| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 11 | 51743 = | 64 (1.010) | 45 (0.940) | 26/158 | 1.1 | 64.0% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 180 | 22 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
TGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAAATATTCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGATTCACTCGCTTGTCGCCTTCCTGC > 11/51643‑51843 | tggtCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAAATATtc < 2:1589469/101‑1 (MQ=255) ggtCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAAATATtct < 2:933983/101‑1 (MQ=255) ctggctcgcaaaaggtcatacagccgaggcaaagtcgggaaacgcgaaggtcggtttttcctaaggggttgtattgcatgctgccactcctgccataCTCg > 1:1314044‑M1/98‑101 (MQ=255) gTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAAATATTCTCGTCa < 1:1328870/101‑1 (MQ=255) ctcgccaaaggtcatacagccgaggcaaagtcgggaaacgcgaaggtcggtttttcctaaggggttgtattgcatgctgccactcctgccataCTCGTCAt > 2:1375201‑M1/94‑101 (MQ=255) ctcgccaaaggtcatacagccgaggcaaagtcgggaaacgcgaaggtcggtttttcctaaggggttgcattgcatgctgccactcctgccataCTCGTCAt > 2:1059274‑M1/94‑101 (MQ=255) gCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAAATATTCTCGTCATa > 1:1482152/1‑101 (MQ=255) cGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAAATATTCTCGTCATAc < 2:244607/101‑1 (MQ=255) ggTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAAATATTCTCGTCATACt > 1:1139094/1‑101 (MQ=255) ggTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAAATATTCTCGTCATACt < 2:594746/101‑1 (MQ=255) tACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAAATATTCTCGTCATACTTc > 2:1677330/1‑101 (MQ=255) aaaggtcatacagccgaggcaaagtcgggaaacgcgaaggtcggtttttcctaaggggttgtattgcatgctgccactcctgccataCTCGTCATACTTCa < 1:1231336‑M1/14‑1 (MQ=255) aCTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAAATATTCTCGTCATACTTCa > 2:1528237/1‑101 (MQ=255) aCTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAAATATTCTCGTCATACTTCa < 2:589353/101‑1 (MQ=255) ggtcatacagccgaggcaaagtcgggaaacgcgaaggtcggtttttcctaaggggttgtattgcatgctgccactcctgccataCTCGTCATACTTCAAGt > 2:963397‑M1/85‑101 (MQ=255) aCGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAAATATTCTCGTCATACTTCAAGtt > 2:848352/1‑101 (MQ=255) cGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAAATATTCTCGTCATACTTCAAGTTg > 2:1642960/1‑101 (MQ=255) catacagccgaggcaaagtcgggaaacgcgaaggtcggtttttcctaaggggttgtattgcatgctgccactcctgccataCTCGTCATACTTCAAGTTGc < 1:857040‑M1/20‑1 (MQ=255) atacagccgaggcaaagtcgggaaacgcgaaggtcggtttttcctaaggggttgtattgcatgctgccactcctgccataCTCGTCATACTTCAAGTTGCa < 2:1315303‑M1/21‑1 (MQ=255) tacagccgaggcaaagtcgggaaacgcgaaggtcggtttttcctaaggggttgtattgcatgctgccactcctgccataCTCGTCATACTTCAAGTTGCAt > 1:1211668‑M1/80‑101 (MQ=255) cagccgaggcaaagtcgggaaacgcgaaggtcggtttttcctaaggggttgtattgcatgctgccactcctgccataCTCGTCATACTTCAAGTTGCAtgt > 1:276762‑M1/78‑101 (MQ=255) cagccgaggcaaagtcgggaaacgcgaaggtcggtttttcctaaggggttgtattgcatgctgccactcctgccataCTCGTCATACTTCAAGTTGCAtgt > 1:921290‑M1/78‑101 (MQ=255) cagccgaggaaaagtcgggaaacgcgaaggtcggtttttcctaaggggttgtattgcatgctgccactcctgccataCTCGTCATACTTCAAGTTGCAtgt > 2:1099575‑M1/78‑101 (MQ=255) tAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAAATATTCTCGTCATACTTCAAGTTGCAtgtg > 1:558806/1‑101 (MQ=255) tAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAAATATTCTCGTCATACTTCAAGTTGCAtgtg < 2:156677/101‑1 (MQ=255) ccgaggcaaagtcggaaaacgcgaaggtcggtttttcctaaggggttgtattgcatgctgccactcctgccataCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGtgct > 2:479452‑M1/75‑101 (MQ=255) aCCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAAATATTCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGtgct > 1:1317702/1‑101 (MQ=255) aCCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAAATATTCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGtgct > 1:1649579/1‑101 (MQ=255) cgaggcaaagtcgggaaacgcgaaggtcggtttttcctaaggggttgtattgcatgctgccactcctgccataCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGtgctg > 1:75097‑M1/74‑101 (MQ=255) ccTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAAATATTCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGtgctg < 2:1012652/101‑1 (MQ=255) gaggcaaagtcgggaaacgcgaaggtcggtttttcctaaggggttgtattgcatgctgccactcctgccataCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGtgctgc < 2:1528111‑M1/29‑1 (MQ=255) aggcaaagtcgggaaacgcgaaggtcggtttttcctaaggggttgtattgcatgctgccactcctgccataCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGctgcg > 2:1371157‑M1/72‑101 (MQ=255) ccTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAAATATTCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGctgcgtc > 2:484472/1‑101 (MQ=255) tGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAAATATTCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGctgcgtctg > 1:699999/1‑101 (MQ=255) gTGCATATCACCCTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAAATATTCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGctgcgtctgcg > 1:1145344/1‑101 (MQ=255) atCACCCTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAAATATTCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCt < 2:1523954/101‑1 (MQ=255) aCCCTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAAATATTCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCTCAc > 2:160585/1‑101 (MQ=255) aCCCTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAAATATTCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCTCAc < 2:1145339/101‑1 (MQ=255) cccTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAAATATTCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCTCAcc > 1:826327/1‑101 (MQ=255) cccTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAAATATTCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCTCAcc > 1:1357843/1‑101 (MQ=255) cTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAAATATTCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCTCAcccc > 1:1535264/1‑101 (MQ=255) cTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAAATATTCTCGTCATACTTCAAGCTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCTCAcccc > 1:600538/1‑101 (MQ=255) tCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAAATATTCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCTCACCCCa < 2:1139089/101‑1 (MQ=255) ggCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAAATATTCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCTCACCCCAGt > 2:141843/1‑101 (MQ=255) gtggtggtgGAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAAATATTCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCTCACCCCAGTCactt > 1:1279735/1‑101 (MQ=255) ggttttcctaagggggtgtattgcatgctgcccctcctgccataCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTTGGTCACCCCACCcacttt < 2:288643‑M1/57‑2 (MQ=255) ggtggtggAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAAATATTCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCTCACCCCAGTCacttac > 1:1614068/1‑101 (MQ=255) tggAATATGCTGATCGGCTGGAACATACTGTAAATATTCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCTCACCCCAGTCACTTACTTATg > 1:817834/1‑101 (MQ=255) ctaaggggttgtattgcatgcttccactcctgccataCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGt < 1:569349‑M1/64‑1 (MQ=255) ctaaggggttgtattgcatgctgccactcctgccataCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGt > 2:792637‑M1/38‑101 (MQ=255) aagggtttgtattgcatgctgccactcctgccataCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTaa > 2:1516845‑M1/36‑101 (MQ=255) aaggggttgtattgcatgctgccactcctgccataCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTaa < 1:210950‑M1/66‑1 (MQ=255) aggggttgtattgcatgctgccactcctgccataCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAg < 1:1119660‑M1/67‑1 (MQ=255) aggcgtggtattgcacgttcccgctcctgccataCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTCCTTATGTAAg > 2:836634‑M1/35‑101 (MQ=255) atGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAAATATTCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCt < 2:63331/101‑1 (MQ=255) 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ggCTGGAACATGCTGTAAATATTCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGAt < 2:856972/101‑1 (MQ=255) catgctgccactcctgccataCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTc < 2:1634578‑M1/80‑1 (MQ=255) catgctgccactcctgccataCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGCGGCTTc < 1:428979‑M1/80‑1 (MQ=255) tGGAACATGCTGTAAATATTCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGATTCa > 1:120728/1‑101 (MQ=255) atgctgccacccctgccataCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCa > 1:1637418‑M1/21‑101 (MQ=255) gAACATGCTGTAAATATTCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGATTCACt > 2:1205605/1‑101 (MQ=255) ccactcctgccataCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACtcgtt < 2:1440045‑M1/87‑3 (MQ=255) 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ccataCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAATCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCtt < 2:1452780‑M1/96‑1 (MQ=255) atatTCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGATTCACTCGCTTGTCGCCtt > 1:1123683/1‑101 (MQ=255) tataCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGATTCACTCTCTTGTCGCCTTc < 1:565970‑M1/97‑1 (MQ=255) tatTCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGATTCACTCGCTTGTCGCCTTc > 1:805108/1‑101 (MQ=255) cataCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTc > 2:366497‑M1/5‑101 (MQ=255) ataCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTTACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTcc < 2:1688096‑M1/98‑1 (MQ=255) ttCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGATTCACTCGCTTGTCGCCTTCCt < 2:169445/101‑1 (MQ=255) ttCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGATTCACTCGCTTGTCGCCTTCCt < 2:558801/101‑1 (MQ=255) taCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGATTCACTCTCTTGTCGCCTTCCt < 2:757945‑M1/99‑1 (MQ=255) taCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGATTCACTCTCTTGTCGCCTTCCt > 2:407333‑M1/3‑101 (MQ=255) taCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGATTCACTCTCTTGTCGCCTTCCt > 1:1201814‑M1/3‑101 (MQ=255) taCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGATTCACTCGCTTGTCGCCTTCCt > 2:811333‑M1/3‑101 (MQ=255) aCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGATTCACTCTCTTGTCGCCTTCCTg < 1:1280894‑M1/100‑1 (MQ=255) aCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGATTCACTCTCTTGTCGCCTTCCTg > 2:579757‑M1/2‑101 (MQ=255) aCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGATTCACTCTCTTGTCGCCTTCCTg < 1:923048‑M1/100‑1 (MQ=255) aCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGATTCACTCGCTTGTCGCCTTCCTg > 2:649489‑M1/2‑101 (MQ=255) CTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGc < 2:18171‑M1/101‑1 (MQ=255) | TGGTCGGTGCGGTACTGACGATATTAACCTTCCTGGTGCATATCACCCTCGGCGTGTGGTGGTGGAATATGCTGATCGGCTGGAACATGCTGTAAATATTCTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGTCTGCGTTCGCTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGATTCACTCGCTTGTCGCCTTCCTGC > 11/51643‑51843 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |