New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 222 | = 1443 | 0 (0.000) | 64 (0.040) | 48/198 | 0.4 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 81 | 9928 = | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
AATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 222/1348‑1443 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGTTGGTCGCTATATGGCGGCGCGCTGGGAGAT > 81/9928‑10026 AATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTG < 2:878050/101‑1 ATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGG > 2:804899/1‑101 TTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGG < 1:1061714/101‑1 TAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGnnnnt < 2:7620/101‑6 AGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGC < 2:145021/101‑1 GCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCC < 1:956307/101‑1 GCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCC > 2:1597352/1‑101 CCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCA > 2:1638328/1‑101 CTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCAC > 1:939168/1‑101 CTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCAC < 1:729903/101‑1 CTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCAC > 2:396305/1‑101 AATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATG < 1:1231174/101‑1 TTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTC < 1:1546565/101‑1 TAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTtc < 2:1023410/101‑3 TAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCG > 2:357262/1‑101 TAAAAGGACTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCG < 2:1250797/101‑1 AAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGA > 1:461595/1‑101 AAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGA > 1:677060/1‑101 AAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGGCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGA > 1:1169707/1‑101 AAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAG < 1:358497/101‑1 AAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAG < 2:460819/101‑1 AAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAG < 1:657794/101‑1 AAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAG > 1:1336601/1‑101 AAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAG < 1:786759/101‑1 CTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGA < 1:1459279/101‑1 CTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGA > 2:269013/1‑101 GACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATT > 2:475232/1‑101 ACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTT < 2:1072394/101‑1 ACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTT < 2:560163/101‑1 CCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTC > 1:1020949/1‑101 ATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCTGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCT > 2:1321588/1‑101 GAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGT < 2:1624408/101‑1 AATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTG < 2:1642925/101‑1 GGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAG < 1:955126/101‑1 GGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAG < 2:23606/101‑1 GAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGC > 2:1382146/1‑101 ATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTTAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCT > 2:1257608/1‑101 ATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCT < 1:368154/101‑1 ATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCT < 2:414825/101‑1 CAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCC < 2:1365954/101‑1 ATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATC < 1:1620247/101‑1 GCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGC > 1:362995/1‑101 CCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCT > 2:206268/1‑101 CTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTA > 2:618962/1‑101 GTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACG > 1:915288/1‑101 GTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGT > 1:601737/1‑101 GTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGT > 1:1038338/1‑101 TTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGTT > 2:281134/1‑101 TTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGTTG < 2:844421/101‑1 TTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGTTG > 2:354076/1‑101 CTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGTTGGTCG < 1:597040/101‑1 TCCAACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGTTGGTCGCTA > 1:1368386/1‑101 AACTTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGTTGGTCGCTATAT < 2:1224653/101‑1 TTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGTTGGTCGCTATATGGC > 2:1682170/1‑101 TTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGTTGGTCGCTATATGGC < 2:1043435/101‑1 TTTTTGGGGTCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGTTGGTCGCTATATGGC > 1:55026/1‑101 ttAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGTTGGTCGCTATATGGCGGCGCGCTG < 1:1257613/99‑1 gCAGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGTTGGTCGCTATATGGCGGCGCGCTG < 2:1623752/100‑1 tGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGTTGGTCGCTATATGGCGGCGCGCTGGG < 1:1321594/100‑1 AGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGTTGGTCGCTATATGGCGGCGCGCTGGG > 2:611128/1‑101 AGTACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGTTGGTCGCTATATGGCGGCGCGCTGGG < 1:797318/101‑1 ACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGTTGGTCGCTATATGGCGGCGCGCTGGGAGA < 2:126480/101‑1 ACAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGTTGGTCGCTATATGGCGGCGCGCTGGGAGA < 1:1577727/101‑1 CAGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGTTGGTCGCTATATGGCGGCGCGCTGGGAGAT < 1:649133/101‑1 AATTAGCCTGAAATTAAAAGGTCTGACTCCAATTGAATATCGGAATCAGACCTATATGCCTCGTGTTTAACTGTCCAACTTTTTGGGGTCAGTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 222/1348‑1443 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aGAGTGGGGCCACCATGTCGAGGGGGGATTTTTCTCTGGTGCTGAAGCCTCCTGGGGGATCGCTAACGGTTGGTCGCTATATGGCGGCGCGCTGGGAGAT > 81/9928‑10026 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |