| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 161 | = 8872 | 0 (0.000) | 59 (1.080) +TGGCGGCTTACGCCG |
48/170 | 0.1 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 52 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
TGAATAATCATAAACCACTCACCTTTGTTGTTATTAGCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 161/8773‑8872 | tGAATAATCATAAACCACTCACCTTTGTTGTTATTAGCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTAt < 1:1068791‑M1/101‑2 (MQ=255)tGAATAATCATAAACCACTCACCTTTGTTGTTATTAGCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTAt < 2:326032‑M1/101‑2 (MQ=255) aataatCATAAACCACTCACCTTTGTTGTTATTAGCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTAtgg < 2:273830‑M1/101‑4 (MQ=255) aataatCATAAACCACTCACCTTTGTTGTTATTAGCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTAtgg > 1:1342783‑M1/1‑98 (MQ=255) aatCATAAACCACTCACCTTTGTTGTTATTAGCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTAtggcgg > 2:222803‑M1/1‑95 (MQ=255) atCATAAACCACTCACCTTTGTTGTTATTAGCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTAtggcggc < 1:779514‑M1/101‑8 (MQ=255) tCATAAACCACTCACCTTTGTTGTTATTAGCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTAtggcggct < 2:1247564‑M1/101‑9 (MQ=255) cATAAACCACTCACCTTTGTTGTTATTAGCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTAtggcggctt < 2:1606933‑M1/101‑10 (MQ=255) aTAAACCACTCACCTTTGTTGTTATTAGCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTAtggcggctta < 1:1166776‑M1/101‑11 (MQ=255) tAAACCACTCACCTTTGTTGTTATTAGCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTAtggcggcttac < 1:510103‑M1/101‑12 (MQ=255) tttGTTGTTATTAGCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTAtggcggcttacgccgccgttgaaa > 2:1424675‑M1/1‑77 (MQ=255) ttgttgTTATTAGCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTAtggcggggttcgccgccgctgagac > 2:16528‑M1/1‑76 (MQ=255) gttgttATTAGCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTAtggcggcttacgccgccgtttaaactt > 2:1090182‑M1/1‑74 (MQ=255) ttgttATTAGCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTAtggcggcttacgccgccgttgaaacttt > 1:1083697‑M1/1‑73 (MQ=255) tgttATTAGCAGCGGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTAtggcggcttacgccgccgttgaaacttta < 1:887272‑M1/101‑30 (MQ=255) tgttATTAGCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTAtggcggcttacgccgccgttgaaacttta > 1:215688‑M1/1‑72 (MQ=255) gttATTAGCAGCAGAACANNNNNNTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTAtggcggcttacgccgccgttgaaactttaa < 2:649430‑M1/101‑31 (MQ=255) tattaGCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTAtggcggcttacgccgccgttgaaactttaatc < 2:1320235‑M1/101‑33 (MQ=255) tattaGCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTAtggcggcttaccccgccgttgaaactttaata > 1:1291633‑M1/1‑69 (MQ=255) attaGCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTAtggcggcttacgccgccgttgaaactttaatca < 2:1495471‑M1/101‑34 (MQ=255) 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ttGCCTGGATTTTTAtgcgggcttacgccgccgttgaaactttaatcatcacccgccacgcggatcaccactttgccgaagtttttacccttcagcaggcc < 2:985381‑M1/101‑87 (MQ=255) tGCCTGGATTTTTAtggcggcttacgccgccgttgaaactttaatcatctcccgccacgcggatcaccactttgccgaagtttttacccttcagcaggccg < 2:1121024‑M1/101‑88 (MQ=255) ccTGGATTTTTAtggcggcttacgccgccgttgaaacttttatcatcacccgccccgcgggtcaccacttttccgaaggtttttaccttcagccggccgat > 2:874969‑M1/1‑12 (MQ=255) ccTGGATTTTTAtggcggcttacgccgccgttgaaactttaatcatcacccgccacgcggatcaccactttgccgaagtttttacccttcagcaggccgat > 1:339168‑M1/1‑12 (MQ=255) cTGGATTTTTAtggcggcttacgccgccgttgaaactttaatcatcacccgccacgcggatcaccactttgccgaagtttttacccttcagcaggccgata > 2:236765‑M1/1‑11 (MQ=255) cTGGATTTTTAtggcggcttacgccgccgttgaaactttaatcatcacccgccacgcggatcaccactttgccgaagtttttacccttcagcaggccgata > 1:226943‑M1/1‑11 (MQ=255) cTGGATTTTTAtggcggcttacgccgccggtgaaaatttaatcatcacccgccccgcggaaaaccactttgccgaagtttttacccttcagcaggccgcta > 2:1658030‑M1/1‑11 (MQ=255) cTGGATTTTTAtggcggctgacgccgccgttgaaactttaatcatcacccgccacgcggatcaccactttgccgaagttttttcccttcagcaggccgata < 2:952416‑M1/101‑91 (MQ=255) ggATTTTTAtggcggcttacgccgccgttgaaactttaatcatcacccgccacgcggatcaccactttgccgaagtttttacccttcagcaggccgataaa > 1:1648298‑M1/1‑9 (MQ=255) ttttAtggcggcttacgccgccgttgaaactttaatcatcacccgccacccggatcacacctttgccgaagtttttacccttcagcaggccgataaaagtc > 1:1367799‑M1/1‑5 (MQ=255) tttAtggcggtttacgccgccgttgaaactttaatcatcacccgccacgcggatcaccactttgccgaagtttttacccttcagcaggccgataaacgtct < 1:640496‑M1/101‑98 (MQ=255) tttAtggcggcttacgccgccgttgaaactttaatcatcacccgccacgcggatcaccactttgccgaagtttttacccttcagcaggccgataaacgtct < 2:1401810‑M1/101‑98 (MQ=255) ttAtggcggcttacgccgccgttgaaactttaatcatcacccgccacgcggatcaccactttgccgaagtttttacccttcagcaggccgataaacgtctg < 1:1281122‑M1/101‑99 (MQ=255) tAtggcggcttacgccgccgttgaaactttaatcatcacccgccacgcggatcaccactttgccgaagtttttacccttcagcaggccgataaacgtctgt > 2:1079054‑M1/1‑2 (MQ=255) | TGAATAATCATAAACCACTCACCTTTGTTGTTATTAGCAGCAGAACAATGACGTGGTTAGTTAATTAAAGCTGAAAATAAGCTTTTTGCCTGGATTTTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 161/8773‑8872 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |