| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 2 | 33362 = | 45 (0.760) | 65 (1.120) +GGA |
49/194 | 0.2 | 54.2% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 2 | = 33439 | 68 (1.140) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
AGAAGACCAGATTAAGAAAATCTGGTGCGTCCGAGTGGACTCGAACCACCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTATGAACGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 2/33461‑33362‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGTGCGTCCGAGTGGACTCGAACCACCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTATGAACGCAACGTTGTAGGTGACAACGGGG < 2/33439‑33341 ||| AGAAGACCAGATTAAGAAAATCTGGTGCGTCCGAGTGGACTCGAACCACCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAG > 1:866560/1‑101 GACCAGATTAAGAAAATCTGGTGCGTCCGAGTGGACTCGAACCACCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATG < 2:1468867/101‑1 CCAGATTAAGAAAATCTGGTGCGTCCGAGTGGACTCGAACCACCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGT < 2:1318182/101‑1 CAGATTAAGAAAATCTGGTGCGTCCGAGTGGACTCCAACCACCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTG < 2:225535/101‑1 AGATTAAGAAAATCTGGTGCGTCCGAGTGGACTCGAACCACCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGC > 1:786380/1‑101 AGATTAAGAAAATCTGGTGCGTCCGAGAGGACTCGAACCACCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGC > 1:210254/1‑101 GATTAAGAAAATCTGGTGCGTCCGAGTGGACTCGAACCACCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCG > 2:630748/1‑101 GATTAAGAAAATCTGGTGCGTCCGAGTGGACTCGAACCACCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCG > 2:583647/1‑101 ATTAAGAAAATCTGGTGCGTCCGAGTGGACTCGAACCACCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGT > 1:423202/1‑101 TTAAGAAAATCTGGTGCGTCCGAGTGGACTCGAACCACCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTt > 2:993777/1‑100 TTAAGAAAATCTGGTGCGTCCGAGTGGACTCGAACCACCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTt < 2:1562871/101‑2 TAAGAAAATCTGGTGCGTCCGAGTGGACTCGAACCACCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTtc > 1:327313/1‑99 TAAGAAAATCTGGTGCGTCCGAGTGGACTCGAACCACCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTtc > 1:1630990/1‑99 AAGAAAATCTGGTGCGTCCGAGTGGACTCGAACCACCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTtca > 2:583880/1‑98 AGAAAATCTGGTGCGTCCGAGTGGACTCGAACCACCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTtcaa > 1:682485/1‑97 GAAAATCTGGTGCGTCCGAGTGGACTCGAACCACCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTtcaat < 2:1578734/101‑6 GAAAATCTGGTGCGTCCGAGTGGACTCGAACCACCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTtcaat > 2:1357549/1‑96 AATCTGGTGCGTCCGAGTGGACTCGAACCACCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTtcaattgg > 1:812891/1‑93 ATCTGGTGCGTCCGAGTGGACTCGAACCACCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGA > 1:91793/1‑101 TCTGGTGCGTCCGAGTGGACTCGAACCACCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGAC < 1:1540562/101‑1 TGGTGCGTCCGAGTGGACTCGAACCACCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTC < 1:463537/101‑1 TGGTGCGTCCGAGTGGACTCGAACCACCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTC > 2:640509/1‑101 TGGTGCGTCCGAGTGGACTCGAACCACCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTC < 1:1188784/101‑1 GCGTCCGAGTGGACTCGAACCGCCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAAC < 2:321655/101‑1 GTCCGAGTGGACTCGAACCACCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCA > 1:1109723/1‑101 GTCCGAGTGGACTCGAACCACCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCA < 1:366032/101‑1 CCGAGTGGACTCGAACCACCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGCGCCACGGACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGACCCAac < 2:986515/101‑3 GAGTGGACTCGAACCACCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCAACGA > 2:1488466/1‑101 GTGGACTCGAACCACCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCAACGACC < 1:1713342/101‑1 GGACTCGAACCACCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCAACGACCCC > 2:958222/1‑101 GACTCGAACCACCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCAACGACCCCC > 1:258347/1‑101 ACTCGAACCACCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCAACGACCCCCA < 2:682480/101‑1 ACTCGAACCACCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACACAGGATGGTGCGTTCAACTGGACTCGAACCAACGACCCCCA < 1:1250142/101‑1 CTCGAACCACCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCAACGACCCCCAC > 1:1419032/1‑101 CTCGAACCACCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCAACGACCCCCAC < 1:640514/101‑1 GAACCACCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCAACGACCCCCACCAT < 1:322155/101‑1 CCACCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCAACGACCCCCACCATGTC > 1:759666/1‑101 CCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCAACGACCCCCACCATGTCAAG < 1:583652/101‑1 GACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCAACGACCCCCACCATGTCAAGGT < 2:620980/101‑1 ACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCAACGACCCCCACCATGTCAAGGTG < 1:816270/101‑1 CCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCAACGACCCCCACCATGTCAAGGTGG < 2:1475926/101‑1 CCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCAACGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTG > 2:78455/1‑101 CCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCAACGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTG < 1:16020/101‑1 CCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCAACGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCT < 2:327313/101‑1 TGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCAACGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAAC < 2:1709682/101‑1 GTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCAACGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACC < 2:671242/101‑1 AAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCAACGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAAC < 2:1419026/101‑1 AAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCAACGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAAC > 2:104946/1‑101 CTCTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCAACGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTATG > 2:1018638/1‑101 CTAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCAACGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTATGAA > 2:615476/1‑101 TAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCAACGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTATGAAC < 1:1423696/101‑1 TAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCAACGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTATGAAC < 1:630753/101‑1 TAACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCAACGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTATGAAC < 1:90514/101‑1 AACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCAACGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTATGAACG > 1:1140509/1‑101 ACCAACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCAACGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTATGAACGC > 1:614566/1‑101 AACTGAGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCAACGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTATGAACGCAAC > 2:1074259/1‑101 AGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCAACGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTATGAACGCAACGTTGT < 1:296420/101‑1 AGCTACGGACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCAACGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTATGAACGCAACGTTGT < 1:1357555/101‑1 GCTACGGACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCAACGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTATGAACGCAACGTTGTA > 2:667077/1‑101 ctacggACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCAACGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTATGAACGCAACGTTGTAG < 2:911352/95‑1 tacggACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCAACGACCCCCACCATGTCAAGGTTGTGCTCTAACCAACTGAGCTATGAACGCAACGTTGTAGG > 1:1550718/6‑101 acggACGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCAACGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTATGAACGCAACGTTGTAGGT < 1:1306059/97‑1 CGCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCAACGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTATGAACGCAACGTTGTAGGTGACAA < 1:790987/101‑1 GCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCAACGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTATGAACGCAACGTTGTAGGTGACAAC < 1:1488472/101‑1 GCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCAACGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTATGAACGCAACGTTGTAGGTGACAAC < 2:1593944/101‑1 GCAGGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCAACGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTATGAACGCAACGTTGTAGGTGACAAC < 1:1018643/101‑1 GGATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCAACGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTATGAACGCAACGTTGTAGGTGACAACGGG > 2:972450/1‑101 GATGGTGCGTTCAATTGGACTCGAACCAACGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTATGAACGCAACGTTGTAGGTGACAACGGGG < 1:233491/101‑1 ||| AGAAGACCAGATTAAGAAAATCTGGTGCGTCCGAGTGGACTCGAACCACCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTATGAACGCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 2/33461‑33362‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGTGCGTCCGAGTGGACTCGAACCACCGACCCCCACCATGTCAAGGTGGTGCTCTAACCAACTGAGCTATGAACGCAACGTTGTAGGTGACAACGGGG < 2/33439‑33341 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |