| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 5 | = 1347 | 70 (1.000) | 69 (1.480) +TTCCCCACCGTTCAGGGTGTTCCCCGCGCC |
49/140 | 0.0 | 73.8% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 97 | = 17078 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 179 total aligned reads displayed.
GGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTCCGTTATGCATGGGGCGGTCAAATATTTCGGCTACCCTGATGAACACAGTGCAGAGCCTGATCAGGTGATCCTTATCGAAGCGGGGCA > 5/1247‑1447 | gggCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGttt < 1:1269347/101‑1 (MQ=255) ccAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttc > 2:41212‑M1/1‑98 (MQ=255) ccAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTAcc < 1:1652073/101‑1 (MQ=255) cAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttcc < 2:896341‑M1/101‑5 (MQ=255) cAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttcc < 2:147131‑M1/101‑5 (MQ=255) cAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttcc > 2:1431572‑M1/1‑97 (MQ=255) aGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccc > 1:1355926‑M1/1‑96 (MQ=255) aGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCa > 2:1640589/1‑101 (MQ=255) gAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCAc < 1:34888/101‑1 (MQ=255) gAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCAc < 1:995952/101‑1 (MQ=255) aaTAGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttcccca > 1:5877‑M1/1‑94 (MQ=255) tGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccg > 2:57212‑M1/1‑91 (MQ=255) tGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccg < 2:513632‑M1/101‑11 (MQ=255) tGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccg < 2:1530130‑M1/101‑11 (MQ=255) cTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgtt < 1:1508390‑M1/101‑13 (MQ=255) cTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCttt > 1:88900/1‑101 (MQ=255) tGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttc > 1:391307‑M1/1‑88 (MQ=255) gACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttca > 2:847246‑M1/1‑87 (MQ=255) gACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttca > 1:1384907‑M1/1‑87 (MQ=255) gACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTcc > 1:715192/1‑101 (MQ=255) 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aGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTCCGTTa < 1:457502/101‑1 (MQ=255) gTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttcagggtg < 2:29116‑M1/101‑20 (MQ=255) tATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttcagggtgtt < 1:753289‑M1/101‑22 (MQ=255) aTCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTCCGTTATGCa < 1:1472900/101‑1 (MQ=255) aTCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTCCGTTATGCa < 2:617414/101‑1 (MQ=255) gTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttcagggtgttcccc < 2:1451353‑M1/101‑26 (MQ=255) gagaGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttcagggtgttccccgc > 1:1570202‑M1/1‑74 (MQ=255) agTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTCCGTTATGCATGGGGCgg > 2:1620568/1‑101 (MQ=255) agTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTCCGTTATGCATGGGGCgg > 1:1011505/1‑101 (MQ=255) agTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTCCGTTATGCATGGGGCgg < 2:80222/101‑1 (MQ=255) agTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTCCGTTATGCATGGGGCga > 1:486134/1‑100 (MQ=255) gTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTCCGTTATGCATGGGGCGGt < 2:1670343/101‑1 (MQ=255) aaTTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttcagggtgttccccgcgccagc > 1:513189‑M1/1‑68 (MQ=255) tCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttcagggtgttccccgcgccagcggg > 1:243667‑M1/1‑65 (MQ=255) cATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttcagggtgttccccgcgccagcgggg < 1:41212‑M1/101‑38 (MQ=255) cATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGAAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTCCGTTATGCATGGGGCGGTCAAata < 1:1151159/101‑1 (MQ=255) tCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttcagggtgttccccgcgccagcggggat < 1:328372‑M1/101‑40 (MQ=255) cGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttcagggtgttccccgcgccagcggggata < 2:502901‑M1/101‑41 (MQ=255) ggCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttcagggtgttccccgcgccagcggggataa < 2:404259‑M1/101‑42 (MQ=255) cagatcttttaTCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTCCGTTATGCATGGGGCGGTCAAATATTTc > 2:450645/11‑101 (MQ=255) gCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTttccccaccgttcagggtgttccccgcgccagcggggataaa > 1:1720388‑M1/1‑59 (MQ=255) 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cTTATGGGGTTTttccccaccgttcagggtgttccccgcgccagcggggataaaccggtcatcacgatgaatcaaaatttcgcccagctgtgttccccgcg > 1:109508‑M1/1‑12 (MQ=255) gggTTTttccccaccgttcagggtgttccccgcgccagcggggataaaccggtcatcacgatgaatcaaaatttcgcccagctgtgttccccgcgccagcg < 1:51046‑M1/101‑96 (MQ=255) tttccccaccgttcagggtgttccccgcgccagcggggataaaccggtcatcacgatgaatcaaaatttcgcccagctgtgttccccgcgccagcggggat < 1:499884‑M1/101‑101 (MQ=255) | GGGCCAGAATTGCTGACCAGTTATCGTGAGAGTAATTCATCGGCACGTTAAATCATATCAGGCGTAATACCACAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGGTTTACCCACGCCTTTCCGTTATGCATGGGGCGGTCAAATATTTCGGCTACCCTGATGAACACAGTGCAGAGCCTGATCAGGTGATCCTTATCGAAGCGGGGCA > 5/1247‑1447 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |