New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 43 | 7 = | 0 (0.000) | 58 (0.890) +A |
47/198 | 0.3 | 62.3% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 5 | = 1333 | 71 (1.010) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTTAGCGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGA > 43/1‑104 | gcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagtg > 2:393643‑M1/101‑101 (MQ=255) gcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagtg > 1:1695951‑M1/101‑101 (MQ=255) ccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagtGCTTAt < 2:339286‑M1/6‑1 (MQ=255) atatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagtGCTTATggg < 1:363837‑M1/9‑1 (MQ=255) atatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagtGCTTATggg < 2:224254‑M1/9‑1 (MQ=255) gccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACa > 1:1321690‑M1/87‑101 (MQ=255) gccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACa > 1:1180163‑M1/87‑101 (MQ=255) ccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACAt > 2:1657960‑M1/86‑101 (MQ=255) ccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACAt < 1:1580854‑M1/16‑1 (MQ=255) agaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACATcc < 2:44487‑M1/18‑1 (MQ=255) agaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACATcc > 1:302359‑M1/84‑101 (MQ=255) agaattgctgaccagntatcgnganagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACATcc > 2:855884‑M1/84‑101 (MQ=255) aattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACATcccc > 1:358209‑M1/82‑101 (MQ=255) tgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtgataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCata < 2:113711‑M1/23‑1 (MQ=255) tgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCata < 2:979346‑M1/23‑1 (MQ=255) ctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCAtata < 2:813647‑M1/25‑1 (MQ=255) tgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATAc < 2:551960‑M1/26‑1 (MQ=255) tgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATAc < 1:855839‑M1/26‑1 (MQ=255) gaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACt < 2:1598289‑M1/27‑1 (MQ=255) accagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTg < 1:860304‑M1/28‑1 (MQ=255) cagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGAc < 1:607586‑M1/30‑1 (MQ=255) cagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGAc < 2:1681825‑M1/30‑1 (MQ=255) ttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTa < 1:1175865‑M1/33‑1 (MQ=255) tatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTAc < 1:807757‑M1/34‑1 (MQ=255) gagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAAt < 1:1312207‑M1/42‑1 (MQ=255) agtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATa > 1:913939‑M1/59‑101 (MQ=255) aattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGAt < 2:88345‑M1/46‑1 (MQ=255) ttcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATgg > 2:1038352‑M1/54‑101 (MQ=255) ttcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATgg > 1:490450‑M1/54‑101 (MQ=255) tcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGc > 2:1312201‑M1/53‑101 (MQ=255) cacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGc < 1:471006‑M1/56‑1 (MQ=255) acgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGca > 2:1602978‑M1/45‑101 (MQ=255) cgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGcac > 1:986759‑M1/44‑101 (MQ=255) cgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGcac < 1:257282‑M1/58‑1 (MQ=255) ttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAg < 2:1389500‑M1/60‑1 (MQ=255) taaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGAACATGTTAATAGATGGCGTGAAGAACAGt < 2:919793‑M1/61‑1 (MQ=255) aaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTc < 2:224721‑M1/62‑1 (MQ=255) atatcaggcgtaataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTc < 1:497896‑M1/67‑1 (MQ=255) atcaggcgtaataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCAt < 1:608722‑M1/69‑1 (MQ=255) atcaggcgtaataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCAt < 2:368450‑M1/69‑1 (MQ=255) aggcgtaataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTg < 1:775427‑M1/72‑1 (MQ=255) gcgtaataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGAt > 1:703336‑M1/28‑101 (MQ=255) gtaataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTa < 1:1691236‑M1/76‑1 (MQ=255) gtaataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTa < 1:1534066‑M1/76‑1 (MQ=255) gtaataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTa > 2:690297‑M1/26‑101 (MQ=255) taataccacagcccttaagttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTAc < 2:1145806‑M1/77‑1 (MQ=255) taataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTAc < 2:1533094‑M1/77‑1 (MQ=255) aataccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTAcc < 1:1402641‑M1/78‑1 (MQ=255) taccacaacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTg < 2:961505‑M1/80‑1 (MQ=255) aacccttaagttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGaa > 1:66677‑M1/16‑101 (MQ=255) ttaagttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTaa < 2:1079165‑M1/91‑1 (MQ=255) taagttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTaaa < 2:366915‑M1/92‑1 (MQ=255) aagttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAAc > 1:368663‑M1/9‑101 (MQ=255) agttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACt < 1:1643634‑M1/94‑1 (MQ=255) agttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACt > 1:813652‑M1/8‑101 (MQ=255) gttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTa > 2:1285075‑M1/7‑101 (MQ=255) ttagtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTaa > 2:1207994‑M1/6‑101 (MQ=255) agtGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAaga > 1:171546‑M1/4‑101 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTTAGCGCTTATGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGA > 43/1‑104 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |