New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 186 | 1 = | 0 (0.000) | 69 (0.880) +C |
60/198 | 0.3 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 42 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCA > 42/1‑101 | cagcgtggatgaagtgctggaactgctggcaggtcgtaagtaatccaatcccaccctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCt > 1:578777‑M2/99‑101 (MQ=255) cagcgtggatgaagtgctggaactgctggcaggtcgtaagtaatccaatcccaccctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCt < 2:1582369‑M2/3‑1 (MQ=255) cgtggatgaagtgctggaactgctggcaggtcgtaagtaatccaatcccaccctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTAt < 2:1145774‑M2/6‑1 (MQ=255) cgtggatgaagtgctggaactgctggcaggtcgtaagtaatccaatcccaccctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTAt < 2:1232071‑M2/6‑1 (MQ=255) gaagtgctggaactgctggcaggtcgtaagtaatccaatcccaccctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCt < 1:564111‑M2/13‑1 (MQ=255) aagtgctggaactgctggcaggtcgtaagtaatccaatcccaccctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTa > 2:1675444‑M2/88‑101 (MQ=255) agtgctggaactgctggcaggtcgtaagtaatccaatcccaccctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTAc < 1:236445‑M2/15‑1 (MQ=255) agtgctggaactgctggcaggtcgtaagtaatccaatcccaccctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTAc < 2:1502882‑M2/15‑1 (MQ=255) gtgctggaactgctggcaggtcgtaagtaatccaatcccgccctctccacaaggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACa < 2:570403‑M2/16‑1 (MQ=255) gtgctggaactgctggcaggtcgtaagtaatccaatcccaccctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACa < 2:714722‑M2/16‑1 (MQ=255) gtgctggaactgctggcaggtcgtaagtaatccaatcccaccctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACa < 2:434127‑M2/16‑1 (MQ=255) gctggaactgctggcaggtcgtaagtaatccaatcccaccctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAgg < 2:728311‑M2/18‑1 (MQ=255) tggaactgctggcaggtcgtaagtaatccaatcccaccctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGAt > 1:810962‑M2/82‑101 (MQ=255) tggaactgctggcaggtcgtaagtaatccaatcccaccctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGAt < 1:253228‑M2/20‑1 (MQ=255) gaactgctggcaggtcgtaagtaatccaatcccaccctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGc > 1:559706‑M2/80‑101 (MQ=255) gaactgctggcaggtcgtaagtaatccaatcccaccctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGc > 1:625000‑M2/80‑101 (MQ=255) aactgctggcaggtcgtaagtaatccaatcccaccctctccacatggagaaggtggggttaattggctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCa > 2:369056‑M2/79‑101 (MQ=255) aactgctggcaggtcgtaagtaatccaatcccaccctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCa < 1:182418‑M2/23‑1 (MQ=255) ctgctggcaggtcgtaagtaatccaatcccaccctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATc > 2:1689657‑M2/77‑101 (MQ=255) tgctggcaggtcgtaagtaatccaatcccaccctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATca < 1:781339‑M2/26‑1 (MQ=255) gctggcaggtcgtaagtaatccaatcccaccctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATcac < 2:54048‑M2/27‑1 (MQ=255) tggcaggtcgtaagtaatccaatcccaccctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACaa > 2:1469944‑M2/73‑101 (MQ=255) ggcaggtcgtaagtaatccaatcccaccctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAAt < 1:1405257‑M2/30‑1 (MQ=255) gcaggtcgtaagtaatccaatcccaccctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAAtt > 1:260910‑M2/71‑101 (MQ=255) aggtcgtaaataatccaatcccaccctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATttg > 2:158578‑M2/69‑101 (MQ=255) tcggaagtaatccaatccccccctctccacatggagaaggtgggtttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATttgttg < 2:355504‑M2/36‑1 (MQ=255) cgtaagtaatccaatcccaccctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGa > 2:1321181‑M2/65‑101 (MQ=255) taagtaatccaatcccaccctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAAt > 2:200348‑M2/63‑101 (MQ=255) aagtaatccaatcccaccctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAAtt > 1:417522‑M2/62‑101 (MQ=255) agtaatccaatcccaccctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAAttt < 2:624995‑M2/41‑1 (MQ=255) gtaatccaatcccacccgctccgcatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTg < 1:1564678‑M2/42‑1 (MQ=255) taatccaatcccaccctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGc > 1:260825‑M2/59‑101 (MQ=255) aatccaatcccaccctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCa < 2:1312846‑M2/44‑1 (MQ=255) atccaatcccaccctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCAc > 1:1365054‑M2/57‑101 (MQ=255) tccaatcccaccctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACg < 1:134209‑M2/46‑1 (MQ=255) caatcccaccctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGtt < 1:1302567‑M2/48‑1 (MQ=255) caatcccaccctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGtt > 1:548365‑M2/54‑101 (MQ=255) tccccccctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCtt < 2:429606‑M2/51‑1 (MQ=255) cccctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAg < 2:836727‑M2/55‑1 (MQ=255) accctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAg > 2:348881‑M2/47‑101 (MQ=255) ccctctccacatggagaaggtgggtttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAgg < 2:790544‑M2/56‑1 (MQ=255) ccctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAgg < 2:1028824‑M2/56‑1 (MQ=255) ccctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAgg > 1:632445‑M2/46‑101 (MQ=255) cctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGc < 1:107083‑M2/57‑1 (MQ=255) cctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGc > 1:1214492‑M2/45‑101 (MQ=255) cctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGc > 2:245421‑M2/45‑101 (MQ=255) cctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGc > 1:1648126‑M2/45‑101 (MQ=255) ctctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGcc > 1:827355‑M2/44‑101 (MQ=255) tctccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCg < 2:1571807‑M2/59‑1 (MQ=255) ccacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGAt < 1:603751‑M2/62‑1 (MQ=255) cacatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATa > 1:1075411‑M2/39‑101 (MQ=255) acatggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATaa > 1:677785‑M2/38‑101 (MQ=255) atggagaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAgg < 2:1524643‑M2/66‑1 (MQ=255) agaaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCt > 2:343637‑M2/32‑101 (MQ=255) aaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTa > 2:1647875‑M2/30‑101 (MQ=255) aaggtggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTa < 1:1290258‑M2/72‑1 (MQ=255) tggggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTAcgcc > 1:1462759‑M2/26‑101 (MQ=255) gggttaattgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTAcgccgc > 1:213677‑M2/24‑101 (MQ=255) attgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCgg > 1:42689‑M2/18‑101 (MQ=255) attgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATACATCACAATTTGTTGAATTTGCCCGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCgg < 1:52426‑M2/84‑1 (MQ=255) ttgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGgc < 1:723868‑M2/85‑1 (MQ=255) tgcctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCggct > 1:269322‑M2/16‑100 (MQ=255) cctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGACGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCt > 1:449292‑M2/14‑101 (MQ=255) ctgatgcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTg < 1:830467‑M2/89‑1 (MQ=255) gcgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCct < 2:1631574‑M2/94‑1 (MQ=255) cgctacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCctc > 1:1360323‑M2/7‑101 (MQ=255) tacGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTctcc > 1:76869‑M2/4‑101 (MQ=255) acGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTctcct > 2:1146664‑M2/3‑101 (MQ=255) acGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTctcct > 1:240488‑M2/3‑101 (MQ=255) gCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGACGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCa > 1:381198/1‑101 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAATTTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCTCA > 42/1‑101 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |