| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 113 | = 14540 | 0 (0.000) | 33 (0.630) | 19/180 | 2.6 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 218 | 11 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
TTGGCATCGACGCATGACTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 113/14440‑14540 | caggcaatggtgctcggaTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCAt > 2:1228953‑M1/19‑101 (MQ=255)caggcaatggtgctcggaTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAAGTTTGTAGGCCTGATAAGACGG‑GTAAGCGTCACAt > 1:421926‑M1/19‑101 (MQ=255) aggcaatggtgctcggaTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCatc < 2:1694524‑M1/84‑2 (MQ=255) aggcaatggtgctcggaTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAAGTTTGTAGGCCTGATAAGACGG‑GTAAGCGTCACatc > 2:539137‑M1/18‑100 (MQ=255) ggCATCGGTGCATAACCGCCGGATGCGTCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACCGTTCAGGCGCAGGTTTGTAGGCATGATAAGATGT‑GCCAGCGTCGCAtca < 2:1468206/101‑3 (MQ=12) ggCATCGACGCATGACTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCATca < 2:612886‑M2/101‑3 (MQ=255) caatggtgctcggaTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTcgcatcagg > 2:1140320‑M1/15‑97 (MQ=255) cATCGGTGCATAACCGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACCGTTCAGGCGCAGGTTTGTAGGCATGATAAGATGT‑GCCAGCGTCGCAtcagg > 1:48606/1‑97 (MQ=9) cATCGGTGCATAACCGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACCGTTCAGGCGCAGGTTTGTAGGCATGATAAGATGT‑GCCAGCGTCGCAtcagg > 1:857952/1‑97 (MQ=9) aatggtgctcggaTGCCTGATGCGGCTTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGtcgcatcaggc > 2:528124‑M1/14‑96 (MQ=255) cGCATGACTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCATcaggcaatgg > 1:1573096‑M2/1‑91 (MQ=255) gctcggatgccggatGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCATcaggcaatggt < 1:1390545‑M2/94‑12 (MQ=255) gCATGACTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCATcaggcaatggt < 1:1446184‑M2/101‑12 (MQ=255) gCATGACTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCATcaggcaatggt > 1:1595432‑M2/1‑90 (MQ=255) cggatgccgGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCATcaggcaatggtgct > 2:1315823‑M2/5‑87 (MQ=255) gatgcCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCATcaggcaatggtgctcg < 1:1619964‑M2/99‑17 (MQ=255) gCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCATcaggcaatggtgctcggat < 1:1512466‑M2/101‑20 (MQ=255) gCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCATcaggcaatggtgctcggat < 1:385502‑M2/101‑20 (MQ=255) gCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAAGTTTGTAGGCCTGATAAGACGG‑GTAAGCGTCACATcaggcaatggtgctcggat > 2:105397‑M2/1‑82 (MQ=255) cGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCTGGCAC‑CTTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGGCAAGCGTCGCATcaggcatgatgcgccaattgc > 2:463075‑M1/1‑80 (MQ=255) cGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTTAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCATcaggcaatggtgctcggatgc > 2:503872‑M2/1‑80 (MQ=255) ggATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCTGGCAC‑CTTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGGCAAGCGTCGCATcaggcatgatgcgccaattgcc < 2:194957‑M1/101‑23 (MQ=255) aTGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCATcaggcaatggtgctcggatgccgg < 2:1606009‑M2/101‑25 (MQ=255) aTGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCATcaggcaatggtgctcggatgccgg > 1:761896‑M2/1‑77 (MQ=255) aTGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAAGTTTGTAGGCCTGATAAGACGG‑GTAAGCGTCACATcaggcaatggtgctcggatgccgg < 1:1245245‑M2/101‑25 (MQ=255) tGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCTGGCAC‑CTTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGGCAAGCGTCGCATcaggcatgatgcgccaattgcctac < 1:675621‑M1/101‑26 (MQ=255) gcggcgTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCATcaggcaatggtgctcggatgccggat > 2:1166458‑M2/1‑75 (MQ=255) cggcgTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCATcaggcaatggtgctcggatgccggatg < 1:262059‑M2/101‑28 (MQ=255) cggcgTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCATcaggcaatggtgctcggatgccggatg < 1:1614990‑M2/101‑28 (MQ=255) cgTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCATcaggcaatggtgctcggatgccggatgcgg > 2:1374582‑M2/1‑71 (MQ=255) cgTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCATcaggcaatggtgctcggatgccggatgcgg < 1:293620‑M2/101‑31 (MQ=255) gtgaacgcCTTATCCGGCCTACGGTTCTGGCAC‑CTTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGGCAAGCGTCGCATcaggcatgatgcgccaattgcctacgttttt > 1:1687423‑M1/4‑70 (MQ=255) gTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCATcaggcaatggtgctcggatgccggatgcggc > 1:612891‑M2/1‑70 (MQ=255) gTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCATcaggcaatggtgctcggatgccggatgcggc < 2:306706‑M2/101‑32 (MQ=255) gTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAAGTTTGTAGGCCTGATAAGACGG‑GTAAGCGTCACATcaggcaatggtgctcggatgccggatgcggc < 2:352689‑M2/101‑32 (MQ=255) tgaacgCCTTATCCGGCCTACGGTTCTGGCAC‑CTTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGGCAAGCGTCGCATcaggcatgatgcgccaattgcctacgtttttt > 2:1633988‑M1/3‑69 (MQ=255) gaacGCCTTATCCGGCCTACGGTTCTGGCAC‑CTTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGGCAAGCGTCGCATcaggcatgatgcgccaattgcctacgtttttta > 2:1416056‑M1/2‑68 (MQ=255) aaaCGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCATcaggcaatggtgctcggatgccggatgcggcgt < 2:62842‑M2/101‑34 (MQ=255) aCGCCTTATCCGGCCTACGGTTCTGGCAC‑CTTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGGCAAGCGGCGCATcaggcatgatgcgccaattgcctacgttttttact > 1:1099849‑M1/1‑66 (MQ=255) aCGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCATcaggcaatggtgctcggatgccggatgcggcgtaa < 2:1506210‑M2/101‑36 (MQ=255) gCCTTATCCGGCCTACGGTTCTGGCAC‑CTTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGGCAAGCGTCGCATcaggcatgatgcgccaattgcctacgttttttactct < 1:705278‑M1/101‑38 (MQ=255) gCCTTATCCGGCCTACGGTTCTGGCAC‑CTTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGGCAAGCGTCGCATcaggcatgatgcgccaattgcctacgttttttactct > 1:508807‑M1/1‑64 (MQ=255) gCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCATcaggcaatggtgctcggatgccggatgcggcgtaaac < 2:209718‑M2/101‑38 (MQ=255) gCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCATcaggcaatggtgctcggatgccggatgcggcgtaaac > 1:929767‑M2/1‑64 (MQ=255) gCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAAGTTTGTAGGCCTGATAAGACGG‑GTAAGCGTCACATcaggcaatggtgctcggatgccggatgcggcgtgaac < 1:595412‑M2/101‑38 (MQ=255) ccTTATCCGGCCTACGGTTCTGGCAC‑CTTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGGCAAGCGTCGCATcaggcatgatgcgccaattgcctacgttttttactctt < 2:1078638‑M1/101‑39 (MQ=255) ttATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCATcaggcaatggtgctcggatgccggatgcggcgtaaacgcc < 1:1481248‑M2/101‑41 (MQ=255) ttATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAAGTTTGTAGGCCTGATAAGACGG‑GTAAGCGTCACATcaggcaatggtgctcggatgccggatgcggcgtgaacgcc < 2:840798‑M2/101‑41 (MQ=255) tATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCATcaggaaatggtgctcggatgccggatgcggcgtaaacgcct < 2:297633‑M2/101‑42 (MQ=255) aTCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCATcaggcaatggtgctcggatgccggatgcggcgtaaacgcctt < 2:1258456‑M2/101‑43 (MQ=255) aTCCGGCCTACGGTTCAGGCACAAGTTTGTAGGCCTGATAAGACGG‑GTAAGCGTCACATcaggcaatggtgctcggatgccggatgcggcgtgaacgcctt < 1:1031414‑M2/101‑43 (MQ=255) aTCCGGCCTACGGTTCAGGCACAAGTTTGTAGGCCTGATAAGACGG‑GTAAGCGTCACATcaggcaatggtgctcggatgccggatgcggcgtgaacgcctt < 1:1200157‑M2/101‑43 (MQ=255) aTCCGGCCTACGGTTCAGGCACAAGTTTGTAGGCCTGATAAGACGG‑GTAAGCGTCACATcaggcaatggtgctcggatgccggatgcggcgtgaacgcctt > 2:352491‑M2/1‑59 (MQ=255) aTCCGGCCTACGGTTCAGGCACAAGTTTGTAGGCCTGATAAGACGG‑GTAAGCGTCACATcaggcaatggtgctcggatgccggatgcggcgtgaacgcctt > 2:1614984‑M2/1‑59 (MQ=255) tCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCATcaggcaatggtgctcggatgccggatgcggcgtaaacgcctta > 2:988128‑M2/1‑58 (MQ=255) cGGCCTACGGTTCTGGCAC‑CTTTTGTAGGCCTGATAAGACGCGGCAAGCGTCGCATcaggcatgatgcgccaattgcctacgttttttactcttgtggcca < 1:1416062‑M1/101‑46 (MQ=255) gCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCATcaggcaatggtgctcggatgccggatgcggcgtaaacgccttatccg > 1:298941‑M2/1‑54 (MQ=255) cTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCATcaggcaatggtgctcggatgccggatgcggcgtaaacgccttatccggc < 1:970905‑M2/101‑50 (MQ=255) gTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCATcaggcaatggtgctcggatgccggatgcggcgtaaacgccttatccggcctacg > 1:766060‑M2/1‑47 (MQ=255) gTTCAGGCACAAGTTTGTAGGCCTGATAAGACGG‑GTAAGCGTCACATcaggcaatggtgctcggatgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacg < 2:237614‑M2/101‑55 (MQ=255) ttCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCATcaggcaatggtgctcggatgccggatgcggcgtaaacgccttatccggcctacgg < 2:800810‑M2/101‑56 (MQ=255) tctggcaccttttgtaggcctgaTAAGACGCGGCAAGCGTCGCATcaggcatgatgcgccaattgcctacgttttttactcttgtggccataaccacgcag < 1:1623775‑M1/91‑57 (MQ=255) ctggcaccttttgtaggcctgATAAGACGCGGCAAGCGTCGCATcaggcatgatgcgccaattgcctacgttttttactcttgtggccataaccacgcagc < 1:1462092‑M1/92‑58 (MQ=255) ctggcaccttttgtaggcctgATAAGACGCGGCAAGCGTCGCATcaggcatgatgcgccaattgcctacgttttttactcttgtggccataaccacgcagc < 2:1035375‑M1/92‑58 (MQ=255) ggCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCATcaggcaatggtgctcggatgccggatgcggcgtaaacgccttatccggcctacggttca > 1:1642246‑M2/1‑42 (MQ=255) gcaccttttgtaggcCTGATAAGACGCGGCAAGCGTCGCATcaggcatgatgcgccaattgcctacgttttttactcttgtggccataaccacgcagcgcc < 2:1110696‑M1/95‑61 (MQ=255) cacaGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCATcaggcaatggtgctcggatgccggatgcggcgtaaacgccttatccggcctacggttcagg > 1:158355‑M2/1‑40 (MQ=255) acaGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCATcaggcaatggtgctcggatgccggatgcggcgtaaacgccttatccggcctacggtttaggc < 1:503877‑M2/101‑63 (MQ=255) acaAGTTTGTAGGCCTGATAAGACGG‑GTAAGCGTCACATcaggcaatggtgctcggatgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacgagatgaag > 2:1481242‑M2/1‑39 (MQ=255) acaAGTTTGTAGGCCTGATAAGACGG‑GTAAGCGTCACATcaggcaatggtgctcggatgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacgagatgaag > 2:492613‑M2/1‑39 (MQ=255) acaAGTTTGTAGGCCTGATAAGACGG‑GTAAGCGTCACATcaggcaatggtgctcggatgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacgagatgaac < 1:971513‑M2/101‑63 (MQ=255) caGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCATcaggcaatggtgctcggatgccggatgcggcgtaaacgccttatccggcctacggttcaggca < 2:86337‑M2/101‑64 (MQ=255) ccttttgtaGGCCTGATAAGACGCGGCAAGCGTCGCATcaggcatgatgcgccaattgcctacgttttttactcttgtggccataaccacgcagcgccgcg < 2:969381‑M1/98‑64 (MQ=255) aGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCATcaggcaatggtgctcggatgccggatgcggcgtaaacgccttatccggcctacggttcaggcac < 1:1579842‑M2/101‑65 (MQ=255) aGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCATcaggcaatggtgctcggatgccggatgcggcgtaaacgccttatccggcctacggttcaggcac < 1:539142‑M2/101‑65 (MQ=255) tGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCATcaggcaatggtgctcggatgccggatgcggcgtaaacgccttatccggcctacggttcaggcacaggtt < 2:158355‑M2/101‑70 (MQ=255) 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cgcggcaagcgtcgCATcaggcatgatgcgccaattgcctacgttttttactcttgtggccataaccacgcagcgccgcgtacgccgctggaatcaccgtg < 1:1184580‑M1/95‑85 (MQ=255) gc‑gTAAGCGTCGCATcaggcaatggtgctcggatgccggatgcggcgtaaacgccttatccggcctacggttcaggcacaagtttgtaggcctgataagac < 1:1082991‑M2/101‑87 (MQ=255) c‑gTAAGCGTCGCATcaggcaatggtgctcggatgccggatgcggcgtaaacgccttatccggcctacggttcaggcacaggtttgtaggcctgataagacg > 2:1118260‑M2/1‑14 (MQ=255) gTAAGCGTCGCATcaggcaatggtgctcggatgccggatgcggcgtaaacgccttatccggcctacggttcaggcacaagtttgtaggcctgataagacgg < 1:521053‑M2/101‑89 (MQ=255) gTAAGCGTCGCATcaggcaatggtgctcggatgccggatgcggcgtaaacgccttatccggcctacggttcaggcacaagtttgtaggcctgataagacgg < 1:1034133‑M2/101‑89 (MQ=255) tAAGCGTCGCATcaggcaatggtgctcggatgccggatgcggcgtaaacgccttatccggcctacggttcaggcacaagtttgtaggcctgataagacggg < 1:459763‑M2/101‑90 (MQ=255) tAAGCGTCGCATcaggcaatggtgctcggatgccggatgcggcgtaaacgccttatccggcctacggttcaggcacaagtttgtaggcctgataagacggg < 1:492618‑M2/101‑90 (MQ=255) gTCGCATcaggcaatggtgctcggatgccggatgcggcgtaaacgccttatccggcctacggttcaggcacaagtttgtaggcctgataagacgggtaagc < 1:308896‑M2/101‑95 (MQ=255) aTcaggcatgatgcgccaattgcctacgttttttactcttgtggccataaccacgcagcgccgcgtacgccgctggaatcaccgtgcttcgccttacgcac > 1:838946‑M1/1‑2 (MQ=255) aTcaggcatgatgcgccaattgcctacgttttttactcttgtggccataaccacgcagcgccgcgtacgccgctggaatcaccgtgcttcgccttacgcac > 2:1438946‑M1/1‑2 (MQ=255) | TTGGCATCGACGCATGACTGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGCCTACGGTTCAGGCACAGGTTTGTAGGCCTGATAAGACGC‑GTAAGCGTCGCAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 113/14440‑14540 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |