New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 19 | = 16877 | 10 (0.160) | 55 (0.070) +GGTGATGCTGCCAACT |
43/168 | 0.3 | 92.9% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 223 | = 698 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
CGTTGGCACCCGCCGCGATAACTTTTTCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGTAATACTCCGTTGACTGAAACAACCAGGTGTTGCTTGAACATGAAATCCGAATGAAATAACGCCGCGATGGCGATAAATTAATCTCATTCGGATGTCG > 19/16777‑16975 | cGTTGGCACCCGCCGCGATAACTTTTTCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATg < 1:472827/101‑1 (MQ=255) gTTGGCACCCGCCGCGATAACTTTTTCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGg < 1:1135756‑M1/101‑2 (MQ=255) ttGGCACCCGCCGCGATAACTTTTTCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGgg < 1:1532574‑M1/101‑3 (MQ=255) tGGCACCCGCCGCGATAACTTTTTCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGTaa > 2:692858/1‑101 (MQ=255) ccgccgCGATAACTTTTTCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgct < 2:1391441‑M1/101‑10 (MQ=255) cgccgcGATAACTTTTTCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctg > 2:978534‑M1/1‑91 (MQ=255) gccgcGATAACTTTTTCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgc > 1:649098‑M1/1‑90 (MQ=255) cgATAACTTTTTCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaac > 1:1282517‑M1/1‑86 (MQ=255) gATAACTTTTTCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaact > 1:855071‑M1/1‑85 (MQ=255) aTAACTTTTTCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaactt > 2:568907‑M1/1‑84 (MQ=255) aTAACTTTTTCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaactt > 1:794072‑M1/1‑84 (MQ=255) aCTTTTTCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttact < 1:420003‑M1/101‑21 (MQ=255) aCTTTTTCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttact > 1:704323‑M1/1‑81 (MQ=255) aCTTTTTCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttact > 1:790630‑M1/1‑81 (MQ=255) aCTTTTTCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttact < 1:997703‑M1/101‑21 (MQ=255) aCTTTTTCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttact > 1:328089‑M1/1‑81 (MQ=255) ttttCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgat > 2:894175‑M1/1‑78 (MQ=255) tttCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgatt < 1:750849‑M1/101‑25 (MQ=255) tCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgattta < 1:139764‑M1/101‑27 (MQ=255) tCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgattta < 1:122504‑M1/101‑27 (MQ=255) cAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgatttag < 1:873931‑M1/101‑28 (MQ=255) aGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacctactgatttagtg > 2:642379‑M1/1‑72 (MQ=255) attattATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgta > 1:767735‑M1/1‑70 (MQ=255) ttattaTCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtat > 1:1457668‑M1/1‑69 (MQ=255) ttattaTCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtat > 2:25663‑M1/1‑69 (MQ=255) attatCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatga > 1:229457‑M1/1‑67 (MQ=255) attatCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatga < 2:96037‑M1/101‑35 (MQ=255) attatCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGGAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatga > 2:392612‑M1/1‑67 (MQ=255) tatCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatg < 1:568912‑M1/101‑37 (MQ=255) tatCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatg < 2:112584‑M1/101‑37 (MQ=255) gcgATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgt < 1:973969‑M1/101‑41 (MQ=255) cgATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtt < 1:1456877‑M1/101‑42 (MQ=255) gATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgttt > 1:1069569‑M1/1‑59 (MQ=255) gATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgttt < 1:894180‑M1/101‑43 (MQ=255) aTCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttt < 1:854816‑M1/101‑44 (MQ=255) cTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttg > 1:1282532‑M1/1‑56 (MQ=255) gTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgag > 1:1403689‑M1/1‑54 (MQ=255) ttGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgagg < 2:109035‑M1/101‑49 (MQ=255) tGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggt < 2:1383312‑M1/101‑50 (MQ=255) gCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtg > 1:920900‑M1/1‑51 (MQ=255) cTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgc > 2:177713‑M1/1‑50 (MQ=255) cTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgc < 1:855400‑M1/101‑52 (MQ=255) gggCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctc < 2:649093‑M1/101‑54 (MQ=255) cTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagt > 2:914880‑M1/1‑44 (MQ=255) cTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggggatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagt > 1:365936‑M1/1‑44 (MQ=255) tAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtg > 2:406407‑M1/1‑43 (MQ=255) aaCGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtgg > 1:638178‑M1/1‑42 (MQ=255) gTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggctt > 2:1305314‑M1/1‑39 (MQ=255) gTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggctt > 2:252726‑M1/1‑39 (MQ=255) tgtAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttct < 2:749442‑M1/100‑65 (MQ=255) tAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgt < 1:114320‑M1/101‑67 (MQ=255) aCGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgttt > 1:1390581‑M1/1‑33 (MQ=255) ttttGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatc > 1:653814‑M1/1‑28 (MQ=255) ttttGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatc > 1:1258106‑M1/1‑28 (MQ=255) tGCGAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtcc < 2:1305704‑M1/101‑82 (MQ=255) agtcattacccTGGACATGTAATACTCCGTTGACTGAAACAACCAGGTGTTGCTTGAACATGAAATCCGAATGAAATAACGCCGCGATGGCGATAAATTaa > 1:1362287/11‑101 (MQ=255) gtcattacccTGGACATGTAATACTCCGTTGACTGAAACAACCAGGTGTTGCTTGAACATGAAATCCGAATGAAATAACGCCGCGATGGCGATAAATTAAt < 2:414037/92‑1 (MQ=255) gAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccttc > 1:1144997‑M1/1‑17 (MQ=255) gAAGCCTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctc > 2:1436594‑M1/1‑17 (MQ=255) cattacccTGGACATGTAATACTCCGTTGACTGAAACAACCAGGTGTTGCTTGAACATGAAATCCGAATGAAATAACGCCGCGATGGCGATAAATTAAtct > 2:223047/8‑101 (MQ=255) cattacccTGGACATGTAATACTCCGTTGACTGAAACAACCAGGTGTTGCTTGAACATGAAATCCGAATGAAATAACGCCGCGATGGCGATAAATTAAtct > 1:737185/8‑101 (MQ=255) attacccTGGACATGTAATACTCCGTTGACTGAAACAACCAGGTGTTGCTTGAACATGAAATCCGAATGAAATAACGCCGCGATGGCGATAAATTAAtctc > 1:1284143/7‑101 (MQ=255) tacccTGGACATGTAATACTCCGTTGACTGAAACAACCAGGTGTTGCTTGAACATGAAATCCGAATGAAATAACGCCGCGATGGCGATAAATTAATCTCAt < 2:270651/97‑1 (MQ=255) ccTTCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgt > 1:601028‑M1/1‑13 (MQ=255) ttCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttc < 2:1069564‑M1/101‑91 (MQ=255) tCTGGACATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttca < 1:1400026‑M1/101‑92 (MQ=255) ccTGGACATGTAATACTCCGTTGACTGAAACAACCAGGTGTTGCTTGAACATGAAATCCGAATGAAATAACGCCGCGATGGCGATAAATTAATCTCATTCg > 2:1391381/2‑101 (MQ=255) ggACATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagct < 2:549172‑M1/101‑95 (MQ=255) ggACATGTAATACTCCGTTGACTGAAACAACCAGGTGTTGCTTGAACATGAAATCCGAATGAAATAACGCCGCGATGGCGATAAATTAATCTCATTCGGAt < 2:92911/101‑1 (MQ=255) ggACATGTAATACTCCGTTGACTGAAACAACCAGGTGTTGCTTGAACATGAAATCCGAATGAAATAACGCCGCGATGGCGATAAATTAATCTCATTCGGAt > 2:957816/1‑101 (MQ=255) cATGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctact < 2:1457662‑M1/101‑98 (MQ=255) aTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactg < 1:120514‑M1/101‑99 (MQ=255) aTGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactg > 2:589722‑M1/1‑3 (MQ=255) | CGTTGGCACCCGCCGCGATAACTTTTTCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGTAATACTCCGTTGACTGAAACAACCAGGTGTTGCTTGAACATGAAATCCGAATGAAATAACGCCGCGATGGCGATAAATTAATCTCATTCGGATGTCG > 19/16777‑16975 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |