New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 223 | = 698 | 0 (0.000) | 65 (0.070) +A |
47/198 | 0.3 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 48 | = 29957 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
CTGCAACATTGTTTTCCTTGCGGGTTGTCCCGAGCCTCTTTGACGGATGTAATTAAAATGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 48/29857‑29957 | cTGCAACATTGTTTTCCTTGCGGGTTGTCCCGAGCCTCTTTGACGGATGTAATTAAAATGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAAc > 2:1607605/1‑101 (MQ=255) gCAACATTGTTTTCCTTGCGGGTTGTCCCGAGCCTCTTTGACGGATGTAATTAAAATGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACtt > 2:1485478‑M2/1‑99 (MQ=255) aCATTGTTTTCCTTGCGGGTTGTCCCGAGCCTCTTTGACGGATGTAATTAAAATGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttact > 2:487275‑M2/1‑96 (MQ=255) cATTGTTTTCCTTGCGGGTTGTCCCGAGCCTCTTTGACGGATGTAATTAAAATGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactg < 1:829780‑M2/101‑7 (MQ=255) aTTGTTTTCCTTGCGGGTTGTCCCGAGCCTCTTTGACGGATGTAATTAAAATGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactga < 2:185965‑M2/101‑8 (MQ=255) aTTGTTTTCCTTGCGGGTTGTCCCGAGCCTCTTTGACGGATGTAATTAAAATGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactga < 1:763250‑M2/101‑8 (MQ=255) aTTGTTTTCCTTGCGGGTTGTCCCGAGCCTCTTTGACGGATGTAATTAAAATGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactga < 2:651868‑M2/101‑8 (MQ=255) ttttCCTTGCGGGTTGTCCCGAGCCTCTTTGACGGATGTAATTAAAATGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgattta < 2:933136‑M2/101‑12 (MQ=255) tCCTTGCGGGTTGTCCCGAGCCTCTTTGACGGATGTAATTAAAATGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtg < 2:1310969‑M2/101‑15 (MQ=255) cTTGCGGGTTGTCAGGAGCCTCTTTGACGGATGTAATTAAAATGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgta > 2:76961‑M2/1‑85 (MQ=255) cGGGTTGTCCCGAGCCTCTTTGACGGATGTAATTAAAATGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgat < 1:572542‑M2/101‑21 (MQ=255) cGGGTTGTCCCGAGCCTCTTTGACGGATGTAATTAAAATGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgat > 1:21650‑M2/1‑81 (MQ=255) gggTTGTCCCGAGCCTCTTTGACGGATGTAATTAAAATGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatg < 1:924059‑M2/101‑22 (MQ=255) ggTTGTCCCGAGCCTCTTTGACGGATGTAATTAAAATGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatgg > 2:913746‑M2/1‑79 (MQ=255) tGTCCCGAGCCTCTTTGACGGATGTAATTAAAATGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgt < 1:468963‑M2/101‑26 (MQ=255) tGTCCCGAGCCTCTTTGACGGATGTAATTAAAATGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgt < 1:412974‑M2/101‑26 (MQ=255) gcccgAGCCTCTTTGACGGATGTAATTAAAATGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgttt > 2:1439202‑M2/2‑74 (MQ=255) cccGAGCCTCTTTGACGGATGTAATTAAAATGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgtttt > 1:185965‑M2/1‑73 (MQ=255) ccGAGCCTCTTTGACGGATGTAATTAAAATGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgttttt < 2:518424‑M2/101‑30 (MQ=255) ccGAGCCTCTTTGACGGATGTAATTAAAATGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgttttt > 2:72781‑M2/1‑72 (MQ=255) cGAGCCTCTTTGACGGATGTAATTAAAATGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttg > 2:924054‑M2/1‑71 (MQ=255) gCCTCTTTGACGGATGTAATTAAAATGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttgagg > 2:1375462‑M2/1‑68 (MQ=255) gCCTCTTTGACGGATGTAATTAAAATGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttgagg > 2:328943‑M2/1‑68 (MQ=255) ctctTTGACGGATGTAATTAAAATGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtg < 2:1371374‑M2/101‑36 (MQ=255) ctctTTGACGGATGTAATTAAAATGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtg < 1:593568‑M2/101‑36 (MQ=255) tctTTGACGGATGTAATTAAAATGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgc > 2:17718‑M2/1‑65 (MQ=255) tGACGGATGTAATTAAAATGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctcca < 1:815069‑M2/101‑41 (MQ=255) gACGGATGTAATTAAAATGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccag > 2:368276‑M2/1‑60 (MQ=255) ggATGTAATTAAAATGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtgg < 1:1634966‑M2/101‑45 (MQ=255) ggATGTAATTAAAATGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtgg < 1:575561‑M2/101‑45 (MQ=255) gATGTAATTAAAATGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggc > 2:620129‑M2/1‑56 (MQ=255) aTGTAATTAAAATGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgattagtgtaagatggtgtttttgaggtgctccagtggctt > 2:1387733‑M2/1‑55 (MQ=255) tAATTAAAATGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttct < 2:1161785‑M2/101‑50 (MQ=255) tAATTAAAATGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttct < 1:43897‑M2/101‑50 (MQ=255) aaTTAAAATGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctg < 2:525954‑M2/101‑51 (MQ=255) aTTAAAATGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgt < 2:1168998‑M2/101‑52 (MQ=255) ttAAAATGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttacggtatgatggggtttttgaggtgctccagtggcttctgtt < 2:1199230‑M2/101‑53 (MQ=255) tAAAATGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgttt > 2:924736‑M2/1‑48 (MQ=255) tAAAATGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgttt < 1:485547‑M2/101‑54 (MQ=255) aaaaTGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttc < 2:1457882‑M2/101‑55 (MQ=255) aTGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctat > 2:637186‑M2/1‑44 (MQ=255) gTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatca > 2:1634960‑M2/1‑42 (MQ=255) gAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctattagct > 2:1716282‑M2/1‑39 (MQ=255) agccccgacatagatATTAATGGGGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggggtttttgaggtgctccagtggcttctggttctatcagctgtt < 2:1637572‑M2/94‑66 (MQ=255) aaTACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctc < 1:1601188‑M2/101‑70 (MQ=255) aTACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcc < 1:292890‑M2/101‑71 (MQ=255) tACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcct > 1:1371380‑M2/1‑30 (MQ=255) cATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgt > 1:8205‑M2/1‑28 (MQ=255) tAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttc > 2:343235‑M2/1‑26 (MQ=255) tAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttc > 1:1310975‑M2/1‑26 (MQ=255) tAGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttc > 2:904274‑M2/1‑26 (MQ=255) aGATATTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttca < 2:1151587‑M2/101‑77 (MQ=255) tatTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagct > 2:395949‑M2/1‑22 (MQ=255) atTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagcta < 1:1213762‑M2/101‑81 (MQ=255) atTAATGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagcta < 1:379833‑M2/101‑81 (MQ=255) aTGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactga < 2:1235259‑M2/101‑85 (MQ=255) tGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgac > 2:546470‑M2/1‑16 (MQ=255) tGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgac > 2:658405‑M2/1‑16 (MQ=255) tGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgac > 1:313287‑M2/1‑16 (MQ=255) tGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgac < 1:656389‑M2/101‑86 (MQ=255) tGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgac > 1:863816‑M2/1‑16 (MQ=255) tGGTGATGCTGCCAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgac > 2:1506163‑M2/1‑16 (MQ=255) gcCAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagcttctgacggggtggggc < 1:53207‑M2/101‑96 (MQ=255) gcCAACttactgatttagtgtatgatggtgcttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggggc < 2:72848‑M2/101‑96 (MQ=255) ccAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgcgccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgatcagctactgaggggggggggct < 1:453655‑M2/101‑97 (MQ=255) cAACttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacgggggggggggt < 2:1111888‑M2/101‑98 (MQ=255) | CTGCAACATTGTTTTCCTTGCGGGTTGTCCCGAGCCTCTTTGACGGATGTAATTAAAATGTTGAATCAAAATACATAGATATTAATGGTGATGCTGCCAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 48/29857‑29957 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |