New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | 149 | 1 = | 0 (0.000) | 65 (0.070) +T |
49/198 | 0.2 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
? | 223 | = 698 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
AAGTTAACGGCGTGAGTGAAATGTGCCGGATGTATCACATCCGGCAATATCCATTAAAACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 149/100‑1 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGAC < 223/698‑615 | AAGTTAACGGCGTGAGTGAAATGTGCCGGATGTATCACATCCGGAAATATCCATTAAAACTGATAGGTCACGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACT < 2:786141/101‑1 AGTTAACGGCGTGAGTGAAATGTGCCGGATGTATCACATCCGGCAATATCCATTAAAACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTT > 2:29021/1‑101 GTTAACGGCGTGAGTGAAATGTGCCGGATGTATCACATCCGGCAATATCCATTAAAACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTA > 2:844648/1‑101 TTAACGGCGTGAGTGAAATGTGCCGGATGTATCACATCCGGCAATATCCATTAAAACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTAC < 2:560925/101‑1 TTAACGGCGTGAGTGAAATGTGCCGGATGTATCACATCCGGCAATATCCATTAAAACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTAC < 1:620923/101‑1 TAACGGCGTGAGTGAAATGTGCCGGATGTATCACCTCCGGCAATATCCATTAAAAATGATAGGGCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACT > 2:888515/1‑101 TAACGGCGTGAGTGAAATGTGCCGGATGTATCACATCCGGCAATATCCATTAAAACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACT < 2:535776/101‑1 AACGGCGTGAGTGAAATGTGCCGGATGTATCACATCCGGCAATATCCATTAAAACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTG > 2:1644247/1‑101 GGCGTGAGTGAAATGTGCCGGATGTATCACATCCGGCAATATCCATTAAAACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT < 2:1084893/101‑1 GTGAGTGAAATGTGCCGGATGTATCACATCCGGCAATATCCATTAAAACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG < 1:482830/101‑1 GTGAGTGAAATGTGCCGGATGTATCACATCCGGCAATATCCATTAAAACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAG < 2:371290/101‑1 GAGTGAAATGTGCCGGATGTATCACATCCGGCAATATCCATTAAAACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTG < 2:42908/101‑1 GAGTGAAATGTGCCGGATGTAACACATCCGGCAATATCCATTAAAACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTG > 1:339053/1‑101 AGTGAAATGTGCCGGATGTATCACATCCGGCAATATCCATTAAAACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT < 1:1478263/101‑1 GTGAAATGTGCCGGATGTATCACATCCGGCAATATCCATTAAAACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTA > 2:789877/1‑101 GAAATGTGCCGGATGTATCACATCCGGCAATATCCATTAAAACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATG > 1:419174/1‑101 AAATGTGCCGGATGTATCACATCCGGCAATATCCATTAAAACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA > 1:153325/1‑101 CGGATGTATCACATCCGGCAATATCCATTAAAACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT < 1:179546/101‑1 GGATGTATCACATCCGGCAATATCCATTAAAACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTT > 1:13452/1‑101 GGATGTATCACATCCGGCAATATCCATTAAAACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTT < 1:362496/101‑1 TGTATCACATCCGGCAATATCCATTAAAACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA < 1:1489505/101‑1 TATCACATCCGGCAATATCCATTAAAACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGG < 1:539683/101‑1 TATCACATCCGGCAATATCCATTAAAACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGG < 1:100220/101‑1 ATCACATCCGGCAATATCCATTAAAACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGT > 1:1000950/1‑101 ATCACATCCGGCAATATCCATTAAAACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGT > 1:266487/1‑101 ACATCCGGCAATATCCATTAAAACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCT < 1:408933/101‑1 ATCCGGCAATATCCATTAAAACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCC > 1:312130/1‑101 ATCCGGCAATATCCATTAAAACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCC > 1:1324415/1‑101 CGGCAATATCCATTAAAACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGT > 2:513166/1‑101 CGGCAATATCCATTAAAACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGT > 2:876598/1‑101 CAATATCCATTAAAACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGC < 1:444629/101‑1 CAATATCCATTAAAACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGC > 2:1387820/1‑101 AATATCCATTAAAACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCT > 1:1585060/1‑101 AATATCCATTAAAACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCT > 1:291008/1‑101 AATATCCATTAAAACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACAGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGAGGat > 1:806604/1‑99 ATATCCATTAAAACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTT > 1:220561/1‑101 TCCATTAAAACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTG < 1:225912/101‑1 CATTAAAACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTT > 2:61810/1‑101 ATTAAAACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTT > 1:1381813/1‑101 ATTAAAACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTT > 2:1060536/1‑101 TAAAACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCT < 1:846694/101‑1 AACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATC < 1:816355/101‑1 CTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAG < 2:31161/101‑1 GATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCT > 1:413056/1‑101 TAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGT > 1:314154/1‑101 TAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGT > 2:1029929/1‑101 GGTCATGCCATCCGCGACAAGGTTATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCC < 2:645727/101‑1 CATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTC < 1:642354/101‑1 ATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCC > 2:713048/1‑101 TGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCT < 2:338877/101‑1 AACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTC > 2:1677026/1‑101 CGCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGC > 2:1054447/1‑101 GCGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGAGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCT > 2:25128/1‑101 CGACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTA < 1:460534/101‑1 GACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTAC < 1:844653/101‑1 ACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACT < 2:1000945/101‑1 CAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTG < 1:1060541/101‑1 AAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGA < 1:1085243/101‑1 AGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTCCTGcg > 1:1553192/1‑99 AGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGAC < 1:653469/101‑1 AGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGAC > 2:1206208/1‑101 AGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGAC > 2:633804/1‑101 AGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGAC > 2:1533394/1‑101 AGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGAC > 1:1514989/1‑101 AGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGAC > 1:455658/1‑101 AGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGAC < 2:1585054/101‑1 | AAGTTAACGGCGTGAGTGAAATGTGCCGGATGTATCACATCCGGCAATATCCATTAAAACTGATAGGTCATGCCAACCGCGACAAGGTGATGCTGCCAAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 149/100‑1 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGAC < 223/698‑615 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |