New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 16 | = 47700 | 0 (0.000) | 58 (0.940) +GCAGCA |
49/188 | 0.2 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 190 | = 6342 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
GTTAGTGGTGGATGGTTCCATCCCATTAAAAGATAACGGTATTTATTGCATGGTTGCCGGTGAGCCGATTGTGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 16/47601‑47700 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCGGTGTTGCCGCAGCTGGAGTTAACCCAACTGGCGCAGTCAGCCTGCAAGAAGTTCTGCCAGGCA < 190/6342‑6243 |||||| GTTAGTGGTGGATGGTTCCATCCCATTAAAAGATAACGGTATTTATTGCATGGTTGCCGGTGAGCCGATTGTGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGGAGGCG > 2:1646507/1‑101 TTAGTGGTGGATGGTTCCATCCCATTAAAAGATAACGGTATTTATTGCATGGTTGCCGGTGAGCCGATTGTGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGC < 1:1176721/101‑1 AGTGGTGGATGGTTCCATCCCATTAAAAGATAACGGTATTTATTGCATGGTTGCCGGTGAGCCGATTGTGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAG < 2:243446/101‑1 AGTGGTGGATGGTTCCATCCCATTAAAAGATAACGGTATTTATTGCATGGTTGCCGGTGAGCCGATTGTGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAG > 2:743359/1‑101 GTGGATGGTTCCATCCCATTAAAAGATAACGGTATTTATTGCATGGTTGCCGGTGAGCCGATTGTGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGC > 2:587690/1‑101 gacGGTTCCATCCCATTAAAAGATAACGGTATTTATTGCATGGTTGCCGGTGAGCCGATTGTGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCAT > 1:1428717/4‑101 GATGGTTCCATCCCATTAAAAGATAACGGTATTTATTGCATGGTTGCCGGTGAGCCGATTGTGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCAT > 1:1270056/1‑101 GGTTCCATCCCATTAAAAGATAACGGTATTGATTGCATGGTTGCCGGTGAGCCGATTGTGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTAT < 1:1128748/101‑1 GTTCCATCCCATTAAAAGATAACGGTATTTATTGCATGGTTGCCGGTGAGCCGATTGTGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATC > 2:1285753/1‑101 TTCCATCCCATTAAAAGATAACGGTATTTATTGCATGGTTGCCGGTGAGCCGATTGTGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCG < 2:1702687/101‑1 ATCCCATTAAAAGATAACGGTATTTATTGCATGGTTGCCGGTGAGCCGATTGTGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTAT > 2:1687053/1‑101 ATCCCATTAAAAGATAACGGTATTTATTGCATGGTTGCCGGTGAGCCGATTGTGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTAT > 1:702522/1‑101 TCCCATTAAAAGATAACGGTATTTATTGCATGGTTGCCGGTGAGCCGATTGTGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATC > 2:1414587/1‑101 CATTAAAAGATAACGGTATTTATTGCATGGTTGCCGGTGAGCCGATTGTGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGT < 1:388047/101‑1 ATTAAAAGATAACGGTATTTATTGCATGGTTGCCGGTGAGCCGATTGTGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTT < 2:138542/101‑1 ATTAAAAGATAACGGTATTTATTGCATGGTTGCCGGTGAGCCGATTGTGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTT > 2:148446/1‑101 AAAAGATAACGGTATTTATTGCATGGTTGCCGGTGAGCCGATTGTGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCT < 1:372460/101‑1 AAAGATAACGGTATTTATTGCATGGTTGCCGGTGAGCCGATTGTGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTG < 1:94907/101‑1 AAGATAACGGTATTTATTGCATGGTTGCCGGTGAGCCGATTGTGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGC > 1:544557/1‑101 GATAACGGTATTTATTGCATGGTTGCCGGTGAGCCGATTGTGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTC < 2:241875/101‑1 ATAACGGTATTTATTGCATGTTTGCCGTTGAGCCGATTGTGGATCCCATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCT < 2:1527591/101‑1 GGTATTTATTGCATGGTTGCCGGTGAGCCGATTGTGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTG > 2:1606055/1‑101 GTATTTATTGCATGGTTGCCGGTGAGCCGATTGTGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGGTCCTGCTCTGCGTGG > 2:920740/1‑101 ATTTATTGCATGGTTGCCGGTGAGCCGATTGTGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGG > 1:1166952/1‑101 TTATTGCATGGTTGCCGGTGAGCCGATTGTGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCG > 2:861774/1‑101 TATTGCATGGTTGCCGGTGAGCCGATTGTGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCGG > 1:1694736/1‑101 TATTGCATGGTTGCCGGTGAGCCGATTGTGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGCCGG > 1:822851/1‑101 ATTGCATGGTTGCCGGTGAGCCGATTGTGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCGGT > 2:1524704/1‑101 CATGGTTGCCGGTGAGCCGATTGTGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCGGTGTTG > 1:649901/1‑101 ATGGTTGCCGGTGAGCCGATTGTGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCGGTGTTGC > 2:349357/1‑101 ATGGTTGCCGGTGAGCCGATTGTGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCGGTGTTGC > 2:170293/1‑101 GGTTGCCGGTGAGCCGATTGTGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCGGTGTTGCCG < 1:1071757/101‑1 GTTGCCGGTGAGCCGATTGTGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCGGTGTTGCCGC > 2:1713967/1‑101 CGGTGAGCCGATTGTGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCGGTGTTGCCGCAGCTG > 2:456552/1‑101 CGGTGAGCCGATTGTGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCGGTGTTGCCGCAGCTG > 2:217020/1‑101 TGAGCCGATTGTGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCGGTGTTGCCGCAGCTGGAG < 1:451233/101‑1 GAGCCGATTGTGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCGGTGTTGCCGCAGCTGGAGT < 1:140255/101‑1 gcgGATTGTGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCGGTGTTGCCGCAGCTGGAGTTA < 2:511332/98‑1 ccaATTGTGAATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCGGTGTTGCCGCAGCTGGAGTTAA < 2:1166947/98‑1 GATTGTGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCGGTGTTGCCGCAGCTGGAGTTAACC > 2:472265/1‑101 TGTGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCGGTGTTGCCGCAGCTGGAGTTAACCCAA > 2:1471972/1‑101 TGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCGGTGTTGCCGCAGCTGGAGTTAACCCAACT > 2:1262125/1‑101 TGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCGGTGTTGCCGCAGCTGGAGTTAACCCAACT < 1:751689/101‑1 TGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCGGTGTTGCCGCAGCTGGAGTTAACCCAACT < 1:349357/101‑1 TGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCGGTGTTGCCGCAGCTGGAGTTAACCCAACT > 1:1328802/1‑101 gagCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCGGTGTTGCCGCAGCTGGAGTTAACCCAACTGG < 2:1284769/98‑1 TCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCGGTGTTGCCGCAGCTGGAGTTAACCCAACTGGCG > 2:60526/1‑101 CATCCGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCGGTGTTGCCGCAGCTGGAGTTAACCCAACTGGCGCAG < 1:148446/101‑1 tcgGCAACGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCGGTGTTGCCGCAGCTGGAGTTAACCCAACTGGCGCAGTC < 2:1597744/98‑1 CGCAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCGGTGTTGCCGCAGCTGGAGTTAACCCAACTGGCGCAGTCAG > 1:1337208/1‑101 CAAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCGGTGTTGCCGCAGCTGGAGTTAACCCAACTGGCGCAGTCAGCC < 1:730185/101‑1 AAAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCGGTGTTGCCGCAGCTGGAGTTAACCCAACTGGCGCAGTCAGCCT < 1:1606061/101‑1 AAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCGGTGTTGCCGCAGCTGGAGTTAACCCAACTGGCGCAGTCAGCCTG < 1:181586/101‑1 AAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCGGTGTTGCCGCAGCTGGAGTTAACCCAACTGGCGCAGTCAGCCTG < 2:649896/101‑1 AAGCGGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCGGTGTTGCCGCAGCTGGAGTTAACCCAACTGGCGCAGTCAGCCTG < 1:1524710/101‑1 GGCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCGGTGTTGCCGCAGCTGGAGTTAACCCAACTGGCGCAGTCAGCCTGCAAG < 1:1663110/101‑1 GCGGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCGGTGTTGCCGCAGCTGGAGTTAACCCAACTGGCGCAGTCAGCCTGCAAGA > 1:900331/1‑101 GGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCGGTGTTGCCGCAGCTGGAGTTAACCCAACTGGCGCAGTCAGCCTGCAAGAAG > 1:951904/1‑101 GGAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCGGTGTTGCCGCAGCTGGAGTTAACCCAACTGGCGCAGTCAGCCTGCAAGAAG < 1:1687059/101‑1 GAAGGCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCGGTGTTGCCGCAGCTGGAGTTAACCCAACTGGCGCAGTCAGCCTGCAAGAAGT > 2:1458110/1‑101 GCGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCGGTGTTGCCGCAGCTGGAGTTAACCCAACTGGCGCAGTCAGCCTGCAAGAAGTTCTG < 2:321171/101‑1 CGCAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCGGTGTTGCCGCAGCTGGAGTTAACCCAACTGGCGCAGTCAGCCTGCAAGAAGTTCTGC > 2:1175392/1‑101 CAGCAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCGGTGTTGCCGCAGCTGGAGTTAACCCAACTGGCGCAGTCAGCCTGCAAGAAGTTCTGCCA > 1:339604/1‑101 CAGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCGGTGTTGCCGCAGCTGGAGTTAACCCAACTGGCGCAGTCAGCCTGCAAGAAGTTCTGCCAGGC > 1:738607/1‑101 AGCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCGGTGTTGCCGCAGCTGGAGTTAACCCAACTGGCGCAGTCAGCCTGCAAGAAGTTCTGCCAGGCA < 1:170293/101‑1 |||||| GTTAGTGGTGGATGGTTCCATCCCATTAAAAGATAACGGTATTTATTGCATGGTTGCCGGTGAGCCGATTGTGGATCACATCCGCAAAGCGGCGGAAGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 16/47601‑47700 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCCATTATCGCTATCGGTTCCTGCTCTGCGTGGGGCGGTGTTGCCGCAGCTGGAGTTAACCCAACTGGCGCAGTCAGCCTGCAAGAAGTTCTGCCAGGCA < 190/6342‑6243 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |