New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 110 | = 15236 | 0 (0.000) | 43 (0.800) +GCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACA |
37/150 | 0.5 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 131 | = 13095 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
ATCATCGCCCCGACTTCCTGGTAAGGTCTTTGCGCAGAGGTGGCAGATTTCATGGTGTTGTGTCCGTTAGGTGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 110/15137‑15236 | atcatcGCCCCGACTTCCTGGTAAGGTCTTTGCGCAGAGGTGGCAGATTTCATGGTGTTGTGTCCGTTAGGTGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCGg > 1:1545717‑M1/1‑100 (MQ=255) atcGCCCCGACTTCCTGGTAAGGTCTTTGCGCAGAGGTGGCAGATTTCATGGGGTTGTGTCCGTTAGGTGCGGGTAATCAAATTTTTGCCGGATGAGgcgg > 1:402849‑M1/1‑97 (MQ=255) cGCCCCGACTTCCTGGTAAGGTCTTTGCGCAGAGGTGGCAGATTTCATGGTGTTGTGTCCGTTAGGTGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtga > 2:28063‑M1/1‑95 (MQ=255) ccccGACTTCCTGGTAAGGTCTTTGCGCAGAGGTGGCAGATTTCATGGTGTTGTGTCCGTTAGGTGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaac < 2:982070‑M1/101‑9 (MQ=255) cccGACTTCCTGGTAAGGTCTTTGCGCAGAGGTGGCAGATTTCATGGTGTTGTGTCCGTTAGGTGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacg > 1:1530036‑M1/1‑92 (MQ=255) ccGACTTCCTGGTAAGGTCTTTGCGCAGAGGTGGCAGATTTCATGGTGTTGTGTCCGTTAGGTGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgc > 1:13060‑M1/1‑91 (MQ=255) gACTTCCTGGTAAGGTCTTTGCGCAGAGGTGGCAGATTTCATGGTGTTGTGTCCGTTAGGTGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgcct < 2:756483‑M1/101‑13 (MQ=255) tGGTAAGGTCTTTGCGCAGAGGTGGCAGATTTCATGGTGTTGTGTCCGTTAGGTGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccgg < 1:1587891‑M1/101‑20 (MQ=255) aaGGTCTTTGCGCAGAGGTGGCAGATTTCATGGTGTTGTGTCCGTTAGGTGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggccta > 1:884855‑M1/1‑78 (MQ=255) aaGGACTTTGCGCAGAGGTGGCAGATTTCATGGTGTTGTGTCTGTTAGGTGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggccta > 2:585764‑M1/1‑78 (MQ=255) aGGTCTTTGCGCAGAGGTGGCAGATTTCATGGTGTTGTGTCCGTTAGGTGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggcctac > 2:246643‑M1/1‑77 (MQ=255) ggTCTTTGCGCAGAGGTGGCAGATTTCATGGTGTTGTGTCCGTTAGGTGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggcctaca > 2:1343548‑M1/1‑76 (MQ=255) tCTTTGCGCAGAGGTGGCAGATTTCATGGTGTTGTGTCCGTTAGGTGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggcctacaac < 2:556981‑M1/101‑28 (MQ=255) cTTTGCGCAGAGGTGGCAGATTTCATGGTGTTGTGTCCGTTAGGTGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggcctacaacg > 1:395459‑M1/1‑73 (MQ=255) tGCGCAGAGGTGGCAGATTTCATGGTGTTGTGTCCGTTAGGTGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggcctacaacgggc < 1:299614‑M1/101‑32 (MQ=255) gcAGAGGTGGCAGATTTCATGGTGTTGTGTCCGTTAGGTGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgcctcatccggcctacaacgggcaat > 2:1203992‑M1/1‑67 (MQ=255) cAGAGGTGGCAGATTTCATGGTGTTGTGTCCGTTAGGTGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggcctacaacgggcaatt < 2:210728‑M1/101‑36 (MQ=255) agGTGGCAGATTTCATGGTGTTGTGTCCGTTAGGTGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggcctacaacgggcaatttta > 2:569185‑M1/1‑63 (MQ=255) agGTGGCAGATTTCATGGTGTTGTGTCCGTTAGGTGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggcctacaacgggcaatttta > 1:1477556‑M1/1‑63 (MQ=255) ggTGGCAGATTTCATGGTGTTGTGTCCGTTAGGTGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggcctacaacgggcaattttac > 2:794845‑M1/1‑62 (MQ=255) tGGCAGATTTCATGGTGTTGTGTCCGTTAGGTGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggcctacaacgggcaattttacgg > 1:814078‑M1/1‑60 (MQ=255) ggCAGATTTCATGGTGTTGTGTCCGTTAGGTGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggcctacaacgggcaattttacggc > 2:1667668‑M1/1‑59 (MQ=255) cAGATTTCATGGTGTTGTGTCCGTTAGGTGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggcctacaacgggcaattttacggccc > 1:895231‑M1/1‑57 (MQ=255) cAGATTTCATGGTGTTGTGTCCGTTAGGTGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggcctacaacgggcaattttacggccc > 2:1439733‑M1/1‑57 (MQ=255) gATTTCATGGTGTTGTGTCCGTTAGGTGCGGTTTATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggcctacaacgggcaattttacggccccc > 2:347545‑M1/1‑55 (MQ=255) aTTTCATGGTGTTGTGTCCGTTAGGTGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggcctacaacgggcaattttacggcccccg > 1:70370‑M1/1‑54 (MQ=255) ttCATGGTGTTGTGTCCGTTAGGTGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggcctacaacgggcaattttacggcccccgtt < 1:1076987‑M1/101‑50 (MQ=255) tGGTGTTGTGTCCGTTAGGTGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggcctacaacgggcaattttacggcccccgttaatc > 1:452314‑M1/1‑48 (MQ=255) ggTGTTGTGTCCGTTAGGTGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggcctacaacgggcaattttacggcccccgttaatct < 2:46086‑M1/101‑55 (MQ=255) ggTGTTGTGTCCGTTAGGTGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggcctacaacgggcaattttacggcccccgttaatct < 1:755030‑M1/101‑55 (MQ=255) ttgtGTCCGTTAGGTGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggcctacaacgggcaattttacggcccccgttaatctcaaa > 2:988060‑M1/1‑43 (MQ=255) tgtgTCCGTTAGGTGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggcctacaacgggcaattttacggcccccgttaatctcaaac > 1:530562‑M1/1‑42 (MQ=255) tgtCCGTTAGGTGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggcctacaacgggcaattttacggcccccgttaatctcaaacta < 1:868066‑M1/101‑62 (MQ=255) gtCCGTTAGGTGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggcctacaacgggcaattttacggcccccgttaatctcaaactat > 1:1487237‑M1/1‑39 (MQ=255) tCCGTTAGGTGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggcctacaacgggcaattttacggcccccgttaatctcaaactata > 2:421691‑M1/1‑38 (MQ=255) ccGTTAGGTGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggcctacaacgggcaattttacggcccccgttaatctcaaactatac < 1:1362549‑M1/101‑65 (MQ=255) cGTTAGGTGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggcctacaacgggcaattttacggcccccgttaatctcaaactatacc < 1:306229‑M1/101‑66 (MQ=255) gTTAGGTGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggcctacaacgggcaattttacggcccccgttaatctcaaactatacca < 1:1255395‑M1/101‑67 (MQ=255) aGGTGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggcctacaacgggcaattttacggcccccgttaatctcaaactataccatta < 1:336991‑M1/101‑70 (MQ=255) aGGTGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggcctacaacgggcaattttacggcccccgttaatctcaaactataccatta < 1:920742‑M1/101‑70 (MQ=255) gTGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggcctacaacgggcaattttacggcccccgttaatctcaaactataccattagc > 1:831192‑M1/1‑30 (MQ=255) tGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcatgaacgccttatcaggcctataacggtcacttttacggcccccgttaatctcagactataccattagcc > 2:1403690‑M1/1‑29 (MQ=255) ggTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggcctacaacgggcaattttacggcccccgttaatctcaaactataccattagcactg < 1:246643‑M1/101‑76 (MQ=255) ttAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggcctacaacgggcaattttacggcccccgttaatctcaaactataccattagcactgga < 2:814073‑M1/101‑78 (MQ=255) ttAATCAAATTTTGGGCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggccttcaacgggcaattttacggcccccgttaatctcaaactataccattagcactgga < 1:1024169‑M1/101‑78 (MQ=255) tAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggcctacaacgggcaattttacggcccccgttaatctcaaactataccattagcactggaa > 1:1192893‑M1/1‑23 (MQ=255) tAATCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggcctacaacgggcaattttacggcccccgttaatctcaaactataccattaacacaggaa > 1:244023‑M1/1‑23 (MQ=255) tCAAATTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggcctacaacgggcaattttacggcccccgttaatctcaaactataccattagcactggaagtt < 1:794850‑M1/101‑82 (MQ=255) aaaTTTTTGCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggcctacaacgggcaattttacggcccccgttaatctcaaactataccattagcactggaagttgg < 1:131955‑M1/101‑84 (MQ=255) tttttGCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggcctacaacgggcaattttacggcccccgttaatctcaaactataccattagcactggaagttggcac < 1:325999‑M1/101‑87 (MQ=255) tGCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggcctacaacgggcaattttacggcccccgttaatctcaaactataccattagcactggaagttggcacgtac < 2:1530030‑M1/101‑91 (MQ=255) gCCGGATGCGgcgtgaacgccttatccggcctacaacgggcaattttacggcccccgttaatctcaaactataccattagcactggaagttggcacgtaca < 1:1243431‑M1/101‑92 (MQ=255) cGGATGCGgcgtgaacgccttatccggcctacaacgggcaattttacggcccccgttaatctcaaactataccattagcactggaagttggcacgtacagg < 2:1240296‑M1/101‑94 (MQ=255) cGGATGCGgcgtgaacgccttatccggcctacaacgggcaattttacggcccccgttaatctcaaactataccattagcactggaagttggcacgtacagg > 2:640770‑M1/1‑8 (MQ=255) tGCGgcgtgaacgccttatccggcctacaacgggcaattttacggcccccgttaatctcaaactataccattagcactggaagttggcacgtacaggtggg < 2:283025‑M1/101‑98 (MQ=255) | ATCATCGCCCCGACTTCCTGGTAAGGTCTTTGCGCAGAGGTGGCAGATTTCATGGTGTTGTGTCCGTTAGGTGCGGTTAATCAAATTTTTGCCGGATGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 110/15137‑15236 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |