Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC | 89 | 12,284 | (GTCGCCAGC)1→2 | intergenic (–/–) | – / – | –/– |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 89 | 12268 = | 2 (0.030) | 50 (0.930) | 45/184 | 0.2 | 96.3% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 89 | = 12276 | 2 (0.040) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
TGCCATTGCGCGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCCGTTAATTCTGATTCAGCAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 89/12375‑12268 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gctggcgaCGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAAGTCGTTAGCCGCATTTTTCCTGGTGCGACTGTTTGGTCACTCCCAACGTACGGCATTAACCATCGCCGCCAGCCT < 89/12276‑12177 TGCCATTGCGCGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCCGTTAATTCTGATTCAGCAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACG > 1:941587/1‑101 CGCGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCCGTTAATTCTGATTCAGCAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGAC > 2:537565/1‑101 CGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCCGTTAATTCTGATTCAGCAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGACGCTGG < 2:1223892/101‑1 GTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCCGTTAATTCTGATTCAGCAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGACGCTGGCGA > 2:1112970/1‑101 TTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCCGTTAATTCTGATTCAGCAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGACGCTGGCGATT < 2:964934/101‑1 TGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCCGTTAATTCTGATTCAGCAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGACGCTGGCGATTA > 2:73042/1‑101 GGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCCGTTAATTCTGCTTCAGCAACCGCTGGCAGTGATGGCGACGCTGGGGGCGCTGGCGATTATTC > 2:478130/1‑101 GTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCCGTTAATTCTGATTCAGCAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGACGCTGGCGATTATTCT > 2:1230291/1‑101 GTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCCGTTAATTCTGATTCAGCAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGACGCTGGCGATTATTCT < 1:1448390/101‑1 GTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCCGTTAATTCTGATTCAGCAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGACGCTGGCGATTATTCT > 2:252438/1‑101 TGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCCGTTAATTCTGATTCAGCAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGACGCTGGCGATTATTCTG > 2:471807/1‑101 GCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCCGTTAATTCTGATTCAGCAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGACGCTGGCGATTATTCTGT < 2:1085863/101‑1 TGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCCGTTAATTCTGATTCAGCAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGACGCTGGCGATTATTCTGTTT > 1:416164/1‑101 TTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCCGTTAATTCTGATTCAGCAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGACGCTGGCGATTATTCTGTTTGGT < 2:941582/101‑1 TTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCCGTTAATTCTGATTCAGCAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGACGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAA < 1:1625851/101‑1 GTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCCGTTAATTCTGATTCAGCAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGACGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAAGTC > 2:219734/1‑101 GTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCCGTTAATTCTGATTCAGCAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGACGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAAGTC < 1:609923/101‑1 TCCGTCGGGATGTTGTTTGATCCGTTAATTCTGATTCAGCAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGACGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAAGTCGTT > 1:521442/1‑101 CCGTCGGGATGTTGTTTGATCCGTTAATTCTGATTCAGCAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGACGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAAGTCGTTA > 1:1009205/1‑101 CGTCGGGATGTTGTTTGATCCGTTAATTCTGATTCAGCAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGACGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAAGTCGTTAG < 1:954453/101‑1 CGTCGGGATGTTGTTTGATCCGTTAATTCTGATTCAGCAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGACGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAAGTCGTTAG < 1:728558/101‑1 TCGGGATGTTGTTTGATCCGTTAATTCTGATTCAGCAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGACGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAAGTCGTTAGCC < 2:1328036/101‑1 GGATGTTGTTTGATCCGTTAATTCTGATTCAGCAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGACGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAAGTCGTTAGCCGCA > 2:993805/1‑101 GATGTTGTTTGATCCGTTAATTCTGATTCAGCAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGACGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAAGTCGTTAGCCGCAT > 2:49214/1‑101 ATGTTGTTTGATCCGTTAATTCTGATTCAGCAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGACGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAAGTCGTTAGCCGCATT > 1:677392/1‑101 TGTTGTTTGATCCGTTAATTCTGATTCAGCAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGACGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAAGTCGTTAGCCGCATTT < 1:673164/101‑1 GTTGTTTGATCCGTTAATTCTGATTCAGCAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGACGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAAGTCGTTAGCCGCATTTT < 2:676995/101‑1 GTTGTTTGATCCGTTAATTCTGATTCAGCAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGACGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAAGTCGTTAGCCGCATTTT < 2:921826/101‑1 GTTGTTTGATCCGTTAATTCTGATTCAGCAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGACGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAAGTCGTTAGCCGCATTTT > 1:469617/1‑101 TTTGATCCGTTAATTCTGATTCAGCAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGACGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAAGTCGTTAGCCGCATTTTTCCT < 1:1600401/101‑1 CGTTAATTCTGATTCAGCAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGTCGACGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAAGTCGTTAGCCGCATTTTTCCTGGTGCGA > 2:687949/1‑101 TTAATTCTGATTCAGCATCCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGACGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAAGTCGTTAGCCGCATTTTTCCTGGTGCGACT < 1:219734/101‑1 TTAATTCTGATTCAGCAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGACGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAAGTCGTTAGCCGCATTTTTCCTGGTGCGACT > 2:1067863/1‑101 ATTCTGATTCAGCAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGACGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAAGTCGTTAGCCGCATTTTTCCTGGTGCGACTGTT < 1:537570/101‑1 ATTCTGATTCAGCAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGACGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAAGTCGTTAGCCGCATTTTTCCTGGTGCGACTGTT > 1:34014/1‑101 CTGATTCAGCAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGACGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAAGTCGTTAGCCGCATTTTTCCTGGTGCGACTGTTTGG < 1:73042/101‑1 GATTCAGCAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGACGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAAGTCGTTAGCCGCATTTTTCCTGGTGCGACTGTTTGGTC < 2:864363/101‑1 TTCAGCAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGACGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAAGTCGTTAGCCGCATTTTTCCTGGTGCGACTGTTTGGTCAC < 1:632348/101‑1 TCAGCACCCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGACGCTGGCCATTATTCTGTTTGGTAAGTCGTTAGCCGCCTTTTTCCTGGTGCGACTGTTTGGTCACT < 2:882108/101‑1 TCAGCAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGACGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAAGTCGTTAGCCGCATTTTTCCTGGTGCGACTGTTTGGTCACT < 2:469612/101‑1 CAGCAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGACGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAAGTCGTTAGCCGCATTTTTCCTGGTGCGACTGTTTGGTCACTC > 1:535876/1‑101 AGCAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGACGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAAGTCGTTAGCCGCATTTTTCCTGGTGCGACTGTTTGGTCACTCC > 1:1431193/1‑101 CAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGATGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAAGTCGTTAGCCGCATTTTTCCTGGTGCGACTGTTTGGTCACTCCCA < 1:803968/101‑1 CTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGACGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAAGTCGTTAGCCGCATTTTTCCTGGTGCGACTGTTTGGTCACTCCCAACGTAC > 1:135914/1‑101 TGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGACGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAAGTCGTTAGCCGCATTTTTCCTGGTGCGACTGTTTGGTCACTCCCAACGTACG < 1:889811/101‑1 AGTGCTGGCGACGCTGGCGACGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAAGTCGTTAGCCGCATTTTTCCTGGTGCGACTGTTTGGTCACTCCCAACGTACGGCAT > 1:620392/1‑101 GCTGGCGACGCTGGCGACGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAAGTCGTTAGCCGCATTTTTCCTGGTGCGACTGTTTGGTCACTCCCAACGTACGGCATTAA < 2:1472031/101‑1 CGACGCTGGCGACGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAAGTCGTTAGCCGCATTTTTCCTGGTGCGACTGTTTGGTCACTCCCAACGTACGGCATTAACCATC < 1:142542/101‑1 GACGCTGGCGACGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAAGTCGTTAGCCGCATTTTTCCTGGTGCGACTGTTTGGTCACTCCCAACGTACGGCATTAACCATCG > 1:79915/1‑101 GACGCTGGCGACGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAAGTCGTTAGCCGCATTTTTCCTGGTGCGACTGTTTGGTCACTCCCAACGTACGGCATTAACCATCG > 1:952765/1‑101 CGCTGGCGACGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAAGTCGTTAGCCGCATTTTTCCTGGTGCGACTGTTTGGTCACTCCCAACGTACGGCATTAACCATCGCC < 1:993810/101‑1 GCTGGCGACGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAAGTCGTTAGCCGCATTTTTCCTGGTGCGACTGTTTGGTCACTCCCAACGTACGGCATTAACCATCGCCG > 2:922346/1‑101 GCTGGCGACGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAAGTCGTTAGCCGCATTTTTCCTGGTGCGACTGTTTGGTCACTCCCAACGTACGGCATTAACCATCGCCG > 2:1482841/1‑101 GGCGACGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAAGTCGTTAGCCGCATTTTTCCTGGTGCGACTGTTTGGTCACTCCCAACGTACGGCATTAACCATCGCCGCCA > 1:55298/1‑101 ACGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAAGTCGTTAGCCGCATTTTTCCTGGTGCGACTGTTTGGTCACTCCCAACGTACGGCATTAACCATCGCCGCCAGCCT < 2:79915/101‑1 TGCCATTGCGCGACGCGTTTGCGGTGCTGTTTTTTGTCTCCGTCGGGATGTTGTTTGATCCGTTAATTCTGATTCAGCAACCGCTGGCAGTGCTGGCGACGCTGGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 89/12375‑12268 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gctggcgaCGCTGGCGATTATTCTGTTTGGTAAGTCGTTAGCCGCATTTTTCCTGGTGCGACTGTTTGGTCACTCCCAACGTACGGCATTAACCATCGCCGCCAGCCT < 89/12276‑12177 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |