| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 137 | 1 = | 0 (0.000) | 79 (1.370) | 55/166 | 0.0 | 80.2% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 21 | = 40480 | 39 (0.720) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAA > 137/1‑100 | gaccagaaacaaaaaaacacccgttagggtgttcaataattggttgcgggggccggatttgaaccgacgaccttcgggttatgagcccgacgagctaccag < 1:1416697‑M1/1‑1 (MQ=255) agaaacaaaaaaacacccgttagggtgttcaataattggttgcgggggccggatttgaaccgacgaccttcgggttatgagcccgacgagctaccaGgctg < 1:498214‑M1/5‑1 (MQ=255) aaacacccgttagggtgttcaataattggttgcgggggccggatttgaaccgacgaccttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCcg < 1:294155‑M1/15‑1 (MQ=255) ctaagggaaagtggttgcgggggccggatttgaaccgacgaccttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGc < 2:851586‑M1/30‑1 (MQ=255) ctaagggaaagtggttgcgggggccggatttgaaccgacgaccttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGc < 1:1091659‑M1/30‑1 (MQ=255) aagggaaagtggttgcgggggccggatttgaaccgacgaccttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCaa < 2:517661‑M1/32‑1 (MQ=255) agggaaagtggttgcgggggccggatttgaaccgacgaccttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCaaa < 2:1500926‑M1/33‑1 (MQ=255) gggaaagtggttgcgggggccggatttgaaccgacgaccttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAAt > 1:641209‑M1/68‑101 (MQ=255) ggaaagtggttgcgggggccggatttgaaccgacgaccttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAAtt > 1:874835‑M1/67‑101 (MQ=255) aaagtggttgcgggggccggatttgaaccgtcgtccttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGATGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCt < 2:1074367‑M1/37‑1 (MQ=255) aaagtggttgcgggggccggatttgaaccgacgaccttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCt > 1:772995‑M1/65‑101 (MQ=255) aaagtggttgcgggggccggatttgaaccgacgaccttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCt < 2:567714‑M1/37‑1 (MQ=255) aagtggttgcgggggccggatttgaaccgacgaccttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTa < 2:583900‑M1/38‑1 (MQ=255) aagtggttgcgggggccggatttgaaccgacgaccttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTa < 1:1572429‑M1/38‑1 (MQ=255) agtggttgcgggggccggatttgaaccgacgaccttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTAc < 2:896078‑M1/39‑1 (MQ=255) agtggttgcgggggccggatttgaaccgacgaccttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTAc > 1:1640936‑M1/63‑101 (MQ=255) agtggttgcgggggccggatttgaaccgacgaccttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTAc > 2:24691‑M1/63‑101 (MQ=255) agtggttgcgggggccggatttgaaccgacgaccttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTAc < 1:562793‑M1/39‑1 (MQ=255) gtggttgcgggggccggatttgaaccgacgaccttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACt > 1:280897‑M1/62‑101 (MQ=255) tggttgcgggggccggatttgaaccgacgaccttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTc > 1:1140073‑M1/61‑101 (MQ=255) gcgggggccggatttgaaccgacgaccttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGtttt < 2:712684‑M1/46‑1 (MQ=255) gcgggggccggatttgaaccgacgaccttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGtttt < 2:506580‑M1/46‑1 (MQ=255) cgggggccggatttgaaccgacgaccttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTg > 2:1378244‑M1/55‑101 (MQ=255) gggggccggatttgaaccgacgaccttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTgg < 2:466027‑M1/48‑1 (MQ=255) ggggccggatttgaaccgacgaccttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCCCCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTggg > 2:1123281‑M1/53‑101 (MQ=255) ggccggatttgaaccgacgaccttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTa > 1:184302‑M1/51‑101 (MQ=255) gcccggattcgaaccgacgaccttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTa > 1:477361‑M1/51‑101 (MQ=255) 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atttgaaccgacgaccttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAAt > 1:1350195‑M1/45‑101 (MQ=255) tttgaaccgacgaccttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATg < 1:917903‑M1/58‑1 (MQ=255) tttgaaccgacgaccttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATg < 1:379801‑M1/58‑1 (MQ=255) ttgaaccgacgaccttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGc > 1:728473‑M1/43‑101 (MQ=255) tgaaccgacgaccttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCa < 2:219452‑M1/60‑1 (MQ=255) accgacgaccttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAAt > 1:547263‑M1/39‑101 (MQ=255) cgacgaccttcgggttatgagcccgacgagctactaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATAc > 1:144628‑M1/37‑101 (MQ=255) cgacgaccttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATAc > 1:1500932‑M1/37‑101 (MQ=255) cgacgaccttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATAc < 2:739664‑M1/65‑1 (MQ=255) cgacgaccttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATAc > 2:1064541‑M1/37‑101 (MQ=255) cgacgaccttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATAc > 1:385846‑M1/37‑101 (MQ=255) acgaccttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATActg > 1:1312721‑M1/35‑101 (MQ=255) gaccttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATActgct < 1:91703‑M1/69‑1 (MQ=255) gaccttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATActgct < 1:1017025‑M1/69‑1 (MQ=255) gaccttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATActgct < 1:110893‑M1/69‑1 (MQ=255) gaccttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATActgct < 2:1640751‑M1/69‑1 (MQ=255) accttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATActgctg > 2:990129‑M1/32‑101 (MQ=255) cttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTggg > 1:592552‑M1/30‑101 (MQ=255) cttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTggg < 1:1474614‑M1/72‑1 (MQ=255) ttcgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGa < 1:383125‑M1/73‑1 (MQ=255) cgggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGAtt < 1:404702‑M1/75‑1 (MQ=255) gggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGAttt < 2:523380‑M1/76‑1 (MQ=255) gggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGAttt > 1:479428‑M1/26‑101 (MQ=255) gggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGAttt > 1:583905‑M1/26‑101 (MQ=255) ggttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTg < 2:1054425‑M1/77‑1 (MQ=255) ggttaggagcccgtcgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTg > 2:717132‑M1/25‑101 (MQ=255) gttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTgg < 1:95637‑M1/78‑1 (MQ=255) ttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGgt > 1:973131‑M1/23‑101 (MQ=255) ttatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGgt < 1:630943‑M1/79‑1 (MQ=255) tatgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGgtg < 1:1060190‑M1/80‑1 (MQ=255) atgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGgtgt < 2:863064‑M1/81‑1 (MQ=255) atgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGgtgt > 1:1089987‑M1/21‑101 (MQ=255) tgagcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTa < 2:1444535‑M1/82‑1 (MQ=255) agcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTAcc > 1:478345‑M1/18‑101 (MQ=255) gcccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCg > 1:744289‑M1/17‑101 (MQ=255) cccgacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCga < 1:925763‑M1/86‑1 (MQ=255) gacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGAc > 1:506585‑M1/13‑101 (MQ=255) gacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGAc > 2:379796‑M1/13‑101 (MQ=255) gacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGAc < 1:452705‑M1/89‑1 (MQ=255) gacgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGAc < 2:878309‑M1/89‑1 (MQ=255) acgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACg > 1:1688154‑M1/12‑101 (MQ=255) cgagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACgg > 2:1474608‑M1/11‑101 (MQ=255) gagctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACggg < 1:1114154‑M1/92‑1 (MQ=255) agctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGa > 2:920479‑M1/9‑101 (MQ=255) gctaccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGAc < 2:973837‑M1/94‑1 (MQ=255) taccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGt > 2:1132864‑M1/6‑101 (MQ=255) ccaGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTaa > 2:1355278‑M1/4‑101 (MQ=255) aGGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTaaaa > 2:424333‑M1/2‑101 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCTGCTCCACCCCGCGCCTGAAACGTGGCAAATTCTACTCGTTTTGGGTAAAAAATGCAAATACTGCTGGGATTTGGTGTACCGAGACGGGACGTAAAA > 137/1‑100 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |