| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 101 | = 16326 | 0 (0.000) | 64 (1.120) | 46/168 | 0.0 | 76.6% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 178 | = 5270 | 39 (0.590) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 224 total aligned reads displayed.
ATTCAGGCGAATGCTGTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAATTTTCAGATAACCGCCACGCCGCATCTTGCGGTTTATGATCCGACGGTACAGTTTGAGTTCTGGTTCTCGGAAAAGCGGATTG > 178/5167‑5370 | aTTCATGCGAATGGTGTTTAC‑‑GTTTTTTTACTGGTTGAAACTG‑TTTTGTCTTGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTa > 1:851959/1‑101 (MQ=255) cAGGCGAATGCTGTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTa > 1:306919/1‑101 (MQ=255) gCGAATGCTGTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTG > 2:323216‑M1/1‑101 (MQ=255) gCGAATGCTGTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTG < 2:1228189‑M1/101‑1 (MQ=255) cGAATGCTGTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGC > 2:328391‑M1/1‑101 (MQ=255) gAATGGTGTTTAC‑‑GTTTTTTTACTGGTTGAAACTG‑TTTTGTCTTGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGG < 2:498552‑M1/101‑1 (MQ=255) gAATGGTGTTTAC‑‑GTTTTTTTACTGGTTGAAACTG‑TTTTGTCTTGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGG < 1:1504062‑M1/101‑1 (MQ=255) aaTGCTGTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTG > 2:354429‑M1/1‑101 (MQ=255) aTGCTGTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGCCATGTGGGTAACTTCGGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCGGCGTGTCCACTATTGCTGG > 1:253755‑M1/1‑101 (MQ=255) gCTGTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGT < 1:750969‑M1/101‑1 (MQ=255) cTGTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTA < 1:828325‑M1/101‑1 (MQ=255) gTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAG > 1:128923‑M1/1‑101 (MQ=255) gTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAG > 1:1055996‑M1/1‑101 (MQ=255) gTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAG > 1:594668‑M1/1‑101 (MQ=255) tttACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGA > 1:1208567‑M1/1‑101 (MQ=255) tttacgtttttttactggttGAAACTG‑TTTTGTCTTGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCA > 1:518817‑M1/8‑101 (MQ=255) tACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATC > 2:571636‑M1/1‑101 (MQ=255) tACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATC < 2:762800‑M1/101‑1 (MQ=255) tACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATC < 2:1343545‑M1/101‑1 (MQ=255) aCGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCA < 1:1258392‑M1/101‑1 (MQ=255) cGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAt > 1:1351870‑M1/1‑100 (MQ=255) cGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAt > 2:178354‑M1/1‑100 (MQ=255) cGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAt < 2:1574896‑M1/101‑2 (MQ=255) cGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAt < 2:239787‑M1/101‑2 (MQ=255) ggggTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTAttgctgggtaagatcagt < 1:1219255‑M2/101‑19 (MQ=255) ggggTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAtg < 2:1371493‑M1/101‑3 (MQ=255) ggggTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAAt > 2:288615/1‑101 (MQ=255) ggggTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGCGAGTCACATCTGACTGAGAGGTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAAt > 2:1453186/1‑101 (MQ=255) ntttttttacTGGTTGAAACTG‑TTTTGTCTTGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAcaaca > 1:981991‑M1/3‑96 (MQ=255) gtttttttacTGGTTGAAACTG‑TTTTGTCTTGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAcaaca > 2:778324‑M1/3‑96 (MQ=255) ggTTTTTTGCTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAATCACCTCTGACTGAGAGTTTGCTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAtgac < 2:1062332‑M1/101‑5 (MQ=255) ggTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTAttgctgggtaagatcagttt < 2:1579250‑M2/101‑21 (MQ=255) ggTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAtaga < 1:1601416‑M1/101‑5 (MQ=255) tttttttaCTGGTTGAAACTG‑TTTTGTCTTGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAcaacac < 2:541252‑M1/100‑7 (MQ=255) gTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAAtttt > 1:109547/1‑101 (MQ=255) ttttttACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTAttgctgggtaagatcagttttc < 2:774377‑M2/101‑23 (MQ=255) tttttACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAtgactcg < 1:689476‑M1/101‑8 (MQ=255) tttttACTGGTTGAAACTG‑TTTTGTCTTGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAcaacactt > 2:1197758‑M1/1‑93 (MQ=255) ttttACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAtgactcgc > 1:499293‑M1/1‑93 (MQ=255) tttACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTAttgctgggtaagatcagttttccag > 2:410360‑M2/1‑76 (MQ=255) aCTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAtagatgctacgg > 1:1334126‑M1/1‑89 (MQ=255) aCTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAATTTTCAGATaa > 1:142119/1‑101 (MQ=255) cTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTAttgctgggtaagatcagttttccagtccg < 2:1234677‑M2/101‑30 (MQ=255) cTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAATTTTCAGATAAc > 1:893148/1‑101 (MQ=255) ggTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTAttgctgggtaagatcagttttccagtccggg > 2:1651574‑M2/1‑70 (MQ=255) tGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAtagatgctacggatatcc < 2:1691891‑M1/101‑19 (MQ=255) gATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAtagatgctacggatatcca > 2:116617‑M1/1‑82 (MQ=255) tACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAtagatgctacggatatccata > 2:1036583‑M1/1‑80 (MQ=255) aCTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAATTTTCAGATAACCGCCAcgcc > 1:1718760/1‑101 (MQ=255) gTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAtagatgctacggatatccatatcca > 2:10861‑M1/1‑76 (MQ=255) tttttGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAATTTTCAGATAACCGCCACGCCGCAt > 2:888639/1‑101 (MQ=255) tttGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAtagatgctacggatatccatatccagaa > 2:676546‑M1/1‑73 (MQ=255) tGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTAttgctgggtaagatcagttttccagtccgggctggatcaaaccttt > 1:1462383‑M2/1‑55 (MQ=255) gTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTAttgctgggtaagatcagttttccagtccgggctggatcaaacctttc > 2:1398322‑M2/1‑54 (MQ=255) cATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTAttgctgggtaagatcagttttccagtccgggctggatcaaacctttcag > 1:1571986‑M2/1‑52 (MQ=255) aTGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTAttgctgggtaagatcagttttccagtccgggctggatcaaacctttcagg > 2:1146579‑M2/1‑51 (MQ=255) tgtgAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAtagatgctacggatatccatatccagaacttcagc > 2:1142764‑M1/1‑66 (MQ=255) gtgAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTAttgctgggtaagatcagttttccagtccgggctggatcaaacctttcaggta > 2:1486207‑M2/1‑49 (MQ=255) tgAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAtagatgctacggatatccatatccagaacttcagcaa > 1:1165161‑M1/1‑64 (MQ=255) tgAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAATTTTCAGATAACCGCCACGCCGCATCTTGCGGTTTa > 1:1474692/1‑101 (MQ=255) aGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTAttgctgggtaagatcagttttccagtccgggctggatcaaacctttcaggtagaa < 2:1157291‑M2/101‑56 (MQ=255) aGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAtagatgctacggatatccatatccagaacttcagcaatc < 1:448153‑M1/101‑40 (MQ=255) tCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAtagatgctacggatatccatatccagaacttcagcaatctg > 2:955294‑M1/1‑60 (MQ=255) cACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAATTTTCAGATAACCGCCACGCCGCATCTTGCGGTTTATGATc < 2:1630176/101‑1 (MQ=255) ccTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAtagatgctacggatatccatatccagaacttcagcaatctgata < 1:1668447‑M1/101‑45 (MQ=255) ctctGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAATTTTCAGATAACCGCCACGCCGCATCTTGCGGATTATGATCCGa > 2:751498/1‑101 (MQ=255) actgaGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTAttactgggtaagatccgttttccagtccgggctggatcaaacctttcaggtagacaagcgccctca < 2:1006109‑M2/101‑67 (MQ=255) actgaGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAtagatgctacggatatccatatccagaacttcagcaatctgatatggatt < 2:436114‑M1/101‑51 (MQ=255) actgaGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAtagatgctacggatatccatatccagaacttcagcaatctgatatggatt > 1:454085‑M1/1‑51 (MQ=255) ctgaGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTAttgctgggtaagatcagttttccagtccgggctggatcaaacctttcaggcagaaaagcgccctcac < 1:943323‑M2/101‑68 (MQ=255) tgaGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAtagatgctacggatatccatatccagaacttcagcaatctgatatggattat < 1:63139‑M1/101‑53 (MQ=255) gagaGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAtagatgctacggatatccatatccagaacttcagcaatctgatatggattata < 2:925487‑M1/101‑54 (MQ=255) agagTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTAttgctgggtaagatcagttttccagtccgggctggatcaaacctttcaggtagaaaagcgccctcaccca < 2:1025242‑M2/101‑71 (MQ=255) agagTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTAttgctgggtaagatcagttttccagtccgggctggatcaaacctttcaggtagaaaagcgccctcaccca < 1:920772‑M2/101‑71 (MQ=255) gagTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTAttgctgggtaagatcagttttccagtccgggctggatcaaacctttcaggtagaaaagcgccctcacccac > 2:1283850‑M2/1‑30 (MQ=255) agTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTAttgctgggtaagatcagttttccagtccgggctggatcaaacctttcaggtagaaaagcgccctcacccact < 1:1649552‑M2/101‑73 (MQ=255) gTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAATTTTCAGATAACCGCCACGCCGCATCTTGCGGTTTATGATCCGACGGTACAGTTTg > 1:315349/1‑101 (MQ=255) tACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAATTTTCAGATAACCGCCACGCCGCATCTTGCGGTTTATGATCCGACGGTACAGTTTGAGt > 1:894162/1‑101 (MQ=255) cTCACTTAGCCGCGTGTCCACTAttgctgggtaagatcagttttccagtccgggctggatcaaacctttcaggtagaaaagcgccctcacccacttaatgc < 2:808509‑M2/101‑79 (MQ=255) tCACTTAGCCGCGTGTCCACTAttgctgggtaagatcagttttccagtccgggctggatcaaacctttcaggtagaaaagcgccctcacccacttaatgcg < 2:956949‑M2/101‑80 (MQ=255) tCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAATTTTCAGATAACCGCCACGCCGCATCTTGCGGTTTATGATCCGACGGTACAGTTTGAGTTCt < 1:1195941/101‑1 (MQ=255) aCTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAtagatgctacggatatccatatccagaacttcagcaatctgatatggattataaccagaaaccat < 2:1077670‑M1/101‑66 (MQ=255) cTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAATTTTCAGATAACCGCCACGCCGCATCTTGCGGTTTATGATCCGACGGTACAGTTTGAGTTCTGGt < 1:586104/101‑1 (MQ=255) ccGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAtagatgctacggatatccatatccagaacttcagcaatctgatatggattataaccagaaaccatataccc > 2:1432826‑M1/1‑30 (MQ=255) ccGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAATTTTCAGATAACCGCCACGCCGCATCTTGCGGTTTATGATCAGACGGTACAGTTTGAGTTCTGGTTCTCg > 1:783586/1‑101 (MQ=255) cgcgTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAATTTTCAGATAACCGCCACGCCGCATCTTGCGGTTTATGATCCGACGGTACAGTTTGAGTTCTGGTTCTCgg > 1:1016486/1‑101 (MQ=255) gtgtCCACTATTGCTGGGTAAGATCAtagatgctacggatatccatatccagaacttcagcaatctgatatggattataaccagaaaccatataccccatt > 1:733174‑M1/1‑26 (MQ=255) gtCCACTATTGCTGGGTAAGATCAtagatgctacggatatccatatccagaacttcagcaatctgatatggattataaccagaaaccatataccccattat > 1:485671‑M1/1‑24 (MQ=255) ccACTATTGCTGGGTAAGATCAtagatgctacggatatccatatccagaacttcagcaatctgatatggattataaccagaaaccatataccccattatgg < 2:861521‑M1/101‑80 (MQ=255) cACTAttgctgggtaagatcagttttccagtccgggctggatcaaacctttcaggtagaaaagcgccctcacccacttaatgcgctaactgcggacgaaat > 2:596589‑M2/1‑5 (MQ=255) cACTAttgctgggtaagatcagttttccagtccgggctggatcaaacctttcaggtagaaaagcgccctcacccacttaatgcgctaactgcggacgaaat > 1:712568‑M2/1‑5 (MQ=255) aCTATTGCTGGGTAAGATCAtagatgctacggatatccatatccagaacttcagcaatctgatatggattataaccagaaaccatataccccattatggtg < 2:468611‑M1/101‑82 (MQ=255) cTAttgctgggtaagatcagttttccagtccgggctggatcaaacctttcaggtagaaaagcgccctcacccacttaatgcgctaactgcggacgaaatta < 2:200070‑M2/101‑99 (MQ=255) cTAttgctgggtaagatcagttttccagtccgggctggatcaaacctttcaggtagaaaagagccctcacccacttaatgcgctaactgcggacgaaatta < 2:1642544‑M2/101‑99 (MQ=255) cTATTGCTGGGTAAGATCAtagatgctacggatatccatatccagaacttcagcaatctgatatggattataaccagaaaccatataccccattatggtga > 2:291907‑M1/1‑19 (MQ=255) cTATTGCTGGGTAAGATCAtagatgctacggatatccatatccagaacttcagcaatctgatatggattataaccagaaaccatataccccattatggtga > 1:5629‑M1/1‑19 (MQ=255) cTATTGCTGGGTAAGATCAATTTTCAGATAACCGCCACGCCGCATCTTGCGGTTTATGATCCGACGGTACAGTTTGAGTTCTGGTTCTCGGAAAAGCGGAt < 1:761333/101‑1 (MQ=255) cTATTGCTGGGTAAGATCAATTTTCAGATAACCGCCACGCCGCATCTTGCGGTTTATGATCCGACGGTACAGTTTGAGTTCTGGTTCTCGGAAAAGCGGAt > 2:704802/1‑101 (MQ=255) aTTGCTGGGTAAGATCAtagatgctacggatatccatatccagaacttcagcaatctgatatggattataaccagaaaccatataccccattatggtgaat > 1:116962‑M1/1‑17 (MQ=255) aTTGCTGGGTAAGATCAtagatgctacggatatccatatccagaacttcagcaatctgatatggattataaccagaaaccatataccccattatggtgaat < 1:1138521‑M1/101‑85 (MQ=255) | ATTCAGGCGAATGCTGTTTACGGGGTTTTTTACTGGTTGATACTGTTTTTGTCATGTGAGTCACCTCTGACTGAGAGTTTACTCACTTAGCCGCGTGTCCACTATTGCTGGGTAAGATCAATTTTCAGATAACCGCCACGCCGCATCTTGCGGTTTATGATCCGACGGTACAGTTTGAGTTCTGGTTCTCGGAAAAGCGGATTG > 178/5167‑5370 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |