| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 19 | = 16877 | 10 (0.160) | 55 (0.070) +GGTGATGCTGCCAACT |
43/168 | 0.3 | 92.9% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 223 | = 698 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
GTTGGCACCCGCCGCGATAACTTTTTCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 19/16778‑16877‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTG < 223/698‑617 |||||||||||||||| GTTGGCACCCGCCGCGATAACTTTTTCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGG < 1:1135756/101‑1 TTGGCACCCGCCGCGATAACTTTTTCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGG < 1:1532574/101‑1 CCGCCGCGATAACTTTTTCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCT < 2:1391441/101‑1 CGCCGCGATAACTTTTTCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTG > 2:978534/1‑101 GCCGCGATAACTTTTTCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGC > 1:649098/1‑101 CGATAACTTTTTCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAAC > 1:1282517/1‑101 GATAACTTTTTCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACT > 1:855071/1‑101 ATAACTTTTTCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTT > 1:794072/1‑101 ATAACTTTTTCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTT > 2:568907/1‑101 ACTTTTTCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACT > 1:704323/1‑101 ACTTTTTCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACT > 1:790630/1‑101 ACTTTTTCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACT < 1:997703/101‑1 ACTTTTTCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACT < 1:420003/101‑1 ACTTTTTCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACT > 1:328089/1‑101 TTTTCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGAT > 2:894175/1‑101 TTTCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT < 1:750849/101‑1 TCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA < 1:122504/101‑1 TCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA < 1:139764/101‑1 CAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG < 1:873931/101‑1 AGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACCTACTGATTTAGTG > 2:642379/1‑101 ATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTA > 1:767735/1‑101 TTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTAT > 1:1457668/1‑101 TTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTAT > 2:25663/1‑101 ATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA < 2:96037/101‑1 ATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA > 1:229457/1‑101 ATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGGAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA > 2:392612/1‑101 TATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATG < 2:112584/101‑1 TATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATG < 1:568912/101‑1 GCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGT < 1:973969/101‑1 CGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTT < 1:1456877/101‑1 GATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT < 1:894180/101‑1 GATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT > 1:1069569/1‑101 ATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTT < 1:854816/101‑1 CTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG > 1:1282532/1‑101 GTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAG > 1:1403689/1‑101 TTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGG < 2:109035/101‑1 TGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGT < 2:1383312/101‑1 GCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG > 1:920900/1‑101 CTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 2:177713/1‑101 CTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC < 1:855400/101‑1 GGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTC < 2:649093/101‑1 CTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGT > 2:914880/1‑101 CTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGGGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGT > 1:365936/1‑101 TAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTG > 2:406407/1‑101 AACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGG > 1:638178/1‑101 GTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTT > 2:1305314/1‑101 GTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTT > 2:252726/1‑101 tGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCT < 2:749442/100‑1 TAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGT < 1:114320/101‑1 ACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTT > 1:1390581/1‑101 TTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATC > 1:1258106/1‑101 TTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATC > 1:653814/1‑101 TGCGAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCC < 2:1305704/101‑1 GAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCTTC > 1:1144997/1‑101 GAAGCCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTC > 2:1436594/1‑101 CCTTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGT > 1:601028/1‑101 TTCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTC < 2:1069564/101‑1 TCTGGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCA < 1:1400026/101‑1 GGACATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCT < 2:549172/101‑1 CATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACT < 2:1457662/101‑1 ATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTG > 2:589722/1‑101 ATGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTG < 1:120514/101‑1 |||||||||||||||| GTTGGCACCCGCCGCGATAACTTTTTCAAGATTATTATCGCGATCTGTTGCTGGGCCTAACGTGGTAACGATTTTTGTTCTGCGAAGCCTTCTGGACATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 19/16778‑16877‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTG < 223/698‑617 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |