New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 120 | = 14144 | 0 (0.000) | 79 (0.060) | 62/168 | 0.0 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 222 | = 1427 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
Only 100 of 434 total aligned reads displayed.
GCCACGGGTGCTTGAGACTGTTTGTCTCAGGTATTCACCGAAAGGCAGACAGAGAAAAGCCCCACCTGACTATAAATCAAAGTTTGTACTGACCCCAAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 120/14045‑14144 | gCCACGGGTGCTTGAGACTGTTTGTCTCAGGTATTCACCGAAAGGCAGACAGAGAAAAGCCCCACCTGACTATAAATCAAAGTTTGTACTGACCCCAAAAa > 2:97936‑M1/1‑100 (MQ=255) gCTTGAGACTGTTTGTCTCAGGTATTCACCGAAAGGCAGACAGAGAAAAGCCCCACCTGACTATAAATCAAAGTTTGTACTGACCCCAAAAagttggacag > 1:1460695‑M1/1‑91 (MQ=255) gagaCTGTTTGTCTCAGGTATTCACCGAAAGGCAGACAGAGAAAAGCCCCACCTGACTATAAATCAAAGTTTGTACTGACCCCAAAAagttggacagttaa > 1:517665‑M1/1‑87 (MQ=255) cTGTTTGTCTCAGGGATTCACCGAAAGGCAGACAGAGAAAAGCCCCACCTGACTATAAATCAAAGTTTGTACTGACCCCAAAAagttggacagttaaacac > 2:217305‑M1/1‑83 (MQ=255) gAAAGGCAGACAGAGAAAAGCCCCACCTGACTATAAATCAAAGTTTGTACTGACCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccg < 2:40101‑M1/101‑41 (MQ=255) aGGCAGACAGAGAAAAGCCCCACCTGACTATAAATCAAAGTTTGTACTGACCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgata < 1:217305‑M1/101‑44 (MQ=255) cagaGAAAAGCCCCACCTGACTATAAATCAAAGTTTGTACTGACCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaatt < 1:244866‑M1/101‑51 (MQ=255) aaaaGCCCCACCTGACTATAAATCAAAGTTTGTACTGACCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagt < 1:1677050‑M1/101‑56 (MQ=255) aGCCCCACCTGACTATAAATCAAAGTTTGTACTGACCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcag > 2:1233079‑M1/1‑43 (MQ=255) gCCCCACCTGACTATAAATCAAAGTTTGTTCTGACCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcaga < 2:1424279‑M1/101‑60 (MQ=255) cccACCTGACTATAAATCAAAGTTTGTACTGACCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagacc < 2:1711629‑M1/101‑62 (MQ=255) tGACTATAAATCAAAGTTTGTACTGACCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattgcgatattcaattggagtcagaccttttaa > 1:376897‑M1/1‑34 (MQ=255) tataAATCAAAGTTTGTACTGACCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttc > 1:492927‑M1/1‑30 (MQ=255) cAAAGTTTGTACTGACCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaa > 2:107488‑M1/1‑23 (MQ=255) aGTTTGTACTGACCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattc < 1:1625879‑M1/101‑82 (MQ=255) gTTTGTACTGACCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattct > 2:345030‑M1/1‑19 (MQ=255) aCTGACCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgct > 1:1208101‑M1/1‑13 (MQ=255) aCTGACCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgct < 2:845989‑M1/101‑89 (MQ=255) aCTGACCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgct > 1:460761‑M1/1‑13 (MQ=255) aCTGACCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgct < 1:62626‑M1/101‑89 (MQ=255) aCTGACCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgct > 2:546073‑M1/1‑13 (MQ=255) aCTGACCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgct > 1:275777‑M1/1‑13 (MQ=255) cTGACCCCGAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctg > 1:1602657‑M1/1‑12 (MQ=255) cTGACCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctg < 2:1511617‑M1/101‑90 (MQ=255) cTGACCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctg < 2:955950‑M1/101‑90 (MQ=255) cTGACCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctg > 1:1658039‑M1/1‑12 (MQ=255) cTGACCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctg < 2:790067‑M1/101‑90 (MQ=255) cTGACCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctg > 2:1270475‑M1/1‑12 (MQ=255) cTGACCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctg < 1:1477286‑M1/101‑90 (MQ=255) cTGACCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctg < 2:744146‑M1/101‑90 (MQ=255) cTGACCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctg > 2:206066‑M1/1‑12 (MQ=255) cTGACCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctg > 1:1417063‑M1/1‑12 (MQ=255) cTGACCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctg > 2:448470‑M1/1‑12 (MQ=255) cTGACCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctg > 1:915105‑M1/1‑12 (MQ=255) cTGACCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctg > 1:1258223‑M1/1‑12 (MQ=255) tGACCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatctaggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgt < 1:671974‑M1/101‑91 (MQ=255) tGACCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgt > 2:1639371‑M1/1‑11 (MQ=255) tGACCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgt > 1:1312113‑M1/1‑11 (MQ=255) gACCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctacttcttctgctgtt < 2:276786‑M1/101‑92 (MQ=255) gACCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgtt < 1:960375‑M1/101‑92 (MQ=255) gACCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgtt < 1:577652‑M1/101‑92 (MQ=255) gACCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgtt < 1:1648743‑M1/101‑92 (MQ=255) gACCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgtt < 1:225144‑M1/101‑92 (MQ=255) gACCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgtt > 1:294471‑M1/1‑10 (MQ=255) aCCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttg < 1:987533‑M1/101‑93 (MQ=255) aCCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttg > 1:814284‑M1/1‑9 (MQ=255) aCCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttg < 1:118801‑M1/101‑93 (MQ=255) aCCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttg < 1:1561584‑M1/101‑93 (MQ=255) aCCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttg < 2:1018157‑M1/101‑93 (MQ=255) aCCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttg > 2:1099797‑M1/1‑9 (MQ=255) aCCCCAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggcctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttg > 2:1121798‑M1/1‑9 (MQ=255) ccccAAAAatttggacagtttaacgcgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgt < 2:1410198‑M1/101‑94 (MQ=255) ccccAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgt < 1:1011809‑M1/101‑94 (MQ=255) ccccAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgt < 2:361424‑M1/101‑94 (MQ=255) ccccAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgt < 2:134926‑M1/101‑94 (MQ=255) ccccAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgt < 2:1531116‑M1/101‑94 (MQ=255) ccccAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgt < 2:492922‑M1/101‑94 (MQ=255) cccAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtc < 2:1595302‑M1/101‑95 (MQ=255) cccAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgta > 1:1154606‑M1/1‑7 (MQ=255) cccAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgta > 2:1377407‑M1/1‑7 (MQ=255) cccAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgta > 1:874864‑M1/1‑7 (MQ=255) cccAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgta < 2:71604‑M1/101‑95 (MQ=255) cccAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgta > 2:1305459‑M1/1‑7 (MQ=255) cccAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgta < 2:658077‑M1/101‑95 (MQ=255) cccAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgta < 1:1026736‑M1/101‑95 (MQ=255) cccAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgta > 1:1370922‑M1/1‑7 (MQ=255) cccAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgta < 1:1468957‑M1/101‑95 (MQ=255) cccAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgta < 1:1542693‑M1/101‑95 (MQ=255) ccAAAAagttggacagttaaactcgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtag < 1:423084‑M1/101‑96 (MQ=255) ccAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtag < 2:1043569‑M1/101‑96 (MQ=255) ccAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtag < 2:156426‑M1/101‑96 (MQ=255) ccAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtag < 2:1579735‑M1/101‑96 (MQ=255) ccAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtag < 2:540424‑M1/101‑96 (MQ=255) ccAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtag < 2:427276‑M1/101‑96 (MQ=255) ccAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtag > 1:1239666‑M1/1‑6 (MQ=255) ccAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtag > 1:747066‑M1/1‑6 (MQ=255) ccAAAAagttagacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtag < 1:708739‑M1/101‑96 (MQ=255) cAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagt > 2:1465984‑M1/1‑5 (MQ=255) cAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagt < 1:884272‑M1/101‑97 (MQ=255) cAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagt < 1:997660‑M1/101‑97 (MQ=255) cAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagt > 1:258483‑M1/1‑5 (MQ=255) cAAAAagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagt < 2:918233‑M1/101‑97 (MQ=255) aaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagta < 1:1117539‑M1/101‑98 (MQ=255) aaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagta > 2:254051‑M1/1‑4 (MQ=255) aaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagta > 2:893335‑M1/1‑4 (MQ=255) aaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagta > 1:1133271‑M1/1‑4 (MQ=255) aaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagta > 2:827570‑M1/1‑4 (MQ=255) aaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagta > 2:1161735‑M1/1‑4 (MQ=255) aaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagta < 2:582436‑M1/101‑98 (MQ=255) aaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagta < 2:1137952‑M1/101‑98 (MQ=255) aaaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagta > 1:1321875‑M1/1‑4 (MQ=255) aaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtat < 1:1407197‑M1/101‑99 (MQ=255) aaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtat < 2:775050‑M1/101‑99 (MQ=255) aaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtat > 1:364397‑M1/1‑3 (MQ=255) aaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtat < 2:311793‑M1/101‑99 (MQ=255) aaaagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtat > 1:1572441‑M1/1‑3 (MQ=255) aagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtattc < 1:1084281‑M1/101‑101 (MQ=255) aagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtattc < 1:1505670‑M1/101‑101 (MQ=255) aagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtattc < 1:178359‑M1/101‑101 (MQ=255) aagttggacagttaaacacgaggcatataggtctgattccgatattcaattggagtcagaccttttaatttcaggctaattcttctgctgttgtagtattc < 2:1209429‑M1/101‑101 (MQ=255) | GCCACGGGTGCTTGAGACTGTTTGTCTCAGGTATTCACCGAAAGGCAGACAGAGAAAAGCCCCACCTGACTATAAATCAAAGTTTGTACTGACCCCAAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 120/14045‑14144 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |