New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 40 | 1 = | 0 (0.000) | 83 (1.230) | 65/200 | 0.0 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 5 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCGGCAGGCGCAGTTTGTTTATTCCAGAAAGGCGTTGAGCGCGTATGAATAT > 40/1‑98 | ctacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTa < 1:863000‑M1/3‑1 (MQ=255) tacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTaa < 2:608357‑M1/4‑1 (MQ=255) tacaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcacttatgggGTaa > 2:1405086‑M1/98‑101 (MQ=255) acaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTaaa < 2:195966‑M1/5‑1 (MQ=255) acaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTaaa > 2:1528207‑M1/97‑101 (MQ=255) acaaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacacttaagttagcgcttatgggGGaaa < 1:89249‑M1/5‑1 (MQ=255) aaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAAcc < 2:1272602‑M1/7‑1 (MQ=255) aaaacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAAcc < 2:450263‑M1/7‑1 (MQ=255) aacgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAAcccc > 2:566302‑M1/93‑101 (MQ=255) tcgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAAccccc > 2:1208789‑M1/92‑101 (MQ=255) acgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAAccccc > 1:259195‑M1/92‑101 (MQ=255) cgcaattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCg > 1:1153229‑M1/91‑101 (MQ=255) ctattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCggg > 2:230259‑M1/89‑101 (MQ=255) caattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCggg > 1:1553519‑M1/89‑101 (MQ=255) caattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggaaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCggg < 2:1557349‑M1/13‑1 (MQ=255) aattgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGgc < 2:1620433‑M1/14‑1 (MQ=255) attgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCccgggag < 1:230259‑M1/15‑3 (MQ=255) ttgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGgcgc < 2:933845‑M1/16‑1 (MQ=255) tgaagaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgtgGTAAACCCCCGGGcgcg < 1:813499‑M1/17‑1 (MQ=255) gaacgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTcc > 2:633977‑M1/81‑101 (MQ=255) acgcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCtt > 2:1318928‑M1/79‑101 (MQ=255) gcgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTa > 1:607473‑M1/77‑101 (MQ=255) cgaggcatcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTAt < 1:1228120‑M1/26‑1 (MQ=255) atcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGAt > 1:501720‑M1/70‑101 (MQ=255) atcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGAt < 2:87041‑M1/32‑1 (MQ=255) atcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGAt > 1:1578198‑M1/70‑101 (MQ=255) atcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGAt > 2:1534286‑M1/70‑101 (MQ=255) tcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATg > 1:1327630‑M1/69‑101 (MQ=255) tcgtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATg > 1:1050119‑M1/69‑101 (MQ=255) cgtcttaacgaggcaccgaggggtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCTGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGa > 2:1697239‑M1/68‑101 (MQ=255) gtcttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGAc > 1:1326132‑M1/67‑101 (MQ=255) cttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGt < 1:1220057‑M1/37‑1 (MQ=255) ttaacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGtt < 2:760282‑M1/38‑1 (MQ=255) taacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTc < 1:134045‑M1/39‑1 (MQ=255) aacgaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGATCCTTTATCAAGATGACGTTCg < 2:1671622‑M1/40‑1 (MQ=255) gaggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAat > 2:1307150‑M1/59‑101 (MQ=255) aggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAata > 2:57‑M1/58‑101 (MQ=255) ggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAatat > 1:1359325‑M1/57‑101 (MQ=255) ggcaccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAatat > 2:1137985‑M1/57‑101 (MQ=255) ccgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCg > 2:47691‑M1/53‑101 (MQ=255) cgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCgg < 2:830683‑M1/50‑1 (MQ=255) cgaggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCgg < 2:1254568‑M1/50‑1 (MQ=255) aggcgtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCGGCa < 1:574940‑M1/52‑1 (MQ=255) gcgtctcattcttcagatttttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAATCCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCGGCAgg > 2:271916‑M1/48‑101 (MQ=255) gtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCGGCAGgcg > 1:1218458‑M1/46‑101 (MQ=255) gtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCGGCAGgcg < 1:835354‑M1/56‑1 (MQ=255) gtcgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCGGCAGgcg < 2:471345‑M1/56‑1 (MQ=255) cgcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCGGCAGGCGCa < 2:1408359‑M1/58‑1 (MQ=255) gcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCGGCAGGCGCAg < 1:990816‑M1/59‑1 (MQ=255) gcattcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCGGCAGGCGCAg > 1:38962‑M1/43‑101 (MQ=255) attcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCGGCAGGCGCAgtt < 1:460672‑M1/61‑1 (MQ=255) ttcttcaggtggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCGGCAGGCGCAgttt < 2:750909‑M1/62‑1 (MQ=255) tcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCGCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCGGCAGGCGCAgtttg > 1:1390577‑M1/39‑101 (MQ=255) tcttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCGGCAGGCGCAgcttg < 1:1030588‑M1/63‑1 (MQ=255) cttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCTGGCAGGCGCAgtttgt < 2:560221‑M1/64‑1 (MQ=255) ttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCGGCAGGCGCAgtttgtt < 1:1032886‑M1/65‑1 (MQ=255) ttcagatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCGGCAGGCGCAgtttgtt > 1:644309‑M1/37‑101 (MQ=255) agatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCGGCAGGCGCAGTTTGTTTAt < 2:1385717‑M1/68‑1 (MQ=255) agatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCGGCAGGCGCAGTTTGTTTAt > 1:762518‑M1/34‑101 (MQ=255) agatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCGGCAGGCGCAGTTTGTTTAt < 2:548429‑M1/68‑1 (MQ=255) agatggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCGGCAGGCGCAGTTTGTTTAt > 2:862995‑M1/34‑101 (MQ=255) ggttcaacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCGGCAGGCGCAGTTTGTTTATTCCa < 2:442907‑M1/72‑1 (MQ=255) aacccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCGGCAGGCGCAGTTTGTTTATTCCAGAAAg > 1:146024‑M1/25‑101 (MQ=255) ccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCGGCAGGCGCAGTTTGTTTATTCCAGAAAGGCg < 1:166184‑M1/80‑1 (MQ=255) ccttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCGGCAGGCGCAGTTTGTTTATTCCAGAAAGGCg > 1:699743‑M1/22‑101 (MQ=255) cttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCGGCAGGCGCAGTTTGTTTATTCCAGAAAGGCGt > 1:87041‑M1/21‑101 (MQ=255) cttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCGGCAGGCGCAGTTTGTTTATTCCAGAAAGGCGt < 2:786802‑M1/81‑1 (MQ=255) cttaagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCGGCAGGCGCAGTTTGTTTATTCCAGAAAGGCGt > 1:82400‑M1/21‑101 (MQ=255) aagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCGGCAGGCGCAGTTTGTTTATTCCAGAAAGGCGTTGa > 1:1579142‑M1/18‑101 (MQ=255) aagttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCGGCAGGCGCAGTTTGTTTATTCCAGAAAGGCGTTGa < 1:1107884‑M1/84‑1 (MQ=255) agttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCGGCAGGCGCAGTTTGTTTATTCCAGAAAGGCGTTGAg > 1:933850‑M1/17‑101 (MQ=255) agttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCGGCAGGCGCAGTTTGTTTATTCCAGAAAGGCGTTGAg > 2:595849‑M1/17‑101 (MQ=255) agttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCGGCAGGCGCAGTTTGTTTATTCCAGAAAGGCGTTGAg > 2:1349258‑M1/17‑101 (MQ=255) agttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCGGCAGGCGCAGTTTGTTTATTCCAGAAAAGCGTTGAg < 2:970926‑M1/85‑1 (MQ=255) agttagagcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCGGCAGGCGCAGTTTGTTTATTCCAGAAAGGCGTTGAg < 1:1112310‑M1/85‑1 (MQ=255) gttagcgcttatgggGTAAACTCCCGGGCGCGTTCCTCTATCAAGATGGCGTTCGAATATGCCGGCAGGGGCAGTTTGTTTATTCCAGAAAGGCGTTGAgc > 2:1174710‑M1/16‑101 (MQ=255) gttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCGGCAGGCGCAGTTTGTTTATTCCAGAAAGGCGTTGAgc > 2:1260755‑M1/16‑101 (MQ=255) ttagcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCGGCAGGCGCAGTTTGTTTATTCCAGAAAGGCGTTGAgcg < 1:551312‑M1/87‑1 (MQ=255) gcgcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCGGCAGGCGCAGTTTGTTTATTCCAGAAAGGCGTTGAGCGCGt < 2:555046‑M1/90‑1 (MQ=255) gcttatgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCGGCAGGCGCAGTTTGTTTATTCCAGAAAGGCGTTGAGCGCGTAt > 1:830688‑M1/10‑101 (MQ=255) atgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCGGCAGGCGCAGTTTGTTTATTCCAGAAAGGCGTTGAGCGCGTATGAat > 2:114413‑M1/6‑101 (MQ=255) atgggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCGGCAGGCGCAGTTTGTTTATTCCAGAAAGGCGTTGAGCGCGTATGAat > 2:1045746‑M1/6‑101 (MQ=255) gggGTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCGGCAGGCGCAGTTTGTTTATTCCAGAAAGGCGTTGAGCGCGTATGAatat > 2:69535‑M1/4‑101 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTAAACCCCCGGGCGCGTTCCTTTATCAAGATGACGTTCGAATATGCCGGCAGGCGCAGTTTGTTTATTCCAGAAAGGCGTTGAGCGCGTATGAATAT > 40/1‑98 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |