| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 222 | = 1443 | 0 (0.000) | 113 (0.070) | 76/194 | 0.0 | 98.7% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 32 | 18696 = | 3 (0.040) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 210 total aligned reads displayed.
AGAAGGAGTTAAACATGGCTTATAAACACATTGGCGTGGCAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGA > 32/18596‑18796 | gaagaattagcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacat > 2:1350195‑M2/101‑101 (MQ=255)gaagaattagcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacat < 2:1274079‑M2/1‑1 (MQ=255)gaagaattagcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacat < 2:1002140‑M2/1‑1 (MQ=255)gaagaattagcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacat < 2:1385287‑M2/1‑1 (MQ=255)gaagaattagcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacat > 2:394891‑M2/101‑101 (MQ=255)gaagaattagcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacat > 1:1135786‑M2/101‑101 (MQ=255)gaagaattagcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacat > 1:833188‑M2/101‑101 (MQ=255)aGAAGGAGTTAAACATGGCTTATAAACACATTGGCGTGGCAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACAt < 1:384821/101‑1 (MQ=255) aagaattagcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTa > 1:1520603‑M2/100‑101 (MQ=255) aagaattagcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTa < 1:1296395‑M2/2‑1 (MQ=255) agaattagcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTaa > 2:499455‑M2/99‑101 (MQ=255) aaGGAGTTAAACATGGCTTATAAACACATTGGCGTGGCAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATaa > 2:882562/1‑101 (MQ=255) gAGTTAAACATGGCTTATAAACACATTGGCGTGGCAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgt > 2:942207‑M2/1‑98 (MQ=255) attagcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGa < 1:1374081‑M2/6‑1 (MQ=255) gTTAAACATGGCTTATAAACACATTGGCGTGGCAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtac > 2:198762‑M2/1‑96 (MQ=255) gTTAAACATGGCTTATAAACACATTGGCGTGGCAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtac < 2:1097008‑M2/101‑6 (MQ=255) gcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCt > 1:1614693‑M2/92‑101 (MQ=255) cctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTc > 1:1045442‑M2/91‑101 (MQ=255) cctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTc > 1:771957‑M2/91‑101 (MQ=255) ctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCa > 1:816585‑M2/90‑101 (MQ=255) aCATGGCTTATAAACACATTGGCGTGGCAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcac < 2:772153‑M2/101‑11 (MQ=255) cATGGCTTATAAACACATTGGCGTGGCAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacc > 1:1719978‑M2/1‑90 (MQ=255) aattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTg > 1:282042‑M2/86‑101 (MQ=255) aaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGt > 1:1487410‑M2/82‑101 (MQ=255) ggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAAt < 1:1687280‑M2/24‑1 (MQ=255) aaaCACATTGGCGTGGCAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttg < 1:448498‑M2/101‑22 (MQ=255) gtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAAtt < 2:319558‑M2/25‑1 (MQ=255) acacATTGGCGTGGCAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttgga < 1:600953‑M2/101‑24 (MQ=255) cacaTTGGCGTGGCAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggac < 1:696573‑M2/101‑25 (MQ=255) tgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCat < 2:795749‑M2/28‑1 (MQ=255) acaTTGGCGTGGCAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacg < 2:670084‑M2/101‑26 (MQ=255) aTTGGCGTGGCAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgat > 1:846089‑M2/1‑74 (MQ=255) tGGCGTGGCAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatga > 2:46899‑M2/1‑72 (MQ=255) tGGCGTGGCAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatga > 2:1121267‑M2/1‑72 (MQ=255) gCGTGGCAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaa > 1:1546421‑M2/1‑70 (MQ=255) caattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATtgat < 1:607911‑M2/34‑1 (MQ=255) cGTGGCAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaat < 2:1680063‑M2/101‑33 (MQ=255) gTGGCAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatg < 1:102005‑M2/101‑34 (MQ=255) attgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATtgatga < 1:447845‑M2/36‑1 (MQ=255) tGGCAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatgg > 2:713381‑M2/1‑67 (MQ=255) gCAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaa > 2:653913‑M2/1‑65 (MQ=255) aaTTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaata > 2:949525‑M2/1‑63 (MQ=255) tatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCtt < 1:115944‑M2/42‑1 (MQ=255) tttCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagc < 1:402743‑M2/101‑41 (MQ=255) atcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTa > 1:732945‑M2/59‑101 (MQ=255) cggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAg < 1:258124‑M2/45‑1 (MQ=255) cggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAg < 1:1037650‑M2/45‑1 (MQ=255) atcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAg > 1:956034‑M2/53‑101 (MQ=255) tcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGt < 1:127015‑M2/50‑1 (MQ=255) cagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGtt < 2:282042‑M2/51‑1 (MQ=255) aaTGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaata > 1:1611774‑M2/1‑53 (MQ=255) agacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTg > 1:1221761‑M2/50‑101 (MQ=255) aTGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaatat < 1:492107‑M2/101‑50 (MQ=255) agaagaTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaatatgtca < 1:1431745‑M2/101‑54 (MQ=255) agaagaTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaatatgtca > 1:880503‑M2/1‑48 (MQ=255) aagaTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaatatgtcaaa > 1:1016733‑M2/1‑46 (MQ=255) agaTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaatatgtcaaag < 2:623809‑M2/101‑57 (MQ=255) agaTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaatatgtcaaag > 1:925726‑M2/1‑45 (MQ=255) agaTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaatatgtcaaag > 1:1095467‑M2/1‑45 (MQ=255) agaTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTACGCGAGTTGTATCCgg > 1:649576/1‑101 (MQ=255) gaTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaatatgtcaaagc > 1:1425386‑M2/1‑44 (MQ=255) gcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTa < 2:1425699‑M2/62‑1 (MQ=255) cctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTAt < 1:16682‑M2/63‑1 (MQ=255) cctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTAt < 2:566940‑M2/63‑1 (MQ=255) cctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTAt > 2:451408‑M2/39‑101 (MQ=255) tcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCt < 1:1527062‑M2/65‑1 (MQ=255) ttACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaatatgtcaaagccaaaat > 1:637043‑M2/1‑38 (MQ=255) gtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTAc > 1:1167139‑M2/35‑101 (MQ=255) gtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTAc > 1:1405880‑M2/35‑101 (MQ=255) aCTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaatatgtcaaagccaaaatac > 1:873633‑M2/1‑36 (MQ=255) cTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaatatgtcaaagccaaaatacc < 2:1421049‑M2/101‑67 (MQ=255) gTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaatatgtcaaagccaaaataccctt < 1:1141641‑M2/101‑70 (MQ=255) aactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCt < 2:833413‑M2/73‑1 (MQ=255) aaTAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaatatgtcaaagccaaaatacccttttg > 1:894343‑M2/1‑29 (MQ=255) tgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCa < 1:202678‑M2/76‑1 (MQ=255) tccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAAc > 1:1565139‑M2/24‑101 (MQ=255) 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aTAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaatatgtcaaagccaaaatacccttttgaaaagcgccttgaagtcgtgaatca < 2:515100‑M2/101‑98 (MQ=255) aTAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaatatgtcaaagccaaaatacccttttgaaaagcgccttgaagtcgtgaatca < 2:371200‑M2/101‑98 (MQ=255) tAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTga < 1:1676195/101‑1 (MQ=255) | AGAAGGAGTTAAACATGGCTTATAAACACATTGGCGTGGCAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGA > 32/18596‑18796 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |