New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 115 | 9586 = | 59 (0.870) | 30 (0.760) +TGCCTGATGCGACGCTTGCGCGTCTTATCAGGCCTAC |
20/126 | 1.0 | 61.8% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 87 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACTTGATATGGCCGATGGCGCGCGTCGGGTTCAGCCCCTTCGGACATACACTGACGCAGTTCATGATGCTGT > 87/1‑101 | ggtaatggcttgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcactggttgcctgatgcgacgcttgcgcgtcttatcaggcctacGGTTTACGCATTa < 1:740388‑M2/13‑1 (MQ=255) ggtaatggcttgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcactggttgcctgatgcgacgcttgcgcgtcttatcaggcctacGGTTTACGCATTa > 2:188442‑M2/89‑101 (MQ=255) gtaatggcttgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcactggttgcctgatgcgacgcttgcgcgtcttatcaggcctacGGTTTACGCATTAc > 2:448623‑M2/88‑101 (MQ=255) gtaatggcttgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcactggttgcctgatgcgacgcttgcgcgtcttatcaggcctacGGTTTACGCATTAc < 2:1067786‑M2/14‑1 (MQ=255) gtaatggcttgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcactggttgcctgatgcgacgcttgcgcgtcttatcaggcctacGGTTTACGCATTAc < 1:992729‑M2/14‑1 (MQ=255) ttgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcactggttgcctgatgcgacgcttgcgcgtcttatcaggcctacGGTTTACGCATTACGCTGcaac < 1:122120‑M2/22‑1 (MQ=255) ttgtaggccggataaggcgtccacgccgcatccgtcactggttgcctgatgcgacgcttgcgcgtcttatcatgcctacGGTTTACGCATTACGCTGcaac < 2:960969‑M2/22‑1 (MQ=255) tgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcactggttgcctgatgcgacgcttgcgcgtcttatcaggcctacGGTTTACGCATTACGCTGcaaca > 1:638738‑M2/79‑101 (MQ=255) ggccggataaggcgttcacgccgcatccggcactggttgcctgatgcgacgcttgcgcgtcttatcaggcctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACAt < 2:36536‑M2/27‑1 (MQ=255) ggataaggcgttcacgccgcatccggcactggctgcctgatgcgacgcttgcgcgtcttatcaggcctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGAc > 2:1607739‑M2/71‑101 (MQ=255) gataaggcgttcacgccgcatccggcactggttgcctgatgcgacgcttgcgcgtcttatcaggcctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACt < 1:419266‑M2/32‑1 (MQ=255) ccgatctgttcacgccgcatccggcactggttgcctgatgcgacgcttgcgcgtcttatcaggcctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACtt < 1:1467659‑M2/33‑1 (MQ=255) ataaggcgttcacgccgcatccggcactggttgcctgatgcgacgcttgcgcgtcttatcaggcctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACtt > 2:93620‑M2/69‑101 (MQ=255) aaggcgttcacgccgcatccggcactggttgcctgatgcgacgcttgcgcgtcttatcaggcctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACTTGa < 2:1146295‑M2/35‑1 (MQ=255) aaggcgttcacgccgcatccggcactggttgcctgatgcgacgcttgcgcgtcttatcaggcctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACTTGa > 1:756742‑M2/67‑101 (MQ=255) aggcgttcacgccgcatccggcactggttgcctgatgcgacgcttgcgcgtcttatcaggcctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACTTGat < 1:1601624‑M2/36‑1 (MQ=255) gcgttcacgccgcatccggcactggttgcctgatgcgacgcttgcgcgtcttatcaggcctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACTTGatat < 1:211945‑M2/38‑1 (MQ=255) cgttcacgccgcatccggcactggttgcctgatgcgacgcttgcgcgtcttatcaggcctacGGTTCACGCATTACGCTGCAACAACATCGACTTGATATg < 1:1365897‑M2/39‑1 (MQ=255) gttcacgccgcatccggcactggttgcctgatgcgacgcttgcgcgtcttatcaggcctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAAcatcgacttagatcgg > 2:1467653‑M2/62‑94 (MQ=255) ttcacgccgcatccggcactggttgcctgatgcgacgcttgcgcgtcttatcaggcctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACTTGATATGGc > 1:1293616‑M2/61‑101 (MQ=255) cgccgcatccggcactggttgcctgatgcgacgcttgcgcgtcttatcaggcctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACTTGATATGGCCGAt < 1:546004‑M2/45‑1 (MQ=255) ccgcatctggcactggttgcctgatgcgacgcttgcgcgtcttatcagtcctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACTTGATATGGCCGATgg < 1:1218185‑M2/47‑1 (MQ=255) gcatccggcactggctgcctgatgcgacgcttgggcgtcttatcaggcctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACTTGATATGGCCGATGgcg > 2:552346‑M2/53‑101 (MQ=255) atccggcactggttgcctgatgcgacgcttgcgcgtcttatcaggcctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACTTGATATGGCCGATGgcgcg > 1:298735‑M2/51‑101 (MQ=255) atccggcactggttgcctgatgcgacgcttgcgcgtcttatcaggcctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACTTGATATGGCCGATGgcgcg > 1:448239‑M2/51‑101 (MQ=255) actggttgcctgatgcgacgcttgcgcgtcttatcaggcctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACTTGATATGGCCGATGGCGCGCGTCggg > 2:854590‑M2/44‑101 (MQ=255) ggttgcctgatgcgacgcttgcgcgtcttatcaggcctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACTTGATATGGCCGATGGCGCGCGTCGGGTTc > 1:1354459‑M2/41‑101 (MQ=255) gttgcctgatgcgacgcttgcgcgtcttatcaggcctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACTTGATATGGCCGATGGCGCGCGTCGGGTTCa < 1:722888‑M2/62‑1 (MQ=255) ttgcctgatgcgacgcttgcgcgtcttatcaggcctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACTTGATATGGCCGATGGCGCGCGTCGGGTTCAg < 1:698162‑M2/63‑1 (MQ=255) ttgcctgatgcgacgcttgcgcgtcttatcaggcctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACTTGATATGGCCGATGGCGCGCGTCGGGTTCAg > 1:1375341‑M2/39‑101 (MQ=255) gcctgatgcgacgcttgcgcgtcttatcaggcctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACTTGATATGGCCGATGGCGCGCGTCGGGTTCAGcc < 2:839341‑M2/65‑1 (MQ=255) ctgatgcgacgcttgcgcgtcttatcaggcctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACTTGATATGGCCGATGGCGCGCGTCGGGTTCAGcccc < 2:1541955‑M2/67‑1 (MQ=255) tgatgcgacgcttgcgcgtcttatcaggcctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACTTGATATGGCCGATGGCGCGCGTCGGGTTCAGCCCCt < 1:288869‑M2/68‑1 (MQ=255) tgatgcgacgcttgcgcgtcttatcaggcctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACTTGATATGGCCGATGGCGCGCGTCGGGTTCAGCCCCt > 2:1088458‑M2/34‑101 (MQ=255) gatgcgacgcttgcgcgtcttatcaggcctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACTTGATATGGCCGATGGCGCGCGTCGGGTTCAGCCCCtt < 1:1525061‑M2/69‑1 (MQ=255) gatgcgacgcttgcgcgtcttatcaggcctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACTTGATATGGCCGATGGCGCGCGTCGGGTTCAGCCCCtt > 2:861252‑M2/33‑101 (MQ=255) atgcgacgcttgcgcgtcttatcaggcctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACTTGATATGGCCGATGGCGCGCGTCGGGTTCAGCCCCTTc < 1:1117697‑M2/70‑1 (MQ=255) gacgcttgcgcgtcttatcaggcctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACTTGATATGGCCGATGGCGCGCGTCGGGTTCAGCCCCTTCGGAc < 2:1368715‑M2/74‑1 (MQ=255) acgcttgcgcgtcttatcaggcctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACTTGATATGGCCGATGGCGCGCGTCGGGTTCAGCCCCTTCGGACa > 2:1539636‑M2/27‑101 (MQ=255) cgcttgcgcgtcttatcaggcctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACTTGATATGGCCGATGGCGCGCGTCGGGTTCAGCCCCTTCGGACAt < 2:1655204‑M2/76‑1 (MQ=255) gcgcgtcttatcaggcctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACTTGATATGGCCGATGGCGCGCGTCGGGTTCAGCCCCTTCGGACATACACt < 1:709278‑M2/81‑1 (MQ=255) gcgcgtcttatcaggcctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACTTGATATGGCCGATGGCGCGCGTCGGGTTCAGCCCCTTCGGACATACACt > 1:1420513‑M2/21‑101 (MQ=255) gcgcgtcttatcaggcctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACTTGATATGGCCGATGGCGCGCGTCGGGTTCAGCCCCTTCGGACATACACt < 1:265382‑M2/81‑1 (MQ=255) cgcgtcttatcaggcctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACTTGATATGGCCGATGGCGCGCGTCGGGTTCAGCCCCTTCGGACATACACTg > 1:551885‑M2/20‑101 (MQ=255) ttatcaggcctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACTTGATATGGCCGATGGCGCGCGTCGGGTTCAGCCCCTTCGGACATACACTGACGCAg < 2:1569366‑M2/88‑1 (MQ=255) tatcaggcctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACTTGATATGGCCGATGGCGCGCGTCGGGTTCAGCCCCTTCGGACATACACTGACGCAGt > 1:953572‑M2/13‑101 (MQ=255) atcaggcctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACTTGATATGGCCGATGGCGCGCGTCGGGTTCAGCCCCTTCGGACATACACTGACGCAGtt < 1:32114‑M2/90‑1 (MQ=255) caggcctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACTTGATATGGCCGATGGCGCGCGTCGGGTTCAGCCCCTTCGGACATACACTGACGCAGTTCa > 2:1363023‑M2/10‑101 (MQ=255) ggcctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACTTGATATGGCCGATGGCGCGCGTCGGGTTCAGCCCCTTCGGACATACACTGACGCAGTTcatc < 1:562809‑M2/94‑2 (MQ=255) gcctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACTTGATATGGCCGATGGCGCGCGTCGGGTTCAGCCCCTTCGGACATACACTGACGCAGTTCatga < 2:593437‑M2/95‑1 (MQ=255) cctacGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACTTGATATGGCCGATGGCGCGCGTCGGGTTCAGCCCCTTCGGACATACACTGACGCAGTTCatgat < 1:162317‑M2/96‑1 (MQ=255) acGGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACTTGATATGGCCGATGGCGCGCGTCGGGTTCAGCCCCTTCGGACATACACTGACGCAGTTCATGATGCt < 2:1661703‑M2/99‑1 (MQ=255) ggTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACTTGATATGGCCGATGGCGCGCGTCGGGTTCAGCCCCTTCGGACATACACTGACGCAGTTCATGATGCtgt > 1:814678/1‑101 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTTTACGCATTACGCTGCAACAACATCGACTTGATATGGCCGATGGCGCGCGTCGGGTTCAGCCCCTTCGGACATACACTGACGCAGTTCATGATGCTGT > 87/1‑101 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |