| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 140 | = 4620 | 3 (0.050) | 103 (0.060) | 73/200 | 0.0 | 98.6% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 222 | = 1443 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
GTTCAGTAAAGTCTGATAACGACAGGCTTAATAAAGGACGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 140/4522‑4620‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTCTT < 222/1443‑1345 GTTCAGTAAAGTCTGATAACGACAGGCTTAATAAAGGACGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGCCATTG > 2:1190133/1‑101 tttAGTAAAATCTGATAACGACAGGCTTAATAAAGGACGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGT < 1:1593295/98‑1 TTCAGTAAAGTCTGATAACGACAGGCTTAATAAAGGACGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGT > 2:330865/1‑101 TCAGTAAAGTCTCATAACGACAGGCTTAATAAAGGACGATAAATCTCTAATAATCCGCAAATGACCCGATTGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTA < 1:830797/101‑1 CAGTAAAGTCTGATAACGACAGGCTTAATAAAGGACGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTAC > 2:505932/1‑101 CAGTAAAGTCTGATAACGACAGGCTTAATAAAGGACGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTAC > 1:655677/1‑101 CAGTAAAGTCTGATAACGACAGGCTTAATAAAGGACGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTAC < 1:158582/101‑1 CAGTAAAGTCTGATAACGACAGGCTTAATAAAGGACGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTAC < 1:1368093/101‑1 AGTAAAGTCTGATAACGACAGGCTTAATAAAGGACGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACT < 1:1705446/101‑1 AGTAAAGTCTGATAACGACAGGCTTAATAAAGGACGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACT < 1:58062/101‑1 AGTAAAGTCTGATAACGACAGGCTTAATAAAGGACGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACT < 1:861399/101‑1 GTAAAGTCTGATAACGACAGGCTTAATAAAGGACGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTG < 1:632781/101‑1 AAAGTCTGATAACGACAGGCTTAATAAAGGACGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGAC < 1:591066/101‑1 AAAGTCTGATAACGACAGGCTTAATAAAGGACGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGAC > 2:1129891/1‑101 AGTCTGATAACGACAGGCTTAATAAAGGACGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCC > 1:15868/1‑101 GTCTGATAACGACAGGCTTAATAAAGGACGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCC < 1:1176277/101‑1 CTGATAACGACAGGCTTAATAAAGGACGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAA > 1:829292/1‑101 CTGATAACGACAGGCTTAATAAAGGACGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAA > 2:891997/1‑101 TGATAACGACAGGCTTAATAAAGGACGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATCCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAA < 1:878942/101‑1 GATAACGACAGGCTTAATAAAGGACGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAA > 2:570928/1‑101 GATAACGACAGGCTTAATAAAGGACGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGAACTGACCCCAAAA > 1:1133318/1‑101 ATAACGACAGGCTTAATAAAGGACGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAA > 1:223604/1‑101 ATAACGACAGGCTTAATAAAGGACGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAA > 1:844298/1‑101 ACGACAGGCTTAATAAAGGACGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTT > 1:1359952/1‑101 ACAGGCTTAATAAAGGACGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGA > 2:1413151/1‑101 ACAGGCTTAATAAAGGACGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGA > 2:655559/1‑101 CAGGCTTGATAAAGGACGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGAC < 2:1634832/101‑1 CAGGCTTAATAAAGGACGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGAC > 1:1081470/1‑101 CAGGCTTAATAAAGGACGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGAC > 2:1165758/1‑101 AGGCTTAATAAAGGACGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACA > 1:279400/1‑101 AGGCTTAATAAAGGACGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACA < 2:780077/101‑1 GGCTTAATAAAGGACGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAG < 2:1078522/101‑1 GGCTTAATAAAGGACGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAG < 2:144240/101‑1 GCTTAATAAAGGACGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGT < 2:338332/101‑1 ATAAAGGACGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAAC < 1:466434/101‑1 AAAGGACGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACAC < 2:1711878/101‑1 GGACGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAG < 1:69093/101‑1 GGACGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAG > 1:314128/1‑101 ACGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGC > 1:911181/1‑101 CGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCA > 1:996962/1‑101 CGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCA < 1:330865/101‑1 ATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATA > 1:550287/1‑101 ATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATA > 1:16168/1‑101 ATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATA > 2:1507530/1‑101 AAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATA > 1:642155/1‑101 AAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATA < 2:938782/101‑1 AATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAG < 1:437337/101‑1 AATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAG < 1:1190138/101‑1 ATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGG > 1:1565358/1‑101 ATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTAGGACAGTTAAACGCGAGGCATATAGG > 1:88738/1‑101 TCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGT > 1:1313917/1‑101 CTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTC > 2:1708878/1‑101 CTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATACCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTC > 2:225144/1‑101 TCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCT > 2:700715/1‑101 ATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATT > 2:1397470/1‑101 ATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATT > 1:1073912/1‑101 AATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCC < 1:759336/101‑1 ATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGGCCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCG > 1:382549/1‑101 ATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCG > 1:1430947/1‑101 TCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGA > 2:616503/1‑101 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GACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATT > 1:464372/1‑101 ACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTG < 2:223604/101‑1 CGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAG < 2:1317915/101‑1 TAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCA < 1:786428/101‑1 TAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCA > 2:1604948/1‑101 CCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACC > 1:1170878/1‑101 CCTGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATACGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGCCAGACC > 2:830555/1‑101 TGCAATTCAAGCTGCTCGACATTGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTT < 1:570933/101‑1 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GTTCAGTAAAGTCTGATAACGACAGGCTTAATAAAGGACGATAAATCTCTAATAATCCGCTAATGACCCGATAGCCCTGCAATTCAAGCTGCTCGACAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 140/4522‑4620‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGTACTGACCCCAAAAAGTTGGACAGTTAAACACGAGGCATATAGGTCTGATTCCGATATTCAATTGGAGTCAGACCTTTTAATTTCAGGCTAATTCTT < 222/1443‑1345 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |