New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 19 | = 43912 | 0 (0.000) | 67 (1.250) | 51/166 | 0.1 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 40 | = 30782 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
CTATCGACGTATTTATAAATGCGGTCTGGTCGTTTTTCTGTTGTCTTCACTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCATACAAGGTTTCGGCGGGGGCGGCCCCCGCCGTGGTTTATCCTCATTCTACGCTTGCGGCAAGCGTTCCGGCAGCTACACCCGCGCCAGAGATAATGCCC > 40/30683‑30882 | cTATCGACGTATTTATAAATGCGGTCTGGTCGTTTTTCTGTTGTCTTCACTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCa < 2:1054811‑M2/101‑2 (MQ=255) cTATCGACGTATTTATAAATGCGGTCTGGTCGTTTTTCTGTTGTCTTCACTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCa > 1:736786‑M2/1‑100 (MQ=255) tATCGACGTATTTATAAATGCGGTCTGGTCGTTTTTCTATTGTCTTCACTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCat < 1:544127‑M2/101‑3 (MQ=255) aTCGACGTATTTATAAATGCGGTCTGGTCGTTTTTCTGTTGTCTTCACTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCata < 1:1495224‑M2/101‑4 (MQ=255) aTCGACGTATTTATAAATGCGGTCTGGTCGTTTTTCTGTTGTCTTCACTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCata < 1:691423‑M2/101‑4 (MQ=255) cGACGTATTTATAAATGCGGTCTGGTCGTTTTTCTGTTGTCTTCACTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCataca < 2:629829‑M2/101‑6 (MQ=255) aCGTATTTATAAATGCGGTCTGGTCGTTTTTCTGTTGTCTTCACTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaag > 2:237446‑M2/1‑94 (MQ=255) cGTATTTATAAATGCGGTCTGGTCGTTTTTCTGTTGTCTTCACTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaagg < 1:942892‑M2/101‑9 (MQ=255) tATTTATAAATGCGGTCTGGTCGTTTTTCTGTTGTCTTCACTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtt > 1:758573‑M2/1‑91 (MQ=255) tATTTATAAATGCGGTCTGGTCGTTTTTCTGTTGTCTTCACTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtt > 2:730335‑M2/1‑91 (MQ=255) tttATAAATGCGGTCTGGTCGTTTTTCTGTTGTCTTCACTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttc > 2:578124‑M2/1‑89 (MQ=255) tttATAAATGCGGTCTGGTCGTTTTTCTGTTGTCTTCACTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttc > 2:1212267‑M2/1‑89 (MQ=255) ttATAAATGCGGTCTGGTCGTTTTTCTGTTGTCTTCACTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcg < 2:192860‑M2/101‑14 (MQ=255) ttATAAATGCGGTCTGGTCGTTTTTCTGTTGTCTTCACTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcg < 2:1281013‑M2/101‑14 (MQ=255) tataAATGCGGTCTGGTCGTTTTTCTGTTGTCTTCACTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcgg > 1:366304‑M2/1‑87 (MQ=255) ataAATGCGGTCTGGTCGTTTTTCTGTTGTCTTCACTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggc < 2:584471‑M2/101‑16 (MQ=255) ataAATGCGGTCTGGTCGTCTTTCTGTTGTCTTCACTGTTCTTCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggc < 2:1044542‑M2/101‑16 (MQ=255) aaTGCGGTCTGGTCGTTTTTCTGTTGTCTTCACTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggt > 1:884183‑M2/1‑83 (MQ=255) aTGCGGTCTGGTCGTTTTTCTGTTGTCTTCACTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtg > 2:1156140‑M2/1‑82 (MQ=255) ggTCTGGTCGTTTTTCTGTTGTCTTCACTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagc > 1:585933‑M2/1‑78 (MQ=255) cTGGTCGTTTTTCTGTTGTCTTCACTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgtt < 1:1196005‑M2/101‑27 (MQ=255) cTGGTCGTTTTTCTGTTGTCTTCACTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgtt < 2:825387‑M2/101‑27 (MQ=255) tGGTCGTTTTTCTGTTGTCTTCACTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttg > 2:1264390‑M2/1‑74 (MQ=255) cGTTTTTCTGTTGTCTTCACTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatga > 2:1668148‑M2/1‑70 (MQ=255) gTTTTTCTGTTGTCTTCACTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgag < 2:1361390‑M2/101‑33 (MQ=255) tttttCTGTTGTCTTCACTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagc < 2:1061543‑M2/101‑34 (MQ=255) ttCTGTTGTCTTCACTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgtt < 2:163539‑M2/101‑37 (MQ=255) ttCTGTTGTCTTCACTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgtt > 1:1118183‑M2/1‑65 (MQ=255) ttCTGTTGTCTTCACTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTCCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgtt < 1:1318169‑M2/101‑37 (MQ=255) tCTGTTGTCTTCACTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgtta > 2:691418‑M2/1‑64 (MQ=255) tgttgtCTTCGCTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaat > 1:1515800‑M2/1‑62 (MQ=255) tgttgtCTTCACTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatgcaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaat > 2:1607927‑M2/1‑62 (MQ=255) ttgtCTTCACTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaatac > 2:1367563‑M2/1‑60 (MQ=255) ttgtCTTCACTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaatac > 2:831088‑M2/1‑60 (MQ=255) ttgtCCTCACTGTTCTGCTCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTAatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaatac > 2:1637934‑M2/1‑60 (MQ=255) tCTTCACTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgc > 2:976368‑M2/1‑57 (MQ=255) tCTTCACTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgc < 1:1163894‑M2/101‑45 (MQ=255) cACTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggtggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcactt > 1:241924‑M2/1‑53 (MQ=255) cACTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcactt > 1:58501‑M2/1‑53 (MQ=255) cACTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcactt < 1:1609242‑M2/101‑49 (MQ=255) aCTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcactta < 1:1569983‑M2/101‑50 (MQ=255) aCTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaagggttctgcggtggagcgttgatgagtgtttatacctcacttt < 2:884053‑M2/101‑50 (MQ=255) cTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcacttat > 1:860283‑M2/1‑51 (MQ=255) gTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaatactgcacttatcc < 1:1341623‑M2/101‑53 (MQ=255) gTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcacttatcc < 2:1608613‑M2/101‑53 (MQ=255) ttCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcacttatccg < 2:526224‑M2/101‑54 (MQ=255) cTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcacttatccgcc < 1:879801‑M2/101‑56 (MQ=255) cTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcacttatccgcc < 1:773004‑M2/101‑56 (MQ=255) cgcCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcacttatccgcctga < 1:1028366‑M2/101‑59 (MQ=255) gcCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcacttatccgcctgat < 1:429784‑M2/101‑60 (MQ=255) cccTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcacttatccgcctgatc < 1:1579181‑M2/101‑61 (MQ=255) ccTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcacttatccgcctgatct < 1:1620930‑M2/101‑62 (MQ=255) ccTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcacttatccgcctgatct < 2:707811‑M2/101‑62 (MQ=255) cTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcacttatccgcctgatcta < 2:656039‑M2/101‑63 (MQ=255) tttCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcacttatccgcctgatctat < 1:1324959‑M2/101‑64 (MQ=255) tttCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcacttatccgcctgatctat > 2:350822‑M2/1‑38 (MQ=255) ttCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcacttatccgcctgatctatc < 1:45042‑M2/101‑65 (MQ=255) tCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcacttatccgcctgatctatcc > 2:502446‑M2/1‑36 (MQ=255) tCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcacttatccgcctgatctatcc > 1:987476‑M2/1‑36 (MQ=255) cTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcacttatccgcctgatctatcca < 2:190727‑M2/101‑67 (MQ=255) tGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcacttatccgcctgatctatccac < 2:325069‑M2/101‑68 (MQ=255) gATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcacttatccgcctgatctatccaca > 1:1027889‑M2/1‑33 (MQ=255) cTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcacttatccgcctgatctatccacaacgttt > 1:1056951‑M2/1‑27 (MQ=255) gCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggtggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcccttatccgcctgatctatccacaacgttttc > 1:539156‑M2/1‑25 (MQ=255) cAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcacttatccgcctgatctatccacaacgttttct < 2:637290‑M2/101‑78 (MQ=255) aaaTGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcacttatccgcctgatctatccacaacgttttctg > 2:1280247‑M2/1‑23 (MQ=255) aaTGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcacttatccgcctgatctatccacaacgttttctgg > 2:1196000‑M2/1‑22 (MQ=255) aTGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcacttatccgcctgatctatccacaacgttttctggg < 1:1176047‑M2/101‑81 (MQ=255) aTGCTCACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcacttatccgcctgatctatccacaacgttttctggg < 2:579752‑M2/101‑81 (MQ=255) cACCCTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcacttatccgcctgatctatccacaacgttttctggggagag > 1:1551747‑M2/1‑16 (MQ=255) tccgatctgcgtgtcatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcacttatccgcctgatctatccacaacgttttctggggagagg > 2:290399‑M2/9‑15 (MQ=255) cccTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggcgcagcgttgatgcgcgttaataccgcacttatccgcctgatctatccacaacgatttctggggcgaggg < 1:526455‑M2/101‑88 (MQ=255) cTTGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcacttatccgcctgatctatccacaacgttttctggggagagggat > 1:656044‑M2/1‑12 (MQ=255) ttGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcccttatccgcctgacctatccacaacgttttctggggagagggatg > 2:1609236‑M2/1‑11 (MQ=255) ttGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcacttatccgcctgatctatccacaacgttttctggggagagggatg > 2:879796‑M2/1‑11 (MQ=255) tGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcacttatccgcctgatctatccacaacgttttctggggagagggatgg > 1:579757‑M2/1‑10 (MQ=255) tGCGCGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcacttatccgcctgatctatccacaacgttttctggggagagggatgg < 1:883711‑M2/101‑92 (MQ=255) gcgcGTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcacttatccgcctgatctatccacaacgttttctggggagagggatggg > 1:791217‑M2/1‑9 (MQ=255) cgcgTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcacttatccgcctgatctatccacaacgttttctggggagagggatgggc < 1:956724‑M2/101‑94 (MQ=255) gcgTGTCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcacttatccgcctgatctatccacaacgttttctggggagaggagatcgga < 1:290399‑M2/101‑95 (MQ=255) tgtCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcacttatccgcctgatctatccacaacgttttctggggagagggatgggcataa < 2:349073‑M2/101‑98 (MQ=255) tCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcacttatccgcctgatctatccacaacgttttctggggagagggatgggcataaac > 2:412098‑M2/1‑2 (MQ=255) tCatacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcacttatccgcctgatctatccacaacgttttctggggagagggatgggcataaac > 2:124296‑M2/1‑2 (MQ=255) catacaaggtttcggcggtgcagcgttgatgagcgttaataccgcacttatccgcctgatctatccacaacgttttctggggagagggatgggcataaact < 1:814736‑M2/101‑101 (MQ=255) | CTATCGACGTATTTATAAATGCGGTCTGGTCGTTTTTCTGTTGTCTTCACTGTTCTGCGCCCTTTCTGATTCGCTGCAAATGCTCACCCTTGCGCGTGTCATACAAGGTTTCGGCGGGGGCGGCCCCCGCCGTGGTTTATCCTCATTCTACGCTTGCGGCAAGCGTTCCGGCAGCTACACCCGCGCCAGAGATAATGCCC > 40/30683‑30882 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |