MQ=255) aGTATTTAATTATTCAACTTAACACTAAAAAAAATCACATATTTAATATCATAATTTTTCTTTGGTCTACGTATGCGGTGATGCTGCCAACTtactgattt > 1:936669‑M2/1‑92 (MQ=255) aGTATTTAATTATTCAACTTAACACTAAAAAAAATCACATATTTAATATCATAATTTTTCTTTGGTCTACGTATGCGGTGATGCTGCCAACTtactgattt < 2:1089779‑M2/101‑10 (MQ=255) gTATTTAATTATTCAACTTAACACTAAAAAAAATCACATATTTAATATCATAATTTTTCTTTGGTCTACGTATGCGGTGATGCTGCCAACTtactgattta < 2:418085‑M2/101‑11 (MQ=255) gTATTTAATTATTCAACTTAACACTAAAAAAAATCACATATTTAATATCATAATTTTTCTTTGGTCTACGTATGCGGTGATGCTGCCAACTtactgattta < 2:1116231‑M2/101‑11 (MQ=255) aTTTAATTATTCAACTTAACACTAAAAAAAATCACATATTTAATATCATAATTTTTCTTTGGTCTACGTATGCGGTGATGCTGCCAACTtactgatttagt > 2:481110‑M2/1‑89 (MQ=255) tAATTATTAAACTTAACACTAAAAAAAATCACATATTTAATAACAGAATTTTTCTTTGGTCTACGTATGCGGTGATGCTGCCATTTtactgatttagtgta > 2:1204787‑M2/1‑86 (MQ=255) aaTTATTCAACTTAACACTAAAAAAAATCACATATTTAATATCATAATTTTTCTTTGGTCTACGTATGCGGTGATGCTGCCAACTtactgatttagtgtat > 1:1681181‑M2/1‑85 (MQ=255) ttattCAACTTAACACTAAAAAAAATCACATATTTAATATCATAATTTTTCTTTGGTCTACGTATGCGGTGATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatga < 1:1422442‑M2/101‑19 (MQ=255) ttattCAACTTAACACTAAAAAAAATCACATATTTAATATCATAATTTTTCTTTGGTCTACGTATGCGGTGATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatga > 2:171206‑M2/1‑83 (MQ=255) ttattCAACTTAACACTAAAAAAAATCACATATTTAATATCATAATTTTTCTTTGGTCTACGTATGCGGTGATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatga < 2:1376493‑M2/101‑19 (MQ=255) attCAACTTAACACTAAAAAAAATCACATATTTAATATCATAATTTTTCTTTGGTCTACGTATGCGGTGATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatg > 2:1383444‑M2/1‑81 (MQ=255) tCAACTTAACACTAAAAAAAATCACATATTTAATATCATAATTTTTCTTTGGTCTACGTATGCGGTGATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggt > 2:187281‑M2/1‑79 (MQ=255) cTTAACACTAAAAAAAATCACATATTTAATATCATAATTTTTCTTTGGTCTACGTATGCGGTGATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgttt < 2:1051157‑M2/101‑27 (MQ=255) tAACACTAAAAAAAATCACATATTTAATATCATAATTTTTCTTTGGTCTACGTATGCGGTGATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgttttt < 2:1611169‑M2/101‑29 (MQ=255) acTAAAAAAAATCACATATTTAATATCATAATTTTTCTTTGGTCTACGTATGCGGTGATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgtttttgagg > 2:1701390‑M2/1‑69 (MQ=255) cTAAAAAAAATCACATATTTAATATCATAATTTTTCTTTGGTCTACGTATACGGTGATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgattgtgtttttgaggt > 2:828072‑M2/1‑68 (MQ=255) aaaaTCACATATTTAATATCATAATTTTTCTTTGGTCTACGTATGCGGTGATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctcca < 2:652318‑M2/101‑40 (MQ=255) aaaTCACATATTTAATATCATAATTTTTCTTTGGTCTACGTATGCGGTGATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccag > 2:729548‑M2/1‑61 (MQ=255) aaTCACATATTTAATATCATAATTTTTCTTTGGTCTACGTATGCGTTGATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagt > 2:938682‑M2/1‑60 (MQ=255) aaTCACATATTTAATATCATAATTTTTCTTTGGTCTACGTATGCGGTGATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagt > 2:1353796‑M2/1‑60 (MQ=255) tatTTAATATCATAATTTTTCTTTGGTCTACGTATGCGGTGATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttct > 2:1422436‑M2/1‑53 (MQ=255) atTTAATATCATAATTTTTCTTTGGTCTACGTATGCGGTGATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctg < 2:642470‑M2/101‑50 (MQ=255) atTTAATATCATAATTTTTCTTTGGTCTACGTATGCGGTGATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctg > 1:20424‑M2/1‑52 (MQ=255) tAATATCATAATTTTTCTTTGGTCTACGTATGCGGTGATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgttt < 1:891369‑M2/101‑53 (MQ=255) tttttCTTTGGTCTACGTATGCGGTGATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgt > 2:374935‑M2/1‑38 (MQ=255) ttttCTTTGGTCTACGTATGCGGTGATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtc < 2:1300532‑M2/101‑65 (MQ=255) cTTTGGTCTACGTATGCGGTGATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctc < 1:229104‑M2/101‑69 (MQ=255) cTTTGGTCTACGTATGCGGTGATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctc < 1:83508‑M2/101‑69 (MQ=255) tttGGTCTACGTATGCGGTGATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcc > 1:1116236‑M2/1‑32 (MQ=255) gTCTACGTATGCGGTGATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgtt < 1:1048392‑M2/101‑74 (MQ=255) tCTACGTATGCGGTGATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttc < 2:904550‑M2/101‑75 (MQ=255) cTACGTATGCGGTGATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttca > 1:1185937‑M2/1‑26 (MQ=255) cTACGTATGCGGTGATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttca > 2:1248567‑M2/1‑26 (MQ=255) gTATGCGGTGATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagcta < 1:492346‑M2/101‑80 (MQ=255) gTATGCGGTGATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagcta > 1:496621‑M2/1‑22 (MQ=255) tGCGGTGATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactg > 1:1611175‑M2/1‑19 (MQ=255) tGCGGTGATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactg > 1:1109117‑M2/1‑19 (MQ=255) tGCGGTGATGCTGCCAACTtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactg > 2:958021‑M2/1‑19 (MQ=255) | AAACTCTCCAGTATTTAATTATTCAACTTAACACTAAAAAAAATCACATATTTAATATCATAATTTTTCTTTGGTCTACGTATGCGGTGATGCTGCCAACT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 50/29644‑29744 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |