| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 110 | = 15236 | 0 (0.000) | 43 (0.800) +GCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACA |
37/150 | 0.5 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 131 | = 13095 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
TATTTGGTTGACCAGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 131/12995‑13095 | tatTTGGTTGACCAGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGt > 1:760683/1‑101 (MQ=255) aTTTGGTTGACCAGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTt < 2:1453698‑M2/101‑2 (MQ=255) ttGGTTGACCAGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgt < 1:47353‑M2/101‑4 (MQ=255) tGGTTGACCAGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgta > 1:1706623‑M2/1‑97 (MQ=255) ggTTGACCAGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtag > 1:152857‑M2/1‑96 (MQ=255) tGACCAGTTTTCGTTTTTTTGCCCCCCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTACCGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggcc > 2:1385445‑M2/1‑93 (MQ=255) tGACCAGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggcc < 2:530557‑M2/101‑9 (MQ=255) tGACCAGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggcc > 2:883509‑M2/1‑93 (MQ=255) gACCAGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccg < 2:421874‑M2/101‑10 (MQ=255) aCCAGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccgg < 1:817080‑M2/101‑11 (MQ=255) ccAGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccgga < 1:28063‑M2/101‑12 (MQ=255) cAGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggat > 2:862916‑M2/1‑89 (MQ=255) cAGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggat > 2:1682634‑M2/1‑89 (MQ=255) aGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggata < 1:1479012‑M2/101‑14 (MQ=255) aGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggata < 2:1376438‑M2/101‑14 (MQ=255) ttttCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggataag > 2:101811‑M2/1‑86 (MQ=255) ttttCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggataag < 1:237586‑M2/101‑16 (MQ=255) ttCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggataaggc < 1:605755‑M2/101‑18 (MQ=255) tCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggataaggcg < 2:158878‑M2/101‑19 (MQ=255) tttttGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggattaggcgttcac < 2:844804‑M2/101‑24 (MQ=255) cccACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggataaggcgttcacgccgca < 2:283025‑M2/101‑30 (MQ=255) ccTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccg < 2:1240296‑M2/101‑34 (MQ=255) ccTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccg > 2:640770‑M2/1‑68 (MQ=255) tGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggc < 1:1243431‑M2/101‑36 (MQ=255) gTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggca < 2:1530030‑M2/101‑37 (MQ=255) gTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcaaaaa < 1:325999‑M2/101‑41 (MQ=255) ccAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcaaaaattt < 1:131955‑M2/101‑44 (MQ=255) aaCTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcaaaaatttga < 1:794850‑M2/101‑46 (MQ=255) ttCCTGTGTTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcaaaaatttgatta > 1:244023‑M2/1‑53 (MQ=255) ttCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcaaaaatttgatta > 1:1192893‑M2/1‑53 (MQ=255) tCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcaaaaatttgattaa < 2:814073‑M2/101‑50 (MQ=255) tCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgaaggccggataaggcgttcacgccgcatccgcccaaaatttgattaa < 1:1024169‑M2/101‑50 (MQ=255) cAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcaaaaatttgattaacc < 1:246643‑M2/101‑52 (MQ=255) ggcTAATGGTATAGTCTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAAGTGACCGTtataggcctgataaggcgttcatgccgcatccggcaaaaatttgattaaccgca > 2:1403690‑M2/2‑47 (MQ=255) gCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcaaaaatttgattaaccgcac > 1:831192‑M2/1‑46 (MQ=255) tAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcaaaaatttgattaaccgcacct < 1:336991‑M2/101‑58 (MQ=255) tAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcaaaaatttgattaaccgcacct < 1:920742‑M2/101‑58 (MQ=255) tGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcaaaaatttgattaaccgcacctaac < 1:1255395‑M2/101‑61 (MQ=255) ggTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcaaaaatttgattaaccgcacctaacg < 1:306229‑M2/101‑62 (MQ=255) gTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcaaaaatttgattaaccgcacctaacgg < 1:1362549‑M2/101‑63 (MQ=255) tataGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcaaaaatttgattaaccgcacctaacgga > 2:421691‑M2/1‑38 (MQ=255) ataGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcaaaaatttgattaaccgcacctaacggac > 1:1487237‑M2/1‑37 (MQ=255) taGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcaaaaatttgattaaccgcacctaacggaca < 1:868066‑M2/101‑66 (MQ=255) gTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcaaaaatttgattaaccgcacctaacggacaca > 1:530562‑M2/1‑34 (MQ=255) tttGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcaaaaatttgattaaccgcacctaacggacacaa > 2:988060‑M2/1‑33 (MQ=255) agaTTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcaaaaatttgattaaccgcacctaacggacacaacacc < 2:46086‑M2/101‑73 (MQ=255) agaTTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcaaaaatttgattaaccgcacctaacggacacaacacc < 1:755030‑M2/101‑73 (MQ=255) gaTTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcaaaaatttgattaaccgcacctaacggacacaacacca > 1:452314‑M2/1‑28 (MQ=255) aaCGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcaaaaatttgattaaccgcacctaacggacacaacaccatgaa < 1:1076987‑M2/101‑78 (MQ=255) cGGGGGCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcaaaaatttgattaaccgcacctaacggacacaacaccatgaaat > 1:70370‑M2/1‑22 (MQ=255) gggggCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcaaaaatttgataaaccgcacctaacggacacaacaccatgaaatc > 2:347545‑M2/1‑21 (MQ=255) gggCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcaaaaatttgattaaccgcacctaacggacacaacaccatgaaatctg > 1:895231‑M2/1‑19 (MQ=255) gggCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcaaaaatttgattaaccgcacctaacggacacaacaccatgaaatctg > 2:1439733‑M2/1‑19 (MQ=255) gCCGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcaaaaatttgattaaccgcacctaacggacacaacaccatgaaatctgcc > 2:1667668‑M2/1‑17 (MQ=255) ccGTAAAATTGCCCGTtgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcaaaaatttgattaaccgcacctaacggacacaacaccatgaaatctgcca > 1:814078‑M2/1‑16 (MQ=255) gTAAAATTGCCCGTtgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcaaaaatttgattaaccgcacctaacggacacaacaccatgaaatctgccacc > 2:794845‑M2/1‑14 (MQ=255) tAAAATTGCCCGTtgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcaaaaatttgattaaccgcacctaacggacacaacaccatgaaatctgccacct > 2:569185‑M2/1‑13 (MQ=255) tAAAATTGCCCGTtgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcaaaaatttgattaaccgcacctaacggacacaacaccatgaaatctgccacct > 1:1477556‑M2/1‑13 (MQ=255) aaTTGCCCGTtgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcaaaaatttgattaaccgcacctaacggacacaacaccatgaaatctgccacctctg < 2:210728‑M2/101‑92 (MQ=255) aTTGCCCGTtgtaggccggatgaggcgttcacgccgcatccggcaaaaatttgattaaccgcacctaacggacacaacaccatgaaatctgccacctctgc > 2:1203992‑M2/1‑9 (MQ=255) gCCCGTtgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcaaaaatttgattaaccgcacctaacggacacaacaccatgaaatctgccacctctgcgca < 1:299614‑M2/101‑96 (MQ=255) cGTtgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcaaaaatttgattaaccgcacctaacggacacaacaccatgaaatctgccacctctgcgcaaag > 1:395459‑M2/1‑3 (MQ=255) gTtgtaggccggataaggcgttcacgccgcatccggcaaaaatttgattaaccgcacctaacggacacaacaccatgaaatctgccacctctgcgcaaaga < 2:556981‑M2/101‑100 (MQ=255) | TATTTGGTTGACCAGTTTTCGTTTTTTTGCCCACCTGTACGTGCCAACTTCCAGTGCTAATGGTATAGTTTGAGATTAACGGGGGCCGTAAAATTGCCCGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 131/12995‑13095 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |