| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 93 | 17,700 | +TGCGCCTTATCCGACCTACATTGGTGGTCCCCGTAGACCTGATAAGACACGTTAACCGTCACATCAGGCATCGCTTGTCGGATGCGGCGCT | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 93 | 17666 = | 29 (0.500) | 28 (1.090) +GTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCA |
21/88 | 0.2 | 80.9% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 93 | = 17700 | 1 (0.020) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
‑‑‑‑‑GGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCTAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 93/17731‑17666‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCG < 93/17700‑17603 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| cctacGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCTAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGGTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGAC < 2:1025812/96‑1 ctacGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCACTAGCTCCCCATCCGATATGCGCTCCTTGATGTGACGGTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACC < 2:1521646/97‑1 GGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCTAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGGTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCA < 1:925901/101‑1 GACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCTAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGGTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAAT < 2:1172618/101‑1 CACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCTAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGGTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTA > 1:878707/1‑101 CACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCTAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGGTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTA < 2:356255/101‑1 CACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCTAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGGTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTA > 2:329084/1‑101 GTAGGTCGGATAAGGCGCTAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGGTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGA > 2:1434560/1‑101 AGGTCGGATAAGGCGCTAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGGTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATA < 1:761728/101‑1 GGTCGGATAAGGCGCTAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGGTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAA > 2:385758/1‑101 CGGATAAGGCGCTAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGGTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGC < 1:1633516/101‑1 aagtcctTAGCGCCGAATCCGACAAGCTATCCCTGATGTGGCGGTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGAACACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAG < 2:1163652/94‑1 AAGGCGCTAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGGTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAG < 2:1150723/101‑1 AGGCGCTAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGGTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGC < 2:358688/101‑1 GCGCTAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGGTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGC > 1:1249262/1‑101 GCTAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGGTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCG > 2:886807/1‑101 AGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGGTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCAT > 1:634991/1‑101 GCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGGTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCG > 2:603864/1‑101 CGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGGTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGAC < 2:1625292/101‑1 GCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGGTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACA < 1:1353793/101‑1 ATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGGTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAG < 1:105791/101‑1 ATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGGTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAG > 2:154105/1‑101 ATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGGTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAG > 2:1250769/1‑101 CCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGGTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCG > 1:47705/1‑101 GACAAGCGATGCCTGATGTGACGGTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGAT < 2:1680553/101‑1 GACAAGCGATGCCTGATGTGACGGTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGAT < 2:1184308/101‑1 GACAAGCGATGCCTGATGTGACGGTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGAT < 1:1439876/101‑1 CGATGCCTGATGTGACGGTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGA > 2:204949/1‑101 GATGCCTGATGTGACGGTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGAT > 1:113533/1‑101 ATGCCTGATGTGACGGTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATG > 2:475466/1‑101 ATGCCTGATGTGACGGTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATG > 2:640127/1‑101 GCCTGATGTGACGGTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTG > 2:48578/1‑101 GCCTGATGTGACGGTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTG < 2:1298553/101‑1 CTGATGTGACGGTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGAC < 2:531987/101‑1 CTGATGTGACGGTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGAC < 1:822597/101‑1 TGATGTGACGGTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACG < 2:1351554/101‑1 TGATGTGACGGTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACG > 2:1527024/1‑101 GTGACGGTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTA > 2:1646397/1‑101 CGGTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTAGGTCAGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGn < 1:1636811/101‑2 GTTAACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGT > 2:1352763/1‑101 AACGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTT < 2:634986/101‑1 CGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTAT < 2:47705/101‑1 CGTGTCTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTAT > 1:421605/1‑101 CTTATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGC < 2:1137754/101‑1 ATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTA > 1:205948/1‑101 ATCAGGTCTACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTA < 1:329084/101‑1 TCTACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTG > 2:1048207/1‑101 CTACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGA < 1:1250684/101‑1 ACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACC < 2:1236943/101‑1 ACGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACC > 1:1515625/1‑101 CGGGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCG > 2:327169/1‑101 GGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGAC < 1:30595/101‑1 GGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGAC < 1:603869/101‑1 GGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACA > 2:493897/1‑101 GGACCACCAATATAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACA > 2:932276/1‑101 AATGTAGGTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGG < 1:1048212/101‑1 GTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGAT > 2:679593/1‑101 GTCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGAT < 1:878153/101‑1 TCGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATA < 2:421600/101‑1 CGGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATAC < 2:55781/101‑1 GGATAAGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACG > 1:730382/1‑101 AGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATA < 1:539278/101‑1 AGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATA < 1:1474880/101‑1 AGGCGCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATA > 2:1331690/1‑101 GCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCG < 1:1068207/101‑1 GCAAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCG < 2:1204504/101‑1 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ‑‑‑‑‑GGGACCACCAATGTAGGTCGGATAAGGCGCTAGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 93/17731‑17666‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AGCGCCGCATCCGACAAGCGATGCCTGATGTGACGTTTAACGTGTCTTATCAGGCCTACGGGTGACCGACAATGCCCGGAAGCGATACGAAATATTCG < 93/17700‑17603 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |