New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 222 | = 1443 | 0 (0.000) | 73 (0.050) | 60/200 | 0.1 | 96.7% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 86 | = 2269 | 5 (0.070) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
ATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 222/1349‑1443 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTACAGCGCTATAACGAACTGGCTGCAAGGCTGGATGCAGCACTGACAACGCAACTCACCACCGG < 86/2269‑2170 ATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACG < 1:1297446/101‑1 ATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACG < 2:1262331/101‑1 ATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACG > 1:1370840/1‑101 ATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACG > 1:530649/1‑101 TAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGA < 2:659901/101‑1 GCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACT < 2:359373/101‑1 CTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACTTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTT > 2:1662789/1‑101 CTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTT > 1:537603/1‑101 TGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTC < 2:768804/101‑1 GAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCGGTACAATCACGGACTTTCG < 1:1201572/101‑1 GAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATAACGGACTTTCG > 2:62932/1‑101 AAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGG > 2:723905/1‑101 AATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGC > 2:496765/1‑101 AATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGC < 2:1383425/101‑1 ATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCG > 2:142688/1‑101 AAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTA < 2:1642283/101‑1 AAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTA > 2:103449/1‑101 AGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAG < 2:421824/101‑1 GGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGC < 2:1432439/101‑1 TCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGT > 1:1476898/1‑101 TGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCG < 2:45359/101‑1 GACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGG < 1:230459/101‑1 ACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGC > 2:57571/1‑101 ACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGC > 2:844974/1‑101 CTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCT > 1:964875/1‑101 CTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCT > 2:1441653/1‑101 CCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGG > 2:93468/1‑101 CCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGG < 2:903259/101‑1 AATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGG < 2:26446/101‑1 ATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGC > 1:908616/1‑101 TTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCT < 1:1206647/101‑1 TGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTA < 1:1283850/101‑1 TGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTA > 2:834031/1‑101 GAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTAC < 2:131961/101‑1 AATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTACA > 2:464071/1‑101 ATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTACAG > 1:1075727/1‑101 ATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTACAG > 1:95306/1‑101 ATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTACAG > 2:1179111/1‑101 TATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTACAGC > 1:205852/1‑101 GAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTACAGCGCTAT < 2:1370834/101‑1 GAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTACAGCGCTAT < 2:52823/101‑1 AATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTACAGCGCTATA < 2:407361/101‑1 ATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTACAGCGCTATAA < 1:655426/101‑1 CCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTACAGCGCTATAACGAACT < 1:103449/101‑1 CCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTACAGCGCTATAACGAACT < 2:1262864/101‑1 CCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTACAGCGCTATAACGAACT < 1:1179116/101‑1 CTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTACAGCGCTATAACGAACTG > 1:104580/1‑101 CTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTACAGCGCTATAACGAACTG > 2:360408/1‑101 TATATGCCTCGTGTTTAAATGTCAAACTTTTTGGGGCCGGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTACAGCGCTCTAACGAACTGG > 2:250474/1‑101 ATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTACAGCGCTATAACGAACTGGCTG > 1:889357/1‑101 TGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTACAGCGCTATAACGAACTGGCTGC > 2:886884/1‑101 GCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTACAGCGCTATAACGAACTGGCTGCA < 2:1490200/101‑1 TCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTACAGCGCTATAACGAACTGGCTGCAAGG > 1:1478726/1‑101 CGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTACAGCGCTATAACGAACTGGCTGCAAGGC < 2:917314/101‑1 TGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTACAGCGCTATAACGAACTGGCTGCAAGGCTG > 2:698199/1‑101 TGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTACAGCGCTATAACGAACTGGCTGCAAGGCTG < 1:886599/101‑1 GTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTACAGCGCTATAACGAACTGGCTGCAAGGCTGG > 1:1638472/1‑101 TTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTACAGCGCTATAACGAACTGGCTGCAAGGCTGGAT < 2:1505859/101‑1 TTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTACAGCGCTATAACGAACTGGCTGCAAGGCTGGAT < 1:57571/101‑1 AACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTACAGCGCTATAACGAACTGGCTGCAAGGCTGGATGC > 2:956764/1‑101 AACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTACAGCGCTATAACGAACTGGCTGCAAGGCTGGATGC < 2:1247024/101‑1 ACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTACAGCGCTATAACGAACTGGCTGCAAGGCTGGATGCA < 2:788623/101‑1 TGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGTCTACAGCGCTATAACGAACTGGCTGCAAGGCTGGATGCAGC < 1:487803/101‑1 TTTTTGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTACAGCGCTATAACGAACTGGCTGCAAGGCTGGATGCAGCACTGACAA < 2:351637/101‑1 TGGGGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTACAGCGCTATAACGAACTGGCTGCAAGGCTGGATGCAGCACTGACAACGCA < 2:85127/101‑1 GGTCAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTACAGCGCTATAACGAACTGGCTGCAAGGCTGGATGCAGCACTGACAACGCAACT > 1:589302/1‑101 CAGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTACAGCGCTATAACGAACTGGCTGCAAGGCTGGATGCAGCACTGACAACGCAACTCAC > 2:121067/1‑101 AGTACAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTACAGCGCTATAACGAACTGGCTGCAAGGCTGGATGCAGCACTGACAACGCAACTCACC < 1:575769/101‑1 CAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTACAGCGCTATAACGAACTGGCTGCAAGGCTGGATGCAGCACTGACAACGCAACTCACCACCG > 2:414475/1‑101 CAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTACAGCGCTATAACGAACTGGCTGCAAGGCTGGATGCAGCACTGACAACGCAACTCACCACCG > 2:148880/1‑101 CAATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTACAGCGCTATAACGAACTGGCTGCAAGGCTGGATGCAGCACTGACAACGCAACTCACCACCG < 1:496770/101‑1 AATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTACAGCGCTATAACGAACTGGCTGCAAGGCTGGATGCAGCACTGACAACGCAACTCACCACCGG < 2:537598/101‑1 AATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTACAGCGCTATAACGAACTGGCTGCAAGGCTGGATGCAGCACTGACAACGCAACTCACCACCGG > 2:639225/1‑101 ATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 222/1349‑1443 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATCACGGACTTTCGGCGATTAAGCGTCGGCTGGGGCTACAGCGCTATAACGAACTGGCTGCAAGGCTGGATGCAGCACTGACAACGCAACTCACCACCGG < 86/2269‑2170 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |