New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 14 | = 52173 | 0 (0.000) | 301 (0.320) +CT |
93/196 | 0.0 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 223 | = 698 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Only 100 of 303 total aligned reads displayed.
AGAAATTATATTTAAAGATGAGTTTGCTGCGGTCATTCCTGACAATGATAGTACTCAGGCGGCATGTGCAAAACGCCTCAACATTCGGTGATGCTGCCAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 14/52074‑52173 | aaaTTATATTTAAAGATGAGTTTGCTGCGGTCATTCCTGACAATGATAGTACTCAGGCGGCATGTGCAAAACGCCTCAACATTCGGTGATGCTGCCAActt < 1:1191333‑M1/101‑4 (MQ=255) aTTATATTTAAAGATGAGTTTGCTGCGGTCATTCCTGACAATGATAGTCCTCAGGCGGCATGTGCAAAACGCCTCAACATTCGGTGATGCTGCCAActtac < 2:1674613‑M1/101‑6 (MQ=255) ttATATTTAAAGATGAGTTTGCTGCGGTCATTCCTGACAATGATAGTACTCAGGCGGCATGTGCAAAACGCCTCAACATTCGGTGATGCTGCCAActtact > 2:433425‑M1/1‑95 (MQ=255) atTTAAAGATGAGTTTGCTGCGGTCATTCCTGACAATGATAGTACTCAGGCGGCATGTGCAAAACGCCTCAACATTCGGTGATGCTGCCAActtactgatt < 2:1656839‑M1/101‑11 (MQ=255) tAAAGATGAGTTTGCTGCGGTCATTCCTGACAATGATAGTACTCAGGCGGCATGTGCAAAACGCCTCAACATTCGGTGATGCTGCCAActtactgatttag < 2:200807‑M1/101‑14 (MQ=255) aaaGATGAGTTTGCTGCGGTCATTCCTGACAATGATAGTACTCAGGCGGCATGTGCAAAACGCCTCAACATTCGGTGATGCTGCCAActtactgatttagt < 2:591480‑M1/101‑15 (MQ=255) aGATGAGTTTGCTGCGGTCATTCCTGACAATGATAGTACTCAGGCGGCATGTGCAAAACGCCTCAACATTCGGTGATGCTGCCAActtactgatttagtgt > 2:568489‑M1/1‑85 (MQ=255) gATGAGTTTGCTGCGGTCATTCCTGACAATGATAGTACTCAGGCGGCATGTGCAAAACGCCTCAACATTCGGTGATGCTGCCAActtactgatttagtgta > 1:465555‑M1/1‑84 (MQ=255) tGAGTTTGCTGCGGTCATTCCTGACAATGATAGTACTCAGGCGGCATGTGCAAAACGCCTCAACATTCGGTGATGCTGCCAActtactgatttagtgtatg > 2:239589‑M1/1‑82 (MQ=255) tgctgcGGTCATTCCTGACAATGATAGTACTCAGGCGGCATGTGCAAAACGCCTCAACATTCGGTGATGCTGCCAActtactgatttagtgtatgatggtg > 2:119098‑M1/1‑76 (MQ=255) cGGTCATTCCTGAGAATGATAGTACTCAGGCGGCATGTGCAAAACGCCTCAACATTCGGTGATGCTGCCAActtactgatttagtgtatgatggtgttttt > 1:1036448‑M1/1‑71 (MQ=255) gTCATTCCTGACAATGATAGGACTCAGGCGGCATGTGCAAAACGCCTCAACATTCGGTGATGCTGCCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttga > 2:1429980‑M1/1‑69 (MQ=255) cATTCCTGACAATGATAGTACTCAGGCGGCATGTGCAAAACGCCTCAACATTCGGTGATGCTGCCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgagg < 2:1137590‑M1/101‑35 (MQ=255) cAATGATAGTACTCAGGCGGCATGTGCAAAACGCCTCAACATTCGGTGATGCTGCCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagt > 1:172412‑M1/1‑58 (MQ=255) aaTGATAGTACTCAGGCGGCATGTGCAAAACGCCTCAACATTCGGTGATGCTGCCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtg > 1:38677‑M1/1‑57 (MQ=255) aaTGATAGTACTCAGGCGGCATGTGCAAAACGCCTCAACATTCGGTGATGCTGCCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtg < 2:708543‑M1/101‑45 (MQ=255) aTGATAGTACTCAGGCGGCATGTGCAAAACGCCTCAACATTCGGTGATGCTGCCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtgg < 2:1082504‑M1/101‑46 (MQ=255) aTGATAGTACTCAGGCGGCATGTGCAAAACGCCTCAACATTCGGTGATGCTGCCAActtactgatttacgggatgatggtgttttggaggtgctccagtgg > 2:1062869‑M1/1‑56 (MQ=255) aCTCAGGCGGCATGTGCAAAACGCCTCAACATTCGGTGATGCTGCCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtt > 1:1581994‑M1/1‑48 (MQ=255) cAGGCGGCATGTGCAAAACGCCTCAACATTCGGTGATGCTGCCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttct < 2:1454808‑M1/101‑57 (MQ=255) aGGCGGCATGTGCAAAACGCCTCAACATTCGGTGATGCTGCCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttcta > 2:1012369‑M1/1‑44 (MQ=255) aGGCGGCATGTGCAAAACGCCTCAACATTCGGTGATGCTGCCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttcta > 1:112841‑M1/1‑44 (MQ=255) ggcATGTGCAAAACGCCTCAACATTCGGTGATGCTGCCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcag < 2:343924‑M1/101‑62 (MQ=255) aTGCGCAAAACGCCTCAACATTCGGTGATGCTGCCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctg > 1:1003696‑M1/1‑37 (MQ=255) tgtgCAAAACGCCTCAACATTCGGTGATGCTGCCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgt > 1:333405‑M1/1‑36 (MQ=255) gCAAAACGCCTCAACATTCGGTGATGCTGCCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccc < 1:1698428‑M1/101‑69 (MQ=255) gCCTCAACATTCGGTGATGCTGCCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgtt < 1:834762‑M1/101‑76 (MQ=255) cTCAACATTCGGTGATGCTGCCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctattca > 1:1152842‑M1/1‑24 (MQ=255) cATTCGGTGATGCTGCCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctac > 2:1552587‑M1/1‑19 (MQ=255) cGGTGATGCTGCCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgac < 1:944703‑M1/101‑87 (MQ=255) cGGTGATGCTGCCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgac > 1:1378338‑M1/1‑15 (MQ=255) cGGTGATGCTGCCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgac < 2:601997‑M1/101‑87 (MQ=255) cGGTGATGCTGCCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgac < 2:734290‑M1/101‑87 (MQ=255) cGGTGATGCTGCCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgac < 1:746641‑M1/101‑87 (MQ=255) ggTGATGCTGCCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacg < 2:1524269‑M1/101‑88 (MQ=255) ggTGATGCTGCCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacg > 1:772657‑M1/1‑14 (MQ=255) gTGATGCTGCCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacgg < 1:1674422‑M1/101‑89 (MQ=255) gTGATGCTGCCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacgg > 2:668703‑M1/1‑13 (MQ=255) gTGATGCTGCCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacgg > 1:230868‑M1/1‑13 (MQ=255) gTGATGCTGCCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacgg < 2:1589500‑M1/101‑89 (MQ=255) gTGATGCTGCCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgcccctcctgttcagctactgacgg > 2:455162‑M1/1‑13 (MQ=255) tGATGCTGCCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggg < 2:647951‑M1/101‑90 (MQ=255) tGATGCTGCCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggg > 1:1407278‑M1/1‑12 (MQ=255) tGATGCTGCCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggg < 2:763245‑M1/101‑90 (MQ=255) tGATGCTGCCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggg < 2:633516‑M1/101‑90 (MQ=255) tGATGCTGCCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggg > 1:1495066‑M1/1‑12 (MQ=255) tGATGCTGCCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggg < 2:952389‑M1/101‑90 (MQ=255) tGATGCTGCCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggg > 2:383423‑M1/1‑12 (MQ=255) tGATGCCGCCAActtactgatttagtggatgattgtggttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggg < 2:976351‑M1/101‑90 (MQ=255) aTGCTGCCAActtcctgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggt < 1:248609‑M1/101‑92 (MQ=255) aTGCTGCCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggt < 2:941653‑M1/101‑92 (MQ=255) aTGCTGCCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggt > 1:573453‑M1/1‑10 (MQ=255) aTGCTGCCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggt < 2:492710‑M1/101‑92 (MQ=255) tgctgcCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtg < 2:790625‑M1/101‑93 (MQ=255) tgctgcCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtg < 2:1000762‑M1/101‑93 (MQ=255) gctgcCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtgg < 2:1150124‑M1/101‑94 (MQ=255) gctgcCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtgg > 1:130169‑M1/1‑8 (MQ=255) gctgcCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtgg > 1:1462668‑M1/1‑8 (MQ=255) gctgcCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtgg < 2:717813‑M1/101‑94 (MQ=255) gctgcCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtgg < 1:1612770‑M1/101‑94 (MQ=255) gctgcCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagatgtccctcctgttcagctactgacggggtgg > 1:513056‑M1/1‑8 (MQ=255) ctgcCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggt < 1:876603‑M1/101‑95 (MQ=255) ctgcCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggt < 2:796420‑M1/101‑95 (MQ=255) ctgcCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggt < 2:279572‑M1/101‑95 (MQ=255) ctgcCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggt < 1:1087859‑M1/101‑95 (MQ=255) ctgcCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggt > 2:856174‑M1/1‑7 (MQ=255) ctgcCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggt < 1:605524‑M1/101‑95 (MQ=255) ctgcCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggt > 2:175933‑M1/1‑7 (MQ=255) ctgcCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggg > 2:895181‑M1/1‑7 (MQ=255) ctgcCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgcgccagtggcttctgtttctatcagctgcccctcctgttcagctactgacggggtggt < 1:418090‑M1/101‑95 (MQ=255) tgcCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtg < 1:133964‑M1/101‑96 (MQ=255) tgcCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtg > 1:862291‑M1/1‑6 (MQ=255) tgcCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtg < 2:963244‑M1/101‑96 (MQ=255) tgcCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtg < 1:443507‑M1/101‑96 (MQ=255) tgcCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtg < 2:466863‑M1/101‑96 (MQ=255) tgcCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtg > 1:125900‑M1/1‑6 (MQ=255) tgcCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtgggg > 1:715509‑M1/1‑6 (MQ=255) gcCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgc > 2:1410387‑M1/1‑5 (MQ=255) gcCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgc > 2:1295822‑M1/1‑5 (MQ=255) gcCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgc > 2:831931‑M1/1‑5 (MQ=255) gcCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgc < 1:921415‑M1/101‑97 (MQ=255) gcCAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgc > 2:1363065‑M1/1‑5 (MQ=255) ccAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcg > 1:1432912‑M1/1‑4 (MQ=255) ccAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcg > 2:1035932‑M1/1‑4 (MQ=255) ccAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcg > 1:66658‑M1/1‑4 (MQ=255) ccAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcg > 1:809418‑M1/1‑4 (MQ=255) ccAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtagcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcg < 2:1511624‑M1/101‑98 (MQ=255) cAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgt > 2:1260113‑M1/1‑3 (MQ=255) cAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgt < 2:1218640‑M1/101‑99 (MQ=255) cAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgt > 2:955070‑M1/1‑3 (MQ=255) cAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgt < 1:28030‑M1/101‑99 (MQ=255) cAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgt < 2:312922‑M1/101‑99 (MQ=255) cAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgt > 1:25405‑M1/1‑3 (MQ=255) cAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgt < 2:1477721‑M1/101‑99 (MQ=255) cAActtactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacgggggggtgcgt > 2:747143‑M1/1‑3 (MQ=255) aacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgta < 1:1084839‑M1/101‑100 (MQ=255) acttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaa > 2:410355‑M1/1‑1 (MQ=255) acttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaa < 1:968606‑M1/101‑101 (MQ=255) acttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaa > 2:1327260‑M1/1‑1 (MQ=255) acttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaa < 2:1542919‑M1/101‑101 (MQ=255) | AGAAATTATATTTAAAGATGAGTTTGCTGCGGTCATTCCTGACAATGATAGTACTCAGGCGGCATGTGCAAAACGCCTCAACATTCGGTGATGCTGCCAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 14/52074‑52173 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |