| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 121 | = 14106 | 0 (0.000) | 51 (0.060) +GGTGATGCTGCCAACT |
39/168 | 0.3 | 100% | intergenic (–/–) | –/– | –/– |
| ? | 223 | = 698 | 0 (0.000) | intergenic (–/–) | –/– | –/– | |||||
CAAATGTCACACCGGCTATCTATTACATGAGTAAGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 121/14007‑14106‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACT < 223/698‑618 |||||||||||||||| aAAATGTCACACCGGCTATCTATTACATGAGTAAGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAG < 1:1014765/100‑1 AATGTCGCACCGGCTATCTATTACATGAGTAAGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGT < 1:61551/101‑1 AATGTCACACCGGCTATCTATTACATGAGTAAGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGT < 1:538741/101‑1 TGTCACACCGGCTATCTATTACATGAGTAAGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGA > 1:610854/1‑101 GTCACACCGGCTATCTATTACATGAGTAAGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGAT < 2:313235/101‑1 TATCTATTACATGAGTAAGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTT > 1:798610/1‑101 TATCTATTACATGAGTAAGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTT > 1:1422997/1‑101 TATCTATTACATGAGTAAGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTT > 2:653464/1‑101 TATCTATTACATGAGTAAGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTT > 2:563625/1‑101 TCTATTACATGAGTAAGGAAAATCCGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACCCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTAC < 2:1540532/101‑1 CTATTACATGAGTAAGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACT < 1:1627662/101‑1 CTATTACATGAGTAAGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACT > 2:374065/1‑101 CTATTACATGAGTAAGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACT < 1:1694328/101‑1 ACATGAGTAAGTAAAATACGCTAAAACAGGCCGGGGGGGTGCCGGCGCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGAGATGCTGCCAAATTACTGATTT > 2:157026/1‑101 ACATGAGTAAGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT > 1:1072742/1‑101 CATGAGTAAGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA < 1:984891/101‑1 GTAAGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTA > 2:1385064/1‑101 GTAAGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGGTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGCGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTA > 1:1210090/1‑101 AAGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATG < 2:1039699/101‑1 AAGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATG < 1:737771/101‑1 AGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA > 1:1520693/1‑101 GAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATG < 1:965356/101‑1 AAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGT > 1:952394/1‑101 AATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTG > 1:349054/1‑101 ATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGT > 1:346957/1‑101 ACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTT < 2:1131733/101‑1 CGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTT < 1:1605126/101‑1 CTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG > 1:886867/1‑101 ACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG < 2:1636605/101‑1 CAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGC > 2:802138/1‑101 AGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCT > 2:1428147/1‑101 AGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCT < 2:471347/101‑1 CCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCA > 1:692750/1‑101 CCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCA > 1:312922/1‑101 CGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAG > 1:562674/1‑101 CGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAG > 1:349394/1‑101 GTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGT < 2:610849/101‑1 GGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCT < 2:1380111/101‑1 TTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTC < 1:563630/101‑1 CCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGT < 2:1629388/101‑1 CCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGT < 1:1684638/101‑1 CCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGT > 1:571955/1‑101 GATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTC > 2:702027/1‑101 GAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCA > 2:509437/1‑101 GAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCA < 2:571950/101‑1 GAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCA < 1:1385070/101‑1 AAACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC > 1:1102377/1‑101 AACGCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCT < 2:1593394/101‑1 GCTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTC < 1:1464856/101‑1 CTTAATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCC > 1:64945/1‑101 AATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTC > 1:536653/1‑101 ATATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCC > 2:1085238/1‑101 TATCATTATGGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCT > 2:1608759/1‑101 GGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTA > 1:789124/1‑101 GGGGAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTA > 1:1137870/1‑101 GGAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACT < 2:704509/101‑1 |||||||||||||||| CAAATGTCACACCGGCTATCTATTACATGAGTAAGGAAAATACGCTACAACAGGCCGTGGGGTTGCCCGATCAGAAAACGCTTAATATCATTATGGGGAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 121/14007‑14106‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACT < 223/698‑618 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |