New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 196 | = 5276 | 0 (0.000) | 47 (0.850) | 41/198 | 0.3 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 74 | 2 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCACCGGCTGCCGCGG > 74/1‑102 | gtaaacgcctgatccgtccaacggttcggattttgtaggcctgataagacgcggtagcgtcgcatcaggcatctgttgccggatgcggcgtaaacgcctTa > 1:702348‑M2/100‑101 (MQ=255) taaacgcctgatccgtccaacggttcggattttgtaggcctgataagacgcggtagcgtcgcatcaggcatctgttgccggatgcggcgtaaacgcctTAt < 2:256413‑M2/3‑1 (MQ=255) taaacgcctgatccgtccaacggttcggattttgtaggcctgataagacgcggtagcgtcgcatcaggcatctgttgccggatgcggcgtaaacgcctTAt < 1:610375‑M2/3‑1 (MQ=255) aacgcctgatccgtccaacggttcggattttgtaggcctgataagacgcggtagcgtcgcatcaggcatctgttgccggatgcggcgtaaacgcctTATcc < 2:352614‑M2/5‑1 (MQ=255) ctgatccgtccaacggttcggattttgtaggcctgataagacgcggtagcgtcgcatcaggcatctgttgccggatgcggcgtaaacgcctTATCCGTCCt < 2:253152‑M2/10‑1 (MQ=255) tgatccgtccaacggttcggattttgtaggcctgataagacgcggtagcgtcgcatcaggcatctgttgccggatgcggcgtaaacgcctTATCCGTCCTa < 1:1490150‑M2/11‑1 (MQ=255) tgatccgtccaacggttcggattttgtaggcctgataagacgcggtagcgtcgcatcaggcatctgttgccggatgcggcgtaaacgcctTATCCGTCCTa < 2:1570229‑M2/11‑1 (MQ=255) atccgtccaacggttcggattttgtaggcctgttaagacgcggtagcggcgcatcaggcgtctgttggcggatgcggcgtaaacccctTCTCCGTCctaag > 1:5474‑M2/89‑99 (MQ=255) atccgtccaacggttcggattttgtaggcctgataagacgcggtagcgtcgcatcaggcatctgttgccggatgcggcgtaaacgcctTATCCGTCCTACg < 2:452600‑M2/13‑1 (MQ=255) tccaacggttcggattttgtaggcctgataagacgcggtagcgtcgcatcaggcatctgttgccggatgcggcgtaaacgcctTATCCGTCCTACGAATTa < 2:898383‑M2/18‑1 (MQ=255) ccaacggttcggattttgtaggcctgataagacgcggtagcgtctcatcaggcatctgttgccgcgtgcggcgtaaacgcttTATCCGTTCTACGAATTAc < 2:838645‑M2/19‑1 (MQ=255) acggttcggattttgtaggcctgataagacgcggtagcgtcccatcaggcatctgttgccggatgcggcgtaaacgcctTATCCGTCCTACGAATTACTta < 1:1649659‑M2/22‑1 (MQ=255) gttcggattttgtaggcctgataagacgcggtagcgtcgcatcaggcatctgttgccggatgcggcgtaaacgcctTATCCGTCCTACGAATTACTTATaa < 1:1526331‑M2/25‑1 (MQ=255) cggattttgtaggcctgataagacgcggtagcgtcgcatcaggcatctgttgcaggatgcggcgtaaacgcctTATCCGTCCTACCAATTACTTATAAAtt < 2:263644‑M2/28‑1 (MQ=255) gattttgtaggcctgataagacgcggtagcgtcgcatcaggcatctgttgccggatgcggcgtaaacgcctTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTAc < 2:550102‑M2/30‑1 (MQ=255) attttgtaggcctgataagacgcggtagcgtcgcatcaggcatctgttgccggatgcggcgtaaacgcctTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTAcc < 1:1018177‑M2/31‑1 (MQ=255) attttgtaggcctgataagacgcggtagcgtcgcatcaggcatctgttgccggatgcggcgtaaacgcctTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTAcc > 1:1372755‑M2/71‑101 (MQ=255) attttgtaggcctgataagacgcggtagcgtcgcatcaggcatctgttgccggatgcggcgtaaacgcctTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTAcc > 2:1220986‑M2/71‑101 (MQ=255) tttgtaggcctgataagacgcggtagcgtcgcatcaggcatctgttgccggatgcggcgtaaacgcctTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGc < 1:379467‑M2/33‑1 (MQ=255) tgtaggcctgataagacgcggtagcgtcgcatcaggcatctgttgccggatgcggcgtaaacgcctTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAg < 1:747109‑M2/35‑1 (MQ=255) gtaggcctgataagacgcggtagcgtcgcatcaggcatctgttgccggatgcggcgtaaacgcctTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGt > 2:486260‑M2/66‑101 (MQ=255) gtaggcctgataagacgcggtagcgtcgcatcaggcatctgttgccggatgcggcgtaaacgcctTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGt > 1:124782‑M2/66‑101 (MQ=255) ggcctgataagacgcggtagcgtcgcatcaggcatctgttgccggatgcggcgtaaacgcctTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTAcc < 1:1608681‑M2/39‑1 (MQ=255) gcctgataaggcgcggtagcgtcgcatcagtcatcggttgccggatgcggcgtaaacgcctTATCCGTCCTCCGAATTACTTATAAATGACCGCAGTACCg < 2:406073‑M2/40‑1 (MQ=255) tgataagacgcggtagcgtcgcatcaggcatctgttgccggatgcggcgtaaacgcctTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCtt > 1:743143‑M2/59‑101 (MQ=255) gataagacgcggtagcgtcgcatcaggcatctgttgccggatgcggcgtaaacgcctTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTa > 2:887079‑M2/58‑101 (MQ=255) ataagacgcggtagcgtcgcatcaggcatctgttgccggatgcggcgtaaacgcctTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTaa > 2:395481‑M2/57‑101 (MQ=255) ataagacgcggtagcgtcgcatcaggcatctgttgccggatgcggcgtaaacgcctTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTaa < 1:631117‑M2/45‑1 (MQ=255) acgcggtagcgtcgcatcaggcatctgttgccggatgcggcgtaaacgcctTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTAt < 1:1464988‑M2/50‑1 (MQ=255) cgcggtagcgtcgcatcaggcatctgttgccggatgcggcgtaaacgcctTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTAtt < 2:1498602‑M2/51‑1 (MQ=255) gcggtagcgtcgcatcaggcatctgttgccggatgcggcgtaaacgcctTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTAttg < 1:1369851‑M2/52‑1 (MQ=255) ggtagcgtcgcatcaggcatctgttgccggatgcggcgtaaacgcctTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTAttgtt < 1:1350001‑M2/54‑1 (MQ=255) ggtagcgtcgcatcaggcatctgttgccggatgcggcgtaaacgcctTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTAttgtt < 2:82774‑M2/54‑1 (MQ=255) gtcgcatcaggcatctgttggcggatgcggcgtaaacgcctTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTtggt > 2:1058531‑M2/42‑101 (MQ=255) gcatcaggcatctgttgccggatgcggcgtaaacgcctTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGc > 1:218980‑M2/39‑101 (MQ=255) catcaggcatctgttgccggatgcggcgtaaacgcctTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCg > 2:601627‑M2/38‑101 (MQ=255) ctgttgccggatgcggcgtaaacgcctTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGc > 1:1136374‑M2/28‑101 (MQ=255) gccggatgcggcgtaaacgcctTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTAt > 2:673670‑M2/23‑101 (MQ=255) ccggatgcggcgtaaacgcctTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATc > 1:716249‑M2/22‑101 (MQ=255) tgcggcgtaaacgcctTATCCGGCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTg > 1:168420‑M2/17‑101 (MQ=255) cggcgtaaacgcctTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGc > 2:694319‑M2/15‑101 (MQ=255) gtaaacgcctTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCACCg > 2:881911‑M2/11‑101 (MQ=255) taaacgcctTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCACCgg > 1:664988‑M2/10‑101 (MQ=255) taaacgcctTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCACCgg > 2:1055219‑M2/10‑101 (MQ=255) aaacgcctTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCACCGGc > 1:1047762‑M2/9‑101 (MQ=255) aacgcctTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCACCGGCt > 2:1178109‑M2/8‑101 (MQ=255) cctTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCACCGGCTGCcg > 1:382855‑M2/4‑101 (MQ=255) tATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCACCGGCTGCCGCgg > 1:328332/1‑101 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTATCCGTCCTACGAATTACTTATAAATTACCGCAGTACCGCTTAATTTATTGTTGTTGGTGGCGGAAGTGATGCTGTATCCACTGGCACCGGCTGCCGCGG > 74/1‑102 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |