| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 113 | = 14494 | 24 (0.410) | 27 (0.680) +GGAGCATTTGTAGGCCTGATAAGACGCGGCAAG |
22/134 | 0.7 | 77.0% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 69 | = 23343 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
CTAATACTTTTAAACTCGGCCCCGGCGTGGATGTGAACTATATGCTGCACACGCAGAATAAGTGAGGTTGATGTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 69/23243‑23343 | cTAATACTTTTAAACTCGGCCCCGGCGTGGATGTGAACTATATGCTGCACACGCAGAATAAGTGAGGTTGATGTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACg > 1:1152985/1‑101 (MQ=255) tAATACTTTTAAACTCGGCCCCGGCGTGGATGTGAACTATATGCTGCACACGCAGAATAAGTGAGGTTGATGTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACGc < 2:634262‑M2/101‑2 (MQ=255) tAATACTTTTAAACTCGGCCCCGGCGTGGATGTGAACTATATGCTGCACACGCAGAATAAGTGAGGTTGATGTTTGGCCGCGCCAATGCCTAATGCGACGc < 1:1406943‑M2/101‑2 (MQ=255) aaTACTTTTAAACTCGGCCCCGGCGTGGATGTGAACTATATGCTGCACACGCAGAATAAGTGAGGTTGATGTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACGct < 2:1622736‑M2/101‑3 (MQ=255) aaTACTTTTAAACTCGGCCCCGGCGTGGATGTGAACTATATGCTGCACACGCAGAATAAGTGAGGTTGATGTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACGct < 2:416635‑M2/101‑3 (MQ=255) aaTACTTTTAAACTCGGCCCCGGCGTGGATGTGAACTATATGCTGCACACGCAGAATAAGTGAGGTTGATGTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACGct < 2:447198‑M2/101‑3 (MQ=255) aTACTTTTAAACTCGGCCCCGGCGTGGATGTGAACTATATGCTGCACACGCAGAATAAGTGAGGTTGATGTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACGctt > 2:853459‑M2/1‑98 (MQ=255) aTACTTTTAAACTCGGCCCCGGCGTGGATGTGAACTATATGCTGCACACGCAGAATAAGTGAGGTTGATGTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACGctt < 1:445555‑M2/101‑4 (MQ=255) cTTTTAAACTCGGCCCCGGCGTGGATGTGAACTATATGCTGCACACGCAGAATAAGTGAGGTTGATGTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACGcttgcc > 2:633366‑M2/1‑95 (MQ=255) ttttAAACTCGGCCCCGGCGTGGATGTGAACTATATGCTGCACACGCAGAATAAGTGAGGTTGATGTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACGcttgccg < 1:337183‑M2/101‑8 (MQ=255) cTCGGCCCCGGCGTGGATGTGAACTATATGCTGCACACGCAGAATAAGTGAGGTTGATGTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACGcttgccgcgtctta > 2:119347‑M2/1‑87 (MQ=255) cTCGGCCCCGGCGTGGATGTGAACTATATGCTGCACACGCAGAATAAGTGAGGTTGATGTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACGcttgccgcgtctta < 2:941558‑M2/101‑15 (MQ=255) ggCCCCGGCGTGGATGTGAACTATATGCTGCACACGCAGAATAAGTGAGGTTGATGTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACGcttgccgcgtcttatca < 2:958969‑M2/101‑18 (MQ=255) gCCCCGGCGTGGATGTGAACTATATGCTGCACACGCAGAATAAGTGAGGTTGATGTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACGcttgccgcgtcttatcag < 1:1048142‑M2/101‑19 (MQ=255) ggATGTGAACTATATGCTGCACACGCAGAATAAGTGAGGTTGATGTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACGcttgccgcgtcttatcaggcctacaaat > 1:1354074‑M2/1‑73 (MQ=255) aTGTGAACTATATGCTGCACACGCAGAATAAGTGAGGTTGATGTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACGcttgccgcgtcttatcaggcctacaaatgc < 2:645485‑M2/101‑31 (MQ=255) gtgAACTATATGCTGCACACGCAGAATAAGTGAGGTTGATGTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACGcttgccgcgtcttatcaggcctacaaatgctc > 1:1622742‑M2/1‑69 (MQ=255) tgAACTATATGCTGCACACGCAGAATAAGTGAGGTTGATGTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACGcttgccgcgtcttatcaggcctacaaatgctcc < 2:417859‑M2/101‑34 (MQ=255) gAACTATATGCTGCACACGCAGAATAAGTGAGGTTGATGTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACGcttgccgcgtcttatcaggcctacaaatgctccc > 2:488039‑M2/1‑67 (MQ=255) tataTGCTGCACACGCAGAATAAGTGAGGTTGATGTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACGcttgccgcgtcttatcaggcctacaaatgctccccgta < 2:1683629‑M2/101‑39 (MQ=255) atatGCTGCACACGCAGAATAAGTGAGGTTGATGTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACGcttgccgcgtcttatcaggcctacaaatgctccccgtag > 1:1597681‑M2/1‑62 (MQ=255) atatGCTGCACACGCAGAATAAGTGAGGTTGATGTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACGcttgccgcgtcttatcaggcctacaaatgctccccgtag < 2:1655031‑M2/101‑40 (MQ=255) atatGCTGCACACGCAGAATAAGTGAGGTTGATGTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACGcttgccgcgtcttatcaggcctacaaatgctccccgtag < 1:1118744‑M2/101‑40 (MQ=255) atGCTGCACACGCAGAATAAGTGAGGTTGATGTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACGcttgccgcgtcttatcaggcctacaaatgctccccgtaggc < 2:120829‑M2/101‑42 (MQ=255) tgctgcACACGCAGAATAAGTGAGGTTGATGTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACGcttgccgcgtcttatcaggcctacaaatgctccccgtaggcc < 2:1082702‑M2/101‑43 (MQ=255) gcACACGCAGAATAAGTGAGGTTGATGTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACGcttgccgcgtcttatcaggcctacaaatgctccccgtaggccggat > 2:989108‑M2/1‑55 (MQ=255) gcACACGCAGAATAAGTGAGGTTGATGTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACGcttgccgcgtcttatcaggcctacaaatgctccccgtaggccggat < 2:1246558‑M2/101‑47 (MQ=255) gcACACGCAGAATAAGTGAGGTTGATGTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACGcttgccgcgtcttatcaggcctacaaatgctccccgtaggccggat < 1:1528416‑M2/101‑47 (MQ=255) cacGCAGAATAAGTGAGGTTGATGTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACGcttgccgcgtcttatcaggcctacaaatgctccccgtaggccggataag > 2:1690818‑M2/1‑52 (MQ=255) cGCAGAATAAGTGAGGTTGATGTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACGcttgccgcgtcttatcaggcctacaaatgctccccgtaggccggataaggc > 1:543276‑M2/1‑50 (MQ=255) cAGAATAAGTGAGGTTGATGTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACGcttgccgcgtcttatcaggcctacaaatgctccccgtaggccggataaggcgt > 2:115293‑M2/1‑48 (MQ=255) aGAATAAGTGAGGTTGATGTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACGcttgccgcgtcttatcaggcctacaaatgctccccgtaggccggataaggcgtt < 1:150106‑M2/101‑55 (MQ=255) gAATAAGTGAGGTTGATGTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACGcttgccgcgtcttatcaggcctacaaatgctccccgtaggccggataaggcgttt > 2:1259494‑M2/1‑46 (MQ=255) aaTAAGTGAGGTTGATGTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACGcttgccgcgtcttatcaggcctacaaatgctccccgtaggccggataaggcgttta > 1:1290228‑M2/1‑45 (MQ=255) aaTAAGTGAGGTTGATGTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACGcttgccgcgtcttatcaggcctacaaatgctccccgtaggccggataaggcgttta < 2:1276758‑M2/101‑57 (MQ=255) aTAAGTGAGGTTGATGTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACGcttgccgcgtcttatcaggcctacaaatgctccccgtaggccggataaggcgtttac > 1:104656‑M2/1‑44 (MQ=255) aaGTGAGGTTGATGTTTGGCCGCGCCAATCCCTGATGCGACGcttgccgcgtcttatcaggcctacacatgctccccgtaggccggataaggcgtttacgc < 2:1118736‑M2/101‑60 (MQ=255) aGTGAGGTTGATGTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACGcttgccgcgtcttatcaggcctacaaatgctccccgtaggccggataaggcgtttacgcc < 1:262081‑M2/101‑61 (MQ=255) gTTGATGTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACGcttgccgcgtcttatcaggcctacaaatgctccccgtaggccggataaggcgtttacgccgcatcc < 2:776818‑M2/101‑67 (MQ=255) tGATGTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACActtgccgcgtcttatcaggcctacaaatgctccccgtaggccggataaggcgtttacgccgcatccgg > 2:261559‑M2/1‑33 (MQ=255) aTGTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACGcttgccgcgtcttatcaggcctacaaatgctccccgtaggccggataaggcgtttacgccgcatccggca > 2:445550‑M2/1‑31 (MQ=255) gTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACGcttgccgcgtcttatcaggcctacaaatgctccccgtaggccggataaggcgtttacgccgcatccggcaac < 1:655931‑M2/101‑73 (MQ=255) ttGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACGcttgccgcgtcttatcaggcctacaaatgctccccgtaggccggataaggcgtttacgccgcatccggcaaccg > 1:920652‑M2/1‑27 (MQ=255) tGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACGcttgccgcgtcttatcaggcctacaaatgctccccgtaggccggataaggcgtttacgccgcatccggcaaccgt > 1:958974‑M2/1‑26 (MQ=255) tGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACGcttgccgcgtcttatcaggcctacaaatgctccccgtaggccggataaggcgtttacgccgcatccggcaaccgt > 1:516577‑M2/1‑26 (MQ=255) | CTAATACTTTTAAACTCGGCCCCGGCGTGGATGTGAACTATATGCTGCACACGCAGAATAAGTGAGGTTGATGTTTGGCCGCGCCAATGCCTGATGCGACG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 69/23243‑23343 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |