| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 100 | = 12817 | 18 (0.300) | 29 (0.550) +CGGCCCCGAATC |
22/176 | 2.1 | 78.5% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 140 | = 11485 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
GAAGATATCAATAACACCATCGATGCTGCACGTCGGGTGTTTGCGAAGTTGTGATCCAGCATGGTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 140/11385‑11485 | gAAGATATCAATAACACCATCGATGCTGCACGTCGGGTGTTTGCGAAGTTGTGATCCAGCATGGTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTAc < 1:311194/101‑1 (MQ=255) aaGATATCAATAACACCATCGATGCTGCACGTCGGGTGTTTGCGAAGTTGTGATCCAGCATGGTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACg < 2:1573478‑M2/101‑2 (MQ=255) aaGATATCAATAACACCATCGATGCTGCACGTCGGGTGTTTGCGAAGTTGTGATCCAGCATGGTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACg > 2:1518447‑M2/1‑100 (MQ=255) aGATATCAATAACACCATCGATGCTGCACGTCGGGTGTTTGCGAAGTTGTGATCCAGCATGGTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACga < 1:1522684‑M2/101‑3 (MQ=255) atatCAATAACACCATCGATGCTGCACGTCGGGTGTTTGCGAAGTTGTGATCCAGCATGGTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACgatt > 2:1585982‑M2/1‑97 (MQ=255) tatCAATAACACCATCGATGCTGCACGTCGGGTGTTTGCGAAGTTGTGATCCAGCATGGTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACgattc < 2:931597‑M2/101‑6 (MQ=255) atCAATAACACCATCGATGCTGCACGTCGGGTGTTTGCGGAGTTGTGATCCAGCATGGTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACgattcg < 1:1716928‑M2/101‑7 (MQ=255) atCAATAACACCATCGATGCTGCACGTCGGGTGTTTGCGAAGTTGTGATCCAGCATGGTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACgattcg < 1:280362‑M2/101‑7 (MQ=255) atCAATAACACCATCGATGCTGCACGTCGGGGGTTTGCGAAGTTGTGATCCAGCATGGTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACgattcg < 2:741171‑M2/101‑7 (MQ=255) cacCATCGATGCTGCACGTCGGGTGTTTGCGAAGTTGTGATCCAGCATGGTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACgattcggggccgtt > 1:116501‑M2/1‑87 (MQ=255) ccATCGATGCTGCACGTCGGGTGTTTGCGAAGTTGTGATCCAGCATGGTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACgattcggggccgtttg > 1:216348‑M2/1‑85 (MQ=255) gctgcACGTCGGGTGTTTGCGAAGTTGTGATCCAGCATGGTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACgattcggggccgtttgtaggcccg < 1:1152497‑M2/101‑25 (MQ=255) gctgcACGTCGGGTGTTTGCGAAGTTGTGATCCAGCATGGTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACgattcggggccgtttgtaggcccg > 2:228211‑M2/1‑77 (MQ=255) ntgcaCGTCGGGTGTTTGCGAAGTTGTGATCCAGCATGGTTTGTCGGATGCGGCGTGNANGCCTTATCCGACCTACgattcggggccgtttgtaggcccga < 1:1257243‑M2/100‑26 (MQ=255) aCGTCGGGTGTTTGCGAAGTTGTGATCCAGCATGGTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACgattcggggccgtttgtaggcccgataag > 1:1703186‑M2/1‑72 (MQ=255) cGTCGGGTGTTTGCGAAGTTGTGATCCAGCATGGTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACgattcggggccgtttgtaggcccgataaga < 2:1441167‑M2/101‑31 (MQ=255) gTCGGGTGTTTGCGAAGTTGTGATCCAGCATGGTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACgattcggggccgtttgtaggcccgataagac < 2:1135187‑M2/101‑32 (MQ=255) gTCGGGTGTTTGCGAAGTTGTGATCCAGCATGGTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACgattcggggccgtttgtaggcccgataagac > 1:1442880‑M2/1‑70 (MQ=255) cGGGTGTTTGCGAAGTTGTGATCCAGCATGGTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACgattcggggccgtttgtaggcccgataagacgc < 2:280184‑M2/101‑34 (MQ=255) gggTGTTTGCGAAGTTGTGATCCAGCATGGTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACgattcggggccgtttgtaggcccgataagacgcg < 2:932793‑M2/101‑35 (MQ=255) ggTGTTTGCGAAGTTGTGATCCAGCATGGTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACgattcggagccgtttgtaggcccgataagacgcgc < 1:960515‑M2/101‑36 (MQ=255) gtgtTTGCGAAGTTGTGATCCAGCATGGTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACgattcggggccgtttgtaggcccgataagacgcgcc < 1:120475‑M2/101‑37 (MQ=255) gtTTGCGAAGTTGTGATCCAGCATGGTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACgattcggggccgtttgtaggcccgataagacgcgccag < 2:812615‑M2/101‑39 (MQ=255) cGAAGTTGTGATCCAGCATGGTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACgattcggggccgtttgtaggcccgataagacgcgccagcgtcg > 2:1179457‑M2/1‑58 (MQ=255) cGAAGTTGTGATCCAGCATGGTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACgattcggggccgtttgtaggcccgataagacgcgccagcgtcg < 2:498615‑M2/101‑44 (MQ=255) aaGTTGTGATCCAGCATGGTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTCTCCGCCCTACgattcggggccgtttgtaggcccgataagacgcgccagcgtcgca > 2:1501031‑M2/1‑56 (MQ=255) aGTTGTGATCCAGCATGGTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACgattcggggccgtttgtaggcccgataagacgcgccagcgtcgcat < 2:1307449‑M2/101‑47 (MQ=255) aGTTGTGATCCAGCATGGTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACgattcggggccgtttgtaggcccgataagacgcgccagcgtcgcat > 2:1202662‑M2/1‑55 (MQ=255) gtgATCCAGCATGGTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACgattcggggccgtttgtaggcccgataagacgcgccagcgtcgcatcggg < 1:708617‑M2/101‑51 (MQ=255) tgATCCAGCATGGTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACgattcggggccgtttgtaggcccgataagacgcgccagcgtcgcatcgggc > 2:1152492‑M2/1‑50 (MQ=255) aTCCAGCATGGTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACgattcggggccgtttgtaggcccgataagacgcgccagcgtcgcatcgggcat > 1:579282‑M2/1‑48 (MQ=255) ccAGCATGGTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACgattcggggccgtttgtaggcccgataagacgcgccatcgtcgcatcgggcatcc > 2:742252‑M2/1‑46 (MQ=255) ccAGCATGGTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACgattcggggccgtttgtaggcccgataagacgcgccagcgtcgcatcgggcatcc < 2:237239‑M2/101‑56 (MQ=255) ccAGCATGGTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACgattcggggccggttgtaggcccgataaggcgcgccagcgtcgcatcgggcatcc < 2:1184363‑M2/101‑56 (MQ=255) cAGCATGGTNNGTCGNNTGCGGCGTGAACGCCNNNTCCGACCTACgattcggggccgtttgtaggcccgataagacgcgccagcgtcgcatcgggcatccg < 2:721768‑M2/101‑57 (MQ=255) aGCATGGTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACgattcggggccgtttgtaggcccgataagacgcgccagcgtcgcatcgggcatccgt < 1:165536‑M2/101‑58 (MQ=255) gCATGGTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACgattcggggccgtttgtaggcccgataagacgcgccagcgtcgcatcgggcatccgtt < 2:906974‑M2/101‑59 (MQ=255) gCATGGTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTACgattcggggccgtttgtaggcccgataagacgcgccagcgtcgcatcgggcatccgtt < 1:1383250‑M2/101‑59 (MQ=255) | GAAGATATCAATAACACCATCGATGCTGCACGTCGGGTGTTTGCGAAGTTGTGATCCAGCATGGTTTGTCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGACCTAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 140/11385‑11485 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |