| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 2 | 1 = | 0 (0.000) | 52 (0.930) +TTAC |
46/192 | 0.2 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 77 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGGCCTGTTTAAAGCTAACCCGTCTTCTCTGCTTTCTACATGCTATGAGAAAAACGACCCGCGTCTGGACGGTGCATTCACCATGTACTACATG > 2/1‑94 | tcggcgctattgtgctggcgattggttatgctctggttgcctggtctggtcacgacgccggtatcgtttatatgggtatggcggctattgcggtcggtaac > 1:92090‑M1/101‑101 (MQ=255) gcgctattgtgctggcgattggttatgctctggttgcctggtctggtcacgacgccggtatcgtttatatgggtatggcggctattgcggtcggtaaCGGc > 1:682134‑M1/98‑101 (MQ=255) ctattgtgctggcgattggttatgctctggttgcctggtctggtcacgacgccggtatcgtttatatgggtatggcggctattgcggtcggtaaCGGCCTg > 1:1179599‑M1/95‑101 (MQ=255) tattgtgctggcgattggttatgctctggttgcctggtctggtcacgacgccggtatcgtttatatgggtatggcggctattgcgggcggtaaCGGCCTGt < 1:911696‑M1/8‑1 (MQ=255) attgtgctggcgattggttatgctctggttgcctggtctggtcacgacgccggtatcgtttatatgggtatggcggctattgcggtcggtaaCGGCCTGtt > 1:443424‑M1/93‑101 (MQ=255) ttgtgctggcgattggttatgctctggttgcctggtctggtcacgacgccggtatcgtttatatgggtatggcggctattgcggtcggtaaCGGCCTGttt > 2:586426‑M1/92‑101 (MQ=255) tgctggcgattggttatgctctggttgcctggtctggtcacgacgccggtatcgtttatatgggtatggcggctattgcggtcggtaaCGGCCTGTTTaaa > 1:1290625‑M1/89‑101 (MQ=255) gctggcgattggttatgctctggttgcctggtctggtcacgacgccggtatcgtttatatgggtatggcggctattgcggtcggtaaCGGCCTGTTTAAAg > 1:1269775‑M1/88‑101 (MQ=255) ctggcgattggttatgctctggttgcctggtctggtcacgacgccggtatcgtttatatgggtatggcggctattgcggtcggtaaCGGCCTGTTTAAAGc < 2:239853‑M1/15‑1 (MQ=255) cgattggttatgctctggttgcctggtctggtcacgacgccggtatcgtttatatgggtatggcggctactgcggtcggtaaCGGCCTGTTTAAAGCTAAc < 1:184305‑M1/19‑1 (MQ=255) gattggttatgctctggttgcctggtctggtcacgacgccggtatcgtttatatgggtatggcggctattgcggtcggtaaCGGCCTGTTTAAAGCTAAcc > 2:1535585‑M1/82‑101 (MQ=255) gttatgctctggttgcctggtctggtcacgacgccggtatcgtttatatgggtatggcggctattgcggtcggtaaCGGCCTGTTTAAAGCTAACCCGtct < 2:272770‑M1/25‑1 (MQ=255) gttatgctctggttgcctggtctggtcacgacgccggtatcgtttatatgggtatggcggctattgcggtcggtaaCGGCCTGTTTAAAGCTAACCCGtct > 2:948714‑M1/77‑101 (MQ=255) ttatgctctggttgcctggtctggtcacgacgccggtatcgtttatatgggtatggcggctattgcggtcggtaaCGGCCTGTTTAAAGCTAACCCGtctt > 1:717995‑M1/76‑101 (MQ=255) atgctctggttgcctggtctggtcacgacgccggtatcgtttatatgggtatggcggctattgcggtcggtaaCGGCCTGTTTAAAGCTAACCCGtcttct < 1:1218826‑M1/28‑1 (MQ=255) gctctggttgcctggtctggtcacgacgccggtatcgtttatatgggtatggcggctatttcgggcggcaaCGGCCTGTTTAAAGCTAACTCATCTActct < 1:1320811‑M1/30‑1 (MQ=255) gctctggtgcccgggtctggtcacgacgtgggtatcgtttatatgggtatggcggctattgcggtcggtatCGGCCTGTTTAAAGCTAACccgtattcgct > 2:868509‑M1/72‑98 (MQ=255) ctggttgcctggtctggtcacgacgccggtatcgtttatatgggtatggcggctattgcggtcggtaaCGGCCTGTTTAAAGCTAACCCGTCTTCTCTGCt > 2:782192‑M1/69‑101 (MQ=255) ctggttgcctggtctggtcacgacgccggtatcgcttatatgggtatggcggctattgcggtcggtaaCGGCCTGTTTAAAGCTAACCCGTCTTCTCTGCt < 1:1071480‑M1/33‑1 (MQ=255) tggttgcctggtctggtcacgacgccggtatcgtttatatgggtatggcggctattgcggtcggtaaCGGCCTGTTTAAAGCTAACCCGTCTTCTCTGCtt < 2:327626‑M1/34‑1 (MQ=255) tggttgcctggtctggtcacgacgccggtatcgtttatatgggtatggcggctattgcggtcggtaaCGGCCTGTTTAAAGCTAACCCGTCTTCTCTGCtt > 1:17883‑M1/68‑101 (MQ=255) ttgcctggtctggtcacgacgccggtatcgtttatatgggtatggcggctattgcggtcggtaaCGGCCTGTTTAAAGCTAACCCGTCTTCTCTGCTTTCt > 1:1503081‑M1/65‑101 (MQ=255) ttgcctggtctggtcacgacgccggtatcgtttatatgggtatggcggctattgcggtcggcaaCGGCCTGGTTAAAGCTTACCCCACTTTTCTGCCTTCt < 1:1153675‑M1/37‑1 (MQ=255) tgcctggtctggtcacgacgccggtatcgtttatatgggtatggcggctattgcggtcggtaaCGGCCTGTTTAAAGCTAACCCGTCTTCTCTGCTTTCTa > 1:1318271‑M1/64‑101 (MQ=255) gcctggtctggtcacgacgccggtatcgtttatatgggtatggcggctattgcggtcggtaaCGGCCTGTTTAAAGCTAACCCGTCTTCTCTGCTTTCTAc < 1:1565347‑M1/39‑1 (MQ=255) gtctggtcacgacgccggtatcgtttatatgggtatggcggctattgcggtcggtaaCGGCCTGTTTAAAGCTAACCCGTCTTCTCTGCTTTCTACATGCt < 1:1164447‑M1/44‑1 (MQ=255) ggtcacgacgccggtatcgtttatatgggtatggcggctattgggggcggtaaCGGTCTGTTTAAAGCTAACCCGTCTTCTCTGCTTTCTACATGCtatta < 1:1117899‑M1/48‑3 (MQ=255) ggtcacgacgccggtatcgtttatatgggtatggcggctattgcggtcggtaaCGGCCTGTTTAAAGCTAACCCGTCTTCTCTGCTTTCTACATGCTATga < 1:774226‑M1/48‑1 (MQ=255) cacgacgccggtatcgtttatatgggtatggcggctattgcggtcggtaaCGGCCTGTTTAAAGCTAACCCGTCTTCTCTGCTTTCTACATGCTATGAGaa > 1:1379178‑M1/51‑101 (MQ=255) gacgccggtatcgtttatatgggtatggcggctattgcggtcggtaaCGGCCTGTTTAAAGCTAACCCGTCTTCTCTGCTTTCTACATGCTATGAGaaaaa > 1:434939‑M1/48‑101 (MQ=255) acgccggtatcgtttatatgggtatggcggctattgcggtcggtaaCGGCCTGTTTAAAGCTAACCCGTCTTCTCTGCTTTCTTCATGCTATGAGAAAAAc < 1:1197588‑M1/55‑1 (MQ=255) ccggtatcgtttatatgggtatggcggctattgcggtcggtaaCGGCCTGTTTAAAGCTAACCCGTCTTCTCTGCTTTCTACATGCTATGAGAAAAACGAc > 1:450798‑M1/44‑101 (MQ=255) cggtatcgtttatatgggtatggcgtctattgcggtcggtaaCGGCCTGTTTAAAGCTAACCCGTCTTCTCTGCTTTCTACATGCTATGAGAAAAACGAcc > 2:165894‑M1/43‑101 (MQ=255) cggtatcgtttatatgggtatggcggctattgcggtcggtaaCGGCCTGTTTAAAGCTAACCCGTCTTCTCTGCTTTCTACATGCTATGAGAAAAACGAcc < 1:168591‑M1/59‑1 (MQ=255) cggtatcgtttatatgggtatggcggctattgcggtcggtaaCGGCCTGTTTAAAGCTAACCCGTCTTCTCTGCTTTCTACATGCTATGAGAAAAACGAcc > 2:27312‑M1/43‑101 (MQ=255) cggtatcgtttatatgggtatggcggctattgcggtcggtaaCGGCCTGTTTAAAGCTAACCCGTCTTCTCTGCTTTCTACATGCTATGAGAAAAACGAcc > 2:1477578‑M1/43‑101 (MQ=255) ggtatcgtttatatgggtatggcggctattgcggtcggtaaCGGCCTGTTTAAAGCTAACCCGTCTTCTCTGCTTTCTACATGCTATGAGAAAAACGAccc > 2:1412371‑M1/42‑101 (MQ=255) gtatcgtttatatgggtatggcggctattgcggtcggtaaCGGCCTGTTTAAAGCTAACCCGTCTTCTCTGCTTTCTACATGCTATGAGAAAAACGACCcg > 1:518004‑M1/41‑101 (MQ=255) tatcgtttatatgggtatggcggctattgcggtcggtaaCGGCCTGTTTAAAGCTAACCCGTCTTCTCTGCTTTCTACATGCTATGAGAAAAACGACCcgc < 1:369281‑M1/62‑1 (MQ=255) cgtttatatgggtatggcggctattgcggtcggtaaCGGCCTGTTTAAAGCTAACCCGTCTTCTCTGCTTTCTACATGCTATGAGAAAAACGACCCGCGTc < 1:57941‑M1/65‑1 (MQ=255) atgggtatggcggctattgcggtcggtaaCGGCCTGTTTAAAGCTAACCCGTCTTCTCTGCTTTCTACATGCTATGAGAAAAACGACCCGCGTCTGGACgg > 1:328433‑M1/30‑101 (MQ=255) gtatggcggctattgcggtcggtaaCGGCCTGTTTAAAGCTAACCCGTCTTCTCTGCTTTCTACATGCTATGAGAAAAACGACCCGCGTCTGGACGGTGCa > 2:1238832‑M1/26‑101 (MQ=255) tatggcggctattgcggtcggtaaCGGCCTGTTTAAAGCTAACCCGTCTTCTCTGCTTTCTACATGCTATGAGAAAAACGACCCGCGTCTGGACGGTGCAt < 2:1398904‑M1/77‑1 (MQ=255) tggcggctattgcggtcggtaaCGGCCTGTTTAAAGCTAACCCGTCTTCTCTGCTTTCTACATGCTATGAGAAAAACGACCCGCGTCTGGACGGTGCATTc > 2:1145985‑M1/23‑101 (MQ=255) ggcggctattgcggtcggtaaCGGCCTGTTTAAAGCTAACCCGTCTTCTCTGCTTTCTACATGCTATGAGAAAAACGACCCGCGTCTGGACGGTGCATTCa < 1:792162‑M1/80‑1 (MQ=255) ggctattgcggtcggtaaCGGCCTGTTTAAAGCTAACCCGTCTTCTCTGCTTTCTACATGCTATGAGAAAAACGACCCGCGTCTGGACGGTGCATTCACCa < 2:240390‑M1/83‑1 (MQ=255) gctattgcggtcggtaaCGGCCTGTTTAAAGCTAACCCGTCTTCTCTGCTTTCTACATGCTATGAGAAAAACGACCCGCGTCTGGACGGTGCATTCACCAt > 2:1164442‑M1/18‑101 (MQ=255) gctattgcggtcggtaaCGGCCTGTTTAAAGCTAACCCGTCTTCTCTGCTTTCTACATGCTATGAGAAAAACGACCCGCGTCTGGACGGTGCATTCACCAt > 2:966536‑M1/18‑101 (MQ=255) tattgcggtcggtaaCGGCCTGTTTAAAGCTAACCCGTCTTCTCTGCTTTCTACATGCTATGAGAAAAACGACCCGCGTCTGGACGGTGCATTCACCATGt < 2:115893‑M1/86‑1 (MQ=255) tattgcggtcggtaaCGGCCTGTTTAAAGCTAACCCGTCTTCTCTGCTTTCTACATGCTATGAGAAAAACGACCCGCGTCTGGACGGTGCATTCACCATGt < 1:1333608‑M1/86‑1 (MQ=255) gtcggtaaCGGCCTGTTTAAAGCTAACCCGTCTTCTCTGCTTTCTACATGCTATGAGAAAAACGACCCGCGTCTGGACGGTGCATTCACCATGTACTACAt > 2:774221‑M1/9‑101 (MQ=255) tcggtaaCGGCCTGTTTAAAGCTAACCCGTCTTCTCTGCTTTCTACATGCTATGAGAAAAACGACCCGCGTCTGGACGGTGCATTCACCATGTACTACATg > 2:1218821‑M1/8‑101 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGGCCTGTTTAAAGCTAACCCGTCTTCTCTGCTTTCTACATGCTATGAGAAAAACGACCCGCGTCTGGACGGTGCATTCACCATGTACTACATG > 2/1‑94 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |