| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 10 | = 54363 | 0 (0.000) | 53 (0.860) +GCTGCCGGATG |
37/178 | 0.9 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 44 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCAAA > 44/1‑100 | taaacgccttatccgacctgcggttatgttccgtttgtaggcctgataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCt < 2:1449694‑M2/15‑1 (MQ=255) cgccttatccgacctacggttatgttccgtttgtaggcctgataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATcc > 2:964462‑M2/83‑101 (MQ=255) ccatatccgacctacggttatgttccgtttgtaggcctgataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGa > 1:271663‑M2/81‑101 (MQ=255) cttatccgacctacggttatgttccgtttgtaggcctgataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGAc < 1:366310‑M2/22‑1 (MQ=255) atccgacctacggttatgttccgtttgtaggcctgataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTa > 2:1655452‑M2/77‑101 (MQ=255) ccgacctacggttatgttccgtttgtaggcctgataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACg < 1:1217743‑M2/27‑1 (MQ=255) acctacggttatgttccgtttgtaggcctgataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGtt > 1:551402‑M2/72‑101 (MQ=255) ctacggttatgttccgtttgtaggcctgataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTAt > 1:593916‑M2/70‑101 (MQ=255) tacggttatgttccgtttgtaggcctgataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATg > 2:1369894‑M2/69‑101 (MQ=255) gttatgttccgtttgtaggcctgataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCt > 2:1256595‑M2/65‑101 (MQ=255) ttatgttccgtttgtaggcctgataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTg < 2:714263‑M2/38‑1 (MQ=255) tatgttccgtttgtaggcctgataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTgg < 1:1493376‑M2/39‑1 (MQ=255) atgttccgtttgtaggcctgataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGc > 2:872089‑M2/62‑101 (MQ=255) tgttccgtttgtaggcctgataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCt < 1:69512‑M2/41‑1 (MQ=255) ttccgtttgtaggcctgataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCg > 2:553135‑M2/59‑101 (MQ=255) ttccgtttgtaggcctgataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCg < 2:1658949‑M2/43‑1 (MQ=255) ttccgtttgtaggcctgataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCg < 2:1232670‑M2/43‑1 (MQ=255) ttccgtttgtaggcctgataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCg > 1:862177‑M2/59‑101 (MQ=255) gtttgtaggcctgataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTgg > 1:1075473‑M2/55‑101 (MQ=255) tgtaggcctgataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCt > 2:117681‑M2/52‑101 (MQ=255) tgtaggcctgataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCt > 2:183977‑M2/52‑101 (MQ=255) taggcctgataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCttt < 2:204082‑M2/52‑1 (MQ=255) aggcctgataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTg < 1:962660‑M2/53‑1 (MQ=255) aggcctgataagacgaacagcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTAATGTTCTTGCTCGTTTGCctttt > 2:207575‑M2/49‑100 (MQ=255) agacntgataagannnnnnntntcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGNTNATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTg < 2:138709‑M2/53‑1 (MQ=255) tgataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAAc < 2:1524966‑M2/58‑1 (MQ=255) gataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACg < 1:701820‑M2/59‑1 (MQ=255) gataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACg > 1:1612483‑M2/43‑101 (MQ=255) ataagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGa > 1:289852‑M2/42‑101 (MQ=255) taagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTTGCAACGAt > 1:602587‑M2/41‑101 (MQ=255) aagacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGGAACGAtt > 2:700272‑M2/40‑101 (MQ=255) gacgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTAt < 2:458980‑M2/64‑1 (MQ=255) cgcacagcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATcc > 2:617676‑M2/36‑101 (MQ=255) cagcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATg > 1:1587268‑M2/32‑101 (MQ=255) cagcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATg < 2:929997‑M2/70‑1 (MQ=255) agcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATga < 1:1369900‑M2/71‑1 (MQ=255) gcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCGACGATTATCCTGTgag > 1:1167115‑M2/30‑101 (MQ=255) gcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATgag < 1:1655458‑M2/72‑1 (MQ=255) gcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATgag > 1:139648‑M2/30‑101 (MQ=255) gcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATgag < 1:1286597‑M2/72‑1 (MQ=255) gcgtcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATgag < 2:1249171‑M2/72‑1 (MQ=255) cgtcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATgaga < 1:97249‑M2/73‑1 (MQ=255) tcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATGAGAtt < 2:1533257‑M2/75‑1 (MQ=255) tcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATGAGAtt < 1:709416‑M2/75‑1 (MQ=255) tcgcatcaggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATGAGAtt < 1:1697334‑M2/75‑1 (MQ=255) caggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCa < 2:1505865‑M2/81‑1 (MQ=255) caggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCa < 1:1605753‑M2/81‑1 (MQ=255) aggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTTTGAGATTGGGGCaa > 1:781785‑M2/20‑101 (MQ=255) aggcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCaa > 2:1692308‑M2/20‑101 (MQ=255) gcaacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAAtt < 2:70656‑M2/84‑1 (MQ=255) aacggctgccggatgCGTCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTAc < 2:926766‑M2/86‑1 (MQ=255) aacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTAc > 2:907739‑M2/16‑101 (MQ=255) aacggctgccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTAc < 2:271663‑M2/86‑1 (MQ=255) gccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCt < 1:902093‑M2/93‑1 (MQ=255) ccggatgCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTTCGGTTATGTTGTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGAAATTACGCGCCCTc < 1:700277‑M2/94‑1 (MQ=255) gCGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCaaa < 2:1075468‑M2/100‑1 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGGCGTGAACGCCCTATCCGACCTACGGTTATGTTCTGGCTCGTTGGCCTTTGGCAACGATTATCCTATGAGATTGGGGCAATTACGCGCCCTCGTCAAA > 44/1‑100 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |