New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 2 | 33362 = | 45 (0.760) | 65 (1.120) +GGA |
49/194 | 0.2 | 54.2% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 2 | = 33439 | 68 (1.140) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
CTCTGCAAACGGTCGAAATAGCGCAGAAAATTACGTTTTGCCTCTTGCCACCTTCCCACTCTGCCGCTAATATTCGTCCCCGTTGTCACCTACAACGTTGCGTTCATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTCGGACGCACCAGATTTTCTTAATCTGGTCTTCTC > 2/33264‑33462 | gttgtcacctacaacgttgcgttcatagctcagttggttagagcaccaccttgacatggtgggggtcgttggttcgagtccaattgaacgcaccatccTGc < 1:1018643‑M1/3‑1 (MQ=255) gttgtcacctacaacgttgcgttcatagctcagttggttagagcaccaccttgacatggtgggggtcgttggttcgagtccaattgaacgcaccatccTGc < 1:1488472‑M1/3‑1 (MQ=255) tctGCAAACGGTCGAAATAGCGCAGAAAATTACGTTTTGCCTCTTGCCACCTTCCCACTCTGCCGCTAATATTCGTCCCCGTTGTCACCTACAACGTTGCg > 1:1186961/1‑101 (MQ=255) ctGCAAACGGTCGAAATAGCGCAGAAAATTACGTTTTGCCTCTTGCCACCTTCCCACTCTGCCGCTAATATTCGTCCCCGTTGTCACCTACAACGTTGCGt > 1:1341381/1‑101 (MQ=255) ctGCAAACGGTCGAAATAGCGCAGAAAATTACGTTTTGCCTCTTGCCACCTTCCCACTCTGCCGCTAATATTCGTCCCCGTTGTCACCTACAACGTTGCGt > 2:652524/1‑101 (MQ=255) tGCAAACGGTCGAAATAGCGCAGAAAATTACGTTTTGCCTCTTGCCACCTTCCCACTCTGCCGCTAATATTCGTCCCCGTTGTCACCTACAACGTTGCGtt < 1:183338/101‑1 (MQ=255) gCAAACGGTCGAAATAGCGCAGAAAATTACGTTTTGCCTCTTGCCACCTTCCCACTCTGCCGCTAATATTCGTCCCCGTTGTCACCTACAACGTTGCGTTc > 1:1599597/1‑101 (MQ=255) cAAACGGTCGAAATAGCGCAGAAAATTACGTTTTGCCTCTTGCCACCTTCCCACTCTGCCGCTAATATTCGTCCCCGTTGTCACCTACAACGTTGCGTTCa > 1:973261/1‑101 (MQ=255) aaaCGGTCGAAATAGCGCAGAAAATTACGTTTTGCCTCTTGCCACCTTCCCACTCTGCCGCTAATATTCGTCCCCGTTGTCACCTACAACGTTGCGTTCAt > 2:258347/1‑101 (MQ=255) aaaCGGTCGAAATAGCGCAGAAAATTACGTTTTGCCTCTTGCCACCTTCCCACTCTGCCGCTAATATTCGTCCCCGTTGTCACCTACAACGTTGCGTTCAt < 1:1089375/101‑1 (MQ=255) cctacaacgttgcgttcatagctcagttggttagagcacaaccttgacatggtgggggtcgttggttcgagtccaattgaacgcaccatcctgcgtccgta > 1:1550718‑M1/92‑96 (MQ=255) ctacaacgttgcgttcatagctcagttggttagagcaccaccttgacatggtgggggtcgttggttcgagtccaattgaacgcaccatcctgcgtccgtag < 2:911352‑M1/11‑7 (MQ=255) cGGTCGAAATAGCGCAGAAAATTACGTTTTGCCTCTTGCCACCTTCCCACTCTGCCGCTAATATTCGTCCCCGTTGTCACCTACAACGTTGCGTTCATAGc > 2:21200/1‑101 (MQ=255) ggTCGAAATAGCGCAGAAAATTACGTTTTGCCTCTTGCCACCTTCCCACTCTGCCGCTAATATTCGTCCCCGTTGTCACCTACAACGTTGCGTTCATAGCt > 2:1109718/1‑101 (MQ=255) acaacgttgcgttcatagctcagttggttagagcaccaccttgacatggtgggggtcgttggttcgagtccaattgaacgcaccatccTGCGTCCGTAGCt < 1:296420‑M1/13‑1 (MQ=255) acaacgttgcgttcatagctcagttggttagagcaccaccttgacatggtgggggtcgttggttcgagtccaattgaacgcaccatccTGCGTCCGTAGCt < 1:1357555‑M1/13‑1 (MQ=255) cGAAATAGCGCAGAAAATTACGTTTTGCCTCTTGCCACCTTCCCACTCTGCCGCTAATATTCGTCCCCGTTGTCACCTACAACGTTGCGTTCATAGCTCAg < 1:1682479/101‑1 (MQ=255) gttgcgttcatagctcagttggttagagcaccaccttgacatggtgggggtcgttggttcgagtccaattgaacgcaccatccTGCGTCCGTAGCTCAGtt > 2:1074259‑M1/84‑101 (MQ=255) aaaTAGCGCAGAAAATTACGTTTTGCCTCTTGCCACCTTCCCACTCTGCCGCTAATATTCGTCCCCGTTGTCACCTACAACGTTGCGTTCATAGCTCAGtt > 2:614561/1‑101 (MQ=255) aTAGCGCAGAAAATTACGTTTTGCCTCTTGCCTCCTTCCCACTCTGCCGCTAATATTCGTCCCCGTTGTCACCTACAACGTTGCGTTCATAGCTCAGTTgg < 2:494523/101‑1 (MQ=255) aTAGCGCAGAAAATTACGTTTTGCCTCTTGCCACCTTCCCACTCTGCCGCTAATATTCGTCCCCGTTGTCACCTACAACGTTGCGTTCATAGCTCAGTTgg > 2:307926/1‑101 (MQ=255) aTAGCGCAGAAAATTACGTTTTGCCTCTTGCCACCTTCCCACTCTGCCGCTAATATTCGTCCCCGTTGTCACCTACAACGTTGCGTTCATAGCTCAGTTgg > 2:423197/1‑101 (MQ=255) gcgttcatagctcagttggttagagcaccaccttgacatggtgggggtcgttggttcgagtccaattgaacgcaccatccTGCGTCCGTAGCTCAGTTGGt > 1:614566‑M1/81‑101 (MQ=255) cgttcatagctcagttggttagagcaccaccttgacatggtgggggtcgttggttcgagtccaattgaacgcaccatccTGCGTCCGTAGCTCAGTTGGtt > 1:1140509‑M1/80‑101 (MQ=255) gttcatagctcagttggttagagcaccaccttgacatggtgggggtcgttggttcgagtccaattgaacgcaccatccTGCGTCCGTAGCTCAGTTGGTTa < 1:630753‑M1/23‑1 (MQ=255) gttcatagctcagttggttagagcaccaccttgacatggtgggggtcgttggttcgagtccaattgaacgcaccatccTGCGTCCGTAGCTCAGTTGGTTa < 1:1423696‑M1/23‑1 (MQ=255) gttcatagctcagttggttagagcaccaccttgacatggtgggggtcgttggttcgagtccaattgaacgcaccatccTGCGTCCGTAGCTCAGTTGGTTa < 1:90514‑M1/23‑1 (MQ=255) cgcAGAAAATTACGTTTTGCCTCTTGCCACCTTCCCACTCTGCCGCTAATATTCGTCCCCGTTGTCACCTACAACGTTGCGTTCATAGCTCAGTTGGTTag > 1:1354393/1‑101 (MQ=255) aaaTTACGTTTTGCCTCTTGCCACCTTCCCACTCTGCCGCTAATATTCGTCCCCGTTGTCACCTACAACGTTGCGTTCATAGCTCAGTTGGTTAGAGcacc < 2:437231/101‑1 (MQ=255) tACGTTTTGCCTCTTGCCACCTTCCCACTCTGCCGCTAATATTCGTCCCCGTTGTCACCTACAACGTTGCGTTCATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCt < 2:1309107/101‑1 (MQ=255) tACGTTTTGCCTCTTGCCACCTTCCCACTCTGCCGCTAATATTCGTCCCCGTTGTCACCTACAACGTTGCGTTCATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCt < 1:1098173/101‑1 (MQ=255) tACGTTTTGCCTCTTGCCACCTTCCCACTCTGCCGCTAATATTCGTCCCCGTTGTCACCTACAACGTTGCGTTCATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCt > 1:455233/1‑101 (MQ=255) gatcttttGCCTCTTGCCACCTCCCCACTCTGCCGCTAATATTCGTCCCCGTTGTCACCTACAACGTTGCGTTCATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCt < 2:835306/97‑1 (MQ=255) gttggttagagcaccaccttgacatggtgggggtcgttggttcgagtccaattgaacgcaccatccTGCGTCCGTAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCtt > 2:104946‑M1/67‑101 (MQ=255) gttggttagagcaccaccttgacatggtgggggtcgttggttcgagtccaattgaacgcaccatccTGCGTCCGTAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCtt < 2:1419026‑M1/35‑1 (MQ=255) gTTTTGCCTCTTGCCACCTTCCCACTCTGCCGCTAATATTCGTCCCCGTTGTCACCTACAACGTTGCGTTCATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGa > 2:866555/1‑101 (MQ=255) ggttagagcaccaccttgacatggtgggggtcgttggttcgagtccaattgaacgcaccatccTGCGTCCGTAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGAc < 2:671242‑M1/38‑1 (MQ=255) tttGCCTCTTGCCACCTTCCCACTCTGCCGCTAATATTCGTCCCCGTTGTCACCTACAACGTTGCGTTCATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTAGatc > 1:835311/1‑99 (MQ=255) gttagagcaccaccttgacatggtgggggtcgttggttcgagtccaattgaacgcaccatccTGCGTCCGTAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACa < 2:1709682‑M1/39‑1 (MQ=255) agagcaccaccttgacatggtgggggtcgttggttcgagtccaattgaacgcaccatccTGCGTCCGTAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACAtgg < 2:327313‑M1/42‑1 (MQ=255) tctTGCCACCTTCCCGCTCTGCCGCTAATATTCGTCCCCGTTGTCACCTACAACGTTGCGTTCATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACAtggtgg < 2:1599591/101‑1 (MQ=255) ctTGCCACCTTCCCACTCTGCCGCTAATATTCGTCCCCGTTGTTACCTACAACGTTGCATTCATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTggg > 2:1140504/1‑101 (MQ=255) caccaccttgacatggtgggggtcgttggttcgagtccaattgaacgcaccatccTGCGTCCGTAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTggg > 2:78455‑M1/56‑101 (MQ=255) caccttgacatggtgggggtcgttggttcgagtccaattgaacgcaccatccTGCGTCCGTAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGt < 1:816270‑M1/49‑1 (MQ=255) accttgacatggtgggggtcgttggttcgagtccaattgaacgcaccatccTGCGTCCGTAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTc < 2:620980‑M1/50‑1 (MQ=255) cttgacatggtgggggtcgttggttcgagtccaattgaacgcaccatccTGCGTCCGTAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCgg < 1:583652‑M1/52‑1 (MQ=255) aCCTTCCCACTCTGCCGCTAATATTCGTCCCCGTTGTCACCTACAACGTTGCGTTCATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCgt > 1:553422/1‑100 (MQ=255) ttCCCACTCTGCCGCTAATATTCGTCCCCGTTGTCACCTACAACGTTGCGTTCATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCgttgg > 1:686934/1‑101 (MQ=255) gacatggtgggggtcgttggttcgagtccaattgaacgcaccatccTGCGTCCGTAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCggtgg > 1:759666‑M1/47‑101 (MQ=255) tCCCCCTCTGCCGCTAATATTCGTCCCCGTTGTCACCTACAACGTTGCGTTCATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCgttggt < 2:1355145/101‑1 (MQ=255) atggtgggggtcgttggttcgagtccaattgaacgcaccatccTGCGTCCGTAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGGTGGTTc < 1:322155‑M1/58‑1 (MQ=255) gtgggggtcgttggttcgagtccaattgaacgcaccatccTGCGTCCGTAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGGTGGTTCGAg < 1:640514‑M1/61‑1 (MQ=255) gtgggggtcgttggttcgagtccaattgaacgcaccatccTGCGTCCGTAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGGTGGTTCGAg > 1:1419032‑M1/41‑101 (MQ=255) tgggggtcgttggttcgagtccagttgaacgcaccatccTGTGTCCGTAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGGTGGTTCGAGt < 1:1250142‑M1/62‑1 (MQ=255) tgggggtcgttggttcgagtccaattgaacgcaccatccTGCGTCCGTAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGGTGGTTCGAGt < 2:682480‑M1/62‑1 (MQ=255) 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tggttcgagtccaattgaacgcaccatccTGCGTCCGTAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTCGGAc < 1:366032‑M1/72‑1 (MQ=255) atatTCGTCCCCGTTGTCACCTACAACGTTGCGTTCATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCaattgaac < 1:307926/101‑8 (MQ=255) atatTCGTCCCCGTTGTCACCTACAACGTTGCGTTCATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCaattgaac < 2:400374/101‑8 (MQ=255) atatTCGTCCCCGTTGTCACCTACAACGTTGCGTTCATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCaattgaac > 2:1550712/1‑94 (MQ=255) gttcgagtccaattgaacgcaccatccTGCGTCCGTAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGGCGGTTCGAGTCCACTCGGACGc < 2:321655‑M1/74‑1 (MQ=255) tCGTCCCCGTTGTCACCTACAACGTTGCGTTCATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCGCCTTGCCATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGGCCAATTGAACGCAc < 2:981300/101‑1 (MQ=255) gagtccaattgaacgcaccatccTGCGTCCGTAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTCGGACGCACCa > 2:640509‑M1/24‑101 (MQ=255) gagtccaattgaacgcaccatccTGCGTCCGTAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTCGGACGCACCa < 1:463537‑M1/78‑1 (MQ=255) gagtccaattgaacgcaccatccTGCGTCCGTAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTCGGACGCACCa < 1:1188784‑M1/78‑1 (MQ=255) gtccaattgaacgcaccatccTGCGTCCGTAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTCGGACGCACCAGa < 1:1540562‑M1/80‑1 (MQ=255) ccccGTTGTCACCTACAACGTTGCGTTCATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGAACGCACCAtc < 1:233491‑M2/101‑3 (MQ=255) tccaattgaacgcaccatccTGCGTCCGTAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTCGGACGCACCAGAt > 1:91793‑M1/21‑101 (MQ=255) cccGTTGTCACCTACAACGTTGCGTTCATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGAACGCACCAtcc > 2:972450‑M2/1‑98 (MQ=255) ccaattgaacgcaccatccTGCGTCCGTAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTCGGACGCACCAGAtt > 1:812891‑M1/20‑101 (MQ=255) 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ccTACAACGTTGCGTTCATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACAACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGAACGCACCAtcctgcgtccgta > 1:1550718‑M2/1‑88 (MQ=255) gcaccatccTGCGTCCGTAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTCGGACGCACCAGATTTTCTTAATCt > 1:786380‑M1/10‑101 (MQ=255) cTACAACGTTGCGTTCATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGAACGCACCAtcctgcgtccgtag < 2:911352‑M2/101‑15 (MQ=255) tACAACGTTGCGTTCATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGAACGCACCAtcctgcgtccgtagc > 2:667077‑M2/1‑86 (MQ=255) accatccTGCGTCCGTAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTCGGACGCACCAGATTTTCTTAATCTgg < 2:1318182‑M1/94‑1 (MQ=255) aCAACGTTGCGTTCATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGAACGCACCAtcctgcgtccgtagct < 1:296420‑M2/101‑17 (MQ=255) catccTGCGTCCGTAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTCGGACGCACCAGATTTTCTTAATCTGGtc < 2:1468867‑M1/96‑1 (MQ=255) gTTGCGTTCATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGTTGGTTCGAGTCCAATTGAACGCACCAtcctgcgtccgtagctcagtt > 2:1074259‑M2/1‑80 (MQ=255) cTGCGTCCGTAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTCGGACGCACCAGATTTTCTTAATCTGGtcttct > 1:866560‑M1/2‑101 (MQ=255) tGCGTCCGTAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTCGGACGCACCAGATTTTCTTAATCTGGTCTtctc > 2:1272635/1‑101 (MQ=255) | CTCTGCAAACGGTCGAAATAGCGCAGAAAATTACGTTTTGCCTCTTGCCACCTTCCCACTCTGCCGCTAATATTCGTCCCCGTTGTCACCTACAACGTTGCGTTCATAGCTCAGTTGGTTAGAGCACCACCTTGACATGGTGGGGGTCGGTGGTTCGAGTCCACTCGGACGCACCAGATTTTCTTAATCTGGTCTTCTC > 2/33264‑33462 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |