| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 197 | 1 = | 0 (0.000) | 66 (1.050) | 57/198 | 0.1 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 202 | = 4398 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCGATGATTGTTGATCTGAATACCAACAAAGTGATCTATTCGAACCACCCGGATCTGG > 197/1‑101 | atctgaatgctcatcatgccgaaatttcaagtttctttatttagcctggccctgatgctggctgtgccttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGc < 2:1199231‑M1/3‑1 (MQ=255) tctgaatgctcatcatgccgaaatttcgagtttctttatttagcctggccctgatgctggctgtgccttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGcc > 2:726560‑M1/98‑101 (MQ=255) ctgaatgctcatcatgccgaaatttcgagtttctttatttagcctggccctgatgcagtctgtgccttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCg > 2:865366‑M1/97‑101 (MQ=255) tgaatgctcatcatgccgaaatttcgagtttctttatttagcctggccctgatgctggctgtgccttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGc < 1:87902‑M1/6‑1 (MQ=255) atgctcatcatgccgaaatttcgagtttctttatttagcctggccctgatgctggctgtgccttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTac > 2:98124‑M1/93‑101 (MQ=255) ctcatcatgccgaaatttcgagtttctttatttagcctggccctgatgctggctgtgccttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTaccac < 2:131831‑M1/12‑1 (MQ=255) ctcatcatgccgaaatttcgagtttctttatttagcctggccctgatgctggctgtgccttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTaccac < 1:978643‑M1/12‑1 (MQ=255) tcatcatgccgaaatttcgagtttctttatttagcctggccctgatgctggctgtgccttttgccccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTaccacc > 2:473610‑M1/89‑101 (MQ=255) catcatgccgaaatttcgagtttctttatttagcctggccctgatgctggctgtgccttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCg < 2:612742‑M1/14‑1 (MQ=255) catgccgaaatttcgagtttctttatttagcctggccctgatgctggctgtgccttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCtt > 2:271560‑M1/85‑101 (MQ=255) atgccgaaatttcgagtttctttatttagcctggccctgatgctggctgtgccttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTc < 1:369452‑M1/18‑1 (MQ=255) ccgaaatttcgggtttctttatttagcctggccctgatgctggctgtgccttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTcaca > 2:1098377‑M1/81‑101 (MQ=255) gaaatttcgagtttctttatttagcctggccctgatgctggctgtgccttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAAc > 2:445255‑M1/79‑101 (MQ=255) ttcgagtttctttatttagcctggccctgatgctggctgtgccttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGaa < 1:1450508‑M1/28‑1 (MQ=255) cgagtttctttatttagcctggccctgatgctggctgtgccttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAAt > 1:1023229‑M1/72‑101 (MQ=255) agtttctttatttagcctggccctgatgctggctgtgccttttgtaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTg < 2:1591928‑M1/32‑1 (MQ=255) agtttctttatttagcctggccctgatgctggctgtgccttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTg > 1:1234900‑M1/70‑101 (MQ=255) tttctttatttagcctggccctgatgctggctgtgccttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGcc < 1:864279‑M1/34‑1 (MQ=255) ttctttatttagcctggccctgatgctggctgtgccttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCt < 2:452626‑M1/35‑1 (MQ=255) ctttatttagcctggccctgatgctggctgtgccttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTcc > 2:1306065‑M1/65‑101 (MQ=255) tttatttagcctggccctgatgctggctgtgccttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCg < 2:838394‑M1/38‑1 (MQ=255) ttatttagcctggccctgatgctggctgtgccttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCgg < 2:111132‑M1/39‑1 (MQ=255) tatttagcctggccctgatgctggctgtgccttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGt > 1:160750‑M1/62‑101 (MQ=255) tttagcctggccctgatgctggctgtgccttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAg > 2:1231939‑M1/60‑101 (MQ=255) tttagcctggccctgatgctggctgtgccttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAg < 1:928566‑M1/42‑1 (MQ=255) tttagcccggccatgatgctggctgtgcctttggcaccgcaggccgttgggaaaaccgcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAg > 2:900879‑M1/60‑101 (MQ=255) ctggccctgatgctggctgtgccttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCgat < 1:11550‑M1/48‑1 (MQ=255) ctggccctgatgctggctgtgccttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCgat < 2:1312436‑M1/48‑1 (MQ=255) tggccctgatgctggctgtgccttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCgatg < 1:763525‑M1/49‑1 (MQ=255) tggccctgatgctggctgtgccttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCgatg < 1:938223‑M1/49‑1 (MQ=255) ccctgatgctggctgtgccttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCGATGAtt < 2:472756‑M1/52‑1 (MQ=255) cctgatgctggctgtgccttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGGCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGAAGCGCGATGAttg < 2:1277589‑M1/53‑1 (MQ=255) cctgatgctggctgtgccttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCGATGAttg < 1:462372‑M1/53‑1 (MQ=255) atgctggctgtgccttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCGATGATTGTTGa < 2:1111223‑M1/57‑1 (MQ=255) tggctgtgccttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCGATGATTGTTGATCTg > 1:1185875‑M1/41‑101 (MQ=255) ggctgtgccttttgcacggcaggccgttgcgaaatcggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCGATGATTGTTGATCTGa > 2:117835‑M1/40‑101 (MQ=255) ctgtgccttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCGATGATTGTTGATCTGAAt > 2:925606‑M1/38‑101 (MQ=255) ctgtgccttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCGATGATTGTTGATCTGAAt > 1:434435‑M1/38‑101 (MQ=255) tgtgccttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCGATGATTGTTGATCTGAATa > 1:131831‑M1/37‑101 (MQ=255) tgtgccttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCGATGATTGTTGATCTGAATa < 1:1049992‑M1/65‑1 (MQ=255) gtgccttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCGATGATTGTTGATCTGAATAc < 2:1028742‑M1/66‑1 (MQ=255) gtgccttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCGATGATTGTTGATCTGAATAc < 1:1688500‑M1/66‑1 (MQ=255) gtgccttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCGATGATTGTTGATCTGAATAc > 1:636935‑M1/36‑101 (MQ=255) gtgccttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCATCCGGTAGCGCGATGATTGTTGATCTGAATAc < 1:564048‑M1/66‑1 (MQ=255) gccttttgcgccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCGATGATTGTTGATCTGAATACca > 2:941333‑M1/34‑101 (MQ=255) gccttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCGATGATTGTTGATCTGAATACca < 1:119791‑M1/68‑1 (MQ=255) cttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCGATGATTGTTGATCTGAATACcaac < 1:1168595‑M1/70‑1 (MQ=255) cttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCGATGATTGTTGATCTGAATACcaac < 1:408162‑M1/70‑1 (MQ=255) cttttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCGATGATTGTTGATCTGAATACcaac > 2:524526‑M1/32‑101 (MQ=255) tttgcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCTCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCGATGATTGTTGATCTGAATACcaacaa < 1:108100‑M1/72‑1 (MQ=255) gcaccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCGATGATTGTTGATCTGAATACCAACAAAGt > 1:1708626‑M1/27‑101 (MQ=255) caccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCGATGATTGTTGATCTGAATACCAACAAAGTg < 2:460910‑M1/76‑1 (MQ=255) accgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCGATGATTGTTGATCTGAATACCAACAAAGTGa < 1:1146208‑M1/77‑1 (MQ=255) ccgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCGATGATTGTTGATCTGAATACCAACAAAGTGAt > 1:528334‑M1/24‑101 (MQ=255) cgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCGATGATTGTTGATCTGAATACCAACAAAGTGATc < 1:951230‑M1/79‑1 (MQ=255) cgcaggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCGATGATTGTTGATCTGAATACCAACAAAGTGATc > 2:564043‑M1/23‑101 (MQ=255) caggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCGATGATTGTTGATCTGAATACCAACAAAGTGATCTa > 1:111132‑M1/21‑101 (MQ=255) ggccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCGATGATTGTTGATCTGAATACCAACAAAGTGATCTAtt > 1:612747‑M1/19‑101 (MQ=255) gccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCGATGATTGTTGATCTGAATACCAACAAAGTGATCTATTc < 2:1231035‑M1/84‑1 (MQ=255) ccgttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCGATGATTGTTGATCTGAATACCAACAAAGTGATCTATTCg > 1:1602550‑M1/17‑101 (MQ=255) gttgcgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCGATGATTGTTGATCTGAATACCAACAAAGTGATCTATTCGaa < 2:93856‑M1/87‑1 (MQ=255) cgaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCGATGATTGTTGATCTGAATACCAACAAAGTGATCTATTCGAaccac < 2:1151658‑M1/91‑1 (MQ=255) gaaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCGATGATTGTTGATCTGAATACCAACAAAGTGATCTATTCGAaccacc < 1:1371610‑M1/92‑1 (MQ=255) aaaacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCGATGATTGTTGATCTGAATACCAACAAAGTGATCTATTCGAACCAccc > 2:1228141‑M1/9‑101 (MQ=255) aacggcAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCGATGATTGTTGATCTGAATACCAACAAAGTGATCTATTCGAACCACCCgg < 1:111884‑M1/95‑1 (MQ=255) cAGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCGATGATTGTTGATCTGAATACCAACAAAGTGATCTATTCGAACCACCCGGATCTg > 2:709861‑M1/2‑101 (MQ=255) AGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCGATGATTGTTGATCTGAATACCAACAAAGTGATCTATTCGAACCACCCGGATCTgg > 1:1028747‑M1/1‑101 (MQ=255) AGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCGATGATTGTTGATCTGAATACCAACAAAGTGATCTATTCGAACCACCCGGATCTgg < 2:554998‑M1/101‑1 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGCCGCTACCACCGCTTCACAACCGGAAATTGCCTCCGGTAGCGCGATGATTGTTGATCTGAATACCAACAAAGTGATCTATTCGAACCACCCGGATCTGG > 197/1‑101 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |