New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 9 | 35670 = | 122 (1.730) | 63 (1.240) +CCAGTGCGAGCAATATCAACGTGGTTTT |
52/144 | 0.0 | 42.0% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 9 | = 35756 | 120 (1.700) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Only 100 of 316 total aligned reads displayed.
AGTGGTGGCTATAGCTCAGTTGGTAGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAAT > 9/35570‑35770 | gacgcgctagcttcaggtgttagtgttcttacggacgtgggggttcaagtcccccccctcgcaccaaacgaggcgatatcaaaaaaagtaagatgactgtg < 2:901234‑M1/2‑1 (MQ=255) tggCTATAGCTCAGTTGGTAGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAg < 2:467783/101‑1 (MQ=255) gctagcttcaggtgttagtgttcttacggacgtgggggttcaagtcccccccctcgcaccaaacgaggcgatatcaaaaaaagtaagatgactgTGCGAAg > 1:901239‑M1/95‑101 (MQ=255) gctagcttcaggtgttagtgttcttacggacgtgggggttcaagtcccccccctcgcaccaaacgaggcgatatcaaaaaaagtaagatgactgTGCGAAg > 2:762122‑M1/95‑101 (MQ=255) agacgcgctagcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccccccctcgcaccaaaaaccacgttgatattgctcgcactggGCGAAg < 1:1190008‑M1/6‑1 (MQ=255) tagcttcaggtgttagtgttcttacggacgtgggggttcaagtcccccccctcgcaccaaacgaggcgatatcaaaaaaagtaagatgactgTGCGAaggg < 1:801521‑M1/9‑2 (MQ=255) acgcgctagcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccccccctcgcaccaaaaaccacgttgatattgctcgcactggGCGAAGGt > 1:41785‑M1/94‑101 (MQ=255) acgcgctagcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccccccctcgcaccaaaaaccacgttgatattgctcgcactggGCGAAGGt > 2:735744‑M1/94‑101 (MQ=255) cTATAGCTCAGTTGGTAGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTg > 1:1309826/1‑101 (MQ=255) cTATAGCTCAGTTGGTAGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTg > 1:238305/1‑101 (MQ=255) cttcaggtgttagtgttcttacggacgtgggggttcaagtcccccccctcgcaccaaacgaggcgatatcaaaaaaagtaagatgactgTGCGAAGGTGGc < 2:225700‑M1/12‑1 (MQ=255) taGCTCAGTTGGTAGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCg > 1:141632/1‑101 (MQ=255) taGCTCAGTTGGTAGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCg < 2:1698511/101‑1 (MQ=255) taGCTCAGTTGGTAGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCg > 1:883955/1‑101 (MQ=255) ctagcttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccccccctcgcaccaaaaaccacgttgatattgctcgcactggGCGCAGGTGGCgg < 1:849217‑M1/13‑1 (MQ=255) tCAGTTGGTAGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAAt < 2:170392/101‑1 (MQ=255) cttcaggtgttagtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccccccctcgcaccaaaaaccacgttgatattgctcgcactggGCGAAGGTGGCGGAAtt > 2:563839‑M1/85‑101 (MQ=255) gTTGGTAGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTgg < 1:1643425/101‑1 (MQ=255) gTTGGTAGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTgg > 1:1720214/1‑101 (MQ=255) ttGGTAGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGt < 1:593386/101‑1 (MQ=255) gtgttcttacggacgtgggggttcaagtcccccccctcgcaccaaacgaggcgatatcaaaaaaagtaagatgactgTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGa < 1:621000‑M1/24‑1 (MQ=255) tgttcttacggacgtgggggttcaagtcccccccctcgcaccaaacgaggcgatatcaaaaaaagtaagatgactgTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGAc < 1:29170‑M1/25‑1 (MQ=255) tAGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGAc < 2:1665787/101‑1 (MQ=255) tAGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGAc < 1:345065/101‑1 (MQ=255) cttacggacgtgggggttcaagtcccccccctcgcaccaaacgaggcgatatcaaaaaaagtaagatgactgTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACgcgc < 2:9599‑M1/29‑1 (MQ=255) gtgtccttacggacgtgggggttcaagtcccccccctcgcaccaaaaaccacgttgatattgctcgcactggGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCt > 1:1338546‑M1/73‑101 (MQ=255) cccTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCt < 2:1060582/101‑1 (MQ=255) cccTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCt > 2:1710477/1‑101 (MQ=255) tgtccttacggacgtgggggttcaagtcccccccctcgcaccaaaaaccacgttgatattgctcgcactggGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTa > 2:784567‑M1/72‑101 (MQ=255) ccTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTa > 2:157187/1‑101 (MQ=255) gtccttacggacgtgggggttcaagtcccccccctcgcaccaaaaaccacgttgatattgctcgcactggGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAg < 1:542022‑M1/31‑1 (MQ=255) acggacgtgggggttcaagtcccccccctcgcaccaaacgaggcgatatcaaaaaaagtaagatgactgTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAg < 1:1694824‑M1/32‑1 (MQ=255) cttacggacgtgggggttcaagtcccccccctcgcaccaaaaaccacgttgatattgctcgcactggGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCtt < 2:1500156‑M1/34‑1 (MQ=255) gtgggggttcaagtcccccccctcgcaccaaacgaggcgatatcaaaaaaagtaagatgactgTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAg < 2:444340‑M1/38‑1 (MQ=255) acggacgtgggggttcaagtcccccccctcgcaccaaaaaccacgttgatattgctcgcactggGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAg > 2:533442‑M1/65‑101 (MQ=255) tgggggttcaagtcccccccctcgcaccaaacgaggcgatatcaaaaaaagtaagatgactgTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAgg > 1:98906‑M1/63‑101 (MQ=255) tgggggttcaagtcccccccctcgcaccaaacgaggcgatatcaaaaaaagtaagatgactgTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAgg < 2:70293‑M1/39‑1 (MQ=255) gATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGgtg > 2:249980/1‑101 (MQ=255) gATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGgtg < 1:1579578/101‑1 (MQ=255) gATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGgtg > 1:1301431/1‑101 (MQ=255) gttcaagtcccccccctcgcaccaaacgaggcgatatcaaaaaaagtaagatgactgTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTa > 2:651586‑M1/58‑101 (MQ=255) cAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAgt < 1:1083724/101‑1 (MQ=255) gggttcaagtcccccccctcgcaccaaaaaccacgttgatattgctcgcactggGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAgtgt > 1:680668‑M1/55‑101 (MQ=255) aagtcccccccctcgcaccaaacgaggcgatatcaaaaaaagtaagatgactgTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAgtgt < 1:930601‑M1/48‑1 (MQ=255) ttcaagtcccccccctcgcaccaaaaaccacgttgatattgctcgcactggGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGttagtgttct > 1:451340‑M1/52‑98 (MQ=255) gTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCt > 2:34010/1‑101 (MQ=255) tcaagtcccccccctcgcaccaaaaaccacgttgatattgctcgcactggGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCtt > 1:1431687‑M1/51‑101 (MQ=255) tCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGTCAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCtt < 1:1382368/101‑1 (MQ=255) ccccccctcgcaccaaacgaggcgatatcaaaaaaagtaagatgactgTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTa < 1:367675‑M1/53‑1 (MQ=255) ggTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGa > 1:1010500/1‑101 (MQ=255) ccctcgcaccaaacgaggcgatatcaaaaaaagtaagatgactgTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGa < 1:161871‑M1/57‑1 (MQ=255) ccctcgcaccaaacgaggcgatatcaaaaaaagtaagatgactgTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGa < 2:914535‑M1/57‑1 (MQ=255) gTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGAc > 2:895203/1‑101 (MQ=255) cctcgcaccaaacgaggcgatatcaaaaaaagtaagatgactgTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGAc < 1:580243‑M1/58‑1 (MQ=255) cccccctcgcaccaaaaaccacgttgatattgctcgcactggGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGt > 1:1500162‑M1/43‑101 (MQ=255) 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atatcaaaaaaagtaagatgactgTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTccccc < 1:1260058‑M1/77‑1 (MQ=255) atatcaaaaaaagtaagatgactgTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGGTTAAGTccccc < 2:1434246‑M1/77‑1 (MQ=255) atcaaaaaaagtaagatgactgTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTccccccc < 1:1097261‑M1/79‑1 (MQ=255) atcaaaaaaagtaagatgactgTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGGTCAAGGccccccc < 1:1453170‑M1/79‑1 (MQ=255) cATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTcccccccc > 2:501044/1‑101 (MQ=255) cgttgatattgctcgcactggGGGAAGGTGGCGGGATTGGGAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCt < 2:206148‑M1/80‑1 (MQ=255) cgttgatattgctcgcactggGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCt > 1:746869‑M1/22‑101 (MQ=255) caaaaaaagtaagatgactgTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCt > 1:9599‑M1/21‑101 (MQ=255) attattAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGGCCCCCCCCt > 1:52112/1‑101 (MQ=255) aaaaaaagtaagatgactgTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTc > 2:215395‑M1/20‑101 (MQ=255) ttgatattgctcgcactggGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCg > 2:308715‑M1/20‑101 (MQ=255) tattaGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCg < 2:1086778/101‑1 (MQ=255) tattaGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCg < 1:866375/101‑1 (MQ=255) tattgctcgcactggGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGcacc < 2:1158829‑M1/86‑1 (MQ=255) tgctcgcactggGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTcgcaccaaa < 1:342733‑M1/89‑3 (MQ=255) tgctcgcactggGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTcgcaccaaa < 1:727502‑M1/89‑3 (MQ=255) aGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCACg < 2:874038/101‑1 (MQ=255) aGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCACg > 1:496928/1‑101 (MQ=255) attgatggtatgcgaaggtGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAaaa < 2:1094162‑M2/92‑4 (MQ=255) ctcgcactggGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCctcgcaccaaacg > 1:1155851‑M1/11‑97 (MQ=255) agatgactgTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGGTCAAGTCCCCCCCctcgcaccaatta < 1:1561271‑M1/92‑5 (MQ=255) gtgACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCACGACtt < 1:32145/101‑1 (MQ=255) atgactgTGCGAAGGGGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGGGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCccctcgcaccaattatc < 2:1541706‑M1/94‑7 (MQ=255) gactgtgcgaaGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAattatctt < 2:1034290‑M2/96‑9 (MQ=255) aCAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCACGACTTTaa > 1:1279386/1‑101 (MQ=255) ctgggcgaaGGTGGCGGAATTTGTAGACGGGCTAGGTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGGCCCCCCCCTCGCACCAattatcttta > 2:1596328‑M2/5‑91 (MQ=255) tgtgcGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAattatctttac > 2:1260053‑M2/3‑90 (MQ=255) tgggcgaAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTTCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGCCCCCCCCCTCGCACCAaacgaggcgat > 2:321119‑M2/4‑90 (MQ=255) aTGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAaaaaccacgtta < 2:344065‑M2/101‑13 (MQ=255) gCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAAt < 2:1010495/101‑1 (MQ=255) gCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGGGCTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGGTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCAattatcttttcttc < 2:498366‑M2/101‑15 (MQ=255) | AGTGGTGGCTATAGCTCAGTTGGTAGAGCCCTGGATTGTGATTCCAGTTGTCGTGGGTTCGAATCCCATTAGCCACCCCATTATTAGAAGTTGTGACAATGCGAAGGTGGCGGAATTGGTAGACGCGCTAGCTTCAGGTGTTAGTGTCCTTACGGACGTGGGGGTTCAAGTCCCCCCCCTCGCACCACGACTTTAAAGAAT > 9/35570‑35770 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |