New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 106 | 14 = | 4 (0.070) | 48 (1.000) | 34/172 | 0.5 | 96.5% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 155 | 15 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGACCATCATCCAGCAACGCTTTCATTGGCGAAAATTCA > 155/1‑114 | tggctgcggcgcaaccggctgttgtggctgctgatactgcggctgcggcggaactggttgttgcggctgctgatattgctgctgcggTGCAACCCggtgtt > 2:124673‑M2/88‑101 (MQ=255) ggctgcggcgcaaccggctgttgtggctgctgatactgcggctgcggcggaactggttgttgcggctgctgatattgctgctgcggTGCAACCGGttgttg < 2:1477771‑M2/15‑1 (MQ=255) cggcgcaaccggctgttgtggctgctgatactgcggctgcggcggaactggttgttgcggctgctgatattgctgctgcggTGCAACCGGTTGTTGCGgct < 2:1448045‑M2/20‑1 (MQ=255) cggcgcaaccggctgttgtggctgctgatactgcggctgcggcggaactggttgttgcggctgctgatattgctgctgcggTGCAACCGGTTGTTGCGgct < 1:1662560‑M2/20‑1 (MQ=255) ggcgcaactggctgttgtggctgctgatactgctgctgcggcgcaaccggttgttgcggctgctgatattgctgctgcggCGCAACCGGTTGTTGCGgctg > 1:961568‑M2/81‑101 (MQ=255) cgcaactggctgttgtggctgctgatactgctgctgcggcgcaaccggttgttgcggctgctgatattgctgctgcggCGCAACCGGTTGTTGCGgctgct > 2:1037671‑M2/79‑101 (MQ=255) cgcaaccggttgttgcggctgctgatattgctgctgcggcgcaaccggttgttgcggctgctgatattgtggctgcggCGCAACCGGCTGTTGTGgctgct < 1:329720‑M2/23‑1 (MQ=255) gcaaccggttgttgcggctgctgatattgctgctgcggcgcaaccggttgttgcggctgctgatattgtggctgcggCGCAACCGGCTGTTGTGGctgctg < 1:900868‑M2/24‑1 (MQ=255) gcaaccggctgttgtggctgctgatactgcggctgcggcggaactggttgttgcggctgctgatattgctgctgcggTGCAACCGGTTGTTGCggcttctt > 1:495586‑M2/78‑100 (MQ=255) caactggctgttgtggctgctgatactgctgctgcggcgcaaccggttgttgcggctgctgatattgctgctgcggCGCAACCGGTTGTTGCGgctgctgg > 2:303339‑M2/77‑100 (MQ=255) caactggctgttgtggctgctgatactgctgctgcggcgcaaccggttgttgcggctgctgataatgctgctgcggCGCAACCGGTTGTTGCGgctgctga > 1:5788‑M2/77‑100 (MQ=255) aactggctgttgtggctgctgatgctgctgctgcggcgcaaccggttgttgcggctgctgatattgctgctgcggCGCAACCGGTTGTTGCggctgctgat < 2:609899‑M2/26‑3 (MQ=255) accggctgttgtggctgctgatactgcggctgcggcggaactggttgttgcggctgctgatattgctgctgcggTGCAACCGGGTGTTGCGGGtggtgttc > 2:590126‑M2/75‑99 (MQ=255) ctggctgttgtggctgctgatactgctgctgcggcgcaaccggttgttgcggctgctgatattgccgctgcggCGCAACCGGATGTTgcggctgctgatat < 2:1472380‑M2/28‑5 (MQ=255) cggctgttgtggctgctgatactgcggctgcggcggaactggttgttgcggctgctgatattgctgctgcggTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAg < 1:1450874‑M2/29‑1 (MQ=255) ggctgttgtggcttctgatactgctgctgcggcgctaccggttgttgcggctgctgatattgctgctgccgCGCAACCGGTTGttgcggctgctgatattg < 2:184815‑M2/30‑7 (MQ=255) ggctgttgtggctgctgatactgcggctgcggcggaactggttgttgcggctgctgatattgctgctgcggTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAgg < 1:968089‑M2/30‑1 (MQ=255) gctgttgtggctgctgatactgcggctgcggcggaactggttgttgcggctgctgatattgctgctgcggTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGt < 1:1431479‑M2/31‑1 (MQ=255) gtgttgtggctgctgatactgcggctgcggcggaactggttgttgcggctgctgatattgctgctgcggTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGtt < 2:180559‑M2/32‑1 (MQ=255) ctgttgtggctgctgatactgctgctgcggcgcaaccggttgttgcggctgctgatattgctgctgcggCGCAACCGGTtgttgcggctgctggtattgtg > 1:422127‑M2/70‑93 (MQ=255) ctgttgtggctgctgatactgcggctgcggcggaactggttgttgcggctgctgatattgctgctgcggTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGGTGTAcagggt > 1:1466910‑M2/70‑99 (MQ=255) tgttgtggctgctgatactgcggctgcggcggaactggttgttgcggctgctgatattgctgctgcggTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTc < 2:1118767‑M2/33‑1 (MQ=255) gctgctgatactgcggctgcggcggaactggttgttgcggctgctgatattgctgctgcggTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGGTCAACAAtt > 2:1102486‑M2/62‑101 (MQ=255) gctgctgatactgcggctgcggcggaactggttgttgcggctgctgatattgctgccgcggGGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAAtt > 2:275273‑M2/62‑101 (MQ=255) ctgctgatactgcggctgcggcggaactggttgttgcggctgctgatattgctgctgcggTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTg < 2:101476‑M2/41‑1 (MQ=255) tgctgatactgcggctgcggcggaactggttgttgcggctgctgatattgctgctgcggTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTgg < 1:1680622‑M2/42‑1 (MQ=255) gctgatactgcggctgcggcggaactggttgttgcggctgctgatattgctgctgcggTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGc < 1:124673‑M2/43‑1 (MQ=255) ctgatactgcggctgcggcggaactggttgttgcggctgctgatattgctgctgcggTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCg < 2:852416‑M2/44‑1 (MQ=255) ctgatactgcggctgcggcggaactggttgttgcggctgctgatattgctgctgcggTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGGTCAacaatttggg > 2:1376658‑M2/58‑97 (MQ=255) atactgcggctgcggcggaactggttgttgcggctgctgatattgctgctgcggTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTaa > 2:1315619‑M2/55‑101 (MQ=255) tgcggctgcggcggaactggttgttgcggctgctgatattgctgctgcggTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAaacaa < 2:387506‑M2/51‑1 (MQ=255) gaactggttgttgcggctgctgatattgctgctgcggTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGa > 1:268870‑M2/38‑101 (MQ=255) aactggttgttgcggctgctgatattgctgctgcggTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGAc > 2:1676893‑M2/37‑101 (MQ=255) actggttgttgcggctgctgatattgctgctgcggTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGAcc < 1:1244577‑M2/66‑1 (MQ=255) ctggttgttgcggctgctgatattgctgctgcggTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTTGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGACca > 1:1440474‑M2/35‑101 (MQ=255) gttgcggctgctgatattgctgctgcggTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGACCATCATcc < 1:1272004‑M2/73‑1 (MQ=255) gcggctgctgatattgctgctgcggTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGACCATCATCCAGc < 1:590131‑M2/76‑1 (MQ=255) ggctgctgatattgctgctgcggTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGACCATCATCCAGCaa < 2:495581‑M2/78‑1 (MQ=255) gctgctgatattgctgctgcggTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGACCATCATCCAGCAAc < 1:1315625‑M2/79‑1 (MQ=255) ctgctgatattgctgctgcggTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGACCATCATCCAGCAACg > 1:305396‑M2/22‑101 (MQ=255) ctgctgatattgctgctgcggTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGACCATCATCCAGCAACg > 1:1711241‑M2/22‑101 (MQ=255) ctgctgatattgctgctgcggTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGACCATCATCCAGCAACg > 1:1457227‑M2/22‑101 (MQ=255) tgctgatattgctgctgcggTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGACCATCATCCAGCAACGc > 1:436180‑M2/21‑101 (MQ=255) gctgatattgctgctgcggTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGACCATCATCCAGCAACGCt > 2:504440‑M2/20‑101 (MQ=255) gctgatattgctgctgcggCGCAACCGGTTCTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGACCATCATCCAGCAACGCt < 2:952494‑M2/82‑1 (MQ=255) ctgatattgctgctgcggTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGACCATCATCCAGCAACGCtt > 2:329136‑M2/19‑101 (MQ=255) gatattgctgctgcggTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGACCATCATCCAGCAACGCTTTc > 1:506633‑M2/17‑101 (MQ=255) atattgctgctgcggTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGACCATCATCCAGCAACGCTTTCa > 2:1346991‑M2/16‑101 (MQ=255) tattgctgctgcggTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGACCATCATCCAGCAACGCTTTCAt > 2:1365098‑M2/15‑101 (MQ=255) attgctgctgcggTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGACCATCATCCAGCAACGCTTTCAtt > 1:1444297‑M2/14‑101 (MQ=255) ttgctgctgcggTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGACCATCATCCAGCAACGCTTTCATTg > 2:970425‑M2/13‑101 (MQ=255) tgctgctgcggTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGACCATCATCCAGCAACGCTTTCATTgg < 2:563398‑M2/90‑1 (MQ=255) gTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGGCCATCATCCAGCCACGCTTTCATTGGCGAAAATTCa > 2:779749‑M2/2‑101 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TATTGCTGCTGCGGTGCAACCGGTTGTTGCGGCTGCTGTACAGGTTCAACAATTGGCGTAAACAACGGTTCGTGTGGACCATCATCCAGCAACGCTTTCATTGGCGAAAATTCA > 155/1‑114 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |