| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 153 | 34 = | 0 (0.000) | 44 (0.600) +TCTCGCGCCACTC |
27/174 | 1.3 | 48.8% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 65 | = 7324 | 106 (1.020) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
GACCACAAGCTCTTTCATGTTGTTATGTCCGCTACAGAGGGTGATGGGGTTATGACCAACGCCAGACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACA‑AT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 153/133‑34‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATGGTGTCCAAATGCAACACGTTT < 65/7324‑7266 ||||||||||||| GACCACAAGCTCTTTCATGTTGTTATGTCCGCTACAGAGGGTGATGGGGTTATGACCAACGCCAGACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACA‑ATT < 1:304459/101‑1GACCACAAGCTCTTTCATGTTGTTATGTCCGCTACAGAGGGTGATGGGGTTATGACCAACGCCAGACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACA‑ATT > 1:291379/1‑101GACCACAAGCTCTTTCATGTTGTTATGTCCGCTACAGAGGGTGATGGGGTTATGACCAACGCCAGACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACA‑ATT > 2:704474/1‑101 ACCACAAGCTCTTTCATGTTGTTATGTCCGCTACAGAGGGTGATGGGGTTATGACCAACGCCAGACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACA‑ATTC > 1:1345446/1‑101 CAAGCTCTTTCATGTTGTTATGTCCGCTACAGAGGGTGATGGGGTTATGACCAACGCCAGACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACA‑ATTCTCGC < 2:1475253/101‑1 CAAGCTCTTTCATGTTGTTATGTCCGCTACAGAGGGTGATGGGGTTATGACCAACGCCAGACTGCCTGATGCGCTACCCTTATCAGGCCTACA‑ATTCTCGC < 2:648527/101‑1 TCTTTCATGTTGTTATGTCCGCTACAGAGGGTGATGGGGTTATGACCAACGCCAGACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACA‑ATTCTCGCGCCAC > 1:918795/1‑101 TTCATGTTGTTATGTCCGCTACAGAGGGTGATGGGGTTATGACCAACGCCAGACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACA‑ATTCTCGCGCCACTCG > 2:1225655/1‑101 TTCATGTTGTTATGTCCGCTACAGAGGGTGATGGGGTTATGACCAACGCCAGACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACA‑ATTCTCGCGCCACTCG < 1:919640/101‑1 TCATGTTGTTATGTCCGCTACAGAGGGTGATGGGGTTATGACCAACGCCAGACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACA‑ATTCTCGCGCCACTCGT > 2:653502/1‑101 ATGTTGTTATGTCCGCTACAGAGGGTGATGGGGTTATGACCAACGCCAGACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACA‑ATTCTCGCGCCACTCGTAG > 2:455517/1‑101 TGTTGTTATGTCCGCTACAGAGGGTGATGGGGTTATGACCAACGCCAGACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACA‑ATTCTCGCGCCACTCGTAGG < 1:412489/101‑1 TGTTGTTATGTCCGCTACAGAGGGTGATGGGGTTATGACCAACGCCAGACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACA‑ATTCTCGCGCCACTCGTAGG > 2:981526/1‑101 TTGTTATGTCCGCTACAGAGGGTGATGGGGTTATGACCAACGCCAGACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACA‑ATTCTCGCGCCACTCGTAGGCC > 2:1107880/1‑101 GTTATGTCCGCTACAGAGGGTGATGGGGTTATGACCAACGCCAGACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACA‑ATTCTCGCGCCACTCGTAGGCCGG > 1:1512340/1‑101 GTCCGCTACAGAGGGTGATGGGGTTATGACCAACGCCAGACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACA‑ATTCTCGCGCCACTCGTAGGCCGGATAAG > 2:129878/1‑101 GTCCGCTACAGAGGGTGATGGGGTTATGACCAACGCCAGACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACA‑ATTCTCGCGCCACTCGTAGGCCGGATAAG < 1:322622/101‑1 CCGCTACAGAGGGTGATGGGGTTATGACCAACGCCAGACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACA‑ATTCTCGCGCCACTCGTAGGCCGGATAAGGC > 1:523021/1‑101 gACAGAGGGTGATGGGGTTATGACCAACTCCAGACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACA‑ATTCTCGCGCCACTCGTAGGCCGGATAAGGCGTTc < 2:1040068/100‑2 ACAGAGGGTGATGGGGTTATGACCAACGCCAGACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACA‑ATTCTCGCGCCACTCGTAGGCCGGATAAGGCGTTca > 2:545862/1‑99 ACAGAGGGTGATGGGGTTATGACCAACGCCAGACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACA‑ATTCTCGCGCCACTCGTAGGCCGGATAAGGCGTTca > 1:1563723/1‑99 ACAGAGGGTGATGGGGTTATGACCAACGCCAGACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACA‑ATTCTCGCGCCACTCGTAGGCCGGATAAGGCGTTca < 2:814875/101‑3 CAGAGGGTGATGGGGTTATGACCAACGCCAGACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACA‑ATTCTCGCGCCACTCGTAGGCCGGATAAGGCGTTCAC < 1:1454862/101‑1 AGAGGGTGATGGGGTTATGACCAACGCCAGACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACA‑ATTCTCGCGCCACTCGTAGGCCGGATAAGGAGTTCACt > 2:593978/1‑100 GGTGATGGGGTTATGACCAACGCCAGACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACA‑ATTCTCGCGCCACTCGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGC > 2:1377279/1‑101 TGGGGTTATGGCCAACGCCAGACTGCCTGATGCGCTACGCTTATAAGGCATTCA‑ATTCGCGCGCCGCTCGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCG < 2:682352/101‑1 TGGGGTTATGACCAACGCCAGACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACA‑ATTCTCGCGCCACTCGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCG < 1:712055/101‑1 TGGGGTTATGACCAACGCCAGACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACA‑ATTCTCGCGCCACTCGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCG > 1:602486/1‑101 GGTTATGACCAACGCCAGACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACA‑ATTCTCGCGCCACTCGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCA > 1:95996/1‑101 GACCAACGCCAGACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACA‑ATTCTCGCGCCACTCGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATGGTG < 1:1256085/101‑1 ACCAACGCCAGACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACA‑ATTCTCGCGCCACTCGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATGGTGa > 1:543689/1‑100 CCAACGCCAGACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACA‑ATTCTCGCGCCACTCGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATGGTGac > 2:1650146/1‑99 AACGCCAGACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACA‑ATTCTCGCGCCACTCGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATGGTGacaa > 1:408922/1‑97 CCAGACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACA‑ATTCTCGCGCCACTCGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATGGTG‑ACAAATGC > 2:363497/1‑101 gcaaaTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGATTCTTGCGCCATTCGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATGGTG‑ACAAATGC > 2:491782/6‑101 CAGACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACA‑ATTCTCGCGCCACTCGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATGGTG‑ACAAATGCc > 1:763286/1‑100 caaaTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGATTCTCGCGCCACTCGTAGGCCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGGCAGTGGTG‑GCAAATGCc < 2:1192039/97‑2 aaaTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGATTCTTGCGCCATTCGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATGGTG‑ACAAATGCct > 2:461481/4‑99 aaaTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGATTCTCGCGCCACTCGTAGGCCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGGCAGTGGTG‑GCAAATGCct > 1:589712/4‑99 aaaTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGATTCTCGCGCCACTCGTAGGCCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGGCAGTGGTG‑GCAAATGCct > 1:416419/4‑99 GACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACA‑ATTCTCGCGCCACTCGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATGGTG‑ACAAATGCctg < 1:1677544/101‑4 aaTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGATTCTCGCGCCACTCGTAGGCCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGGCAGTGGTG‑GCAAATGCctg < 2:602481/99‑4 ACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACA‑ATTCTCGCGCCACTCGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATGGTG‑ACAAATGCctga > 2:781875/1‑97 aTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGATTCTTGCGCCATTCGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATGGTG‑ACAAATGCctga < 1:129878/100‑5 aTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGATTCTCGCGCCACTCGTAGGCCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGGCAGTGGTG‑GCAAATGCctga > 2:1499013/2‑97 CTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACA‑ATTCTCGCGCCACTCGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATGGTG‑ACAAATGCctgat < 1:1377285/101‑6 CTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACA‑ATTCTCGCGCCACTCGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATGGTG‑ACAAATGCctgat < 2:708959/101‑6 CTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACA‑ATTCTCGCGCCACTCGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATGGTG‑ACAAATGCctgat > 2:1319468/1‑96 TGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGATTCTCGCGCCACTCGTAGGCCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGGCAGTGGTG‑GCAAATGCctgat > 2:72024/1‑96 TGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGATTCTCGCGCCACTCGTAGGCCGGATAAGGCGTCCACGCCGCATCCGGCAGTGGTG‑GCAAATGCctgat < 2:129980/101‑6 CTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACA‑ATTCTCGCGCCACTCGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATGGTG‑ACAAATGCctgatgcgc > 2:1167393/1‑92 ||||||||||||| GACCACAAGCTCTTTCATGTTGTTATGTCCGCTACAGAGGGTGATGGGGTTATGACCAACGCCAGACTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACA‑AT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 153/133‑34‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATGGTGTCCAAATGCAACACGTTT < 65/7324‑7266 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |