| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 134 | = 12836 | 0 (0.000) | 387 (1.330) | 138/168 | -0.0 | 73.6% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 219 | = 1716 | 278 (0.530) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 815 total aligned reads displayed.
CGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCTTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTT > 219/1616‑1816 | cGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATaa < 1:878332/101‑1 (MQ=255) gTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTTCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAa < 1:208971‑M2/101‑2 (MQ=255) gTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAa < 1:632211‑M2/101‑2 (MQ=255) gTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAa < 2:1712106‑M2/101‑2 (MQ=255) tAATGAATTACGTGTTCACTCTTGATACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAat > 2:911180‑M2/1‑99 (MQ=255) tAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTTCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAat < 1:860764‑M2/101‑3 (MQ=255) aaTGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTTCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAatt < 1:232332‑M2/101‑4 (MQ=255) aaTGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAatt < 1:274545‑M2/101‑4 (MQ=255) aTGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTTCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattg > 1:149260‑M2/1‑97 (MQ=255) tGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattgt > 2:1451034‑M2/1‑96 (MQ=255) gAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattgtt < 2:630273‑M2/101‑7 (MQ=255) gAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattgtt > 1:459069‑M2/1‑95 (MQ=255) aaTTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattgtta > 2:425883‑M2/1‑94 (MQ=255) aaTTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattgtta > 1:1716169‑M2/1‑94 (MQ=255) aaTTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattgtta > 2:210738‑M2/1‑94 (MQ=255) aaTTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattgtta > 1:437577‑M2/1‑94 (MQ=255) aaTTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattgtta < 2:607805‑M2/101‑8 (MQ=255) aTTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattgttaa < 1:1180122‑M2/101‑9 (MQ=255) ttACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattgttaaa > 1:1059690‑M2/1‑92 (MQ=255) ttACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattgttaaa < 1:1475772‑M2/101‑10 (MQ=255) ttACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTACTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattgttaaa < 2:359932‑M2/101‑10 (MQ=255) aCGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattgttaaaga > 2:1133150‑M2/1‑90 (MQ=255) gtTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTTCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattgttaaagagcag > 2:40416‑M2/1‑86 (MQ=255) gtTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTTCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattgttaaagagcag < 2:1026871‑M2/101‑16 (MQ=255) gtTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattgttaaagagcag < 1:1660692‑M2/101‑16 (MQ=255) ttCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattgttaaagagcagt < 2:1332346‑M2/101‑17 (MQ=255) ctctTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCg > 2:754497/1‑101 (MQ=255) ctTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattgttaaagagcagtgccgct < 1:497254‑M2/101‑23 (MQ=255) gagaCTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattgttaaagagcagtgccgctttg > 2:1602051‑M2/1‑76 (MQ=255) agaCTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCgg > 1:414157/1‑101 (MQ=255) tGGTATTCATTTTTCGTCTTTCGACGTTAAGAATCTGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGAcgcgctttag > 2:658207/1‑95 (MQ=255) gTATTCATTTTTCGTCTTTCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGAcgcgctttagcg > 1:1639561/1‑93 (MQ=255) gTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAg < 1:607383/101‑1 (MQ=255) tATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattgttaaagagcagtgccgctttgctttttctc < 2:1360566‑M2/101‑35 (MQ=255) aTTCATTTTTCGTCTTTCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGAcgcgctttagcgca > 1:123228/1‑91 (MQ=255) aTTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattgttaaagagcagtgccgctttgctttttctca < 2:109637‑M2/101‑36 (MQ=255) ttCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattgttaaagagcagtgccgcttcgctttttctcag < 1:1086990‑M2/101‑37 (MQ=255) ttCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTc < 1:1103079/101‑1 (MQ=255) aTTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattgttaaagagcagtgccgcttcgctttttctcagcgg < 1:1002551‑M2/101‑40 (MQ=255) aTTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattgttaaagagcagtgccgcttcgctttttctcagcgg < 2:1051862‑M2/101‑40 (MQ=255) aTTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACt > 1:1510879/1‑101 (MQ=255) aTTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACt < 2:16812/101‑1 (MQ=255) aTTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACt < 1:1298913/101‑1 (MQ=255) tttttCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTg > 2:1656252/1‑101 (MQ=255) ttttCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGt > 2:1286779/1‑101 (MQ=255) tCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTcgc < 2:524176/101‑1 (MQ=255) cGTCTTGCGACGTTAAGAATCTGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattgttaaagagcagtgccgctttgctttttctcagcggcgcggg < 2:178191‑M2/101‑46 (MQ=255) cGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattgttaaagagcagtgccgctttgctttttctcagcggcgcggg > 1:56379‑M2/1‑56 (MQ=255) cGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattgttaaagagcagtgccgctttgctttttctcagcggcgcggg > 1:797340‑M2/1‑56 (MQ=255) cGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattgttaaagagcagtgccgctttgctttttctcagcggcgcggg > 1:692799‑M2/1‑56 (MQ=255) tCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAg < 1:1262010/101‑1 (MQ=255) cTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattgttaaagagcagtgccgctttgctttttctcagcggcgcggggtg > 1:535868‑M2/1‑53 (MQ=255) cTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAgg > 1:1592637/1‑101 (MQ=255) gTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattgttaaagagcagtgccgctttgctttttctcagcggcgcggggtgtgcataat < 2:1572635‑M2/101‑57 (MQ=255) gTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAattgttaaagagcagtgccgctttgctttttctcagcggcgcggggtgtgcataat < 1:377994‑M2/101‑57 (MQ=255) 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aattgttaaagagcagtgccgctttgctttttctcagcggcgcggggtgtgcataatacgctttcccgctacagagtcaagcatttatttttgctttctct > 2:33223‑M2/1‑1 (MQ=255) aattgttaaagagcagtgccgcttcgctttttctcagcggcgcggggtgtgcataatacgctttcccgctacagagtcaagcatttatttttgctttctct > 1:177295‑M2/1‑1 (MQ=255) aaTTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCTTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGAttt < 2:1510873/101‑1 (MQ=255) | CGTAATGAATTACGTGTTCACTCTTGAGACTTGGTATTCATTTTTCGTCTTGCGACGTTAAGAATCCGTATCTTCGAGTGCCCACACAGATTGTCTGATAAATTGTTAAAGAGCAGTTGCGACGCGGCTTTCAGCTCACTGTCGCGAGGTGGCGTATATTACGCTTTCCTCTTTCAGAGTCAACCCTGAATTTCAGGATTT > 219/1616‑1816 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |