| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | 222 | 1 = | 0 (0.000) | 87 (0.060) | 63/196 | 0.1 | 97.2% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 32 | = 18698 | 5 (0.070) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 198 total aligned reads displayed.
AAGGAGTTAAACATGGCTTATAAACACATTGGCGTGGCAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAA > 32/18598‑18797 | aaGGAGTTAAACATGGCTTATAAACACATTGGCGTGGCAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATaa > 2:882562/1‑101 (MQ=255) ggAGTTAAACATGGCTTATAAACACATTGGCGTGGCAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGTATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtg < 2:631733‑M2/101‑3 (MQ=255) gAGTTAAACATGGCTTATAAACACATTGGCGTGGCAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgt < 2:1008908‑M2/101‑4 (MQ=255) gAGTTAAACATGGCTTATAAACACATTGGCGTGGCAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgt > 2:942207‑M2/1‑98 (MQ=255) attagcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGa < 1:1374081‑M2/6‑1 (MQ=255) gTTAAACATGGCTTATAAACACATTGGCGTGGCAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtac > 2:177997‑M2/1‑96 (MQ=255) gTTAAACATGGCTTATAAACACATTGGCGTGGCAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtac < 2:1097008‑M2/101‑6 (MQ=255) gTTAAACATGGCTTATAAACACATTGGCGTGGCAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtac < 1:348773‑M2/101‑6 (MQ=255) gcctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCt > 1:1614693‑M2/92‑101 (MQ=255) cctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTc > 2:50504‑M2/91‑101 (MQ=255) cctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTc > 1:771957‑M2/91‑101 (MQ=255) aaaCATGGCTTATAAACACATTGGCGTGGCAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgc < 1:221705‑M2/101‑9 (MQ=255) ctgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCa > 1:816585‑M2/90‑101 (MQ=255) tgaaattaaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCAc < 1:1018162‑M2/13‑1 (MQ=255) aCATGGCTTATAAACACATTGGCGTGGCAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcac < 2:772153‑M2/101‑11 (MQ=255) aaaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGt > 1:1487410‑M2/82‑101 (MQ=255) tataAACACATTGGCGTGGCAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttg > 2:142213‑M2/1‑83 (MQ=255) aaaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGtt < 2:715320‑M2/21‑1 (MQ=255) aaggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTa < 2:141916‑M2/22‑1 (MQ=255) ggtctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAAt < 1:1687280‑M2/24‑1 (MQ=255) tctgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTc > 1:1289799‑M2/76‑101 (MQ=255) cacaTTGGCGTGGCAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggac < 1:696573‑M2/101‑25 (MQ=255) tgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCat < 2:296880‑M2/28‑1 (MQ=255) tgactccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCat < 2:795749‑M2/28‑1 (MQ=255) actccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCatat > 1:782703‑M2/72‑101 (MQ=255) aTTGGCGTGGCAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgat > 1:846089‑M2/1‑74 (MQ=255) ctccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATAtt > 1:184232‑M2/71‑101 (MQ=255) ctccaattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATAtt > 2:497429‑M2/71‑101 (MQ=255) tGGCGTGGCAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatga < 2:288071‑M2/101‑30 (MQ=255) tGGCGTGGCAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatga > 2:1121267‑M2/1‑72 (MQ=255) tGGCGTGGCAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatga > 2:46899‑M2/1‑72 (MQ=255) gCGTGGCAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaa > 1:1546421‑M2/1‑70 (MQ=255) caattgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATtgat < 1:259530‑M2/34‑1 (MQ=255) ttgaatatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTgatgat < 1:499460‑M2/37‑1 (MQ=255) cAATTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaat > 1:607783‑M2/1‑64 (MQ=255) atatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCt < 1:1026977‑M2/41‑1 (MQ=255) atatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCt < 1:1043574‑M2/41‑1 (MQ=255) aaTTTCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaata < 1:608986‑M2/101‑39 (MQ=255) tatcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCtt < 1:115944‑M2/42‑1 (MQ=255) tttCCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagc < 1:402743‑M2/101‑41 (MQ=255) atcggaatcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTa > 1:732945‑M2/59‑101 (MQ=255) gggAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagccccta < 2:279066‑M2/101‑46 (MQ=255) atcagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAg > 1:956034‑M2/53‑101 (MQ=255) cagacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGtt < 1:569054‑M2/51‑1 (MQ=255) aaTGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaata > 1:1611774‑M2/1‑53 (MQ=255) agacctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTg > 1:1221761‑M2/50‑101 (MQ=255) aTGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaatat < 1:492107‑M2/101‑50 (MQ=255) tGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaatatg < 1:1284654‑M2/101‑51 (MQ=255) acctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTa > 2:1676189‑M2/48‑101 (MQ=255) ctatatgcctcgtgtttaactgtccaactttttggggtcagtacaTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATc > 2:705158‑M2/46‑101 (MQ=255) agaagaTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaatatgtca > 1:880503‑M2/1‑48 (MQ=255) aagaTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaatatgtcaaa > 1:1016733‑M2/1‑46 (MQ=255) agaTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaatatgtcaaag > 2:531138‑M2/1‑45 (MQ=255) agaTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAAtgtactgcacccattttgttggacgatgaaatggaatagcccctaatatgtcaaag > 1:925726‑M2/1‑45 (MQ=255) agaTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTACGCGAGTTGTATCCgg > 1:649576/1‑101 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |